UNIVERSIDAD DE CÓRDOBA

PROGRAMA INGENIERÍA AMBIENTAL

DOCENTE: LEIDY MENDOZA NOVA

Taller de Dominio de Archea

Dylan Viloria Pretelt

Omar Hurtado Altamiranda

Docente: Leidy Mendoza

Universidad de Córdoba

Dpt. Ingeniería Ambiental

Montería

2018
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TALLER N°1- MICROBIOLOGÍA

PARA TENER EN CUENTA: Debajo de cada pregunta resuelta debe estar

referenciada la bibliografía consultada, esta actividad se debe realizar en grupo de
tres estudiantes y será socializada en la próxima clase.

1. Escribe las principales características genéticas, morfológicas y fisiológicas

diferenciales entre bacterias, Archaea y Eukarya.
2. ¿Cuáles son los lugares más remotos o extremos donde se han reportado
microorganismos? (Anexe la fuente científica de cada reporte)
3. ¿Cómo contribuyen los microorganismos al mantenimiento de la calidad
ambiental?
4. ¿Cómo sabemos que en un ambiente natural existe una diversidad
microbiana sin aislar y cultivar los microorganismos que contiene?
5. ¿Cómo podría usted distinguir por simple observación microscópica un
microorganismo fotótrofo de otro quimiótrofo?
6. Que características distinguen a un microorganismo halófilos extremos,
realiza una lista de sus principales hábitats y menciona el nombre científico
de algunas especies de este grupo.
7. ¿Cuál es la función de la bacteriorrodopsina y de la halorrodopsina?
8. ¿Cómo se produce la síntesis de ATP en los Metanógenos?
9. ¿Cómo consiguen los hipertermófilos que macromoléculas tales como
proteínas y ADN no se destruyan por el calor?, explica detalladamente
cómo se da la estabilidad térmica de estas biomoléculas.
10. ¿Cómo consigue thermoplasma que su membrana soporte condiciones tan
hostiles?.
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SOLUCION

1R/

bacteria Archaea Eukarya

genética cromosoma circular,  cromosoma circular, tr múltiples cromosomas lin
s traducción y transcri aducción y transcripció eales, histonas, traducció
pción únicas n similares a Eukarya n y transcripción similares
a Archaea
morfoló Las bacterias se la morfología de este Son diversas las
gicas diferencian de las tipo de células propiedades que
células eucarióticas procariotas es distinta caracterizan a las
en que no tienen al dominio bacteriano , arqueas: tienen una
membrana nuclear su tamaño es de 0,1 membrana unicelular
ni orgánulos μm y más de 15 μm cuya envoltura o pared es
citoplasmáticos, aun con morfología distinta a la de las
así son organismos comunes esferas, bacterias; las membranas
dotados de una barras, espirales y arqueas están
gran complejidad. placas aunque existen compuestas por lípidos
 las principales algunas arqueas que con una composición
estructuras tienen morfología glicerina distinta a la de
presentes en las irregular , rectángulas , los eucariotas, con la
bacterias son: cuadradas... finalidad de brindar a las
primeras una alta
Cápsula bacteriana. capacidad de resistencia
Es una capa térmica.
externa que no
presenta una Las arqueas individuales
estructura definida y tienen un diámetro
está presente en las variable (de 0.1 a 15
bacterias micrómetros) y pueden
patógenas. Entre presentar múltiples
sus funciones formas, como esféricas,
destaca la espirales, y hasta
regulación del rectangulares.
intercambio de
sustancias o la Sus flagelos presentan
protección frente a composiciones diferentes
bacteriófagos o a los de las bacterias,
anticuerpos. pudiendo ser mucho más
largos y gruesos. Las
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 Pared arqueas, según sus

bacteriana. Es una formas, pueden presentar
envuelta rígida que procesos metabólicos
mantiene la forma muy distintos entre ellos.
de la célula frente a
los cambios de
presión osmótica,
regula el paso de
iones y es resistente
a los antibióticos.
Su estructura se
observa gracias a
la tinción gram, que
permite diferenciar
dos grupos de
bacterias: las gram
positiva y las gram
negativa.

fisiológi Son Son llamadas Todos los integrantes del

cas microorganismos arqueobacterias, dominio Eukarya (reino
unicelulares, de también se les planta, animalia, fungí)
forma diferente y conocen como poseen células con una
hábitat variable.  extremófilas ya que verdadera organización
Algunas son viven en ambientes nuclear, es decir, el
capaces de extremos. núcleo está constituido
formarse una características: por la envoltura nuclear o
envoltura o 1. son procariontas. carioteca cuya función es
cápsula.   2. unicelulares. separa y aislar el ADN del
Todas se multiplican 3. la mayoría son resto de la célula, de ahí
por división.  heterótrofas. la denominación de
Algunas bacterias 4. poseen lípidos dominio Eukarya. Otras
son capaces de diferentes a los de las características sus
formar endoporos membranas celulares células poseen un
más resistentes a de los eucariontes. sistema de
las formas adversas 5. sobreviven en áreas endomembranas o
de vida.  muy contaminadas. sistema vacuolar
El oxígeno es 6. algunas son citoplasmático integrado
indispensable para anaerobias obligadas. por los retículos
las bacterias 7. su nombre proviene endoplsmáticos rugoso,
aeróbicas y resulta de su hábitat. liso, el aparato de Golgi y
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nocivo para las *termófilas: se la carioteca. 

anaeróbicas que lo encuentran en según el nivel de
toman de fumarolas marinas. organización biológica
compuestos *acidofilas: se que presenten los
oxigenados.  encuentran en lugares diferentes organismos se
Las bacterias son en donde el pH es destacan en el dominio
capaces de generar acido. Eukarya los organismos
mutantes.  *metanogenas: se de nivel celular( poríferos
Las bacterias dan encuentran en y plantas celulares o
origen a la espacios carentes de talofitas y los hongos)
enfermedad oxígeno. cuyas células no se
llamadas *halófilas: en espacios diferencian en tejidos,
esquitomiasis, se con grandes nivel tisular cuyas células
caracteriza por concentraciones de se diferencian en tejidos
abscesos y sal. (celenterados), nivel
hemorragias. orgánico( platelmintos) y
sistemas de órganos
( invertebrados
superiores y
vertebrados). 

2R/

Existen varios lugares en la Tierra donde las condiciones físicas y químicas son
atípicas para que la mayoría de organismos puedan sobrevivir, pero la exhaustiva
exploración científica de estos ambientes extremos ha mostrado que los límites de
la vida se extienden más allá de lo que siempre habíamos pensado.

Se ha documentado la presencia de microorganismos resistentes a condiciones

tan hostiles como las de las minas abandonadas de uranio en Alemania; Río Tinto,
en España, cuya acidez es igual a la del jugo de limón (pH = 2,0), e incluso en
Chernobyl (Ucrania), donde los niveles de radiación llegan hasta los 500.000 rads
(1.000 rads son suficientes para producir la muerte de un ser humano).

Los hábitats donde viven los extremófilo Incluyen manantiales calientes, sistemas 

hidrotermales submarinos poco profundos o sistemas de aberturas termales
abisales, tierras y mares polares fríos y glaciares alpinos; lagos salinos y
ambientes con valores de pH extremos, sea ácido (zonas de solfataras, minas) o
alcalino (fuentes carbónicas, tierras y lagos alcalinos); y con relativa frecuencia, en
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zonas que combinan dos o más factores extremos, como alta temperatura y
condiciones ácidas, en los manantiales ácidos y calientes de zonas volcánicas, o
baja temperatura y alta presión, en los fondos marinos se han aislado bacterias y
arqueas extremófilas de pozos petroleros, aguas termales, zonas desérticas,
suelos alcalinos zonas volcánicas , entre otros, revelando la gran biodiversidad y
el gran potencial biotecnoló- gico de la micro flora mexicana
[ CITATION Ros14 \l 9226 ]

3R/ Los diferentes grupos de microorganismos ayudan al mantenimiento de la

calidad ambiental de diversas formas:
 Participan en gran medida en el tratamiento biológico de residuos líquidos y
sólidos. Estos tratamientos pueden ser de tipo aerobio, anaerobio o mixto.
 Juegan un papel importante como indicadores de contaminación.
 Muchos de ellos son útiles en procesos de biorremediacion de suelo y agua.
 Contribuyen a la fertibilidad del suelo, degradando la materia orgánica de
restos de animales y plantas muertos, aso como la participación de algunas
bacterias en la fijación de nitrógeno atmosférico.
 Pueden utilizarse en el diseño y construcción de biosensores que pueden ser
utilizados en la determinación de analitos de interés ambiental.

4R/

Una diversidad microbiana son todos aquellos microorganismos los cuales sin
ellos un ecosistema y/o ambiente no podría llegar a existir en sí, es decir, son
esenciales para la diversidad biológica. Dichos microorganismos son los
responsables defunciones únicas en los ciclos biogeoquímicos (fijación del
nitrógeno, nitrificación, desnitrificación, fijación quimiolitotrófica del dióxido de
carbono, formación de metano, reducción de sulfatos), en la formación del suelo,
en la regulación del clima, en la composición atmosférica (incluyendo los gases
invernadero) y la descomposición de materia orgánica.
Se sabe que en un ambiente natural existe una diversidad microbiana sin aislar y
cultivar los microorganismos que contiene cuando podemos notar estos
fenómenos en un ambiente. Además de eso, las actividades de los
microorganismos en comunidades puede afectar el habitad y cambiar sus
características físicas y químicas, lo cual sería evidencia de la diversidad
microbiana
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5R/ Al observar en un microscopio podemos distinguir los autótrofos de los

quimiotrofos, a través de los pigmentos que les permiten utilizar la luz como fuente
de energía.

6R/ Halófilos : Se llaman halófilos a aquellos oraganismos que requieren cierta

concentración de NaCl para su desarrollo y crecimiento. Pueden ser clasificados
en función de la cantidad de sal que requieren, en la tabla 1 se muestran las
distintas concentrqaciones de NaCl que necesitan los halófilos para crecer

Ambientes

La diversidad de los microorganismos halófilos es muy variada muchos de estos

microorganismos han sido asilados de hábitats que presentan alta salinidad
ubicados en diferentes puntos geográficos del planeta , los ambientes
extremadamente salinos son raros, la mayoría se encuentran en zonas calientes y
secas, como son los lagos salinos ( gran lago salado de Utah y el mar muerto),
suelos saladfos y alimentos salados principalmente, las salinas marinas son
tambein buenos hábitat para los procariotas halófilos extremos. Se han aislado
halófilos extremos en alimentos con alta concentración de sal, como salmueras,
salsa de soya y pescado [ CITATION Ven98 \l 9226 ]

Microorgansimos Procedencia Crecimiento optimo %

NaCl
Actinopolyspor a Contaminante en medio 10
halophila con 25% de NaCl,
Canadá
A. mortivallis Suelo salado. Valle de la 5-25
muerte, California
A. iraquiensis Suelo salino, Iraq 10-15
Nocardiopsis bucentensis Suelo salado, Alicante, 10
España
Streptimonospora salina Lago salado Oeste de 15
china

7R/

La bacteriorrodopsina (bR) es una proteína que, al ser estimulada por la luz,

funciona como una bomba de protones interviniendo en la síntesis de ATP
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mediante un proceso de fotofosforilación que convierte la energía lumínica en

química (fotosíntesis). La bR codificada por el gen bop, es el constituyente de
la membrana celular de las haloarqueas extremas, llega a ocupar hasta el 50%
de ésta cuando hay concentraciones bajas de 0 2demostrando la gran
adaptación de estos microorganismos a condiciones anaeróbicas. Desde que
fue propuesta la función fotorreceptora de la bR, numerosos estudios se han
realizado con el fin de elucidar su secuencia aminoacídica, su conformación
estructural, sus propiedades fisicoquímicas, las características de su expresión
y regulación génica. Las excelentes propiedades fotoquímicas y
termodinámicas de la bR la hacen una molécula peculiar y candidata para
aplicaciones biotecnológicas en biocomputación como memorias ópticas,
sistemas fotoeléctricos y en biomateriales, siendo de gran interés comercial las
fuentes de aislamiento y producción. En esta revisión, se describe la génesis,
función, expresión génica y aplicación biotecnológica de la bacteríorrodopsína.

El halorhodopsina es una proteína de membrana que funciona como bomba de

iones regulados por la luz , específico para iones cloruro, que se encuentran
en arqueas filogenéticamente muy viejos, llamados halobacterias . Es una proteína
de la familia de siete dominios transmembrana de retinilideno
proteína , homólogo a la bomba de protones luz impulsada bacteriorrodopsina , y
similar en su estructura terciaria (pero no en primaria o secuencia
de aminoácidos ) a la rodopsina en los vertebrados, que son pigmentos sensibles
a la luz de la retina. La halorodopsina también comparte similitud de secuencia
con la canalrodopsina , otro canal iónico impulsado por la luz. El halorhodopsina
contiene el derivado esencial de vitamina A isomerizable por la luz de todo-
trans- retinal . Debido a los intensos esfuerzos realizados para resolver la
estructura secundaria y la función de esta molécula, halorhodopsina es una de las
pocas proteínas de membrana se conoce que su estructura cristlina .
La halorrodopsina usa energía de luz verde / amarilla para mover los iones cloruro
a la célula, superando el potencial de membrana. Además de los cloruros,
transporta otros haluros y nitratos a la célula. La captura de cloruro de potasio por
las células ayuda a mantener el equilibrio osmótico durante el crecimiento celular,
pero es costoso en energía. Al realizar esta misma tarea, las bombas de aniones
de luz emitida pueden reducir significativamente el uso de energía
metabólica. propiedades halorhodopsina son similares a los de la
bacteriorrodopsina , y estas dos bombas de iones impulsados por iones de
transporte de luz en direcciones opuestas: bacteriorrodopsina expulsa cationes e
introduce halorhodopsinaaniones .
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Las isoformas de halorrodopsina se pueden encontrar en muchas especies

de halobacterias , como Halobacterium salinarum y Natronobacterium
pharaonis . Están estudiando sus diferencias y usándolas para analizar cada parte
del fotociclo y sus propiedades como bombas. Después de la bacteriorrodopsina,
la halorhodopsina puede ser la opsina tipo I (microbiana) mejor estudiadas. El pico
de absorbancia del complejo de halorrodopsina retinal es de aproximadamente
570 nm.

8R/

Los metanógenos son autótrofos arqueobacterias que utilizan la respiración

anaeróbica para la síntesis de ATP ellos para dicha síntesis utilizan CO2
tomado de su entorno de crecimiento como el sustrato de carbono para el
crecimiento. Algunos usan CO2 como agente oxidante de una cadena de
transporte de electrones que, por un mecanismo quimiosmótico, mantiene un
gradiente iónico transmembrana electroquímica que alimenta la producción de
ATP. El agente reductor que impulsa la cadena de transporte de electrones es
hidrógeno, también tomado del entorno de crecimiento. Este hidrógeno es el
producto final de residuos del metabolismo de otros microorganismos heterótrofos.

Este fenómeno es importante debido a la utilización de hidrógeno por los

metanógenos reduce la presión parcial de hidrógeno de los retículo-rumen y esto
altera el patrón de metabolismo de hidrógeno "donantes " especies asociadas
syntrophic. ya que estos organismos tienen hidrogenasas hidrógeno y minúsculas.
Subir o bajar 
la presión parcial de hidrógeno en su entorno de crecimiento determina sus vías d
e fermetación y por lo tanto afecta a su producción de ATP que afecta a su
crecimiento.

La ecuación muestra la reducción del CO2 por H2 para producir metano. Esta
reacción redox sostiene la respiración anaeróbica que permite la producción de
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ATP. El metano producido por la reducción del dióxido de carbono se pierde desde
el retículo-rumen por eructos.

9R/
Dado que viven en ambientes extremos, requieren mecanismos de adaptación que
incluyan particularidades que permitan conferir estabilidad térmica a sus
estructuras (pared celular y membrana citoplasmática) y a sus biomoléculas (ADN,
proteínas, etc.).

1. Pared celular: es la parte más externa de las Archaea, disponiéndose

alrededor de la célula y protegiendo el contenido celular. No contiene
peptidoglicano, lo que les confiere una resistencia natural frente a la
lisozima. La pared más común es una capa superficial para cristalina
(capa S) formada por proteínas o glucoproteínas de simetría hexagonal,
Kandler, O. et al (1998). Una particularidad excepcional viene de la
mano del género Thermoplasma que carece de pared, Madigan, M. et al
(2004), carencia que suple gracias al desarrollo de una membrana
celular cuya estructura química es única: contiene un lípido tetraéter con
manosa y glucosa en una proporción muy alta respecto al total de
lípidos. Además, se acompaña de glicoproteínas que, junto a este lípido,
confieren a la membrana de Thermoplasma spp propiedades de
estabilidad frente a las condiciones ácidas y termófilas en las que vive.
2. Membrana citoplasmática (Figura 2): es la principal adaptación a la
temperatura. Esta membrana es radicalmente distinta a la conocida para
bacterias y eucariotas. La membrana de las Archaeabacterias se
construye sobre un patrón de bifitanil tetraéter, van de Vossenberg, JL.
et al (1998), estableciéndose pues, enlaces éter, Albers, SV. et al
(2000), entre las moléculas de glicerol (que en las Archaeabacterias es
el Lglicerol) y las cadenas laterales hidrofóbicas que jamás serán de
ácidos grasos. Estas cadenas laterales están formadas en su mayoría
por unidades repetitivas de isopreno, Albers, SV. et al (2000). En ciertos
puntos de la membrana, las cadenas laterales se unen mediante
enlaces de tipo covalente y en estos puntos se forma una monocapa,
Madigan, M. et al (2004). De esta forma la membrana es mucho más
estable y resistente a la desorganización por temperatura que las
bicapas de ácidos grasos presentes en los organismos eucariotas y en
las bacterias.
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3. Proteínas: se desnaturalizan a altas temperaturas por lo que también

deben adaptarse. Para lograrlo utilizan unos complejos proteicos
(chaperoninas) y unas proteínas (chaperonas) también conocidas como
proteínas del choque térmico, Rodríguez, G. et al (2004). Su función es
unirse a la proteína que se está sintetizando o englobarla, creando un
ambiente propicio para el correcto plegamiento de la misma, ayudándole
a alcanzar su conformación terciaria. Además, pueden colaborar en el
transporte de las nuevas proteínas hasta su lugar de acción.
4. Ácido desoxirribonucleico (ADN): también va a adaptarse a las altas
temperaturas valiéndose de varios mecanismos:
• 2, 3- difosfoglicerato potásico cíclico Æ este soluto solamente ha sido
aislado en algunas especies del género Methanopyrus y se caracteriza
por evitar el daño químico que sufre a estas temperaturas el ADN,
Gomes, E. et al (2007).
• Topoisomerasa Æ esta enzima la presentan todos los termófilos e
hipertermófilos. Se encarga de introducir giros positivos en el ADN,
confiriéndole mayor estabilidad frente a las altas temperaturas, Bergerat,
A. et al (1997).
• Sac7dÆ esta proteína se ha encontrado en el género Sulfolobus y se
caracteriza por aumentar, hasta en 40ºC, la temperatura de fusión del
ADN. Robinson, H. et al (1998).
. Histonas Æ estas proteínas se asocian con el ADN y colaboran en su
superenrrollamiento, Gomes, E. et al (2007).
5. Moléculas de almacenamiento celular energético (ATP y NAD+):
resultan ser un punto de inflexión para estos organismos por ser
moléculas esenciales para el metabolismo energético y sin las cuales, la
vida tal y como la conocemos, no ha podido ser demostrada. Ambas
moléculas son inestables por encima de los 140ºC, límite por encima del
cual todavía no encontramos organismos vivos.

10R/
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Thermoplasma es un género de arqueas que pertenece a la Thermoplasmata, que

prosperan en ambientes ácidos y alta temperatura. Thermoplasma son anaerobios
facultativos y respiran utilizando azufre y carbono orgánico. No contienen
una pared celular pero en cambio contienen una MEMBRANA única compuesta
principalmente de un tetra- éter lipoglicano que contiene lípidos atípica tetra- éter
unido a una de glucosa y oligosacárido que contiene manosa. Lo cual hace de las
thermoplasma mas estable a las condiciones acidas.

La estabilidad de lípidos, proteínas y ADN es esencial para la vida de estos

organismos. Analizando las secuencias de AA de sus proteínas podemos observar
que son prácticamente iguales a las de otros organismos mesófilos. Estudiándolos
con detalle podemos detectar mínimos cambios en la secuencia de AA que
implican un plegamiento de la proteína algo diferente, lo cual nos lleva a afirmar
que su conformación espacial es lo que le confiere la termorresistencia. También
actúan como estabilizadores de proteínas ciertas sustancias como el diinositol-P
y/o termosomas como los de Pyrodictium occultum.

El ADN no se separa sus hebras a esta temperatura porque existen tres motivos
principales:

-La presencia de grandes cantidades de 2,3-difosfoglicerato potásico, sustancia

que evita la desnaturalización del ADN.

-Incremento del porcentaje de guanina citosina.

-El mecanismo de Girasa Reversa (DNA topoisomerasa), el cual introduce vueltas

positivas en la cadena de ADN lo que también lo hace más resistente a la
desnaturalización térmica.

-Además de los anteriores mecanismos existen otras proteínas implicadas en la

protección del ADN
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Bibliografía
Ninfa R., J. S. (2006). Microorganismos extremofilos. Actinomicetos halofilos en mexico . mexico :
Revista mexicana de ciencias farmaceuticas .

Rosa O., A. M. (2014). Utilization of microorganisms from extreme environments and their. ESPAÑA
: BIOTECNOLOGÍA Y CIENCIAS AGROPECUARIAS .

Ventosa A., N. J. (1998). Biology of moderaty halophilic aerobic bacteria. Microbiology and
molecular biology review.

http://bio-diversidad-prepa.blogspot.com.co/2010/11/dominio-archaea.html

https://www.clubensayos.com/Ciencia/CARACTER%C3%8DSTICAS-DEL-DOMINIO-
EUKARYA/1735936.html
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