Bioquimica I Ciclo Krebs Practica

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Bioquimica I

Instructor : M.C. Miguel Ángel Díaz Alday

OXIDACION MITOCONDRIAL DEL SUCCINATO (ciclo krebs y fosforilacion


oxidativa)

OBJETIVO

El alumno demostrara la oxidación mitocondrial del succinato, utilizando un


aceptor artificial de electrones, la cantidad del cual será determinada por
espectrofotometría.

INFORMACION GENERAL

Los animales superiores son heterótrofos, es decir, no pueden sintetizar su propia


energía (como lo hacen las plantas en la fotosíntesis), sino que deben ingerir esa
energía en los alimentos que consumen, y posteriormente extraer parte de la
misma mediante una compleja serie de reacciones bioquímicas.

La principal fuente de energía para los animales y el hombre son los


carbohidratos, el metabolismo energético de estos compuestos incluye reacciones
como la glucólisis, ciclo de Krebs y la cadena respiratoria. Dependiendo de si las
condiciones microambientales son aerobias (con presencia de oxigeno), o
anaerobias (en ausencia de oxigeno), las reacciones proseguirán por una vía, o
bien, se detendrán a cierto nivel.

La mitocondria, es un pequeño organelo celular en donde se llevan a cabo las


reacciones que requieren la presencia de oxigeno. En la mitocondria se hallan
numerosas enzimas que hacen posible la oxidación de los metabolitos del ciclo de
Krebs.

La oxidación puede implicar: ganancia de oxigeno, perdida de hidrogeno, o mas


específicamente, perdida de electrones.

La producción de energía por parte de la mitocondria, implica el transporte de


electrones a lo largo de una cadena de reacciones y de varias maneras, una de
ellas, es la colorimétrica, usando un aceptor artificial de electrones, el cual cambia
de color cuando capta dichos electrones.
Para medirá con exactitud el grado en el cual se produce el cambio de color, se
usara un aparato muy común en el laboratorio de bioquímica, el
espectrofotómetro.

Sin entrar en muchos detalles, este aparato nos mide la cantidad de luz que
atraviesa un medio coloreado (transmitancia), o bien, nos puede medir la cantidad
de luz que es retenida o absorbida por ese medio coloreado (absorbancia).

A mayor cantidad de substancias coloreadas tenga una muestra, mayor cantidad


de luz será capaz de absorber, pero ello también dependerá del espesor de la
cubeta (los tubos de cuarzo donde se colocan las muestras dentro del aparato).

Para el caso de la práctica, se usará como aceptor artificial de electrones al


ferrocianuro (se usará ferrocianuro de potasio).

Esta substancia es de color amarillo, y a medida que va aceptando electrones, va


haciéndose cada vez más pálida. A mayor cantidad de electrones aceptados, más
pálida se vulva la solución, esta disminución de color se puede mediar con gran
exactitud usando el espectrofotómetro.

MATERIALES REACTIVOS

4 tubos de ensayo 120 x 10mm Buffer de fosfatos pH 7.4 0.1M

1 gradilla Succinato en buffer 0.01M

3 pipetas de 1ml Malonato en buffer 0.01M

2 pipetas de 0.1ml Cianuro de potasio

2 vasos p.p. 250ml1 baño Maria Ferrocianuro de potasio 0.01M

1 termómetro Ácido tricloroacético al 10%

1 mortero y mano1 trozo de gasa

1 centrifuga con tubos MATERIAL BIOLÓGICO


1 espectrofotómetro con cubetas Trozo de corazón de res (fresco).

1 licuadora

hielo picado

DESARROLLO DEL EXPERIMENTO.

1. Pese 10 gramos de corazón de res fresco (puede ser de otra especie).

2. Pique finamente el trozo de corazón, añada 190ml de buffer de fosfatos bien


frío.

3. Coloque en un vaso licuador y licue por 1 minuto.

4. Filtre a través de gasa fina y recoja el filtrado en un vaso de precipitados.

5. Coloque en baño Maria de hielo el vaso de precipitados que contiene el filtrado


(homogenizado).

6. Numere 3 tubos de ensayo y proceda como muestra el esquema:

Tubo 1 Tubo 2 Tubo 3

Buffer de fosfatos 3ml 2ml 1.9ml

Succinato en buffer 1ml 1ml

Malonato en buffer 0.1ml

_______________________________________________________________
____

Homogenizado del
paso No 5 1ml 1ml 1ml

NOTA: Checar que esté bien mezclado.

_______________________________________________________________
____Cianuro de potasio 1 gota 1 gota 1 gota

7. Colocar los tubos en un baño Maria a 37°Cpor 5 minutos.

8. Añadir a cada tubo 1ml de ferrocianuro de potasio. Mezcle bien, anotar el tiempo
al que se hizo la adición.

9. Diez minutos después agregue a cada tubo 5ml de ácido tricloroacético. Mezcle
bien.

10. Centrifugue cada tubo por 5 minutos a 2,000 r.p.m.

11. Obtenga el sobrenadante de cada tubo y tome la lectura de la absorbancia en


el espectrofotómetro, a una longitud de onda de 420nm. NOTA: UTILICE
AGUA DESTILADA COMO BLANCO PARA CALIBRAR EL APARATO.

12. Calcule el numero de micromoles de ferrocianuro que quedan en cada tubo,


para ello considere lo siguiente:
3
a) La Extinción molar (E) del ión ferrocianuro es de 1 X 10 litros mol-1 cm -1
a
420nm.

b) El volumen total en cada tubo, luego de la adición del ácido tricloroacético es


de 10ml.c) La longitud del rayo de luz que atraviesa la cubeta es de 1-1.2 cm.
(Consulte a su instructor para el caso de las cubetas que usted está usando)

FORMULA A EMPLEAR PARA LOS CALCULOS

C = A_

EB

C = Concentración
A = Abosorbancia medida en el espectrofotómetro

E = Exticnción molar (1 X 10 3 mol -1 cm-1)

B = Espesor de la cubeta (cms)

Micromoles de Fe (CN) 3 Micromoles de Fe


(CN) 3

Al final de la reacción usados por el sistema

Tubo 1

Tubo 2

Tubo 3

12. Resultados esperados

Tubo 1. ------ No contiene el substrato (succinato), solo el buffer, de aquí que no


exista oxidación, por lo tanto es el tubo que conserva más cantidad de
ferrocianuro sin aceptar electrones (y sin cambiar de color).

Tubo 2. ------ La presencia del substrato (succinato), en este tubo, permite que
dicho succinato se oxide, proceso que implica un transporte de electrones,
los cuales soncaptados por el ferrocianuro, el cual se va decolorando a medida
que ello ocurre. Este tubo debe dar el valor mas alto de micromoles de
ferrocianuro empleados por el sistema enzimático y el menos numero de
micromoles de ferrocianuro que quedan después de terminada la reacción.

Tubo 3. ------ La presencia del malonato que contiene este tubo, actúa como un inhibidor de
tipo competitivo para la succinato deshidrogenasa (la enzima que cataliza la remoción de
hidrogeno del succinato). Por lo tanto, el succinato al no oxidarse, se mantiene. Este tubo
debe dar, en base a lo señalado, un valor de micromoles de ferrocianuro que quedan
después de la prueba, mayor al del tubo No 2.

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