Estructura Del ADN

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Estructura ADN

El DNA almacena la información genética: Friedrich Las bases nitrogenadas pueden ser bases púricas que se
Miescher (1868, Suiza) distinguen fácilmente, porque están formadas por dos
anillos y las bases pirimidinas formadas por un solo
Elementos simples transmisores de la herencia,
anillo.
experimentos de hibridación en plantas.

• Estudios sistemáticos del núcleo

• Aislamiento de sustancia que contenía fósforo:


nucleína (a partir de leucocitos (pus) de vendajes
quirúrgicos). Nucleína

• Nucleína: fracción acídica (DNA); fracción básica Lo otro importante es el C2 (es lo que le da el apellido)
(proteína), esta fracción acida era el ADN y la básica donde se une, ya sea, un ribonucleótido o un
eran las proteínas unidas a este ADN, entonces ya en desoxirribonucleótido, los primeros tienen un OH en el
1800 se hablaba de estos elementos transmisores de C2 y son los que forman parte del ARN (acido
herencia, existía “algo”, que tienen un material ribonucleótido), y en el caso de que el C2 tenga un
interesante a analizar. hidrogeno será el desoxirribonucleótido, porque se
pierde el oxígeno que estaba en el hidroxilo, entonces
• Encuentra la misma sustancia desde cabezas de hidroxilos siempre en un ribonucleótido y un solo
esperma de Salmón hidrogeno en el desoxirribonucleótido (que forma parte
• Gregor Mendel (1865) de la cadena de ADN).

“Experimentos in Plant-Hybridization” (Society o Natural En el C3 siempre hay un hidroxilo y es importante,


Science in Brünn, Austria) porque es el hidroxilo que está en el C3 junto con el
fosfato en el C5 del siguiente nucleótido, los que forman
el enlace fosfodiéster, es decir, los que permiten la
cadena de nucleótidos, ya sea en los ribonucleótidos
como los desoxirribonucleótidos, es decir, en la cadena
de ARN o ADN.

Purinas y Pirimidinas que se encuentran en ácidos


nucleicos

Todo el material está formado por nucleótidos.

La estructura de los nucleótidos se observa a la


izquierda, lso cuales están formados por una pentosa
que es un azúcar de 5C, una ribosa. Al carbono 5 va
unido el fosfato que puede ser 1, 2 o 3, es decir,
monofosfatado, difosfatado, o trifosfatado. En el
carbono 1 va unida la base nitrogenada. Estos dos
carbonos son importantes. En el C1 va unida B.N y en el Las bases púricas están formadas por dos anillos,
C5 va el fosfato. teniendo a la guanina y adenina, y las pirimidinas están
formadas por un anillo, teniéndose a la citosina, timina
y uracilo.
Síntesis de ácidos nucleicos: Estructura química del Algunas características fisicoquímicas de los ácidos
ácido ribonucleico (RNA) y del ácido nucleicos: el ARN se hidroliza fácilmente en condiciones
desoxirribonucleico (DNA) alcalinas, acá se muestra la representación de un ARN
de una molécula de ribonucleótidos unidos, a través de
enlaces fosfodiéster, en el ribonucleótido en la molec de
ARN el C2 tendrá siempre hidroxilos, por lo tanto en una
solución rica en hidroxilos (alcalino), estos OH atacaran
nucleofilicamente a los OH del C2 y este Nü al enlace
fosfodiéster, de esa forma se rompe el enlace, por esto
en condiciones alcalinas uno puede hidrolizar la
molécula de ARN y dejar solamente los nucleótidos.

Para la purificación de ADN y ARN, si se quiere eliminar


el ARN, se puede colocar en solución alcalina y de esa
Acá se ve el enlace fosfodiéster, el cual está formado forma eliminarlo, y quedará solo el ADN. Ahora, si se
por el C3 que tiene un hidroxilo que se une al fosfato necesita hidrolizar ambas, los colocamos en una
que se encuentra en el C5 del siguiente nucleótido, solución acida, pues la acida romperá todos los enlaces
entonces siempre está unido el C3 hidroxilo del primer fosfodiéster.
nucleótido al C5 que tiene un fosfato del siguiente
nucleótido. Por ello tanto en ADN como en ARN, se Nomenclatura
habla de un extremo 5’ y 3’, porque el primer
nucleótido va a dejar libre el grupo fosfato que se
encuentra en el C5 siendo este el extremo 5’ (primer
nucleótido), y el ultimo nucleótido queda al extremo 3’
donde se encontrara un hidroxilo en el C3 libre.

El sentido de cómo se va escribiendo, sintetizando la


molécula de ADN o ARN, se hace igual a como se escribe
con un lápiz y papel, de izquierda a derecha, entonces Siempre habrá secuencias anotadas en los libros,
una molécula de ADN o ARN se escribe de izquierda a publicaciones científicas o en data base, siempre estará
derecha, va de 5’ a 3’, es decir, el primer nucleótido escrita de 5’ a 3’, porque en el 5’ habrá un fosfato libre
siempre dejara un C5 con el fosfato libre y en el último y en el 3’ habrá un OH libre. En la replicación de ADN la
nucleótido habrá en el C3 un hidroxilo libre. polimerasa sintetizará de 5’ a 3’.
Hidrólisis del RNA en condiciones alcalinas Complementariedad de ácidos nucleicos

En el caso del ADN que es una doble hebra de ADN, las


cuales van unidas, estabilizadas a la forma helicoidal,
pero están estabilizadas, porque se guardan hacia el
interior, si están en solución acuosa siempre estarán las
moléculas más apolares que son las BN. Entonces, hacia entregando una cierta información, es decir, que
el interior las BN se unirán entre sí, una pirimidina con estaban almacenando una info heredable.
una púrica, citocinas con guanina (3 enlaces H) y entre
El experimento consistía en tomar el neumococo que es
adenina y timina con dos enlaces hidrogeno, siempre
altamente letal y la inyectaron a un ratoncito y el ratón
quedan hacia el
murió, luego tomaron otra bacteria distinta no
interior estabilizando
encapsulada, como bacteria control la cual inyectaron al
la doble hebra
ratón y el ratón no murió, porque la bacteria no era
helicoidal.
letal. Luego, tomaron el neumococo y lo calentaron, así
Siempre tres enlaces H se eliminan las bacterias. Entonces, calentaron, ebullir la
entre un C-G y dos solución bacteria de neumococo y con eso mataron a
enlaces H entre T-A, y las bacterias, inyectaron al ratón y el ratón sobrevivió,
estos estabilizarán a la entonces observaron que al ebullir el ratón sobrevivía.
doble hebra. Entonces, la pregunta que se hicieron cuando vieron
que el ratón sobrevivía, fue ¿qué es lo que está
produciendo que muera el animal? Tomaron estas
bacterias muertas por calor (los neumococos) y le
pusieron células no encapsuladas. Hicieron esta mezcla
calentados por color, mezclaron con las bacterias no
El DNA almacena la información genética: Avery, letales y esta mezcla la inyectaron al animal y el ratón
MacLeod, McCarty (1944, USA) murió.

Experimentos que apuntaron al DNA como materia ¿Qué es lo que está matando al animal? Lo que mataba
genético. al animal, era algo que venía en el neumococo,
independiente que este muerto por calor o no, si lo
Estreptococos pneumoniae: neumococo. DNA de cepas colocan con bacterias vivas, el neumococo algo les
patógenas de bacterias podía transferirse a cepas no transmite que las hace ahora letal. Entonces, ¿Qué es lo
patógenas. que transmite?¿De qué está formada la bacteria? La
bacteria está formada por material proteico, y por
ácidos nucleicos, la pregunta fue ¿qué es lo que la hace
toxica, el material nucleico o las proteínas?

Hicieron 2 experimentos en paralelo, tomaron a la


bacteria no letal y la mezclaron en un caso con el ADN
purificado del neumococo, y en paralelo mezclaron las
no letales con las proteínas del neumococo. En ambos
casos, ambas mezclan las inyectaron a un ratón de
forma independiente. En el ratón donde se mezcló ADN
+ bacteria no letal, el ratón murió. En el otro caso,
proteínas + bacteria no letal, el ratón sobrevivió,
entonces se permitió concluir que en el ácido nucleico
es donde hay una información guardada, almacenada y
Experimentos que apuntaban a que el ADN fuera un que puede ser transmitida a otra célula. Det que los
material genético, que estuviera guardando información elementos transmisores de la herencia son el ADN (ac
genética, la cual podía ser heredada, porque ya los nucleicos) y no las proteínas.
ensayos de hibridación en plantas que había hecho
Mendel, donde vio que había info en las plantas que se
iba heredando, lo que denomino elementos
transmisores de la herencia, en este caso a través de
estos experimentos pudieron determinar que había algo
en este ADN, en estas moléculas que estarían
El DNA almacena la información genética: Erwin Análisis del contenido total de A, T, G y C hecho por
Chargaff (1940-50, USA) Erwin Chargaff

Junto a Watson y Crick estudiaron, y vieron que se 1962, Watson, Crick y Wilkins reciben el Premio Nobel
almacenaba la info y que podía ser transmisible. en Medicina y Fisiología

Chargaff estudió la composición de las bases de DNA, El DNA almacena la información genética: Rosalind
determinado que estas varían entre especies, lo que es Franklin y Maurice Wilkins (1953, USA)
cierto, pues hay diferencias si observamos secuencias,
composición. Sin embargo, hay una alta homología e
identidad, pues entre el ADN de un ratón y nosotros
somos 90% similares, y en homología casi un 100%,
porque tenemos prácticamente las mismas proteínas.

El DNA de diferentes tejidos (misma especie, humanos


por ejemplo) tienen la misma composición de bases, el
mismo ADN, es decir, las células hepáticas como las
neuronas tienen la misma composición genética.

El DNA de una especie dada no varía con la edad, estado


nutricional ni variaciones ambientales, al nacer y al
morir tenemos el mismo contenido genético, porque
hay ciertas variaciones ambientales que pueden generar Fueron los que realizaron y permitieron describir la
mutaciones, pero no hay una variación completa del estructura del ADN.
genoma, son solo mutaciones puntuales (cambio de un
El patrón en forma de cruz (típica estructura que lo
nucleótido, unión de uno con otro, etc.).
sacaron de otros estudios, alfa hélice) indica que el
En todos los DNA (independiente de la especie) A = T y polímero de DNA es helicoidal (trabajo previo de Linus
G = C => A + G = T + C (Purinas = Pirimidinas), el número Pauling en proteínas globulares: a-hélice en
de bases púricas es igual al número de bases hemoglobina)
pirimidinas.
• Doble periodicidad en torno al eje longitudinal: 0.34
1953: James Watson y Francis Crick nm (3.4 A) y 3.6 nm (36 A) Elevación de la hélice=
manchas intensas en la parte superior en inferior (0.34
Determinaron que, a través de los resultados de
nm, 3.4 A).
Rosalind Franklin y Maurice Wilkins, ellos realizaron los
experimentos que permitieron describir la molécula de • Molécula formada por una doble hebra
ADN. Que fue descrita por Watson y Crick.
El DNA almacena la información genética: James
Descripción de la molécula de ADN: Watson y Francis Crick (1953)

1. Dos hebras son complementarias (se habla de las Esquema que se realizo de
BN), si hay una púrica hay una pirimidina en el otro la estructura del ADN,
lado, en el fondo van anti paralelamente. realizado por W y C, que
2. Complementariedad se basa en interacciones permite describir y observar
especificas entre bases nitrogenadas de los dos surcos, un surco menor
nucleótidos que componen cada hebra. y un surco mayor que son
3. Postulan mecanismo básico para la replicación de importantes para la union de
esta doble hebra de ADN. las proteinas que se estan
uniendo al ADN, ya sea
En su postulado consideran: Estudios de estructura por
durante la cromatina,
difracción por rayos X de Maurice Wilkins y Rosalind
Franklin
compactacion del ADN o durante los procesos de
replicacion o transcripcion.

Los factores de transcripcion (u otras proteínas) se unen


en estos surcos para poder abrir la molecula y hacer la
transcripcion. Ahora, inicialemente W y C, vieron que la
complementariedad de BN hacia el interior de la helice
estaban en una forma perpendicular al eje, aunque hoy
en dia sabemos que existe un angulo entre ellos.

Modelo de Watson y Crick

• Dos cadenas helicoidales (dextrógiras) enrolladas en


torno a un mismo eje.

• Esqueleto hidrofílico (desoxirribosas y fosfatos) se


encuentran en el exterior de la hélice (contacto con
agua)

• Bases púricas y pirimidinas apiladas al interior de la


hélice unidas entre sí con enlaces hidrógenos (bases
Están son distintas formas de esquematización de la
planas perpendicular al eje).
doble hebra. La de la izq. corresponde a la estructura
• Relación espacial entre las dos cadenas da origen a un tipo B, es la forma a la cual el ADN se encuentra en su
surco mayor y a un surco menor forma más estable y como se encuentra en nuestra
células (en solución). Siempre se va a observar un surco
• Cada base se aparea con una base de la otra cadena y
mayor y uno menor.
se sitúan en el mismo plano, se sabe que eso no es así
hoy en día, pues hay un ángulo. Estructura Primaria, Secundaria y Terciaria de los
Ácidos Nucleicos (nomenclatura)
• Pares de bases unidos por puentes de hidrogeno.
1. La estructura primaria corresponde (composición de
• Cadenas antiparalelas (significa que una ira en sentido
nucleótidos: A-G-C-T) a su estructura covalente y a la
5’3’ y la otra 3’5’) unidas por enlace fosfodiéster 5’-3’.
secuencia del nucleósido monofosfato (frecuentemente
• 10 residuos por cada vuelta de la hélice (10.5) como la secuencia de bases que ellas contienen).
Importancia es que la información genética se almacena
en la estructura primaria del DNA. Depende del
contenido de nucleótidos, hay ciertos cambios
estructurales, hay zonas ricas en CG logran ser más
compactadas.

2. La estructura secundaria se refiere a la forma en que


los ácidos nucleicos asumen de acuerdo a su estructura
primaria: B-DNA, A-DNA, y Z-DNA son todas formas de
estructura secundaria que el ADN puede tener, lo que
va a depender del componente acuoso, la conformación
de las BN. B-DNA corresponde a la forma predominante
en el ambiente acuoso de la célula (contiene los surcos).
A y Z cambia según el tipo de nucleótidos. Mientras
haya agua alrededor, toda la cadena, estructura polares
estarán hacia fuera y apolares hacia dentro. Si cambio el
contenido acuoso, cambiará.
3. La estructura terciaria se refiere al plegamiento de estará en posición anti. Estas orientaciones definen la
gran escala en un polímero lineal, el cual es de mayor estructura secundaria.
orden respecto del observado en la estructura
Tanto en B-DNA y A-DNA, ambas bases púricas y
secundaria. La estructura terciaria es la forma
pirimidinas asumen la orientación anti. En cambio, en la
tridimensional del plegamiento de la cadena completa.
orientación Z-DNA las bases pirimidinas son anti, pero
las bases púricas son siempre syn. Como resultado de lo
anterior el esqueleto de fosfatos en la forma Z-DNA
describe un patrón en zigzag, dando origen al nombre Z-
DNA.

*Esto define lo que es A,B y Z.

El DNA puede adoptar diferentes estructuras

1. Forma B: La mayoría del DNA se encuentra en forma


B, el cual es una hélice que sigue la “regla de la mano
derecha”. Encontradas en las moléculas de DNA
acuosas. Posición Anti, en la tipo B tenemos bases
nitrogenadas hacia el interior y centro, originando
enlaces H.

Las dos 2. Forma A: También es una hélice que sigue la “regla


orientaciones más estables de las bases respecto de sus de la mano derecha” pero que se encuentra
anillos de desoxirribosa se denominan syn y anti. predominantemente en RNA de doble-hebra y en
híbridos DNA RNA. Tb se encuentran hacia el interior,
En la orientación syn, la base se sitúa sobre el anillo de pero + hacia la superficie. Esta estructuración se
azúcar. Es fácil verla en púricas, porque tienen dos observa cuando hay poco contenido acuoso.
anillos. En la orientación anti la base gira hacia el
exterior del anillo del azúcar. En las piridinas, si el O del Esta estructuración se observa principalmente cuando
anillo se encuentra sobre el de la ribosa, es orientación hay menos agua, y es por eso cuando hay menos agua
syn, y si el O esta hacia el lado contrario (imagen der.) ya no solo hay contenido estructura más polares, hacia
fuera, las apolares tb tenderían a asomarse hacia fuera, Se pueden ver las diferencias, la tipo A es más
porque ya el contenido acuoso es mucho menor. Por homogénea, los surcos no se distinguen, la tipo B la cual
ello es que cambia la estructura tipo A, pese a que sigue se encuentra en nuestras células, se observa un surco
siendo una doble hebra similar a la B, son embargo las mayor y uno menor, y tenemos la tipo Z que es zigzag.
bases nitrogenadas se van un poco más a la superficie.
Fuerzas que estabilizan la doble hélice
En ese caso ambos surcos, mayor y menor se vuelven
del mismo tamaño, se asemejan entre sí, a diferencia de  Puentes de hidrogeno entre las BN
lo que se observa en la forma B.  Interacciones hidrofóbicas entre regiones apolares,
que serían las bases nitrogenadas
3. Forma Z: El Z-DNA es
una hélice que sigue la  Interacciones electroestáticas del fosfato con el
“regla de la mano medio acuoso, la parte apolar se encuentra hacia
izquierda” y se afuera, hacia el medio acuoso.
encuentra en Espectros de absorción de los nucleótidos más
polinucleótidos que comunes y sus coeficientes de absorción molar a 260
alternan purinas y nm y pH 7,0
pirimidinas en cada
hebra, tal como se
muestra a continuación:

5'CGCGCG3'
3'GCGCGC5‘

Las pirimidinas forma


anti y la púricas forma
syn y eso forma una
estructura tipo zigzag, y Relación con las características fisicoquímicas de las
normalmente este tipo molec de ADN, estas caract son dadas por las
de estructuración se estructuras del ADN nos permite a nosotros poder
encuentra cuando hay medir el contenido de ADN, cuantificarlo en una
un alto contenido de citocinas y guaninas, porque entre solución. Estas características están dadas porque las
ellas los enlaces hidrógenos son más, por lo tanto son BN tienen la capacidad de absorber luz en el rango UV, y
mucho más compactas, de hecho estas regiones son c/u tiene una absorbancia diferente y esta diferencia
difíciles de separar, se generan estructuras más nos permite cuantificar el contenido de ac nucleicos,
complejas. cuanto de ADN hay en una solución.

Características generales de las distintas formas

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