TEMA 6: ÁCIDOS NUCLEICOS

1. Composición de los ácidos nucleicos

2. Ácido desoxirribonucleico (ADN)
2.1 Estructura del ADN
. Estructura primaria
. Estructura secundaria
. Estructura terciaria
2.2. Empaquetamiento de las fibras de ADN
2.3 El ADN en las células procariotas y eucariotas
2.4 Desnaturalización del ADN
3. Ácido ribonucleico (ARN)
3.1 Tipos de ARN
. ARN mensajero
. ARN ribosómico
. ARN transferente
. ARN nucleolar
4. Nucleótidos no nucleicos.

1. COMPOSICIÓN DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS

Los ácidos nucleicos (ADN y ARN) son macromoléculas formadas por la unión de muchos
monómeros denominados nucleótidos. Éstos son moléculas compuestas por la unión de 3 unidades:
una molécula de ácido fosfórico, un monosacárido (una pentosa) y una base nitrogenada.

- Una molécula de ácido fosfórico (H3PO4):

- Un monosacárido de 5 átomos de C
(aldopentosa), que puede ser ribosa o
desoxirribosa, cicladas en forma de
β-D-ribofuranosa y β-D-2-desoxirribofuranosa.

- Una base nitrogenada (estructura cíclica que

contiene C y N). Existen dos tipos de bases
nitrogenadas:

● Púricas: Derivan de la purina (dos anillos). Son dos: adenina (A) y guanina (G).
● Pirimidínicas: Derivan de la pirimidina (un anillo). Son citosina (C), timina (T) y uracilo
(U).

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 La unión entre la pentosa y una base nitrogenada da lugar a un nucleósido. El enlace que
une ambas moléculas se llama N-glucosídico y se produce entre el C-1' de la pentosa y un N de la
base (el N-1 si es pirimidínica o el N-9 si es púrica) con la pérdida de una molécula de agua.

Los nucleósidos se nombran añadiendo al nombre de la base:

- la terminación -osina si es una base púrica (adenosina y guanosina),
- la terminación -idina si se trata de una base pirimidínica (citidina, uridina, timidina).
Si la pentosa es la desoxirribosa, se coloca delante el prefijo desoxi- (ej. desoxiadenosina).

Si a un nucleósido se le une una molécula de ácido fosfórico, se forma un nucleótido. La

unión se realiza mediante un enlace fosfoéster entre el -OH del C-5' de la pentosa y el ácido
fosfórico, perdiéndose una molécula de agua.

Los nucleótidos se nombran como el nucleósido del que proceden eliminando la "a" final (en
algunas fuentes no se elimina) y añadiendo a continuación el lugar de unión de la pentosa con el ión
fosfato (5') y el número de fosfatos unidos. Por ejemplo, desoxiadenosin-5'-monofosfato (dAMP).

En nucleósidos y nucleótidos los carbonos de las pentosas se numeran como 1’, 2’, 3’, 4’ y 5’, para diferenciarlos de
los carbonos de las bases.

Los grupos -OH unidos a los átomos de P aparecen como -O- en disolución. Esto es debido a
que a pH fisiológico esos grupos se encuentran ionizados (en forma de ión fosfato PO3-4).

La unión de 2 nucleótidos forma un dinucleótido. Dicha unión se realiza mediante enlace

fosfodiéster entre el grupo fosfato situado en posición 5' de un nucleótido y el grupo hidroxilo que se
encuentra en el C-3' de otro nucleótido. En la formación de este enlace se libera una molécula de
agua.

El dinucleótido se puede unir a más nucleótidos y formar trinucleótidos, tetranucleótidos, etc.

La unión de cientos o miles de nucleótidos constituye un polinucleótido, también llamado ácido
nucleico.

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 En todos los polinucleótidos existe un extremo (llamado extremo 5'), donde se localiza un
grupo fosfato libre unido al C-5' de una pentosa, y otro extremo (denominado extremo 3') con una
pentosa con el grupo -OH del C-3' libre. Es decir, ambos extremos son distintos.

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2. ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLEICO (ADN)

El ADN es un polímero de desoxirribonucleótidos (contienen desoxirribosa). En cuanto a las

bases nitrogenadas pueden aparecer adenina, guanina, citosina y timina, pero nunca uracilo.

2.1 ESTRUCTURA DEL ADN.

En el medio acuoso celular, el ADN adopta (igual

que las proteínas) una estructura tridimensional en la que
se pueden describir varios niveles de complejidad
creciente, son las estructuras primaria, secundaria y
terciaria.

- Estructura primaria.

Es la secuencia de nucleótidos unidos por enlaces

fosfodiéster. Una cadena de ADN presenta dos extremos
libres: el 5', unido al grupo fosfato, y el 3', unido al
hidroxilo.

Como todos los nucleótidos contienen fosfato y

desoxirribosa, la diferencia entre las moléculas de ADN de
los distintos organismos radica únicamente en el orden de
las bases nitrogenadas que cuelgan de las pentosas.

Cuando se representa una cadena de ADN

normalmente sólo se indica la secuencia de
desoxirribonucleótidos de manera abreviada. Así un
polinucleótido como el representado en la figura se abrevia
como 5' AGTC 3'.

- Estructura secundaria: el modelo de Watson y Crick.

La estructura espacial del ADN fue establecida en 1953 por Watson y Crick, basándose en
dos descubrimientos previos:

. En 1950, Chargaff, tras estudiar gran cantidad de muestras de ADN, pertenecientes a

diversas especies de organismos, observó que el número de adeninas siempre es igual al de
timinas, y el de guaninas al de citosinas.

%A = %T %C = %G

. Por otra parte, en esta misma época, Rosalind Franklin aplicó el método de difracción de
rayos X al ADN y dedujo que esta molécula posee una estructura helicoidal y que en ella
existen detalles estructurales repetidos cada 0,34 nm y cada 3,4 nm.

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 A partir de estos datos, Watson y Crick propusieron un modelo de doble hélice del ADN que
aún sigue vigente. Este modelo presenta las siguientes características:

● El ADN está constituido por dos cadenas de polinucleótidos unidas entre sí.
● Las dos cadenas son antiparalelas, es decir, que el extremo 3' de una de ellas se enfrenta
con el extremo 5' de la otra.
● La unión entre las cadenas se realiza por medio de puentes de H entre las bases
nitrogenadas, concretamente, la adenina forma 2 de estos puentes con la timina y la
guanina 3 con la citosina. Se dice que las dos cadenas son complementarias.

● Las dos cadenas están enrolladas en espiral formando una doble hélice alrededor de un eje
imaginario.
● Las bases nitrogenadas quedan en el interior de la doble hélice, mientras que los esqueletos
pentosa-fosfato se sitúan en la parte externa. Los planos de las bases nitrogenadas
enfrentadas son paralelos entre sí y perpendiculares al eje de la hélice.
● El enrollamiento de las dos cadenas es dextrógiro (hacia la derecha) y plectonémico (las
cadenas no se pueden separar sin desenrollarlas).
● El diámetro de la doble hélice es de 2 nm, la longitud de cada vuelta es de 3,4 nm y cada
0,34 nm se encuentra un par de bases complementarias. Por lo tanto existen 10 pares de
nucleótidos por cada vuelta.

La configuración espacial descrita por Watson y Crick se denomina forma B y durante mucho
tiempo fue considerada como la única. En la actualidad se conocen otros dos tipos de estructura en
doble hélice:
o La forma A, también dextrógira pero con los pares de bases inclinados respecto al eje de la
hélice. Esta forma se obtiene por desecación de la forma B y nunca se encuentra en
condiciones fisiológicas, sólo se ha observado en laboratorio. Es más ancha y corta que la B.
o La forma Z es más larga y estrecha que la B, aquí la doble hélice es levógira y presenta
irregularidades en forma de de zig-zag. Aunque in vivo predomina el B-ADN, se ha podido
observar la presencia de algunas regiones Z en el genoma de células eucariotas. Su función,
aún por confirmar, parece estar relacionada con los mecanismos de regulación de la
expresión de los genes.
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- Estructura terciaria.

El ADN no se encuentra en las células en la forma extendida correspondiente a su estructura

secundaria, sino plegado y enrollado sobre sí mismo, es decir, superenrollado, dando lugar a un
tercer nivel estructural, que se detalla en el siguiente apartado de empaquetamiento de las fibras de
ADN. El superenrollamiento (enrollar algo que ya está enrollado) del ADN es necesario, entre otras
razones, porque las largas cadenas de ADN deben alojarse en el interior de la célula (procariotas) o
del núcleo (eucariotas), de dimensiones muy inferiores a la longitud del ADN. Por ejemplo:

2.2. EL EMPAQUETAMIENTO DE LAS FIBRAS DE ADN.

Como se muestra en la tabla anterior, las moléculas de ADN son muy largas con respecto a
las células que las contienen, por lo que deben reducir su longitud enrollándose. Dato: 1Å = 0,1 nm

Este enrollamiento tiene lugar en varias fases:

a. FIBRA DE CROMATINA DE
100 Å

Constituida por una cadena

de nucleosomas (formados
por la unión de 8 moléculas
distintas de histonas) de 100
Å de diámetro sobre la que
se enrolla un fragmento de
ADN de 200 pb (pares de
bases). Esta forma es la
llamada EUCROMATINA, y
es como se encuentra
durante la interfase celular
(entre una mitosis y la
siguiente).

b. FIBRA DE CROMATINA DE 300 Å

También llamada SOLENOIDE, se forma cuando las histonas

H1 de la fibra de cromatina de 100 Å se unen entre sí para
formar un eje de rotación mayor, formando una estructura de
300 Å.

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c. DOMINIOS EN BUCLE

La cromatina de 300 Å se
enrolla formando bucles
sobre un eje central
proteico (andamio proteico)
formando los dominios en
bucles, de unos 3000 Å de
diámetro.

Mediante una serie de

plegamientos sucesivos, se
formarían los cromosomas,
de unos 14000 Å, los
cuales reducen su longitud
con respecto a la cadena
de ADN de la que están
formados hasta 10.000
veces.

2.3 EL ADN EN LAS CÉLULAS PROCARIOTAS Y EUCARIOTAS.

- Los organismos procariotas son células (bacterias) de tamaño pequeño (0,2 a 5 μm de

diámetro), con membrana plasmática y generalmente con cápsula y pared celular rígidas, pero
carecen de membrana nuclear, de orgánulos y de cualquier otro tipo de compartimentación interna.

En procariotas existe una molécula de ADN circular bicatenario, es decir, con sus extremos
cerrados, que recibe el nombre de cromosoma bacteriano, localizado en el citoplasma, en la llamada
zona nuclear o nucleoide, sin membrana que la delimite. Es frecuente encontrar, además, otras
moléculas circulares más pequeñas llamadas plásmidos.

- Las células eucariotas son más variadas y complejas. Son de mayor tamaño (10- 50 μm),
poseen membrana plasmática, pueden tener pared celular (plantas), tienen citoesqueleto interno, y
muestran una gran compartimentación citoplasmática, con diferentes tipos de orgánulos y estructuras
membranosas (mitocondrias, cloroplastos, lisosomas, RER, REL, complejo de Golgi, etc.).

El núcleo tiene como característica esencial la presencia de una doble membrana nuclear. En
el interior del núcleo, el ADN se presenta como largas moléculas lineales de doble hebra (ADN lineal
bicatenario), estrechamente asociadas a proteínas, llamadas histonas. Cada molécula de ADN, con
sus proteínas asociadas, forma una fibra visible al microscopio electrónico. El conjunto de todas
estas fibras constituye la cromatina (en interfase). Cuando la célula se va a dividir, cada fibra de
cromatina se compacta y forma los cromosomas.

Aunque la mayor parte del ADN (más del 90%) de las células eucariotas está en el núcleo,
en las mitocondrias y cloroplastos también hay ADN, que codifica algunas de las proteínas de estos
orgánulos. Este ADN está organizado en cromosomas circulares, al igual que el de procariotas,
aunque de menor longitud.

- En los virus, el ADN puede adoptar múltiples formas. Pueden tener ADN monocatenario o
bicatenario, según esté compuesta de una sola hebra de ADN o de dos. Ambos pueden presentarse
de forma lineal o circular. Además, los virus pueden tener ARN en lugar de ADN, pero nunca los dos.

2.4 DESNATURALIZACIÓN DEL ADN.

Cuando el ADN se somete a temperaturas elevadas o a cambios de pH, las dos cadenas de
polinucleótidos se separan al romperse los puentes de hidrógeno entre las bases nitrogenadas. Este
proceso, denominado desnaturalización, es reversible siempre que el tratamiento aplicado no haya
sido muy drástico. El proceso por el que se recupera la doble hélice, se denomina renaturalización.
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3. ÁCIDO RIBONUCLEICO (ARN)

El ARN está formado por la unión de ribonucleótidos (contienen ribosa) de adenina, guanina,
citosina y uracilo (no hay timina), mediante enlaces fosfodiéster en sentido 5'→ 3', como el ADN. En
algunos tipos de ARN, como el ARN transferente, además de las 4 bases (A,C,G,U) pueden aparecer
otras derivadas de éstas (dihidrouracilo, metilguanina, etc), aunque siempre minoritarias (un 10%).

La cadena de ARN es más corta que las de ADN y puede localizarse tanto en el núcleo como
en el citoplasma celular. Excepto en los reovirus, donde se incluyen los rotavirus (provocan
gastroenteritis), el ARN está constituido por una única cadena, aunque en el ARN transferente hay
tramos bicatenarios por apareamiento de bases.

La función del ARN es extraer la información del ADN y dirigir la síntesis de proteínas a partir
de esta información.

3.1 TIPOS DE ARN.

- ARN mensajero (ARNm). Constituye entre el 3 y el 5% del total de

ARN celular. Es una larga cadena de ribonucleótidos con una
estructura lineal. Su función es copiar la información genética del
ADN (proceso llamado transcripción) por la acción de la
ARN-polimerasa y transportarla desde el núcleo hasta los ribosomas,
para que se sinteticen las proteínas.

El ARNm tiene una vida muy corta, de algunos minutos, ya

que rápidamente es destruido por la acción de unas enzimas
llamadas ribonucleasas, pues de lo contrario el proceso de síntesis
proteica continuaría indefinidamente.

- ARN ribosómico (ARNr). Es el tipo más abundante, ya que constituye entre el

80 y el 85% del ARN celular total. Las moléculas de ARNr son largas y
monocatenarias, aunque en algunas regiones puede presentar una estructura de
doble cadena por apareamiento entre bases nitrogenadas complementarias.

Varias moléculas de este ARN, asociadas a un conjunto de proteínas

básicas, forman las dos subunidades de los ribosomas, orgánulos que sintetizan
las proteínas. En procariotas son de 70S y en eucariotas de 80 S (S=Svedberg).

- ARN transferente (ARNt).

El ARNt constituye,
aproximadamente, un 10% del
ARN celular total y está formado
por pocos nucleótidos (entre 70 y
90). Se encuentra de forma
dispersa en el citoplasma. Su
función es transportar los
aminoácidos presentes en el
citoplasma celular hasta los
ribosomas, para que allí se unan
y formen las proteínas (proceso
llamado traducción).
Hay un ARNt específico para
cada aminoácido. Las diferencias
entre los distintos ARNt se deben
fundamentalmente, a una
secuencia de 3 bases
nitrogenadas denominada
anticodón.
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 Las moléculas de ARNt tienen una estructura secundaria muy característica, en la que
existen tramos de doble hélice (denominados brazos). En los extremos de tres de los brazos hay
zonas sin emparejar que forman los denominados bucles.

En el extremo 5' siempre hay guanina y un ácido fosfórico libre. El extremo 3' está formado
por la secuencia de bases CCA. Al nucleótido terminal de adenina se une el aminoácido que va a ser
transportado.

La estructura extendida del ARNt tiene forma de hoja de trébol, aunque en la realidad los
brazos se disponen plegados, formando una L invertida, que recibe el nombre de "estructura en
boomerang".

- ARN nucleolar (ARNn). Se encuentra asociado a diferentes proteínas formando parte del nucleolo
de las células eucariotas. Tiene un elevado peso molecular y su función es dividirse en fragmentos
más pequeños para fabricar ARN r y formar así las dos subunidades de los ribosomas.

4. NUCLEÓTIDOS NO NUCLEICOS

Además de los nucleótidos que constituyen los ácidos nucleicos existen otros que se
encuentran libres en las células, se denominan nucleótidos no nucleicos, y llevan a cabo funciones
básicas para los seres vivos. Podemos destacar: los nucleótidos de adenina y los nucleótidos que
actúan como coenzimas.

4.1 NUCLEÓTIDOS DE ADENINA.

- ADP y ATP.

El ADP (adenosín difosfato) y el ATP (adenosín trifosfato) son las moléculas transportadoras
de energía más importantes.

En las células hay muchas reacciones que producen energía (exotérmicas). Si esta energía
se desprendiera libremente lo haría en forma de calor y apenas tendría utilidad para el organismo.
Resulta más eficaz disponer de un sistema capaz de acumular la energía liberada en las reacciones
del metabolismo, de manera que pueda ser utilizada posteriormente.

Cuando se libera energía en una reacción,

se utiliza para formar ATP a partir de ADP y ácido
fosfórico. El enlace así constituido es altamente
energético, es decir, que para su formación se
requiere una cantidad considerable de energía (7
kcal/mol). Lógicamente la rotura de este enlace
liberará la misma cantidad de energía. Por hidrólisis
del ATP se forma ADP y ácido fosfórico y se libera
la energía de ese enlace.

Es habitual representar los enlaces ricos en energía, que

existen entre los grupos fosfatos con el símbolo ( ~ ), en lugar
de la notación usual ( − ) de los enlaces.

Además del ATP y el ADP, también intervienen en algunas

reacciones metabólicas los nucleótidos de guanina GTP y GDP
para almacenar y liberar energía.

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 - AMP cíclico (AMPc).

El adenosín monofosfato cíclico es un nucleótido de adenina,

ribosa y un fosfato que se une a los carbonos 3' y 5' de la ribosa,
formando una estructura cíclica.

El AMPc se forma en las células a partir del ATP intracelular,

mediante una reacción catalizada por la adenilato ciclasa que se localiza
en la membrana celular. Esta enzima se activa cuando determinadas
hormonas se unen a la membrana plasmática a receptores
específicos.

adenilato ciclasa
ATP -------------------------> AMPc + P-P

El AMPc actúa como "segundo mensajero", ya que

transmite en el interior de la célula las señales que le llegan a
través de la sangre mediante las hormonas, que son los
"primeros mensajeros".

7.2 NUCLEÓTIDOS CON FUNCIÓN COENZIMÁTICA.

Las coenzimas son moléculas orgánicas no proteicas que intervienen en las reacciones
catalizadas enzimáticamente actuando, generalmente, como transportadores de electrones. Muchos
de ellos son nucleótidos.

- Piridín-nucleótidos (NAD+/NADH,
NADP+/NADPH)

Son dinucleótidos formados por la

unión mediante enlace fosfodiéster de un
nucleótido de nicotinamida y otro de
adenina.

La nicotinamida, también llamada

vitamina B3 o niacina, es una base
nitrogenada derivada de la piridina.

Existen dos piridín-nucleótidos:

- NAD+: nicotinamín adenín dinucleótido. Al

captar electrones se transforma en NADH.

- NADP+: nicotinamín adenín dinucleótido

fosfato. Su fórmula es igual a la del NAD,
pero lleva un grupo fosfato en el nucleótido
de adenina. Al captar electrones se
transforma en NADPH.

Ambas son coenzimas de las

deshidrogenasas, enzimas que catalizan las
reacciones de oxidación-reducción. En estas
deshidrogenaciones toman H+ y electrones
de algunas moléculas que se oxidan,
quedando estas coenzimas en estado
reducido: NADH o NADPH.

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- Flavín-nucleótidos.

Están formados por una base nitrogenada, la flavina, y como pentosa, un derivado de la
ribosa, el ribitol, que no se cicla. Al unirse ambos para formar el nucleósido, constituyen un
compuesto denominado riboflavina o vitamina B2.

Los nucleótidos de flavina son

dos:
- FMN: flavín-mononucleótido. La
riboflavina está unida a un grupo
fosfato. Su forma reducida es
FMNH2.
- FAD: flavín-adenín-dinucleótido,
formado por una molécula de
FMN unida mediante enlace
fosfodiéster a otro nucleótido de
AMP (adenosín monofosfato). Su
forma reducida es FADH2.

Ambos son también coenzimas de

deshidrogenasas. En su forma
oxidada (FMN y FAD) captan
electrones y protones durante la
oxidación de un sustrato para
transformarse en su forma reducida
(FMNH2 y FADH2).

- Coenzima A.

La coenzima A está formada por ADP,

ácido pantoténico o vitamina B5, y una cadena
corta de etilamina unida a un grupo tiol (-SH). Se
designa abreviadamente con el término CoA, o
bien con el de CoA-SH. Gracias a este grupo (-SH)
puede unirse a los grupos acilo (R-CO-), radicales
de ácidos orgánicos, y transportarlos por la célula.
Es un cofactor de enzimas que intervienen
en la oxidación de ácidos grasos, carbohidratos y
aminoácidos y muchas otras reacciones de
biosíntesis.

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