Marcadoresmoleculares

Marcadores moleculares
John Fredy Osorio Lopez

Estudiante: Maestria en
Biologia Vegetal.
2016
Qué es un marcador?
Un marcador es considerado como un
carácter cuyo patrón de herencia puede
definirse en un nivel morfológico
(fenotípico), bioquímico o molecular.
Se asocian marcadores con caracteres,
para esclarecer la probabilidad de relación
entre un locus genéticos y un carácter
determinado
Desde el punto de vista de un análisis
de relación genética los marcadores
moleculares son:
 Puntos específicos fijados a un

cromosoma.
 La herencia es completamente
Mendeliana
GENÉTICA
Primera ley de Mendel?
En un diploide los dos Alelos de un gen

segregan en los gametos con igual
frecuencia
individuo: Aa  gametos: A 50%, a

50%
Primera ley de Mendel y frecuencias
F2?
F1  F1: Aa  Aa
Como se interpreta esto con marcadores moleculares:
AA Aa aa AA Aa aa
Dominante Co-dominante
TIPOS DE MARCADORES GENÉTICOS
1.Marcadores morfológicos: Efecto

combinado de muchos genes y el ambiente).
•Caracteresmorfológicos son los más antiguos

y ampliamente usados.
•Son profundamente afectados por

fluctuaciones ambientales y por las etapas de
desarrollo de la planta, así como por el vasto
número de individuos a analizar.
Marcador morfológico
Visualización de los
Fragmentos Amplificados
1 2 M 1 2 M
Polimorfismo
Cualquier señal o traza molecular que nos permite estudiar un caracter
(Fenotipo) o gen (Genotipo) asociado a este, y de herencia mendeliana
(Marcador Genético) y detectada como secuencias de ADN o proteínas
Detección de variabilidad a nivel de secuencias de ADN.
Fuentes de origen de MM
1. ADN cromosómico (genómico)
ADN codificante
ADN no codificante
ADN altamente repetido
2. ADN extracromosómico
ADN mitocondrial
ADN de cloroplastos
AFLP RAPD SSR
Procedimientos Generales en el uso de MM:
1. Extracción de DNA
2. Generación de polimorfismo
Enzimas de restricción
Reacción PCR
Combinación de los 2 anteriores (enzimas de
restricción y PCR)
3. Electroforesis (horizontal, y/o vertical)
4. Detección de los fragmentos
Sondas marcadas
Bromuro de etidio, UV
Quimioluminiscencia
tincion en plata
5. Autoradiografía y/o fotografia
6. Evaluación de los fragmentos
7. Análisis estadístico
Sistema de marcadores DNA
probe
*******
Basados DNA
Basados en
en hibridación
hibridación
RFLP,
RFLP,VNTR,
VNTR,
oligonucleotide
oligonucleotidefingerprinting
fingerprinting
Basados
Basados en
en amplificación
amplificación DNA
RAPD,
RAPD,DAF,
DAF,AFLP,
AFLP,SSR,
SSR,
MP-PCR,
MP-PCR,ISSR,
ISSR,IRAP,
IRAP,REMAP,
REMAP,
STS,
STS,SCAR,
SCAR,CAPS
CAPS
ATTAGTCTTACCTAGGAATCGATT
Basados
Basados en
en secuenciamiento
secuenciamiento TAATCAGAATGGATCCTTAGCTAA
EST,
EST, SNP,
SNP,
DNA
DNA microarray
microarray
Gupta et al., 1999

Tipo de polimorfismo
Alta resolucion:
Al nivel de par de bases
Baja resolucion:
Al nivel de fragmentos
de restriccion o
fragmentos amplificados
RFLP
RAPD
AFLP
SCAR
CAPS
SSR
i-SSR
RAPD
Random Amplified
Polymorphic DNA
Amplificación de ADN anónimo con

cebadores de secuencia arbitraria
RAPD: iniciaodores unicos , cortos y aleaoritos
Temperatura de Hibridizacion: 36-42C

Consiste en la amplificación mediante PCR de un ADN anónimo,
utilizando para ello un cebador de secuencia arbitraria
Normalmente se usa un solo iniciador de 10 nucleótidos de longitud
RAPD:AMPLIFICA MULTIPLES REGIONES (MULTILOCI)
Correspondencia entre fragmentos
amplificados y bandas en un gel
_
+
Los RAPDs son marcadores dominantes
A A 1 2 3
1
A a
2 AA Aa aa
a a
3
Ventajas
 Requiere baja cantidad de DNA
 Facil de obtener
 Aplicabilidad a cualquier genoma
 Bajo costo
Desventajas
 Problemas de reproducibilidad
 Presencia de homoplasia en las bandas
 Nivel de información limitada debido a su
naturaleza dominante (no se puede diferenciar un
heterocigoto de un homocigoto, el locus se reduce
a un solo alelo)
RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)
 Reaccion PCR
 Primersdeben encontrar
secuencias
complementarias entre
200 – 2500 pb
 Tincion(bromuro de
etidium)
RAPD
Reaccion PCR
Electroforesis
Tinción y visualización de los fragmentos de
amplificación
Polimorfismo con la
técnica RAPD
Fases sucesivas en la creación de una
nueva variedad
1. Gestion de recursos
2. Cambios en los genotipos
3. Selección (selección estabilizadora),
4. Multiplicación del genotipo mejorado
Mejoramiento genetico de plantas
Idiotipo
Biologia
Tecnologia
Métodos de
Tiempo mejoramiento
Materiales Objetivos
Presupuesto Contexto:
Agronomico
Industrial
Ganancia
Alimenticio
genética
Poblaciones naturales, social
variedades nativas, …
Fases sucesivas en la creación de una
nueva variedad
1. Gestion de recursos genéticos
2. Cambios en los genotipos
3. Selección (selección estabilizadora),
4. Multiplicación del genotipo mejorado
Selección asistida por marcadores moleculares
– Molecular assisted selection (MAS)
Es la selección indirecta por la presencia o
ausencia de un fenotipo o componente fenotípico
deseado, basado en la secuencia o patrones de
banda de los marcadores moleculares ubicadas
dentro o cerca de genes que controlan el fenotipo.
La secuencia polimorfico o patron de banda del
marcador molecular es indicativo de la presencia o
ausencia de un gen específico o segmento
cromosomal que es conocido y que lleva un alelo
deseado.
Ubicacion taxonomica:
Family:Palmaceae
Sub-family: Coryphyoideae
Tribe:Phoeniceae
Genus: Phoenix
El genero Phoenix, presenta ~ 12 especies, incluida
CONVERTIR LOS MARCADORES AFLP A SCAR
Secuenciar el fragmento y elaborar iniciadores especificos
SCAR
“Sequence-characterized amplified regions”
Aplicaciones
Búsqueda de co-dominancia
• Selección asistida
• Análisis de asociación
MM como herramienta en Mejoramiento
Confiabilidad y repetibilidad
Marcadores con estrecho ligamiento a genes de
caracteristicas importantes
Muy importante para caracteristicas dificiles (aquellas
que no pueden ser facil o confiablemente medidos
usando metodologias tradicionales (e.g. resistencia a
nematodes…)
Otros pueden no ser visibles o solo detectados en
plantas maduras
Otros son muy dificiles o costosas para el tamizado
La posibilidad de manejar poblaciones de mejoramiento
de gran tamaño (en espacio reducido)
Limitaciones de la Tecnica MAS
Mapa genetico denso para el cultivo
Marcador ligado al gen (<5 cM)
Equipamiento
Tecnicos calificados para lab.

Producción de semillas y uso de marcadores
moleculares
Caracterización de cultivares
Pureza genética de cultivares
Conclusion:
Marcadores moleculares pueden tener numerosas aplicaciones
en los diferentes fases de la seleccion:
Optimizacion de la conservacion de recursos geneticos
Seleccion de los parentales
Identificacion de alelos interesantes
Construccion de genotipos acumulando alelos interesantes
Finalmente, los MM dispone al mejorador para gestionar y
valorizar la variabilidad genética
Consideración
La selección asistida por marcadores y la

selección fenotípica tradicional no son estrategias
excluyentes y los programas de mejoramiento
genético de mayor eficiencia se logran mediante
una combinación de ambas estrategias.
GRACIAS

Marcadoresmoleculares

Cargado por

Copyright:

Formatos disponibles

Marcadoresmoleculares

Cargado por

Información del documento

Descripción original:

Título original

Derechos de autor

Formatos disponibles

Compartir este documento

Compartir o incrustar documentos

Opciones para compartir

¿Le pareció útil este documento?

¿Este contenido es inapropiado?

Copyright:

Formatos disponibles

Marcadoresmoleculares

Cargado por

Copyright:

Formatos disponibles

Marcadores moleculares

John Fredy Osorio Lopez

 Puntos específicos fijados a un

Primera ley de Mendel?

En un diploide los dos Alelos de un gen

individuo: Aa  gametos: A 50%, a

1.Marcadores morfológicos: Efecto

•Caracteresmorfológicos son los más antiguos

•Son profundamente afectados por

Gupta et al., 1999

Amplificación de ADN anónimo con

Temperatura de Hibridizacion: 36-42C

Tecnicos calificados para lab.

La selección asistida por marcadores y la

También podría gustarte