Chap 4 Enzymes

La cellule , unité structurale du vivant
La cellule, unité fonctionnelle du vivant

Réseau de voies métaboliques dans une cellule: chaque molécule est représentée
par un point, chaque réaction par un trait. Chaque réaction implique un ou plusieurs
enzymes
Enzyme= protéine issue de l’expression d’un gène
Dans notre organisme, toutes les cellules ont le même patrimoine génétique.
Pourtant, ils existent une grande diversité de cellules qui ont des fonctions propres
Transmission, variation et expression
du patrimoine génétique
Chap 4.Les enzymes: des biomolécules aux propriétés

catalytiques
Problème :Comment les enzymes participent à la vie cellulaire et à la

spécialisation des cellules ?
I- Les enzymes,des biocatalyseurs de réactions chimiques
A-Notion de catalyseur
Pour qu’une réaction chimique ait lieu les molécules réactives doivent se
rencontrer et certains de leurs atomes vont interagir. Pour cela elles doivent
acquérir une certaine quantité d’énergie dite énergie d’activation
Or à température ambiante très peu de molécules ont l’énergie suffisante pour
que la réaction se produise spontanément. Elle ne peut se produire en un temps
raisonnable qu’en présence d’un catalyseur.
Les trois propriétés d’un catalyseur sont :
•augmenter la vitesse de réaction sans en modifier le sens, ni le résultat
•agir à faible concentration
•se retrouver intact à la fin de la réaction
Sans catalyseur
Réaction possible
S (substrat) P (produit) Vitesse faible
Avec catalyseur
Sens de la réaction et résultat
S + C (catalyseur) P+ C (catalyseur) identique
Vitesse élevée
Sans catalyseur
Avec catalyseur
Sans catalyseur
Avec catalyseur
B- Des catalyseurs agissent dans les conditions du vivant
Contrairement aux catalyseurs chimiques (ex : HCl), les enzymes (ex :

l’amylase) sont des catalyseurs qui ne fonctionnent que dans des gammes de
température (et de pH) restreintes.
La température optimale de fonctionnement est celle de l’organisme ou du
milieu dans lequel il vit (ex : 37°C).
Les enzymes agissent donc dans les conditions du vivant : ce sont des
biocatalyseurs
0°C
100°C
II- Un fonctionnemnt des enzymes lié à leur structure tridimensionnelle
A- Des caractéristiques cinétiques particulières
1-Une activité enzymatique étudiée par la vitesse initiale
L’étude de l’activité enzymatique
se fait à partir de la vitesse initiale
c'est-à-dire la vitesse au début de
la réaction. La mesure de la vitesse
initiale peut se faire en
déterminant soit la vitesse initiale
de disparition du substrat, soit la
vitesse initiale d’apparition du
produit.
Dans tous les cas la vitesse initiale

correspond à la valeur absolue de
la pente du vecteur tangent à la
courbe à l’origine
HACHETTE spé 1ère 2019
Vi= f(S)
L’étude de la variation de la vitesse initiale de réaction en fonction de

la concentration initiale de substrat et à concentration d’enzyme
constante montre un phénomène de saturation : alors que la
concentration en substrat augmente, la vitesse initiale n’augmente
plus. Cette vitesse initiale atteinte est appelée vitesse initiale
maximale( VMAX)
hydrolyse
Pas d’
hydrolyse
B- Une double spécificité
L’hydrolyse de l’amidon est catalysée spécifiquement par l’amylase

L’amidon est le substrat spécifique de l’amylase
L’hydrolyse
Les enzymesdunesaccharose
sont capablesest de
catalysée spécifiquement
catalyser par laque
la transformation saccharase
d’un seul
Le saccharose
type est illeysubstrat
de substrat : spécifiquede
a donc spécificité desubstrat
la saccharase
Classification des enzymes ( en fonction du type de réaction catalysée)
Nathan spé 1ère 2019
L’amylase et la saccharase catalysent des réactions d’hydrolyse.

Ce sont des enzymes du catabolisme
Modèle moléculaire : ADN et ADN polymérase

L’ADN polymérase catalyse la synthèse de l’ADN
C’est un complexe enzymatique de l’anabolisme
Les enzymes contrairement aux catalyseurs chimiques ne catalysent qu’une

sorte de réaction chimique.
On parle de spécificité de réaction
Belin spé 1ère 2019
La double spécificité des enzymes et leur diversité

sont fondamentales pour la réalisation du
métabolisme cellulaire
Comment expliquer la spécificité de substrat et d’action des enzymes ?
Hypothèse : Les enzymes étant des protéines, leur fonction et liée à leur structure (séquence
et structure tridimensionnelle)
C-Des propriétés de fonctionnement liées à la structure tridimensionnelle des enzymes
Les hypothèses historiques
1- Cinétique enzymatique et formation d’un complexe enzyme-substrat
Influence de la concentration en enzyme sur la vitesse initiale

Magnard spé 1ère 2019
La vitesse initiale est proportionnelle à la quantité d’enzyme car

l’augmentation du nombre de molécules d’enzyme augmente le nombre de
molécules de substrat liées à l’enzyme
Vi= f(S)
Les phénomènes
En revanche de proportionnalité
la vitesse et de
initiale atteint une saturation
Vmax s’interprètent donc
lors de l’augmentation de la par la
formation d’un
concentration en complexe
substrat carenzyme-substrat,
dans ce cas toutes interaction étroite
les molécules et temporaire
d’enzymes sont
entreliées
déjà l’enzyme
à une et son substrat
molécule de substrat
2- Notion de site actif
amylase
Amidon dans une

crevasse
Complexe amylase/amidon (logiciel Rastop)

Amidon et site actif de l’amylase
Le site actif est une cavité de forme tridimensionnelle complémentaire de celle
du substrat
Les acides aminés du site actif de l’amylase
Le site actif comprend deux catégories d’acides aminés :
Les acides aminés du site de fixation : grâce auxquels l’enzyme établit des liaisons
faibles avec un substrat spécifique permettant la formation transitoire du
complexe enzyme/substrat: ils sont responsables de la Spécificité de substrat
•Les acides aminés du site catalytique réagissent avec le substrat et le transforment

en produit : ils sont responsables de la spécificité de réaction.
Spécificité de
substrat
Spécificité de
réaction
Les acides aminés du site actif de l’amylase

La double structure du site actif de l’enzyme permet donc d’expliquer sa double
spécificité
Hachette spé 1ère 2019
3-Mutation et activité catalytique
Les mutations en provoquant des modifications de la
séquence de l’enzyme peuvent éventuellement entraîner
des modifications de la structure tridimensionnelle au
niveau du site actif et ainsi modifier ou empêcher l’activité
catalytique de l’enzyme
Amylase fonctionnelle ( Trp 58) Amylase mutée ( Ala 58)

III-Les enzymes, des marqueurs de la spécialisation cellulaire
A- Une expression des enzymes variable selon le type cellulaire
Cellule hépatique (à gauche) et cellule musculaire (à droite) observées au

microscope électronique à transmission en fausses couleurs. Manuel Nathan
1ère spécialité 2019
Dans notre organisme, toutes les cellules ont le même patrimoine génétique.
Pourtant, ils existent une grande diversité de cellules qui ont des fonctions propres.
Il existe
A travers différents
l’étude de cestypes cellulairesargumenter
documents, de structures
le et fonction
fait que lesdifférentes
enzymes soient
des marqueurs de la spécialisation cellulaire*.
Le phénotype est constitué par l'ensemble de ses caractéristiques qui peuvent être
morphologiques, physiologiques, cellulaires et moléculaires.
Comme les enzymes assurent presque toutes les fonctions cellulaires, elles contribuent à la
réalisation du phénotype aux différents niveaux d'organisation. Environ 4 000 enzymes
différentes fonctionnent simultanément dans une cellule donnée et représentent l'expression du
génotype de cette cellule. Les quelques 200 types cellulaires de l'organisme humain diffèrent
par leur répertoire enzymatique.
Bordas spé 1ère 2019
OnLes
peut ainsi
gènes établir pour
contenus chaque
dans le type
génome ne cellulaire
s’exprimentunpas
profil
tousenzymatique : ensemble
dans une cellule. des
Les cellules
enzymes dont la ne
d’un organisme cellule est équipée
possèdent donc pas toutes les mêmes protéines, le même équipement
enzymatique.
Certains enzymes (ADN polymérase) sont présents dans la plupart des cellules tandis que
d’autres (amylase) ne sont présents que dans certaines cellules.
Les enzymes étant spécifiques, seules les réactions catalysées par les
enzymes présents dans la cellule y sont possibles : il y a donc
spécialisation cellulaire
Les cellules musculaires et les cellules du foie possédant le glycogène
synthase peuvent stocker le glucose sous forme de glycogène ; mais seul
le foie peut libérer du glucose dans le sang car ils possèdent la glucose 6
phosphatase
Les enzymes sont donc des marqueurs de la spécialisation cellulaire. Les

propriétés à l’échelle moléculaire ont donc des conséquences importantes
à l’échelle cellulaire
Hachette spé 1ère 2019

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Problème :Comment les enzymes participent à la vie cellulaire et à la

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L’hydrolyse de l’amidon est catalysée spécifiquement par l’amylase

Nathan spé 1ère 2019

L’amylase et la saccharase catalysent des réactions d’hydrolyse.

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Les enzymes contrairement aux catalyseurs chimiques ne catalysent qu’une

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La vitesse initiale est proportionnelle à la quantité d’enzyme car

Nathan spé 1ère 2019

Amidon dans une

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•Les acides aminés du site catalytique réagissent avec le substrat et le transforment

Les acides aminés du site actif de l’amylase

Amylase fonctionnelle ( Trp 58) Amylase mutée ( Ala 58)

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