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En biologie, le domaine (néolatinisé en dominium) est dans certaines classifications biologiques le premier niveau de rang au-dessus des règnes. Il est parfois considéré comme un synonyme du terme plus traditionnel d'empire, toutefois ces notions ne se recouvrent pas totalement.

Historique

Le terme domaine a été introduit pour discuter de la classification du monde vivant selon un modèle divisant celui-ci en trois grands groupes holophylétiques. Bien qu'étant de fait synonymes, l'emploi des termes domaine ou empire n'est pas tout à fait neutre. Le mot domaine est généralement rejeté par les taxonomistes qui contestent le modèle à trois domaines de Woese. Ce terme est également parfois rejeté par des taxonomistes qui acceptent ce système, simplement au nom de l'antériorité du terme empire.

Le modèle à trois domaines

Fichier:Phylogenetics-french.jpg

Arbre phylogénétique universel montrant les trois domaines selon Guillaume Lecointre & Hervé Le Guyader (2006) et d'après Purificación López-Garcıá & David Moreira (2008)^[2].

La classification de Carl Woese^[3] distingue trois domaines supposés holophylétiques :

le domaine Eubacteria ou Bacteria
le domaine Archaebacteria ou Archaea
et le domaine Eukaryota ou Eucarya

Ces taxons reflètent des différences évolutives fondamentales du génome des organismes vivants.

Les unicontes et bicontes sont des sous-domaines des Eucaryotes^[4].

D'autres modèles ont été proposés, parmi lesquels :

modèle à deux domaines (ou empires) : Procaryotes (ou Monères) et Eucaryotes^[5]^,^[6].
modèle à six règnes : Archaebacteria, Eubacteria, Protista, Fungi, Animalia et Plantae^[7].

Notes et références

↑ d'après (en) Sina M. Adl et al., « The New Higher Level Classification of Eukaryotes with Emphasis on the Taxonomy of Protists », Journal of Eukaryotic Microbiology, International Society of Protistologists, vol. 52, n^o 5,‎ octobre 2005, p. 399-451 (PMID 16248873, DOI 10.1111/j.1550-7408.2005.00053.x), en développant les opisthokontes pour maintenir les animaux et champignons au rang de règne (en négligeant les Apusozoa de positionnement encore incertain).
↑ (en) Purificación López-Garcıá & David Moreira, "Tracking microbial biodiversity through molecular and genomic ecology", Research in Microbiology, Vol.159, No.1, January-February 2008, p.67–73. DOI 10.1016/j.resmic.2007.11.019
↑ (en) C. R. Woese, W. E. Balch, L. J. Magrum, G. E. Fox and R. S. Wolfe, « An ancient divergence among the bacteria », dans Journal of Molecular Evolution, vol. 9, 1977, p. 305–311
↑ (en) Alexandra Stechmann et Thomas Cavalier-Smith, « The root of the eukaryote tree pinpointed », Current Biology, vol. 13, n^o 17,‎ 2 septembre 2003, R665-R666 (PMID 12956967, DOI 10.1016/S0960-9822(03)00602-X, lire en ligne)
↑ (en) E. Mayr, « Two empires or three? », Proc. Natl. Acad. Sci USA., vol. 95, n^o 17,‎ 1998, p. 9720–9723 (PMCID 33883, DOI 10.1073/pnas.95.17.9720, lire en ligne)
↑ (en) T. Cavalier-Smith, « Only six kingdoms of life », Proc. R. Soc. Lond. B, vol. 271,‎ 2004, p. 1251–62 (PMID 15306349, PMCID 1691724, DOI 10.1098/rspb.2004.2705, lire en ligne)
↑ Michael L. Cain, Hans Damman, Robert A. Lue, Carol Kaeseuk Yoon, Découvrir la biologie, De Boeck Supérieur, Bruxelles, 2006, p.26-27. ISBN 2-8041-4627-8

Voir aussi

[1] 'après (en) Sina M. Adl et al., « The New Higher Level Classification of Eukaryotes with Emphasis on the Taxonomy of Protists », Journal of Eukaryotic Microbiology, International Society of Protistologists, vol. 52, n^o 5,‎ octobre 2005, p. 399-451 (PMID 16248873, DOI 10.1111/j.1550-7408.2005.00053.x), en développant les opisthokontes pour maintenir les animaux et champignons au rang de règne (en négligeant les Apusozoa de positionnement encore incertain).

[2] (en) Purificación López-Garcıá & David Moreira, "Tracking microbial biodiversity through molecular and genomic ecology", Research in Microbiology, Vol.159, No.1, January-February 2008, p.67–73. DOI 10.1016/j.resmic.2007.11.019

[3] (en) C. R. Woese, W. E. Balch, L. J. Magrum, G. E. Fox and R. S. Wolfe, « An ancient divergence among the bacteria », dans Journal of Molecular Evolution, vol. 9, 1977, p. 305–311

[ASCS2003-4] (en) Alexandra Stechmann et Thomas Cavalier-Smith, « The root of the eukaryote tree pinpointed », Current Biology, vol. 13, n^o 17,‎ 2 septembre 2003, R665-R666 (PMID 12956967, DOI 10.1016/S0960-9822(03)00602-X, lire en ligne)

[Mayr1998-5] (en) E. Mayr, « Two empires or three? », Proc. Natl. Acad. Sci USA., vol. 95, n^o 17,‎ 1998, p. 9720–9723 (PMCID 33883, DOI 10.1073/pnas.95.17.9720, lire en ligne)

[CavalierSmith2004-6] (en) T. Cavalier-Smith, « Only six kingdoms of life », Proc. R. Soc. Lond. B, vol. 271,‎ 2004, p. 1251–62 (PMID 15306349, PMCID 1691724, DOI 10.1098/rspb.2004.2705, lire en ligne)

[7] Michael L. Cain, Hans Damman, Robert A. Lue, Carol Kaeseuk Yoon, Découvrir la biologie, De Boeck Supérieur, Bruxelles, 2006, p.26-27. ISBN 2-8041-4627-8

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 La classification de [[Carl Woese]]<ref>{{en}} C. R. Woese, W. E. Balch, L. J. Magrum, G. E. Fox and R. S. Wolfe, « An ancient divergence among the bacteria », dans Journal of Molecular Evolution, vol. 9, 1977, p. 305–311</ref> distingue trois domaines supposés [[holophylétique]]s :
 # le domaine [[Eubacteria]] ou [[Bacteria]]

v · m Taxonomie
Notions générales	Taxon Nom scientifique Rang taxonomique Nomenclature Systématique Classification scientifique des espèces Classification classique Classification phylogénétique Clade Cladistique Systématique évolutionniste Type Ootaxonomie
Nomenclature	Nom binominal ou trinominal Nom valide, correct ou illégitime Taxon obsolète Synonyme, chrésonyme et homonyme Basionyme et protonyme Protologue (publication originale) Nomenclature botanique, zoologique et bactérienne Citation d'auteurs en botanique, en zoologie et en bactériologie
Rang taxonomique	Realm (en virologie) Subrealm (en virologie) Empire / Domaine / Super-règne Règne Sous-règne Rameau Infra-règne Super-embranchement Embranchement / Division / Phylum Sous-embranchement Infra-embranchement Super-classe Classe Sous-classe Infra-classe Cohorte Super-ordre Ordre Sous-ordre Infra-ordre Super-famille Famille Sous-famille Tribu Sous-tribu Genre Sous-genre Section Sous-section Série Espèce Sous-espèce Variété ou Race Forme

Version du 19 février 2015 à 14:58

Historique

Le modèle à trois domaines

Notes et références

À lire

Voir aussi