Negli anni successivi l'impianto rimase attivo, subendo varie modifiche e aggiornamenti nel corso degli anni, i più importanti dei quali avvennero nel 1994 con l'aggiunta di nuovi spazi all'esterno della costruzione e la ristrutturazione di diversi ambienti interni<ref name=regione/>.
Lo stabilimento termale venne chiuso allealla fine del 1999<ref name=regione/> con la prospettiva di una riapertura negli anni seguenti, dopo una radicale ristrutturazione<ref>{{cita news|url=https://sportelloquotidiano.com/2017/11/11/catafascio-delle-terme-bobbio-accordi-disattesi-progetti-futuri/|titolo=Il catafascio delle Terme di Bobbio tra accordi disattesi e progetti futuri|data=11 novembre 2017|autore=Tomas Trenchi}}</ref>. Nel 2003 venne approvato dal consiglio comunale di Bobbio un piano che prevedeva la riapertura delle terme che sarebbero state dotate anche di una clinica estetica e la costruzione, sulla sponda opposta della Trebbia, di un albergo, dotato di piscina e beauty-farm, posto al servizio dello stabilimento termale<ref name=notiziario/>. Negli anni successivi, tuttavia i lavori, con l'eccezione della costruzione, poi, interrotta di una serie di villette sulla sponda sinistra della Trebbia, non iniziarono mai, culminando, nel 2016, con il fallimento della società proponente<ref>{{cita news|url=http://www.ilpiacenza.it/cronaca/ambientalisti-a-confronto-per-il-recupero-dell-area-delle-terme-di-bobbio.html|titolo=Ambientalisti a confronto per il recupero dell'area delle terme di Bobbio|data=30 ottobre 2017|autore=Renato Passerini|pubblicazione=IlPiacenza}}</ref>. Studi condotti nel 2018 portarono alla conclusione che le fonti utilizzate fino al 1999 non sarebbero più recuperabili a causa della presenza di cobatteri e di [[gas metano]] nei pressi della galleria di captazione<ref>{{cita news|url=http://www.ilpiacenza.it/politica/terme-di-bobbio-village-prodi-misto-recuperare-l-area-per-uso-pubblico.html|titolo=Terme di Bobbio Village, Prodi (Misto): «Recuperare l'area per uso pubblico»|data=5 agosto 2019|pubblicazione=IlPiacenza}}</ref>.
In località Rio Foglino (''Foino''), sulla sponda destra della Trebbia, a circa {{M|300|ul=m}} di distanza dal [[ponte Gobbo]], nei primi anni duemila venne realizzata una piccola costruzione in [[mattoni]] con una piccola piscina rendendo accessibile gratuitamente la fonte<ref name=provincia/>.