La generale aridità del clima condiziona fortemente la vegetazione. Prevalgono i paesaggi della [[savana]], con [[Boscaglia e macchia di Acacia-Commiphora somala|formazioni arboree xerofile]], che sugli altipianialtopiani cedono il passo alle [[Boscaglie xerofile montane della Somalia|formazioni erbose]] tipiche delle steppe, mentre la [[foresta tropicale]] è limitata alle parti più umide della Somalia meridionale lungo il corso dei due fiumi maggiori ([[Foresta a galleria|foreste a galleria]]). Tipiche sono alcune essenze aromatiche, come l'[[Boswellia|incenso]] e la [[Commiphora|mirra]], insieme all'[[Euphorbia|euforbia]] cactiforme e a essenze gommifere. Caratteristici ambienti umidi sono le paludi lungo la costa meridionale, parallelamente al basso corso dell'[[Uebi Scebeli]].
