PAPOLA

PAPOLA
Ідентифікатори
Символи	PAPOLA, PAP, poly(A) polymerase alpha, PAP-alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 605553 MGI: 109301 HomoloGene: 23389 GeneCards: PAPOLA
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • nucleotidyltransferase activity; • manganese ion binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • ATP binding; • magnesium ion binding; • polynucleotide adenylyltransferase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • termination of RNA polymerase II transcription; • RNA 3'-end processing; • mRNA processing; • mRNA polyadenylation; • mRNA 3'-end processing; • regulation of mRNA 3'-end processing; • RNA polyadenylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	10914
	18789
	ENSG00000090060
	ENSMUSG00000021111
	P51003
	Q61183
NM_001252006; NM_001252007; NM_001293627; NM_001293628; NM_001293632;
	NM_032632; NM_001363662; NM_001363664; NM_001363665; NM_001363666
	NM_011112; NM_001347440
NP_001238935; NP_001238936; NP_001280556; NP_001280557; NP_001280561;
	NP_116021; NP_001350591; NP_001350593; NP_001350594; NP_001350595
	NP_001334369; NP_035242
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PAPOLA (англ. Poly(A) polymerase alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 745 амінокислот, а молекулярна маса — 82 843^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPFPVTTQGS	QQTQPPQKHY	GITSPISLAA	PKETDCVLTQ	KLIETLKPFG
VFEEEEELQR	RILILGKLNN	LVKEWIREIS	ESKNLPQSVI	ENVGGKIFTF
GSYRLGVHTK	GADIDALCVA	PRHVDRSDFF	TSFYDKLKLQ	EEVKDLRAVE
EAFVPVIKLC	FDGIEIDILF	ARLALQTIPE	DLDLRDDSLL	KNLDIRCIRS
LNGCRVTDEI	LHLVPNIDNF	RLTLRAIKLW	AKRHNIYSNI	LGFLGGVSWA
MLVARTCQLY	PNAIASTLVH	KFFLVFSKWE	WPNPVLLKQP	EECNLNLPVW
DPRVNPSDRY	HLMPIITPAY	PQQNSTYNVS	VSTRMVMVEE	FKQGLAITDE
ILLSKAEWSK	LFEAPNFFQK	YKHYIVLLAS	APTEKQRLEW	VGLVESKIRI
LVGSLEKNEF	ITLAHVNPQS	FPAPKENPDK	EEFRTMWVIG	LVFKKTENSE
NLSVDLTYDI	QSFTDTVYRQ	AINSKMFEVD	MKIAAMHVKR	KQLHQLLPNH
VLQKKKKHST	EGVKLTALND	SSLDLSMDSD	NSMSVPSPTS	ATKTSPLNSS
GSSQGRNSPA	PAVTAASVTN	IQATEVSVPQ	VNSSESSGGT	SSESIPQTAT
QPAISPPPKP	TVSRVVSSTR	LVNPPPRSSG	NAATSGNAAT	KIPTPIVGVK
RTSSPHKEES	PKKTKTEEDE	TSEDANCLAL	SGHDKTEAKE	QLDTETSTTQ
SETIQTAASL	LASQKTSSTD	LSDIPALPAN	PIPVIKNSIK	LRLNR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію, РНК, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Thuresson A.-C., Aastroem J., Aastroem A., Groenvik K.-O., Virtanen A. (1994). Multiple forms of poly(A) polymerases in human cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 979—983. PMID 8302877 DOI:10.1073/pnas.91.3.979
Dettwiler S., Aringhieri C., Cardinale S., Keller W., Barabino S.M. (2004). Distinct sequence motifs within the 68-kDa subunit of cleavage factor Im mediate RNA binding, protein-protein interactions, and subcellular localization. J. Biol. Chem. 279: 35788—35797. PMID 15169763 DOI:10.1074/jbc.M403927200
Kaufmann I., Martin G., Friedlein A., Langen H., Keller W. (2004). Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase. EMBO J. 23: 616—626. PMID 14749727 DOI:10.1038/sj.emboj.7600070

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14981 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P51003 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14981 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P51003 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

PAPOLA

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук