Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
LRRK2
Ідентифікатори
Символи LRRK2 Зовнішні ІД
OMIM : 609007 MGI: 1913975 HomoloGene: 18982 GeneCards: LRRK2 шифр КФ 2.7.11.1
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Паркінсона , autosomal dominant Parkinson disease 8 , хвороба Паркінсона , young-onset Parkinson disease , hereditary late onset Parkinson disease [ 1]
Онтологія гена Молекулярна функція
• protein homodimerization activity • signaling receptor complex adaptor activity • clathrin binding • co-receptor binding • transferase activity • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • protein kinase activity • protein kinase A binding • peroxidase inhibitor activity • SNARE binding • nucleotide binding • identical protein binding • GO:0006184 GTPase activity • syntaxin-1 binding • protein serine/threonine kinase activity • tubulin binding • transmembrane transporter binding • microtubule binding • MAP kinase kinase activity • GTP binding • ATP binding • GTP-dependent protein kinase activity • beta-catenin destruction complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinase activity • actin binding • magnesium ion binding
Клітинна компонента
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle • ендосома • екзосома • Wnt signalosome • soma • trans-Golgi network • мітохондріальна мембрана • синапс • цитоплазма • мітохондріальна зовнішня мембрана • synaptic vesicle membrane • перикаріон • ендоплазматичний ретикулум • клітинна мембрана • Мікроворсинки • мітохондріальний матрикс • dendrite cytoplasm • growth cone • cell projection • дендрит (нейробіологія) • лізосома • neuron projection • Golgi-associated vesicle • мітохондрія • мітохондріальна внутрішня мембрана • autolysosome • terminal bouton • внутрішньоклітинний • мембрана • membrane raft • аксон • amphisome • multivesicular body, internal vesicle • Синаптичні бульбашки • inclusion body • міжклітинні контакти • cytoplasmic side of mitochondrial outer membrane • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • postsynapse • міжклітинний простір • клітинне ядро • внутрішньоклітинна мембранна органела • caveola neck • endoplasmic reticulum exit site • glutamatergic synapse • presynaptic cytosol • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес
• lysosome organization • GO:0001306 response to oxidative stress • cellular response to dopamine • regulation of autophagy • positive regulation of autophagy • positive regulation of dopamine receptor signaling pathway • regulation of neuroblast proliferation • intracellular distribution of mitochondria • negative regulation of protein processing • negative regulation of protein processing involved in protein targeting to mitochondrion • protein localization to mitochondrion • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • автофагія • neuromuscular junction development • фосфорилювання • positive regulation of protein binding • regulation of branching morphogenesis of a nerve • mitochondrion localization • positive regulation of protein autoubiquitination • regulation of synaptic vesicle transport • positive regulation of protein phosphorylation • regulation of kidney size • regulation of synaptic vesicle exocytosis • positive regulation of MAP kinase activity • peptidyl-threonine phosphorylation • MAPK cascade • Wnt signalosome assembly • protein phosphorylation • regulation of synaptic transmission, glutamatergic • excitatory postsynaptic potential • negative regulation of hydrogen peroxide-induced cell death • regulation of dopamine receptor signaling pathway • regulation of membrane potential • protein autophosphorylation • regulation of mitochondrial fission • regulation of neuron maturation • reactive oxygen species metabolic process • positive regulation of programmed cell death • regulation of neuron death • regulation of mitochondrial depolarization • cellular response to oxidative stress • negative regulation of late endosome to lysosome transport • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of lysosomal lumen pH • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • locomotory exploration behavior • Golgi organization • canonical Wnt signaling pathway • neuron projection morphogenesis • positive regulation of protein ubiquitination • regulation of canonical Wnt signaling pathway • exploration behavior • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • tangential migration from the subventricular zone to the olfactory bulb • regulation of protein kinase A signaling • calcium-mediated signaling • negative regulation of thioredoxin peroxidase activity by peptidyl-threonine phosphorylation • negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of neuron death • negative regulation of protein targeting to mitochondrion • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • determination of adult lifespan • negative regulation of excitatory postsynaptic potential • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • neuron death • GTP metabolic process • negative regulation of autophagosome assembly • olfactory bulb development • cellular response to starvation • regulation of dendritic spine morphogenesis • диференціація клітин • ендоцитоз • negative regulation of protein binding • mitochondrion organization • cellular response to manganese ion • negative regulation of macroautophagy • regulation of locomotion • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of retrograde transport, endosome to Golgi • regulation of CAMKK-AMPK signaling cascade • positive regulation of histone deacetylase activity • endoplasmic reticulum organization • Сперматогенез • регуляція експресії генів • negative regulation of neuron projection development • striatum development • regulation of protein stability • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process • regulation of ER to Golgi vesicle-mediated transport • protein localization to endoplasmic reticulum exit site • neuron projection arborization • regulation of synaptic vesicle endocytosis • positive regulation of synaptic vesicle endocytosis • positive regulation of microglial cell activation • protein import into nucleus
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних Ортологи
Види
Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 40.2 – 40.37 Mb Хр. 15: 91.56 – 91.7 Mb PubMed search[ 2] [ 3] Вікідані
LRRK2 (англ. Leucine rich repeat kinase 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 4] амінокислот , а молекулярна маса — 286 103[ 5]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MASGSCQGCE EDEETLKKLI VRLNNVQEGK QIETLVQILE DLLVFTYSER ASKLFQGKNI HVPLLIVLDS YMRVASVQQV GWSLLCKLIE VCPGTMQSLM GPQDVGNDWE VLGVHQLILK MLTVHNASVN LSVIGLKTLD LLLTSGKITL LILDEESDIF MLIFDAMHSF PANDEVQKLG CKALHVLFER VSEEQLTEFV ENKDYMILLS ALTNFKDEEE IVLHVLHCLH SLAIPCNNVE VLMSGNVRCY NIVVEAMKAF PMSERIQEVS CCLLHRLTLG NFFNILVLNE VHEFVVKAVQ QYPENAALQI SALSCLALLT ETIFLNQDLE EKNENQENDD EGEEDKLFWL EACYKALTWH RKNKHVQEAA CWALNNLLMY QNSLHEKIGD EDGHFPAHRE VMLSMLMHSS SKEVFQASAN ALSTLLEQNV NFRKILLSKG IHLNVLELMQ KHIHSPEVAE SGCKMLNHLF EGSNTSLDIM AAVVPKILTV MKRHETSLPV QLEALRAILH FIVPGMPEES REDTEFHHKL NMVKKQCFKN DIHKLVLAAL NRFIGNPGIQ KCGLKVISSI VHFPDALEML SLEGAMDSVL HTLQMYPDDQ EIQCLGLSLI GYLITKKNVF IGTGHLLAKI LVSSLYRFKD VAEIQTKGFQ TILAILKLSA SFSKLLVHHS FDLVIFHQMS SNIMEQKDQQ FLNLCCKCFA KVAMDDYLKN VMLERACDQN NSIMVECLLL LGADANQAKE GSSLICQVCE KESSPKLVEL LLNSGSREQD VRKALTISIG KGDSQIISLL LRRLALDVAN NSICLGGFCI GKVEPSWLGP LFPDKTSNLR KQTNIASTLA RMVIRYQMKS AVEEGTASGS DGNFSEDVLS KFDEWTFIPD SSMDSVFAQS DDLDSEGSEG SFLVKKKSNS ISVGEFYRDA VLQRCSPNLQ RHSNSLGPIF DHEDLLKRKR KILSSDDSLR SSKLQSHMRH SDSISSLASE REYITSLDLS ANELRDIDAL SQKCCISVHL EHLEKLELHQ NALTSFPQQL CETLKSLTHL DLHSNKFTSF PSYLLKMSCI ANLDVSRNDI GPSVVLDPTV KCPTLKQFNL SYNQLSFVPE NLTDVVEKLE QLILEGNKIS GICSPLRLKE LKILNLSKNH ISSLSENFLE ACPKVESFSA RMNFLAAMPF LPPSMTILKL SQNKFSCIPE AILNLPHLRS LDMSSNDIQY LPGPAHWKSL NLRELLFSHN QISILDLSEK AYLWSRVEKL HLSHNKLKEI PPEIGCLENL TSLDVSYNLE LRSFPNEMGK LSKIWDLPLD ELHLNFDFKH IGCKAKDIIR FLQQRLKKAV PYNRMKLMIV GNTGSGKTTL LQQLMKTKKS DLGMQSATVG IDVKDWPIQI RDKRKRDLVL NVWDFAGREE FYSTHPHFMT QRALYLAVYD LSKGQAEVDA MKPWLFNIKA RASSSPVILV GTHLDVSDEK QRKACMSKIT KELLNKRGFP AIRDYHFVNA TEESDALAKL RKTIINESLN FKIRDQLVVG QLIPDCYVEL EKIILSERKN VPIEFPVIDR KRLLQLVREN QLQLDENELP HAVHFLNESG VLLHFQDPAL QLSDLYFVEP KWLCKIMAQI LTVKVEGCPK HPKGIISRRD VEKFLSKKRK FPKNYMSQYF KLLEKFQIAL PIGEEYLLVP SSLSDHRPVI ELPHCENSEI IIRLYEMPYF PMGFWSRLIN RLLEISPYML SGRERALRPN RMYWRQGIYL NWSPEAYCLV GSEVLDNHPE SFLKITVPSC RKGCILLGQV VDHIDSLMEE WFPGLLEIDI CGEGETLLKK WALYSFNDGE EHQKILLDDL MKKAEEGDLL VNPDQPRLTI PISQIAPDLI LADLPRNIML NNDELEFEQA PEFLLGDGSF GSVYRAAYEG EEVAVKIFNK HTSLRLLRQE LVVLCHLHHP SLISLLAAGI RPRMLVMELA SKGSLDRLLQ QDKASLTRTL QHRIALHVAD GLRYLHSAMI IYRDLKPHNV LLFTLYPNAA IIAKIADYGI AQYCCRMGIK TSEGTPGFRA PEVARGNVIY NQQADVYSFG LLLYDILTTG GRIVEGLKFP NEFDELEIQG KLPDPVKEYG CAPWPMVEKL IKQCLKENPQ ERPTSAQVFD ILNSAELVCL TRRILLPKNV IVECMVATHH NSRNASIWLG CGHTDRGQLS FLDLNTEGYT SEEVADSRIL CLALVHLPVE KESWIVSGTQ SGTLLVINTE DGKKRHTLEK MTDSVTCLYC NSFSKQSKQK NFLLVGTADG KLAIFEDKTV KLKGAAPLKI LNIGNVSTPL MCLSESTNST ERNVMWGGCG TKIFSFSNDF TIQKLIETRT SQLFSYAAFS DSNIITVVVD TALYIAKQNS PVVEVWDKKT EKLCGLIDCV HFLREVMVKE NKESKHKMSY SGRVKTLCLQ KNTALWIGTG GGHILLLDLS TRRLIRVIYN FCNSVRVMMT AQLGSLKNVM LVLGYNRKNT EGTQKQKEIQ SCLTVWDINL PHEVQNLEKH IEVRKELAEK MRRTSVE
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз , кіназ , серин/треонінових протеїнкіназ , активаторів гтфаз , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія , диференціація клітин .
Білок має сайт для зв'язування з АТФ , нуклеотидами , ГТФ .
Локалізований у цитоплазмі , мембрані, мітохондрії , внутрішній мембрані мітохондрії , клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі , клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах , лізосомі , зовнішній мембрані мітохондрій , апараті гольджі , синапсах , ендосомах .
Zach S., Felk S., Gillardon F. (2010). Signal transduction protein array analysis links LRRK2 to Ste20 kinases and PKC zeta that modulate neuronal plasticity. PLoS ONE . 5 : E13191—E13191. PMID 20949042 DOI :10.1371/journal.pone.0013191 Wang Y., Jiang F., Zhuo Z., Wu X.H., Wu Y.D. (2013). A method for WD40 repeat detection and secondary structure prediction. PLoS ONE . 8 : E65705—E65705. PMID 23776530 DOI :10.1371/journal.pone.0065705 Toft M., Mata I.F., Kachergus J.M., Ross O.A., Farrer M.J. (2005). LRRK2 mutations and Parkinsonism. Lancet . 365 : 1229—1230. PMID 15811454 DOI :10.1016/S0140-6736(05)74809-1 Kay D.M., Kramer P., Higgins D.S., Zabetian C.P., Payami H. (2005). Escaping Parkinson's disease: a neurologically healthy octogenarian with the LRRK2 G2019S mutation. Mov. Disord . 20 : 1077—1078. PMID 16001413 DOI :10.1002/mds.20618 Paisan-Ruiz C., Nath P., Washecka N., Gibbs J.R., Singleton A.B. (2008). Comprehensive analysis of LRRK2 in publicly available Parkinson's disease cases and neurologically normal controls. Hum. Mutat . 29 : 485—490. PMID 18213618 DOI :10.1002/humu.20668 Bardien S., Lesage S., Brice A., Carr J. (2011). Genetic characteristics of leucine-rich repeat kinase 2 (LRRK2) associated Parkinson's disease. Parkinsonism Relat. Disord . 17 : 501—508. PMID 21641266 DOI :10.1016/j.parkreldis.2010.11.008
