千种植物项目:修订间差异
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'''千种植物项目'''({{lang|en|1KP project}}<ref> 1KP project,http://www.onekp.com/project.html</ref>)是由加拿大科学家在2008年11月发起,由深圳华大基因研究院负责对1000多种植物包括藻类、陆地及水生植物进行测序。目前已有多个科研团体参与这个项目。项目的所有测序数据将会通过公共渠道公开,尤其是NCBI或其他公开网站。 |
'''千种植物项目'''({{lang|en|1KP project}}<ref> 1KP project,http://www.onekp.com/project.html</ref>)是由加拿大科学家在2008年11月发起,由深圳华大基因研究院负责对1000多种植物包括藻类、陆地及水生植物进行测序。目前已有多个科研团体参与这个项目。项目的所有测序数据将会通过公共渠道公开,尤其是NCBI或其他公开网站。 |
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2016年4月9日 (六) 01:03的版本
千种植物项目(1KP project[1])是由加拿大科学家在2008年11月发起,由深圳华大基因研究院负责对1000多种植物包括藻类、陆地及水生植物进行测序。目前已有多个科研团体参与这个项目。项目的所有测序数据将会通过公共渠道公开,尤其是NCBI或其他公开网站。
项目介绍
应用
目前,华大基因完成该项目所有物种的转录组测序。科学家们对产生的数据集进行进化分析和植物功能注释,取得了大量的科研成果。另外,科学家们还针对该项目的所有测序数据,依托深圳华大基因研究院强大的计算资源,构建免费在线的Blast比对平台(Blast for OneKP Project[2]),提供在线Blast分析服务。该平台包括5个blast工具,即blastn、tblastn、tblastx、blastp、blastx,可针对性的选择参考物种数据集,使得数据分析的针对性更高,这是植物研究者们的一大福音。
参考来源
- ^ 1KP project,http://www.onekp.com/project.html
- ^ Blast for OneKP Project,http://www.bioinfodata.org/app/Blast4OneKP/