Για την περίοδο 1961–62, η Ένωση Ποδοσφαιρικών Σωματείων Ηπείρου είναι η διοργανώτρια αρχή, υπεύθυνη για τη διεξαγωγή των καθιερωμένων ποδοσφαιρικών διοργανώσεων, στους νομούς Ιωαννίνων,Άρτας,Πρέβεζας και το νησί της Λευκάδας.
Οι 3 πρώτες ομάδες συμμετείχαν στο τουρνουά Β εθνικής 1962.Άγνωστο τι έγινε στην ισοβαθμία Νικόπολης και Ατρόμητου.Τελικά συμμετείχε ο Ατρόμητος.Ατρόμητος και Ολυμπιακός ενώθηκαν και δημιούργησαν τον ΑΟ Ιωαννίνων.Οπότε δεν υποβιβάστηκε κάποια ομάδα.
Δεν συμμετείχε ο Ολυμπιακός Άρτας που συμμετείχε τελικά και αυτός στην συγχώνευση της Αναγέννησης Άρτας.Ανέβηκαν στην Α ερασιτεχνική η Λευκάτα Λευκάδας και η ΑΕ Πρέβεζας.Δεν υποβιβάστηκε η Θύελλα Κατσικάς.