Alfa-helico: Malsamoj inter versioj

[nekontrolita versio]

Enhavo forigita Enhavo aldonita

Enteksta

Nuna versio ekde 00:15, 25 apr. 2022

La ĉefa trajto de la alfa-helico estas la volviĝo de la polipeptida ĉeno en spiralan aranĝiĝon, tiel ke hidrogen-ligoj de la speco

                \       /
                 N-H:O=C
                /       \

povas formiĝi inter grupoj N-H kaj C=O, kiuj estas tri aŭ kvar aminoacidajn unuojn disaj (averaĝe 3,6 restaĵojn/volviĝo de spiralo).

Plejparto da proteinoj havas helicajn regionojn de diversaj longoj, intermiksitaj kun regionoj de hazarda volvaĵo.

Alfa-helicoj en proteinoj troviĝas kiam sekvo de reziduoj havas la paro de anguloj fi/psi kiu pli malpli egalas -60º/-50º.

En globecaj proteinoj alfa-helicoj konsistas de 4 aŭ 5 ĝis ĉirkaŭ 40 reziduoj, sed la averaĝa longo estas 10 reziduoj (3 volviĝoj). Malkiel DNA kies bazoj direktas H-ligojn al la kerno/interno de la duobla helico kaj fosfat-grupoj ekstere, alfa-helicoj en proteinoj havas H-ligojn direktitaj al la reziduo en la sama pozicio de alia volviĝo (unuope supren kaj malsupren) kaj la flankajn-grupojn direktitaj al la ekstero de la helico.

Pro tiu direkto de la flank-grupoj al la ekstero de alfa-helicoj, kiam alfa-helico havas sian surfacon direktita al akvaĵaj solvaĵoj, la reziduoj estas averaĝe hidrofilaj kaj kiam la surfaco direktigas al ne-akvaĵaj solvaĵoj (ekz-e membranoj), la aminoacidoj estas averaĝe hidrofobaj.

Ĝenerale, alanino (Ala, A), glutamato (Glu, G), leŭcino (Leu, L), kaj metionino (Met, M) estas bonaj stabiligaj aminoacidoj por alfa-helicoj, malkiel prolino (Pro, P), glicino (Gly, G), tirozino (Tyr, T), kaj serino (Ser, S), kiuj estas malbonaj.

Eksteraj ligiloj

Kategorio Alfa-helico en la Vikimedia Komunejo (Multrimedaj datumoj)

http://www.pnas.org/cgi/content/full/100/20/11207 Arkivigite je 2006-02-27 per la retarkivo Wayback Machine
http://www2.ufp.pt/~pedros/anim/2frame_helixen.htm Arkivigite je 2012-07-16 per la retarkivo Wayback Machine

@@ Linio 1: / Linio 1: @@
-La ĉefa trajto de la alfa-helico estas la volviĝo de la polipeptida ĉeno en spiralan aranĝiĝon, tiel ke hidrogen-ligoj de la speco
+La ĉefa trajto de la '''alfa-helico''' estas la volviĝo de la polipeptida ĉeno en spiralan aranĝiĝon, tiel ke hidrogen-ligoj de la speco
                  \       /
                   N-H:O=C
                  /       <nowiki>\</nowiki>
 povas formiĝi inter grupoj N-H kaj C=O, kiuj estas tri aŭ kvar
 aminoacidajn unuojn disaj (averaĝe 3,6 [[aminoacida restaĵo|restaĵojn]]/volviĝo de spiralo).
-La plejparto da proteinoj havas helicajn regionojn de diversaj longoj, intermiksitaj kun regionoj de hazarda volvaĵo.
+Plejparto da proteinoj havas helicajn regionojn de diversaj longoj, intermiksitaj kun regionoj de hazarda volvaĵo.
-alfa-helicoj en proteinoj troviĝas kiam sekvo de reziduoj havas la paro de anguloj fi/psi kiu pli malpli egalas -60º/-50º.
+Alfa-helicoj en proteinoj troviĝas kiam sekvo de reziduoj havas la paro de anguloj fi/psi kiu pli malpli egalas -60º/-50º.
 En globecaj proteinoj alfa-helicoj konsistas de 4 aŭ 5 ĝis ĉirkaŭ 40 reziduoj, sed la averaĝa longo estas 10 reziduoj (3 volviĝoj).
 Malkiel DNA kies bazoj direktas H-ligojn al la kerno/interno de la duobla helico kaj fosfat-grupoj ekstere, alfa-helicoj en proteinoj havas H-ligojn direktitaj al la reziduo en la sama pozicio de alia volviĝo (unuope supren kaj malsupren) kaj la [[flanka-grupo|flankajn-grupojn]] direktitaj al la ekstero de la helico.
-Pro tiu direkto de la flank-grupoj al la ekstero de alfa-helicoj, kiam alfa-helico havas sian surfacon direktita al akvaĵaj solvaĵoj, la reziduoj estas averaĝe [[hidrofila|hidrofilaj]] kaj kiam la surfaco direktigas al ne-akvaĵaj solvaĵoj (ekz-e membranoj), la aminoacidoj estas average [[hidrofoba|hidrofobaj]].
+Pro tiu direkto de la flank-grupoj al la ekstero de alfa-helicoj, kiam alfa-helico havas sian surfacon direktita al akvaĵaj solvaĵoj, la reziduoj estas averaĝe [[hidrofila]]j kaj kiam la surfaco direktigas al ne-akvaĵaj solvaĵoj (ekz-e membranoj), la aminoacidoj estas averaĝe [[hidrofoba]]j.
 Ĝenerale, alanino (Ala, A), glutamato (Glu, G), leŭcino (Leu, L), kaj metionino (Met, M) estas bonaj stabiligaj aminoacidoj por alfa-helicoj, malkiel prolino (Pro, P), glicino (Gly, G), tirozino (Tyr, T), kaj serino (Ser, S), kiuj estas malbonaj.
+<gallery>
+Dosiero:AlphaHelixBALL.png|<!-- thumb|maldekstra|180px|de:Alpha-Helix innerhalb eines Proteins, Darstellung der Atome und Zylinder-Darstellung.   de->eo:Alfa-helico _innerhalb_ _eines_ _Proteins_, _Darstellung_ _der_ _Atome_ _und_ _Zylinder_-_Darstellung_. -->
+Dosiero:Alpha1.png|<!-- thumb|maldekstra|180px|de:Wasserstoffbrücken -->
+Dosiero:Folding proteine 1EFN focussing on alpha helix.png|<!-- thumb|maldekstra|180px|de:Helixrad -->
+Dosiero:AlphaHelix Coiled-Coil.png|<!-- thumb|maldekstra|180px|de:coiled Coil -->
+</gallery>
+{{-}}
+== Eksteraj ligiloj ==
+{{Projektoj}}
+* http://www.pnas.org/cgi/content/full/100/20/11207 {{Webarchiv|url=https://web.archive.org/web/20060227102018/http://www.pnas.org/cgi/content/full/100/20/11207 |date=2006-02-27 }}
+* http://www2.ufp.pt/~pedros/anim/2frame_helixen.htm {{Webarchiv|url=https://web.archive.org/web/20120716201839/http://www2.ufp.pt/~pedros/anim/2frame_helixen.htm |date=2012-07-16 }} <!-- en:Interactive model of an &alpha;-helix   en->eo:_Interactive_ modelo (da, de) (an, _) &_alpha_;-(helico (apartigilo), helico) -->
+[[Kategorio:Proteomiko]]