Cladistica
Cladistica
Cladistica
nodo
bifurcado
nodo
rama multifurcado
terminal
rama interna
o internodo
raíz
Monday, April 27, 2009
árbol sin raíz
En estos árboles
filogenéticos la
longitud de ramas
representa el tiempo
evolutivo
~reloj molecular
C
B D
se
parecen G comparten un
ancestro común
(homólogo)
A F E
anfibios
mamíferos
tortugas
lagartos y serpientes
cocodrílos
aves Amniota
anfibios
mamíferos
tortugas Reptilia
lagartos y serpientes
cocodrílos
aves
anfibios
mamíferos
Homeotermia
tortugas
lagartos y serpientes
cocodrílos
aves
La matriz
1) Vertebras 1 0 0 0
2) 4 patas 1 1 0 0
3) Pelo 1 1 1 0
4) Placenta 1 1 1 1
c, t, r, h c, r, h c, h h
lagartos
vértebras
4 patas
cocodrílo
pelo
4 pasos
placenta
aves
Monday, April 27, 2009
terminología
agrupamientos
Un clado o una especie que esta dentro de otro clado se dice que está
anidado dentro de ese clado.
Maximum Likelihood
Inferencia bayesiana
Bootstrapping
Jackknifing
7 pasos
Monday, April 27, 2009
Medidas para evaluar los árboles
Indíces de consistencia (CI) y de retención (RI)
original
A
C G A A G C A C T T Bootstrapping
B
C G A A C C G G T T anfibi
C
G G T A C C G G A T re-muestreo con reemplazo
D
G C T A G C G C A T
mamí
Taxa Caracteres
8 10 7 4 1 10 2 8 5 3 C
tortug
replica 1
A
C T A A C T G C C A
B
G T G A C T G G C A
B
lagart
C
G T G A G T G G C T
D
C T G A G T C C G T 70
original
A
C G A A G C A C T T Jakknifing
B
C G A A C C G G T T anfibi
C
G G T A C C G G A T re-muestreo sin remplazo
D
G C T A G C G C A T
mamí
Taxa Caracteres
8 10 7 4 1 10 2 8 5 3 C
tortug
replica 1
A
C T A A C T G C C A
B
G T G A C T G G C A
B
lagart
C
G T G A G T G G C T
D
C T G A G T C C G T 70