RUTA DEL ACIDO SHIKIMICO:

La ruta del ácido shikímico es un conjunto de reacciones metabólicas de gran relevancia en la biosíntesis de metabolitos secundarios. El ácido
shikímico es precursor de diversos intermediarios metabólicos aromáticos, tales como los taninos, el cloranfenicol, el ácido 4-aminobenzoico, los
fenilpropanoides, los lignanos, los aminoácidos aromáticos (tirosina, fenilalanina y triptófano), así como sus derivados: glucósidos cianogénicos
aromáticos, aminas biógenas aromáticas, catecolaminas, betalaínas, melaninas, bisindoles, los flavonoides, las fenazinas y diversos alcaloides tales
como los tetrahidroisoquinolínicos, los alcaloides del ergot y los morfinanos, entre otros. El intermediario principal es el ácido shikímico, un
compuesto originalmente aislado de plantas del género Illicium.

Esta ruta es empleada por bacterias, algas, plantas y algunos hongos pero no por animales y protozoarios.

Principales rutas
Ruta del 3-deshidroquinato
El ácido shikímico se biosintetiza originalmente del fosfoenol piruvato y la eritrosa 4-fosfato para formar el precursor denominado ácido 3-
deshidroquínico. Este se obtiene por tres reacciones estas son las siguientes:

 Acoplamiento del fosfoenolpiruvato y la D-Eritrosa 4 fosfato para obtener el acido 3 deoxi D arabinoheptusolonico-7-fosfato. siendo la
enzima DAHP sintetasa la que participa en esta condensacion.
 Eliminacion del acido fosforico del DAHP llevado a cabo por una oxidacion que genera un enol gracias a la precensia del NAD+ y se forma
un intermediario que sufre un re-arreglo para convertirse en el acido 3-dehidroquinico, reaccion catalizada por la 3-deshidroquinato
sintasa.
 Reduccion del acido 3-dehidroquinico a acido quinico por accion de la misma enzima que participa en la oxidacion del DAHP y en
presencia del NADH.
 El acido shikimico es formado por la deshidratacion del acido 3-deshidroquinico formandose primero el acido 3-deshidroshikimico por
accion de la 3-deshidroquinato deshidratasa y posteriormente es reducida por el NADPH por accion de la enzima shikimato
deshidrogenasa.

Éste ácido puede formar varios metabolitos, como el ácido gálico, el ácido protocatecuico, el ácido quínico y el ácido shikímico:

 El ácido gálico es precursor de los denominados taninos hidrolizables.

 El ácido quínico es precursor de varios metabolitos secundarios, como el ácido clorogénico.
 El ácido protocatecuico es un antimicrobial presente en muchas plantas.

Ruta del corismato

El ácido shikímico puede producir por una vía enzimática de 3 pasos uno de los metabolitos intermedios más importantes de la ruta del ácido
shikímico, el ácido corísmico:

 En esta ruta se llevan a cabo 3 reacciones:

Fosforilación del shikimato, en donde se forma el ácido 3-fosfoshikímico por acción de la shikimato quinasa y ATP;
 Conjugación con una molécula de fosfoenol piruvato por acción de la 3-fosfoshikimato 1-carboxiviniltransferasa, en donde se forma el
ácido 5-enolpiruvilshikímico 3-P (EPSP)
 Eliminación del fosfato catalizada por la corismato sintasa.

El ácido corísmico puede producir metabolitos de gran diversidad química:

 El ácido 4-hidroxibenzoico es un compuesto encontrado en muchas plantas. Es precursor de las ubiquinonas.

 El ácido antranílico es precursor del triptófano, las quinolonas, las acridonas y algunos policétidos que utilizan al antranilato como unidad
de iniciación.
 El ácido 4-aminobenzoico, el cual es requerido en la biosíntesis del ácido fólico.
 El ácido isocorísmico, precursor del ácido salicílico y el ácido 2,3-dihidroxibenzoico, componente de la enterobactina.
 El ácido prefénico, precursor de los aminoácidos fenilalanina y tirosina.

Ruta del prefenato: Biosíntesis de los aminoácidos aromáticos

Las rutas de los aminoácidos aromáticos L-fenilalanina y L-tirosina a partir del ácido prefénico pueden variar de acuerdo al organismo, y en muchos
casos puede operar más de una ruta en una especie. En esencia, tres tipos de reacción están implicadas: Transaminación, aromatización
descarboxilativa e hidroxilaciones, pero lo que cambia en los organismos es el orden en el que se llevan a cabo. Así, en algunos organismos se pueden
producir tanto sustratos del ácido arogénico como del prefénico. Muchas bacterias y plantas tienden a sintetizar la fenilalanina y la tirosina por
separado.

Ruta de los fenilpropanoides

La L-fenilalanina y la L-tirosina son bloques de contrucción para una amplia gama de metabolitos secundarios: los fenilpropanoides (Compuestos tipo
C6C3). En plantas, el primer paso es la eliminación del nitrógeno de la fenilalanina en forma de amoniaco para generar el ácido trans-cinámico (En el
caso de la tirosina se forma Ácido p-coumárico) Todas las plantas pueden desaminar fenilalanina por medio de la fenilalanina amoniaco liasa (PAL),
pero la desaminación de tirosina parece ser más restringida a miembros de la familia Poaceae. La tirosina amoniaco liasa (TAL) ha sido encontrada
en plantas y bacterias. Aquellos organismos que no pueden desaminar la tirosina obtienen el ácido p-coumárico por hidroxilación del ácido cinámico.
Rutas de los arilpiruvatos

Los productos de transaminación de aminoácidos aromáticos son el ácido fenilpirúvico y el ácido p-hidroxifenilpirúvico, los cuales pueden ser
interconvertibles en algunos organismos via prefenato. El ácido fenilpirúvico puede reducirse para formar ácido 3-fenil láctico, el cual puede
transformarse por transposición en ácido trópico, componente de la hiosciamina. El ácido fenilpirúvico puede dimerizarse por medio de una
condensación aldólica doble para formar ácido polipórico, el cual es precursor de varios terfenilos, por ejemplo atromentina, volucrisporina,
leucomelona, muscafurina, ácido telefórico y xileritrina. El ácido polipórico puede escindirse oxidativamente para formar ácido pulvínico y sus
derivados.

 El ácido 4-hidroxifenilpirúvico es precursor de la 4-hidroxifenilglicina, aminoácido componente de péptidos no ribosomales, como en el

caso de la vancomicina.
 El ácido homogentísico es un catabolito de la tirosina. También es precursor en la biosíntesis de las plastoquinonas.

Rutas de la DOPA

La 3,4-dihidroxifenilalanina (DOPA) es un precursor relevante en el metabolismo de la tirosina y la fenilalanina. Se produce por la hidroxilación de la
tirosina y produce varios metabolitos secundarios tales como las melaninas, las catecolaminas, las betalaínas, las higroaurinas, los alcaloides
tetrahidroisoquinolínicos y otros alcaloides.

Glucósidos cianogénicos y glucosinolatos de aminoácidos aromáticos

Los aminoácidos aromáticos pueden formar glucósidos cianogénicos y glucosinolatos. Ambos siguen las mismas rutas generales para ambos tipos de
compuestos, en donde la formación de la aldoxima es el metabolito intermediario que puede formar el glucósido cianogénico o el glucosinolato,
dependiendo de la especie. A continuación se ilustra como ejemplo la biosíntesis de los derivados de la tirosina, durrina y sinalbina. La mirosinasa
hidroliza de manera general a todos los glucosinolatos cuando la planta presenta un daño físico.

Rutas del ácido antranílico

Acridinas y quinolinas

El ácido antranílico es precursor de varios metabolitos secundarios por condensación o conjugación con moléculas provenientes de otras rutas.

Cuando el ácido antranílico se esterifica con una molécula de coenzima A, puede participar como unidad de iniciación en la formación de un policétido
mixto con 2 unidades. Mediante los mismos mecanismos de los policétidos se pueden formar sistemas aromáticos policíclicos fusionados, tales como
los alcaloides quinolónicoss. La prenilación con pirofosfato de dimetilalilo (DMAPP) puede generar alcaloides con esqueleto de furo[2,3-b]quinolina.
La N-metilantraniloil-Coenzima A puede formar un tricétido, el cual es precursor de los alcaloides acridínicos, tales como la rutacridona, la acronicina
y la melicopicina.

La antraniloil coenzima A puede condensarse en una reacción tipo Mannich con el catión pirrolinio (derivado de la ornitina) para producir alcaloides
del tipo 1,2,3,9-tetrahidropirrolo[2,1-b]quinazolina, por ejemplo la peganina. Se ha homologado esta ruta con otras quinazolinas, tales como la
febrifuguina.

Indol y triptófano

El indol es biosintetizado a partir de ácido antranílico y pirofosfato de 5-fosfato-1-ribosilo. Se forma el fosfato de 3-indolilglicerol como intermediario,
el cual elimina una molécula de alanina para formar indol ligado a la enzima (No se encuentra libre). Este indol realiza una SEA con una molécula de
serina para formar el triptófano. Este aminoácido puede seguir las siguientes rutas:

Descarboxilación: El producto de descarboxilación del triptófano es la triptamina, la cual puede seguir varios caminos:

 Alquilaciones: La triptamina puede alquilarse o hidroxilarse, formando así los alcaloides indoliletil amínicos o triptaminas. Un ejemplo
clásico es la psilocibina aislada de los hongos alucinógenos Psilocybe.
 Ciclización por radicales libres: Se forman alcaloides pirroloindolicos, tales como la fisostigmina.
 Reacción de Mannich: La amina forma primero una imina con un carbonilo. La base de Schiff formada reacciona con el anillo aromático en
una reacción tipo Mannich para dar una heterociclización que forma alcaloides β-carbolínicos. Los compuestos carbonílicos más comunes
son el ácido pirúvico, el cual forma 1-metil β-carbolinas (como la harmina) o la secologanina.
 Transaminación: Esta ruta puede formar auxinas o escatol.

Transaminación: El producto es el ácido 3-indolilpirúvico. Este intermediario es una alternativa para formar auxinas.

Eliminación de piruvato: A partir de la triptofanasa, el triptófano elimina piruvato para producir indol libre. Este indol se puede hidroxilar para formar
indoxilo. Este intermediario puede formar el glucósido indicano, pigmentos bisindólicos (como el colorante índigo o la púrpura de Tiro) o isatinas (Via
N-acetil isatina.

5-Hidroxilación: Se forma el intermediario 5-hidroxitriptófano. Este compuesto es precursor de aminas biológicamente activas, tales como la
serotonina y la melatonina.

Prenilación: La SEA de una unidad de pirofosfato de dimetilalilo forma el intermediario L-4-Dimetilalil triptófano. Este es el precursor de los alcaloides
del ergot.
Escisión oxidativa: Por una ruptura oxidativa del anillo heterocíclico del indol, se forma la quinurenina, un intermediario catabólico que puede formar
ácido 3-hidroxiantranílico, el cual puede formar isofenoxazinas y ácido nicotínico. Otro producto posible es el ácido 5-(2'carboxietil)-4,6-
dihidroxipicolínico.

El triptófano también puede formar glucosinolatos, por ejemplo, la glucobrasicina.

Existen otros compuestos que proceden del triptófano o el ácido antranílico cuyas biosíntesis se revisarán en sus artículos correspondientes, tales
como la camalexina, brassilexina, la estaurosporina, la piocianina, la violaceína, las benzoxazinas, las criptolepinas, la luciferina.