UNIVERSIDAD DE LAS FUERZAS ARMADAS – “ESPE”

DEPARTAMENTO DE CIENCIAS DE LA VIDA

CARRERA DE INGENIERÍA EN BIOTECNOLOGÍA

BIOLOGÍA DE LOS MICROORGANISMOS Y LOS SISTEMAS BIOLÓGICOS

BIOQUÍMICA I

Nombre: Miguel Sánchez

NRC: 5633

CUESTIONARIO DE ÁCIDOS NUCLEICOS

1. Defínase los siguientes términos:

 Genética: En la actualidad se le denomina a la investigación científica de la
herencia.
 Replicación: La síntesis de DNA que implica el apareamiento complementario de
las bases púricas y pirimídicas de las dos cadenas que forman la hélice.
 Transcripción: La síntesis de RNA que implica el apareamiento de las bases de
los ribonucleótidos con las bases de la molécula de DNA.
 Esqueleto azúcar-fosfato: Superficie externa del DNA que posee grupos fosfato
con carga negativa.
 Bacteriófago: Virus que afecta exclusivamente a bacterias.

3. Descríbase la estructura de orden superior del DNA que se denomina

superenrollamiento.

Se juntan los extremos de una molécula lineal de DNA, la cual gira o se enrolla sobre
sí misma de tal forma que su eje forma otra hélice, es decir, tiene un enrollamiento
helicoidal.

5. Escríbanse tres propiedades biológicas facilitadas por el superenrollamiento.

Las moléculas de DNA lineales ocupan dimensiones mayores a las de la célula, el

núcleo o el orgánulo que las deben contener; por lo tanto al pasar por el
superenrollamiento su volumen es inferior.
 Permite que se acerquen regiones de la molécula que se encuentran alejadas en la
estructura lineal, facilitando los procesos de replicación y transcripción.
Mientras la molécula se encuentra en esta posición, contiene almacena energía
potencial en forma de energía de torsión y que facilita la separación de las cadenas en
procesos como la replicación y transcripción.

7. Descríbase la estructura de un nucleosoma.

La estructura de un nucleosoma es la unión de las histonas al DNA, las histonas son un
grupo de proteínas básicas pequeñas que se encuentran en todos los organismos eucariotas.
Las histonas, que son de cinco clases principales (Hl, H2A, H2B, H3 Y H4), tienen estructuras
primarias semejantes entre las especies eucariotas.

9. Escríbanse las diferencias estructurales entre el RNA y el DNA.

Las diferencias estructurales entre el DNA y RNA son que el DNA está constituido por
una doble cadena polinucleotidica mientras que el RNA se compone de una cadena
polinucleotidica. El DNA tiene una estructura espacial de doble hélice mientras que el RNA
no presenta una estructura espacial definida.

11. ¿Cuáles son las tres formas más comunes del RNA? ¿Qué funciones tienen en la
célula?

Las tres formas comunes del RNA son el RNAm, RNAr y RNAt. Sus funciones celulares
respectivamente son las de intermediario para llevar información a contenida en el DNA al
citoplasma, mensajero. La función celular del RNAr es ser intermediarios en la traducción de
la secuencia de las bases del RNAm en los ribosomas. Los RNAt tienen como función
transportar al amino ácido para colocarlos en posiciones específicas para formar las proteínas.
13. Defínanse los siguientes términos:
 Telómero: las estructuras de los extremos de los cromosomas que amortiguan la
pérdida de secuencias codificadoras esenciales tras una ronda de replicación del
DNA.
 Minisatélite: Dos clases relativamente pequeñas de secuencias repetitivas
 Perfil de DNA: Las técnicas de análisis de DNA que se utilizan de forma habitual
para verificar la identidad de las víctimas y/o de los autores de crímenes violentos
 Intrón: Son secuencias no codificadoras.
 Exón: Son secuencias no codificadoras están entremezcladas entre las secuencias.
15. La temperatura de fusión de una molécula de DNA incrementa al aumentar el
contenido de bases Gc. ¿Por qué?
Cuando el DNA nativo se calienta, su absorbancia no cambia hasta que se alcanza una
temperatura determinada. La "temperatura de fusión" T de una molécula de DNA varía con
su composición de bases. Cuando el DNA desnaturalizado se enfría, su absorbancia cae, pero
a lo largo de una curva diferente. No vuelve a su valor de absorbancia original.
17. Organícense los términos siguientes de forma jerárquica:
a) Cromosoma (3)
b) Gen (2)
c) Nucleosoma (4)
d) Par de bases nucleotídicas (1)
19. Defínase los siguientes términos: a. transcriptoma b. RNA no codificador c.
RNA corto nucleolar d. microsatélite e. RNA corto interferente
 Transcriptoma: Conjunto de todas las moléculas de ARN (también llamadas
transcritos) presentes en una célula o grupo de células en un momento
determinado.
 RNA no codificador: Es una molécula de ARN funcional, que a diferencia
del RNA mensajero no se traduce en una proteína.
 RNA corto nucleolar : Es una larga molécula de ácido ribonucleico ,
sintetizado y localizado en el nucléolo de las células eucariotas , a partir de la
transcripción del ADN, formado por una secuencia de unos 13.000 nucleótidos
, y que es precursor e indispensable para la síntesis de la mayor parte del ARN
ribosómico.
 Microsatélite: Son pequeños trozos de ADN en el genoma muy simples,
constan de 6 a 8 pares de bases.
 RNA corto interferente: Es una molécula de ARN que suprime la expresión
de genes específicos mediante mecanismos conocidos globalmente como
riboinferencia o interferencia por ARN.

21. Defínase los siguientes términos:

a. Cadena con sentido: Hebra o cadena de DNA con la misma secuencia que el
RNA mensajero, que se transcribe (excepto por la presencia de timinas en vez de
uracilos) en sentido 5' a 3'. También se denomina cadena codificante.
 b. efecto hipocrómico:El efecto hipercrómico es el incremento de absorbancia en
un material. El caso opuesto es el efecto hipocrómico. El caso más conocido es la
hipercromicidad del ADN, que ocurre cuando el dúplex se desnaturaliza, dando
dos cadenas sencillas que absorben más en el ultravioleta.
c. Transposición: Reacción en la que en las moléculas de una sustancia sufren un
cambio de conectividad entre dos o más de sus átomos para formar un nuevo
producto sin que haya pérdida de alguno de ellos.
d. Transcrito:se define como participio irregular de transcribir, que quiere decir el
que transcribe, reproduce, copia o duplica en una parte lo que esta escrito
anteriormente denominado también como copiar y también del mismo sistema de
escritura al que se ha redactado o que representa los elementos de un idioma
mediante un sistema de escritura.
e. Elemento genético móvil: Los elementos genéticos móviles son elementos
capaces de trasladarse de un lugar a otro insertándose dentro del ADN.

23. ¿Cómo se retienen los patrones de metilación del DNA de una generación celular a
la siguiente? Véase el recuadro Bioquímica en perspectiva disponible en línea sobre
epigenética y el epigenoma.
La metilación del ADN en dinucleótidos CpG es uno de los mecanismos epigenéticos
implicados en la regulación de la expresión génica en mamíferos. Los patrones de metilación
son específicos para cada especie y tipo de tejido. La maquinaria implicada comprende
diferentes proteínas reguladoras incluyendo a las ADN metiltransferasas, desmetilasas
putativas, proteínas de unión a CpG metilados, enzimas modificadoras de histonas y
complejos remodeladores de la cromatina.
25. Cuando un hidrocarburo aromático se intercala entre dos pares de bases apiladas,
¿qué efecto es posible en la estructura del DNA?

En el ADN, el apilamiento π se da entre nucleótidos adyacentes y suma en la estabilidad

de la estructura molecular. Las bases nitrogenadas de los nucleótidos están hechas de anillos
de purina o pirimidina, consistentes ambos de anillos aromáticos Dentro de la molécula de
ADN, los anillos aromáticos se ubican casi perpendicularmente a la dimensión longitudinal
de las hebras de ADN. En consecuencia, las caras de los anillos aromáticos están alineados
paralelamente unos a otros, permitiendo que las bases participen en interacciones aromáticas.
A través de estas interacciones aromáticas, los enlaces π se extienden de los átomos
participantes en los enlaces dobles, se traslapan con los enlaces π de las bases adyacentes.
Éste es un tipo de enlace químico no covalente. Aunque un enlace no covalente es más débil
que un enlace covalente, la suma de todas las interacciones de apilamiento π dentro de la
molécula de doble hebra del ADN crean una gran red de energía estabilizante.

27. La AZT se usa en el tratamiento del sida. Examínese su estructura y sugiérase

su mecanismo de acción.

La AZT (azidotimidina) sustituye un grupo azida por el grupo 5’ –hidroxilo, que es

necesario para crear los enlaces de fosfato de azúcar del esqueleto de DNA. Cuando la
AZT se incorpora en la cadena de DNA creciente, el grupo 5’ –azida impide la adición
del siguiente nucleótido y de este modo interrumpe el proceso de transcripción inversa.

Mecanismo de acción de zidovudine (3'-azido-3'-deoxythymidine) en la replicación

del VHI-1: es un análogo sintético de la pirimidina e inhibe los retrovirus de los animales
y de los mamíferos (HTLV-1 y VHI). El AZT es convertido en trifosfato por la
fosforilación hecha por los enzimas celulares y así el AZT-TP es incorporado en la cadena
nueva de ADN, inhibiendo su elongación (ya que no tiene los radicales -OH en la posición
3’). El blanco del AZT TP es la transcriptasa inversa, que usa el AZT TP en lugar de la
molécula habitual timidina trifosfato. El virus VHI puede volverse resistente a los efectos
de la AZT, debido a las mutaciones que afectan a la estructura de la transcriptasa inversa
(incluyendo cambios en los sitios activos del enzima).

29. ¿Cómo y por qué se modifican las bases del tARN?

Las bases del tARN se modifican debido a que se debe tener el anticodón
correspondiente al codón del mARN para así en los ribosomas dar lugar al aminoácido
correspondiente de la cadena polipeptídica creciente.

31. En condiciones fisiológicas, el DNA se encuentra en forma de DNA B. Sin

embargo, las horquillas de RNA y los híbridos RNA-ADN adoptan la estructura
de DNA A. Considerándose las diferencias estructurales entre el DNA y el RNA,
explíquese este fenómeno.

Este fenómeno ocurre debido a que las horquillas de ARN y los híbridos de ARN-
ADN durante la fase de la replicación necesitan que sus hebras se encuentran más
separadas entre sí, con el objetivo de que se empiecen a formar las cadenas hijas.
33. Explíquese en términos generales cómo participan las poliaminas en la
consecución de una estructura muy comprimida del DNA.

Las poliaminas son moléculas policatiónicas constituidas por varios grupos amino.
En la compresión o enrollamiento del ADN participan dos tipos de poliaminas, las
putrescinas se unen a los surcos menores y mayores, mientras que la espermina solo se
une a los mayores. Estas uniones permiten estabilizar a la doble hélice cuando comienza
a enrollarse, pues al ser polímeros con altas cargas negativas, estas se neutralizan con las
cargas positivas de las poliaminas.

35. Jerome Vinograd encontró que el DNA circular de un poliomavirus se separa

en dos bandas diferentes cuando se centrifuga. Una banda consta de DNA
superenrollado y la otra de DNA laxo. ¿Cómo podría identificarse cada banda?

Para identificar cada una de las bandas se puede utilizar una corrida electroforética,
ya que cada banda contiene diferente composición de volumen, siendo el DNA
superenrollado más denso que el DNA relajado o laxo. Las distintas conformaciones
hacen que cada molécula viaje a distinta velocidad en el gel de electroforesis,siendo así
que el ADN superenrollado migre una distancia mayor al ADN relajado.

37. El flujo de información genética va del DNA al RNA y a las proteínas. En

determinados virus, el flujo de información va del RNA al DNA. ¿Es posible que
dicho flujo de información comience desde las proteínas? ¿Por qué?

Este diagrama ilustra que la información genética codificada en las secuencias de

bases de DNA fluye del DNA, una molécula que se replica a sí misma durante la división
celular, al RNA, que especifica la estructura primaria de las proteínas. Como se concibió
en un principio, el dogma central afirmaba que la información genética fluía en una sola
dirección: del DNA al RNA y a las proteínas. Sin embargo, hace algunos años se
descubrió una importante excepción al dogma central. Algunos de los virus que poseen
genomas de RNA también tienen una actividad enzimática que se denomina transcriptasa
inversa. Una vez que uno de estos virus ha infectado una célula hospedadora, la
transcriptasa inversa copia el RNA vírico para formar una copia de DNA. El DNA vírico
se inserta entonces en un cromosoma del hospedador.
39. Se desea aislar DNA mitocondrial sin rastros de DNA nuclear. ¿Cómo se
realizaría esta tarea?

El DNA mitocondrial (mtDNA) codifica dos rRNA, 22 tRNA y varias proteínas, la

mayoría de las cuales se utilizan en el transporte de electrones. El resto de las proteínas
mitocondriales se sintetizan en el citoplasma y se transportan al interior de las
mitocondrias. De forma semejante, el genoma de los cloroplastos codifica varias clases
de RNA y determinadas proteínas, muchas de las cuales están asociadas directamente con
la fotosíntesis. Las actividades de los genomas nucleares y de los organelos están muy
coordinadas. Por consiguiente, con frecuencia son difíciles de discernir sus
contribuciones individuales con la función del organelo.

41. El conjunto de moléculas de m RNA presente dentro de una célula cambia con
el tiempo. Explíquese la causa.

Cambia ya que el RNA participa directamente en la síntesis de las enzimas, de las

proteínas estructurales y de otros polipéptidos necesarios para generar todas las demás
biomoléculas que intervienen en el funcionamiento del organismo. La secuencia de bases
de cada RNA mensajero (mRNA) especifica la secuencia primaria de un polipéptido
particular.

43. Se ha resuelto finalmente el caso de un asesinato de un niño de 10 años en un

pequeño poblado gracias a los esfuerzos de un detective que aprovechó una
nueva base de datos estatal de DNA que contiene muestras de DNA de
criminales condenados. Explíquese cómo se resolvió este caso, comenzando con
la llegada de una unidad de peritos forenses al lugar del asesinato. ¿Qué avances
tecnológicos hicieron posible la resolución del caso?

Debido a las variaciones genéticas, las secuencias minisatélite de DNA se fragmentan

de forma diferente. (Estas diferencias genéticas se denominan polimorfismos de la
longitud de los fragmentos de restricción, o RFLP.) Tras separar los fragmentos de
restricción según su tamaño, por medio de electroforesis en gel de agarosa, y transferirlos
a papel filtrante de nitrocelulosa, se exponen a sondas marcadas radiactivamente. Debido
a que los tamaños de los fragmentos que se. unen a estas sondas se diferencian de una
persona a otra, se han utilizado con éxito los patrones de bandas para condenar o absolver
a sospechosos de casos criminales.
45. Durante el proceso infeccioso, los virus pueden incorporar segmentos del genoma
del hospedador en sus estructuras. Explíquese el modo en que este fenómeno
puede contribuir a la aparición de nuevas enfermedades o exacerbar patologías
existentes.

Con frecuencia, los virus infectan más de un hospedador. Algunas de las secuencias
de ácidos nucleicos obtenidas de uno o más hospedadores dan a una partícula vírica una
ventaja selectiva (p. ej., al facilitar el ataque a una célula hospedadora). Por ejemplo, los
virus de la influenza humana a menudo se tornan más virulentos después de que han
infectado pollos y cerdos.

47. Los agentes alquilantes son compuestos que reaccionan con grupos hidroxilo y
amino para formar moléculas alquiladas. Por ejemplo:

Cuando un individuo se expone accidentalmente a estas sustancias, diversos sistemas

fisiológicos son afectados a través de alteraciones del genoma. No es raro que una de las
consecuencias sea cáncer (proliferación celular descontrolada a causa del daño genómico)
cuando ocurre una serie de tales exposiciones. Aplicando los conocimientos adquiridos
sobre el genoma, sugiérase en términos generales cómo podría producirse cáncer.

Se puede dar por la alquilación el cual es un proceso en el que las sustancias electrófilas
atacan a las moléculas que poseen un par de electrones sin compartir. Cuando los
electrófilos reaccionan con estas moléculas, por lo general añaden grupos alquilo que
contienen carbono. La adenina y la guanina son muy susceptibles a la alquilación, aunque
la timina y la citosina también pueden ser afectadas. Las bases alquiladas con frecuencia
se aparean de forma incorrecta (p. ej., la metilguanina se aparea con la timina en lugar de
con la citosina) lo que conduce a posibles mutaciones por transición en las siguientes
rondas de replicación. En el caso de la metilguanina, el par GC se transforma en el par
AT. Las mutaciones por transversión también pueden tener lugar cuando el grupo
alquilante es voluminoso. Las alquilaciones también pueden promover la formación de
un tautómero, que puede dar lugar a mutaciones de transición.
49. Se ha sugerido que el DNA de restos fósiles podría extraerse, clonarse y
emplearse para revivir especies extintas. Coméntese sobre la factibilidad de esta
idea.

Esta idea es muy factible ya que se fundamenta principalmente en evidencias fósiles y

anatómicas, la respaldan los datos de la secuencia primaria del citocromo c que indican
que la proteína es idéntica en ambas especies. Se cree que los canguros, las ballenas y las
ovejas, cuyas moléculas de citocromo c se diferencian por 1 0 residuos de la proteína
humana, evolucionaron a partir de un antecesor común que vivió