Tema 2
Tema 2
Tema 2
A pH fisiológico(pH ~ 7) R
a
NH3+ C COO-
Grupo amino Grupo
Forma Zwiteriónica carboxílico
H
H H
C C Las propiedades de
NH2 CO2H los 20 aminoácidos
R R
CO2H NH2 viene determinadas
por las diferentes
L D cadenas laterales, R.
S R
T2-Dra. Caubet 2
Los aminoácidos tienen dos (o más) valores de pKa.
A bajos pHs, la forma zwitterion puede protonarse para dar un ión con
una carga neta positiva. A pHs elevados, se puede formar un anión
carboxilato, con una carga neta negativa.
T2-Dra. Caubet 3
Aminoácidos
R1 R2
NH3+ C COO- + NH3+ C COO- +
H H El ácido carboxílico
H 2O H2O
condensa con un
grupo amino
R1 R2 R3 eliminándose una
NH3+ C CO NH C CO NH C CO molécula de agua.
H Enlace H Enlace H
peptídico peptídico
La secuencia de
F T D
aminoácidos se llama
A G N S K A
G S Estructura Primaria
T2-Dra. Caubet 6
Características del enlace Peptídico
Carácter parcial de doble enlace:
T2-Dra. Caubet 7
Estructura del péptido
N-terminal C-terminal
T2-Dra. Caubet 8
Factores que afectan la distribución espacial de
una proteína
SH S
+ 2H+ + 2e-
SH S
Enlace de hidrógeno
C=O- +
H-N
(d) (e)
Ejemplos de estructura secundaria:
(a) Hélice a; (b) Lámina b paralela;
(c) Lámina b antiparalela. Regiones
de estructura irregular: (d)
Enrollamiento al azar; (e) Lazo en
horquilla.
T2-Dra. Caubet 11
Estructura terciaria
En una proteína
globular, las cadenas
laterales no polares se
colocan hacia dentro y
las polares hacia fuera,
hacia el medio externo
polar.
T2-Dra. Caubet 13
Naturaleza jerárquica de la estructura de las
proteínas
(a) ... Gly - Ala - Cys - Tyr - His - Phe - Cys ... (a) Estructura Primaria
(secuencia de aminoácidos)
(b) ↓
(c)
(b) Estructura Secundaria
(hélice-α, láminas-β)
↓
(c) Estructura Terciaria
(estructura tridimensional
(d) formada por la unión de las
estructuras secundarias)
↓
(d) Estructura Cuaternaria
(estructura formada por más
Química Bioinorgánica, J.S. Casas, V. Moreno, A, Sánchez, T2-Dra. Caubet de una cadena de 14
J.L. Sánchez, J. Sordo. Ed. Síntesis, Madrid, 2002.
Estructura tridimensional de las proteínas
Estructura
terciaria
Estructura Cuaternaria
T2-Dra. Caubet 15
Relación intima entre la estructura de la
proteína y su función
• La actividad biológica de las proteínas viene
determinada por su estructura terciaria.
• Las bolsas (“pockets”) (sitios activos) permiten el
transporte y la reacción de moléculas seleccionadas.
Una posición de enlace en una proteína captura (enlaza) una molécula pequeña
para su transporte o reacción con un reactivo apropiado localizado en aquella
posición. T2-Dra. Caubet 16
Relación intima entre la estructura de la
proteína y su función
Un método de desnaturalizar
proteínas, destruyendo la estructura
secundaria y terciaria, es romper los
enlaces disulfuro. Si la oxidación por
aire los regenera, las estructuras de
alto orden son regeneradas y la
actividad biológica regenerada. T2-Dra. Caubet 17
Resumen
Blandos
Intermedios
Glu, Asp
a) b) c)
T2-Dra. Caubet 21
Resumen
Las propiedades (tales como los potenciales redox) son
moduladas por las proteínas
Porfina Metaloporfirina
R1 O
N HN
COCH3
Clorina (Mg) NH N
R2 R3
CH3 CH3
T2-Dra. Caubet 24
Ácidos nucleicos y sus constituyentes
El DNA y el RNA son polímeros de unidades monómeras
llamadas nucleótidos
Un nucleótido a su vez está formado por:
- una base heterocíclica nitrogenada
- un anillo de azúcar: ribosa o desoxirribosa
- y ácido fosfórico
enlace b-N-
glicosídico
OH ribosa
H desoxiribosa
Nucleósido
T2-Dra. Caubet 25
Nucleótido
Componentes del DNA
NH2 O NH2 O
N N
N HN N NH
N N
N H H2N N H N O N O
H H
NH2
O N
HO
O
H H
H H
OH H
T2-Dra. Caubet 27
Diferencias estructurales entre DNA y RNA
DNA RNA
O O
H3C
NH NH
N O N O
H H
Thymine (T) Uracil (U)
O: pdGpdTpdC
O: pd(GTC)
• Covalente:
enlaces fosfodiester en el esqueleto
• Hidrógeno:
entre bases complementarias
Primarias o Naturales (Watson-Crick)
Secundarias o apareamiento Hoogsteen
(non-Watson-Crick)
T2-Dra. Caubet 29
Estructura secundaria
T2-Dra. Caubet 30
Conformaciones del DNA
(a)
O
M
O N
NH
O P
M O N NH2
O N
O
O O
M
(b) (c)
L
M
L
:
(a) Interacciones con los átomos dadores de la base,
el azúcar y el fosfato; b) Interacción mediante enlace
Intercalante hidrógeno de ligandos coordinados; (c) Intercalación.
FAD
NAD+/NADH
FMN
Nucleótidos que participan en
o 2H+ + 2 e-
procesos redox
FMNH2
T2-Dra. Caubet 33
Hidròlisi
Reserva Ca
Metabolisme
Producció d’energia
Síntesi d’ATP
Redox
Fe, Cu
T2-Dra. Caubet 34