BIOQUÍMICA

CLASE 4: Ácidos Nucleicos:

Clasificación y estructura.
Dra. Dariela Núñez
Departamento de Química Ambiental
Facultad de Ciencias
 Ácidos Nucleicos
• Década de 1950 se determinó la estructura
del ácido desoxirribonucleico por James
Watson y Francis Crick. Casi un siglo después
de que Miescher (1869) aisalara del núcleo de
leucocitos una sustancia ácida rica en fósforo
que llamó nucleína.

• Durante siglos se habían observado los James Watson y Francis Crick.

patrones hereditarios sin entender el
mecanismo que transmite desde los padres a
la progenie rasgos físicos y procesos de
desarrollo.

• Surgieron áreas de la investigación científica

como la genética y la biología molecular. Friedrich Miescher
 Ácidos Nucleicos
• Biomoléculas formadas químicamente por
- Carbono
- Hidrógeno
- Oxígeno
- Nitrógeno
- Fósforo
Posee carácter ácido.
 Ácidos Nucleicos:
ADN y ARN
• Existen dos tipos de ácidos nucleicos: ADN y ARN. El ADN guarda la
información genética en todos los organismos celulares, el ARN es necesario
para que se exprese la información contenida en el ADN.

• Macromoléculas formadas por la repetición de monómeros denominados

nucleótidos.

• Un nucleótido está formado por :

- Una pentosa: ribosa o desoxirribosa.

- Una base nitrogenada: púrica o pirimidínica.
- Un grupo fosfato

Estructura del nucleotido monofosfato

de adenosina (AMP)
 Nucléosidos y nucleótidos
Enlace N-!-glucosídico.
Se forma por la eliminación
• La molécula generada a través de la de una molécula de agua
unión de la base nitrogenada a la (grupo OH de la pentosa y H
de la base)
pentosa recibe el nombre de
nucleósido. El enlace ocurre a través
del C 1’ de la pentosa y los nitrógenos
de las posiciones 1 (pirimidínicas) o 9
(púricas) de las bases nitrogenadas
mediante un enlace de tipo N-!-
glucosídico.

• La unión del nucleósido con el ácido

fosfórico se realiza a través de un
Los nucleótidos pueden tener 1,2 o
enlace tipo éster entre el grupo OH
3 grupos fosfatos unidos al C-5’ de
del C 5’ de la pentosa y el ácido
la pentosa , existiendo por lo tanto,
fosfórico, originando un Nucleótido. nucleótidos 5 monofosfato,
difosfato o trifosfato
 Pentosas
• La pentosa en el caso de los ácidos desoxirribonucleicos es la 2-D-
desoxirribosa (ADN) y en el caso de los ácidos ribonucleicos (ARN) es la D-
ribosa.

• La diferencia entre la ribosa y la desoxirribosa es que la primera tiene un

grupo hidroxilo en el carbono 2' y la segunda un hidrógeno solamente. El
signo prima se añade para diferenciar los carbonos numerados de las
pentosas de las bases nitrogenadas.
 Bases nitrogenadas
• Las bases nitrogenadas son moléculas cíclicas y en la composición de
dichos anillos participa, además del carbono, el nitrógeno.

• Estos compuestos pueden estar formados por uno o dos anillos. Aquellas
bases formadas por dos anillos se denominan bases púricas (derivadas de
la purina). Dentro de este grupo encontramos: Adenina (A), y Guanina
(G).

• Si poseen un solo ciclo, se

denominan bases
pirimidínicas (derivadas de la
pirimidina), como por ejemplo
la Timina (T), Citosina (C),
Uracilo (U).
 Propiedades de las
bases nitrogenadas
• Son bases débiles, anillos aromáticos.

• Son hidrofóbicas y baja solubilidad en agua a pH7.

• Absorben luz a 250-280 nm, lo que permite su identificación y conocer su

concentración.

• Las interacciones hidrofóbicas de las bases sitúan paralelamente los

planos de los anillos (pila de monedas). El apilamiento también involucra
interacciones de van der Waals entre las bases.

• El apilamiento minimiza el contacto de las bases con el agua y favorece la

formación de la estructura tridimensional de los ácidos nucleicos.
Nomenclatura
Desoxirribonucleotidos
Ribonucleotidos
 Nucleótidos libres o
no nucleicos
Funciones:
- Nucleótidos polifosforilados:
- Transporte de grupos fosfatos
- Reserva energética: ATP
- Activación energética de moléculas
UDP- glucosa → Síntesis de gluógeno
- Nucleótidos cíclicos (segundos mensajeros. AMPc)
- Derivados nucleotídicos NAD, FAD, Coenzima A
 Nucleótidos libres o
no nucleicos
• ATP (adenosin trifosfato): Es el portador primario de energía de la célula.
Esta molécula tiene un papel clave para el metabolismo de la energía. La
mayoría de las reacciones metabólicas que requieren energía están
acopladas a la hidrólisis de ATP.
Este nucleótido posee tres grupos fosfatos unidos entre sí. Estos grupos
fosfatos dado el pH celular se encuentran desprotonados, de manera que
poseen cargas negativas.
Como estas cargas están muy cerca
se repelen fuertemente. Para
mantenerlos juntos, se establecen
uniones de alta energía entre los
fosfatos, por lo tanto, cuando la
molécula se hidroliza la energía se
libera. Del mismo modo para
sintetizar una molécula de ATP se
requiere energía.
 Nucleótidos libres o
no nucleicos

• NAD+ y NADP+: (nicotinamida adenina

dinucleótido y nicotinamida adenina
dinucleótido fosfato). Son coenzimas que
intervienen en las reacciones de oxido-
reducción, son moléculas que transportan
electrones y protones. Intervienen en
procesos como la respiración y la
fotosíntesis.
 Ácidos nucleicos
• Los ácidos nucleícos son cadenas
de nucleotidos unidos por enlaces
covalentes.

• Dichas uniones covalentes se

denominan uniones fosfodiéster.
El grupo fosfato de un nucleótido
se une con el hidroxilo del carbono
5’ de otro nucleótido, de este
modo en la cadena quedan dos
extremos libres, de un lado el
carbono 5’ de la pentosa unido al
fosfato y del otro el carbono 3’ de
la pentosa.
 Ácidos nucleicos
• Los grupos hidroxilo de los residuos
de las pentosas forman puentes de
hidrógeno con el agua.

• Los grupos fosfato con un pka

cercano a 0, se encuentran
completamente cargados
negativamente a pH 7.

• Las cargas negativas se encuentran

generalmente neutralizadas por
proteínas, iones metálicos o
poliaminas.
 Ácido desoxirribonucleico
ADN
• Se encuentra en los
núcleos celulares
(Cromatina) de
célunas eucariotas.
También hay una
pequeña cantidad en
la mitocondria y
cloroplasto. En
bacterias se
encuentran en el
citoplasma.

Todas las células de un organismo contienen igual contenido de ADN

excepto los gametos.

No se modifican por la edad ni por factores ambientales o

nutricionales.
 ADN
El ADN posee cuatro tipos de nucleotidos que reciben su nombre de acuerdo
al tipo de base nitrogenadaque contienen: las que están formadas por un
doble anillo de purina, adenina (A) y guanina (G); y las que están formadas
por un anillo sencillo de pirimidina y que son de menor tamaño, citosina (C) y
timina (T).

Las bases nitrogenadas

de los nucleótidos del
ARN son: adenina,
citosina y guanina;
pero carecen de timina,
que es reemplazada
por el uracilo (U).
 ADN
• El modelo de Watson y Crick, describe a la molécula del ADN como una
doble hélice, enrollada sobre un eje, como si fuera una escalera de caracol
y cada diez pares de nucleótidos alcanza para dar un giro completo.

• El ADN es una doble hélice con las bases dirigidas hacia el centro,
perpendiculares al eje de la molécula (como los peldaños de una escalera
de caracol) y las unidades de azúcar fosfato a lo largo de los lados de las
hélices (como las barandas de una escalera de caracol).
 ADN
Este enfrentamiento
se realiza siempre
entre una base púrica
con una pirimídica, lo
que permite el
mantenimiento de la
distancia entre las dos
hebras. La Adenina se
une con la timina
formando dos
puentes de hidrógeno
y la citosina con la
guanina a través de
tres puentes de
hidrógeno.
 ADN
Las hebras son antiparalelas, pues una de ellas tiene sentido 5’ a 3’, y la otra
sentido 3’ a 5’. Y son complementarias.
 Factores que estabilizan
la doble hélice
• Los puentes de hidrógeno entre las bases tienen un papel muy importante
para estabilizar la doble hélice, si bien individualmente son débiles hay un
número extremadamente grande a lo largo de la cadena.

Las interacciones
hidrofóbicas entre las
bases también
contribuyen con la
estructura (apilamiento
de las bases).

Los grupos fosfatos que se

encuentran en el exterior
de la doble hélice pueden
reaccionar con el agua
aportando mayor
estabilidad.
 ARN
• El ARN es una molécula de una sola hebra, el ARN adquiere su nombre
dependiendo de su función, y existen:

- ARN mensajero (ARNm),

- ARN de transferencia (ARNt)
- ARN ribosomal (ARNr)
- Otros: ARNi

Todas estas moléculas están involucradas en la producción de proteínas para

las que codifica el ADN.
ARN
 ARNm
• Codifican las cadenas polipeptídicas

• En células ecuarioticas el ADN se encuentra en el núcleo y la síntesis de

proteínas ocurre en los ribosomas que se enuentran en el citoplasma.

Por lo tanto, se requiere

de una molécula que
lleve la información
genética desde el núcleo
a los ribosomas, un
mensajero.

El proceso de copia del

molde desde el ADN al
ARNm se donomina
transcripción.
 RNAt
• Actúan como moléculas
adaptadoras en la síntesis
proteica.

• Poseen en un extremo una unión

covalente don un aminoácido.

• Se aparean con el RNAm de tal

forma que los aminoácidos se
unen a la cadena polipeptídica en
proceso de creciemiento con la
secuencia correcta.
 ARNr
• Son componentes de de los ribosomas junto
con algunas proteínas.
• Lugar donde se unen los aminoácidos.
 Estructura de los RNA
• Monohebras tienden a formar
un estructura tridimensional
helicoidal determinada por las
interacciones de apilamiento.

• Secuencias complementarias
darán lugar a estructuras más
complejas.

• Se forman bucles de horquillas

cuando hay secuencias
autocomplementarias cercanas
en la hebra de RNA (tipo de
estructura secundaria más
común)
 Química de los
ácidos nucleicos
• El ADN posee una estabilidad intrínseca, sus
transformaciones son muy lentas.
• La estabilidad es muy importante ya que cualquier
alteración puede tener consecuencias fisiológicas
importantes.
• Calor y valores extremos de pH desnaturalizan el DNA.
• La desnaturalización no rompe los enlaces covalentes,
rompe los enlaces de hidrógeno y las interacciones de
apilamiento y por lo tanto su estructura de doble
hélice, dando origen a dos hebras separadas.
 Química de los
ácidos nucleicos
• Renaturalización, cuando la temperatura o el pH dentro de los margenes
fisiológicos, los segmentos parcialmente separados vuelven a enrrollarse o a
hibridar.

• Si estan completamente separados, la renaturalización ocurre en dos pasos:

- Las hebras se reconocen al azar (lento).
- Las bases se comienzan a aparear como una cremallera hasta formar la doble
hélice.

• Cada especie de DNA tiene una temperatura de desnaturalización caratcerística

(tm) o temperatura de fusión. Cuanto mayor es el contenido G≡C mayor es la
temperatura de fusión.

• Mutaciones: alteraciones en la estructura del ADN que dan lugar a cambios

permanentes en la información genética codificada por la molécula. (UV, rayos X,
agentes químicos)
 Descubrimientos
importantes
• 1953 :
- James Watson y Francis Crick dedujeron la
estructura de doble hélice del DNA y
propusieron la base para deducir su
replicación.
- Frederick Sanger resolvió la secuencia de
aminoácidos de las cadenas polipetídicas de la
insulina. Pronto se deduciría que ésta secuencia
estaba relacionada con la de los ácidos
nucleicos (10 años).
 Ejemplo práctico
• En muestras aisladas de dos especies
bacterianas no identificadas, X e Y, la adenina
representa el 32% y el 17% respectivamente
del total de las bases.
• ¿Qué proporciones relativas de adenina,
guanina, timina y citosina esperaría encontrar
en las dos muestras de DNA?
• Una de las bacterias fue aislada de una fuente
termal ¿Cuál podría ser la bacteria termófila?
 Secuenciación Sanger
• https://www.youtube.com/watch?v=oeJoTZC
RrvU

Se usa hasta el día de hoy para secuenciar

secuencias cortas de ADN.

Otras técnicas modernas: Illumina , Nanopore.

 CRISPR
• https://www.youtube.com/watch?v=MnYppm
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