MA526 - S12 - S22 - Lectura - Genética Molecular

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MA526 Biología Ambiental

Unidad 3 – Tema 5
Biología Molecular

H05.1 Replicación del ADN: describe el proceso de


replicación del ADN
H05.2 Transcripción: describe el proceso de transcripción del
ADN
H05.3 Traducción y Código genético: resuelve problemas
sobre expresión genética en células eucariontes

DOGMA CENTRAL

Bases Moleculares de la Herencia

En el ADN, el fosfato de cada nucleótido


(monómero) se une al azúcar siguiente y forma un
“esqueleto” de fosfato y azúcares alternados
desde la que se proyectan las bases. La cadena
de polinucleótidos tiene direccionalidad, desde el
extremo 5´ (con el grupo fosfato) hacia el extremo
3´ (con el grupo -OH). 5´ y 3´se refieren a los
números asignados en los carbonos del anillo del
azúcar. Recuerda que la hebra 5´→ 3´ es
conocida como la hebra codante; mientras que la
hebra con dirección 3´→ 5´ se llama hebra molde
o no codante. Las bases nitrogenadas de la doble
hélice están apareadas de la siguiente manera:
adenina con timina (A – T) y guanina con
citosina (G – C). En 1956, Francis Crick
denominó dogma central al flujo de información
genética que sigue la siguiente secuencia:

Sin embargo, actualmente se han determinado mecanismos, que vienen a ser las
excepciones del dogma central, como:
- Enzimas que sintetizan ADN a partir de ARN ➔ Transcriptasa reversa
- Ribozimas: ARN con actividad catalítica, es decir, comportamiento de enzimas.
- Priones, proteínas que producen enfermedades degenerativas.
1. Replicación del ADN
La replicación de ADN ocurre en la fase S del ciclo celular. Sus características son las
siguientes: semiconservativa: porque cada molécula de ADN es la mitad “vieja” y la otra
mitad “nueva”; semidiscontinua: porque la hebra antiparalela (3´→5´) se sintetiza

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mediante fragmentos de Okasaki; bidireccional: porque se sintetizan ambas hebras de las
dos direcciones.

1.1 Orígenes de replicación: la


replicación de una
molécula de ADN
comienza en sitios
especiales llamados
orígenes de replicación.
Las proteínas que inician la
replicación del ADN
reconocen la secuencia de
los orígenes de replicación
y se fijan al ADN,
separando las dos
cadenas y abriendo una
“burbuja” de replicación. La
replicación del ADN
progresa entonces en
ambas direcciones hasta
que se copia la molécula
entera. En las células
eucariontes, pueden existir
miles de orígenes de
replicación. Se forman
múltiples burbujas de replicación que eventualmente se fusionan, acelerando, de este
modo, la copia de las moléculas de ADN muy largas.

1.2 Inicio de la síntesis de ADN: para iniciar la síntesis de ADN se necesita de un segmento
corto llamado cebador que es un segmento corto de ARN con extremo 3´ libre y es
sintetizado por la enzima primasa. Los cebadores tienen por lo general de 5 a 10
nucleótidos de largo. Luego la ADN polimerasa añade un nucleótido de ADN al extremo
3´del cebador de ARN y continúa agregando nucleótidos a la cadena de ADN en
crecimiento de acuerdo con las reglas de apareamiento de bases (A – T y G – C). Estos
cebadores de ARN son reemplazados por ADN gracias a otro tipo de ADN polimerasa.

1.3 Elongación de la cadena nueva de ADN: la elongación o crecimiento de una cadena


nueva de ADN en la horquilla de replicación se cataliza por enzimas denominadas ADN
polimerasas. La velocidad de elongación es de alrededor de 500 nucleótidos por
segundo en las bacterias y 50 por segundo en las células humanas. En la bacteria E.
coli participan en la replicación dos ADN polimerasas diferentes: ADN pol I y ADN pol

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III. En los eucariontes es más complejo, existen al menos 11 tipos de ADN polimerasas
diferentes, que funcionan bajo los mismos principios generales.

1.4 Elongación de la hebra antiparalela: las ADN polimerasas solo agregan nucleótidos al
extremo 3´ libre de una cadena de ADN en crecimiento, nunca al extremo 5´. Entonces,
a partir de la hebra codante (5´→ 3´) se sintetiza, iniciando por el extremo 3´, una hebra
hija 5´→ 3´. Sin embargo, a partir de la hebra molde (3´→ 5´), en lugar de iniciar la
síntesis desde el extremo 5´, la síntesis se realiza mediante fragmentos en la misma
dirección. Estos fragmentos se conocen como fragmentos de Okazaki y son unidos
mediante otra enzima, la ADN ligasa. En el caso de los fragmentos de Okazaki, cada
fragmento tiene su propio cebador.

1.5 Otras proteínas que participan en la replicación del ADN: hasta ahora hemos visto a la
ADN polimerasas, la ligasa y la primasa. Sin embargo, también participan otros tipos
como la helicasa, la topoisomerasa y las proteínas de unión a cadenas únicas. La
helicasa es una enzima que desenrolla la doble hélice en la horquilla de replicación y
la topoisomerasa ayuda a aliviar esa tensión. Después de que la helicasa separa las
dos hebras parentales, las moléculas de la proteína de unión cadena simple (SSB)
se unen a las cadenas desapareadas del ADN para estabilizarlas.

1.6 Reparación del ADN: existe una tasa de error de uno en 100 000 pares de bases
durante la replicación del ADN. En la reparación de errores de apareamiento, las
células emplean enzimas especiales, llamadas nucleasas, para corregir los
nucleótidos apareados incorrectamente. Las moléculas de ADN están expuestas de
manera constante a agente químicos y físicos potencialmente nocivos. Los reactivos
químicos (en el ambiente y los que se producen de forma natural en la célula), las
emisiones radioactivas, los rayos X y la luz UV pueden modificar los nucleótidos de un
modo que puede afectar a la información genética codificada, por lo general, de manera
adversa. Además, las bases del ADN a menudo sufren cambios químicos espontáneos
en condiciones celulares normales. Por suerte, estos errores se corrigen antes que se
conviertan en mutaciones perpetuas aprovechando la estructura de bases apareadas.

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H05.1: Describe el proceso de replicación del ADN
Ejemplo resuelto:
¿Cuál es la base para la diferencia en la forma en que se sintetizan las moléculas
de ADN de las hebras adelantada y retrasada?

a. Los orígenes de replicación se producen solo en el extremo 5´


b. Las helicasas y las proteínas de unión a una cadena única actúan en el extremo

c. La ADN polimerasa solo puede unir nuevos nucleótidos en el extremo 3´de una
cadena de crecimiento
d. La ADN ligasa solo actúa en la dirección 3´→ 5´
e. La polimerasa solo puede actuar sobre una cadena a la vez

Bioactividad 1
Complete las casillas en blanco en cuanto a la replicación

Enzima Función

Elonga la nueva cadena de ADN a partir de la horquilla formada

Nucleasa

Alivia la tensión originada por el desenrrollamiento de las Helicasas,


rompiendo, girando y uniendo de nuevo las cadenas de ADN.

Ligasa

Se encarga de la síntesis del segmento iniciador de la síntesis de


ADN

1. Transcripción
La transcripción es la síntesis del ARN mensajero (mARN) a partir de la hebra molde
(3´→5´) del ADN. Recordemos que el ARN es un polímero cuyos monómeros o nucleótidos
contienen: A, G, C, U, ribosa y fosfato. La transcripción se inicia cuando una enzima
denominada ARN polimerasa separa las dos cadenas del ADN y engancha los nucleótidos
de ARN entre sí a medida que aparean sus bases a lo largo del molde de ADN. Las ARN
polimerasas solo pueden ensamblar un polinucleótido en la dirección 5´→3´. Las ARN
polimerasas no necesitan cebador.

El ADN tiene secuencias específicas de nucleótidos que indican en dónde comienza y


termina la transcripción de un gen. De esta manera, se denomina promotor a la secuencia
del ADN donde se fija la ARN polimerasa e inicia la transcripción. Se llama unidad de
transcripción al segmento de ADN que se transcribe en una molécula de ARN. Las
bacterias tienen un solo tipo de ARN polimerasa que sintetiza no solo el mARN sino también
otros tipos de ARN que actúan en la síntesis proteica. En cambio, los eucariontes tienen
tres tipos de ARN polimeras en su núcleo, numeradas I, II y III. El que se emplea para la
síntesis del mARN es la ARN pol II. Los otros dos tipos transcriben moléculas de ARN que
no se traducen en proteínas.

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La transcripción tiene tres etapas: iniciación, elongación y terminación de la cadena de
ARN. En la iniciación, el promotor de las células eucariontes cosiste de un conjunto de
proteínas llamados factores de transcripción al cual se une la ARN pol II para iniciar la
síntesis del mARN. Este promotor consta de una secuencia llamada caja TATA. En la
elongación, a medida que la ARN pol II se mueve a lo largo del ADN, continúa
desenrollando la doble hélice y expone de 10 a 20 bases de ADN a la vez para el
apareamiento con nucleótidos de ARN. La enzima añade nucleótidos al extremo 3´de la
molécula de ARN en crecimiento. Luego la nueva molécula o hebra de ARN se despega
de su molde de ADN y la doble hélice se regenera. En los eucariontes, la transcripción
avanza a una velocidad de 60 nucleótidos por segundo. El mecanismo de terminación es
diferente entre procariontes y eucariontes. En lo procariontes, existe una secuencia simple
llamada terminador.

Sin embargo, en los eucariontes se requiere de una secuencia de señalización de


poliadenilación (AAUAAA) en dirección 3´que permite el desprendimiento del ARN. Este
ARN liberado se conoce como pre-mARN (ARN inmaduro).

Maduración del pre-mARN: para la maduración del pre-mARN se requiere que ocurran los
tres eventos siguientes:
- Añadir un cap 5' al inicio del ARN
- Añadir una cola de poli-A (cola de nucleótidos A) al final del ARN
- Cortar y quitar los intrones, o secuencias "inútiles", y pegar las secuencias restantes,
las buenas (exones)

El cap 5' o capuchón 5´se agrega al primer nucleótido del pre-mARN durante la
transcripción. El cap 5´es un nucleótido modificado de guanina (G) que protege al pre-
mARN de la degradación. También ayuda al ribosoma a unirse al mARN y a comenzar a
leerlo para hacer una proteína. El extremo 3' del pre-mARN contiene una secuencia
llamada señal de poliadenilación que contiene de 100 - 200 nucleótidos de adenina (A),
formando una cola de poli-A. La cola le brinda al transcrito mayor estabilidad y lo ayuda a
ser exportado del núcleo hacia el citosol.

El pre-mARN contiene secuencias llamadas intrones y exones. Los exones son los que
sirven para la posterior síntesis de proteínas y los intrones podrían brindar algunos
beneficios como diversificar la producción de proteínas de un solo gen. Los intrones son
eliminados por una unidad llamada esplicesoma el cual también une los exones entre sí..

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Si el esplicesoma no elimina un intrón se producirá una proteína errónea durante la
traducción.

H05.2: Describe el proceso de transcripción del ADN


Ejemplo resuelto:
¿Cuál de las siguientes afirmaciones siguientes no es verdadera para el
procesamiento del ARN?

a. Los exones se cortan antes de que el mARN abandone el núcleo


b. Los nucleótidos se pueden añadir en ambos extremos del ARN
c. Las ribozimas pueden actuar en el corte y empalme del ARN
d. El corte y empalme del ARN puede ser catalizado por los esplicesomas

Explicación: las ribozimas no participan en el procesamiento del ARN

Bioactividad 2: en las células eucariontes, la transcripción no puede empezar


hasta que:
a. Las dos cadenas de ADN se separan completamente y se exponen al promotor
b. Varios factores de transcripción se unen al promotor
c. Se remueven los casquetes 5´del mARN
d. Se eliminan los intrones del ADN de la cadena molde
e. Las ADN nucleasas aislaron la unidad de transcripción

2. Traducción y Código genético

El Código genético es el lenguaje de la genética y contiene las secuencias 5’→3’ del ARN
mensajero. Está formado por A, U, G, y C que representan a las bases nitrogenadas
adenina, timina, guanina y citosina. Se lee en grupos de 3 nucleótidos denominados
tripletes o codones. Los codones están escritos en dirección 5’→3’ porque se sintetizan a
partir del ADN molde. El código genético es degenerado, porque un mismo aminoácido
puede estar codificado por más de un codón o triplete. El código genético no es ambiguo:

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ningún codón especifica más
de un aminoácido. Es casi
universal, ya que es el mismo
en procariotes y eucariotes,
salvo en algunos codones de
la mitocondria y algunas
especies. Cada tres bases
consecutivas dan lugar a un
aminoácido; como son 4
bases nitrogenadas y 20
aminoácidos entonces puede
haber 64 (es decir, 43)
palabras posibles, más que
suficientes para codificar
todos los aminoácidos. Por
ejemplo: 5´-UGG-3´es el
codón que codifica para el
aminoácido triptófano.

En el mecanismo de traducción participan tres tipos de ARN que se unen para iniciar la
síntesis de proteínas:
- El ARN mensajero sintetizado en la transcripción y que madura en el citoplasma
- El ARN ribosomal sintetizado en el nucleólo y ensamblado en el citoplasma. El ARN
ribosomal es el ribosoma propiamente dicho.
- El ARN de transferencia que se encuentra en el citoplasma.

4.1 ARN de transferencia (tARN): el tARN se sintetiza en el núcleo y debe viajar a través
de éste hasta el citoplasma, donde se produce la traducción. Tanto en células
procariontes como eucariontes, cada molécula de tARN se utiliza de forma repetida.
Su función es tomar el aminoácido designado en el citosol, depositar su carga en el
ribosoma y luego abandonar el ribosoma para tomar otro aminoácido. Una molécula de
tARN se parece a una hoja de trébol, pues se tuerce y se pliega en una estructura
tridimensional compacta. El tARN posee el anticodón, que viene a ser el triplete de
bases que lo une a un codón específico del mARN. El extremo 3´constituye el sitio de
fijación para un aminoácido.

4.2 Ribosomas (ARN ribosomal asociado a proteínas): los ribosomas facilitan el


acoplamiento específico de los anticodones del tARN con los codones del mARN

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durante la síntesis proteica. Un ribosoma está compuesto por dos subunidades,
llamadas grande y pequeña. En los eucariontes, las unidades se fabrican en el nucleólo
y salen por los poros nucleares para ensamblarse en el citoplasma

4.3 Construcción de un polipéptido: la traducción presenta tres etapas: iniciación,


elongación y terminación.. En la iniciación, la subunidad ribosómica pequeña se une
con el mARN y con un tARN iniciador específico que lleva el aminoácido metionina. La
subunidad pequeña luego se mueve, o barre, en dirección 3´a lo largo del mARN hasta
que alcanza el codón de iniciación, AUG, que señala el comienzo de la traducción;
Finalmente, se une la subunidad ribosómica grande, completando un complejo de
iniciación de la traducción.

En la elongación de la traducción, los aminoácidos se añaden uno a uno al precedente.


El mARN se mueve a través del ribosoma solo en dirección 5´→ 3´ codón por codón.
El ciclo de elongación dura menos de un décimo de segundo en los procariontes y se
repite cada vez que se añade un aminoácido a la cadena hasta completar el
aminoácido.

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En la terminación de la traducción un codón de detención (stop) indica el fin de la
síntesis del polipéptido. Los tripletes de bases UAG, UAA y UGA no codifican
aminoácidos, sino que actúan como señales para detener la traducción. Esta es una
señal que disocia el complejo de traducción.

H05.3: Resuelve problemas sobre expresión genética en células


eucariontes
Ejemplo resuelto:
Complete el siguiente cuadro usando el código genético para los aminoácidos:
Doble hebra de 5´ C C A T G G C G T T C T 3´
ADN 3´ G G T A C C G C A A G A 5´
mARN codón 5´ C C A U G G C G U U C U 3´
tARN 3´ G G U A C C G C A A G A 5´
anticodón
Aminoácido Pro Trp Arg Ser
El cuadro está resuelto con el color rojo. El cuadro original solo tenía la información en
color negro

Bioactividad 3: Complete el siguiente cuadro haciendo uso del código genético


para los aminoácidos y siguiendo como ejemplo el ejercicio resuelto:
Doble hebra de 5´ A A A T G C G G C C T T T C C A A C G G C 3´
ADN
mARN codón
tARN
anticodón
Aminoácido

Actividad para trabajar en clase:


Dada la siguiente secuencia de aminoácidos, complete el siguiente cuadro:
Doble hebra de ADN 5´ 3´

mARN codón
tARN anticodón
Aminoácido Met Pro Thr Ile Ala Stop

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1. 0 de ARN, indique en los recuadros el nombre correspondiente y la función que
realizan

2. Acerca del código genético, marque la alternativa incorrecta:


a. Son las instrucciones contenidas en un gen para fabricar una proteína
específica.
b. Los tripletes o codones, son la forma de lectura del código genético
c. Una vez conocida la estructura del ARN se descifró el código
d. A, T, G, y C son las "letras" que representan a las bases nitrogenadas: adenina,
timina, guanina y citosina, respectivamente.
e. Ninguna de las anteriores.

3. Acerca de las características de un codón, marque la alternativa correcta:


a. Codón es un triplete de nucleótidos que codifica para un determinado
aminoácido.
b. Los codones están escritos en dirección 5’→3’.
c. El código genético es degenerado, porque un mismo aminoácido puede estar
codificado por más de un codón o triplete.
d. El código genético no es ambiguo: ningún codón especifica más de un
aminoácido.
e. Todas las anteriores

4. Se dice que el código genético es degenerado debido a que:


a. un aminoácido puede ser codificado por varios codones
b. un aminoácido es codificado por un solo codón.
c. un aminoácido resulta de la mutación de un codón.
d. un aminoácido no es movilizado por el ARN de transferencia

5. Es la enzima encargada de transcribir el ADN:


a. ADN polimerasa
b. Helicasa
c. topoisomerasa
d. ARN polimerasa

6. En la replicación, acerca de la enzima primasa y su función en la hebra retrasada:


a. Une los fragmentos de Okazaki
b. Alarga el fragmento de Okazaki y lo añade al cebador
c. Sintetiza un cebador de ARN en el extremo 5´de cada fragmento de Okazaki
d. Elimina el cebador del extremo 5´de cada fragmento de Okazaki

7. Si una proteína tiene 300 aminoácidos, ¿cuántos nucleótidos debe tener el ARN
mensajero que interviene en su biosíntesis?

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a. 100
b. 900
c. 200
d. 600

8. Son excepciones al Dogma Central de la Biología Molecular, excepto:


a. Priones
b. Ribozimas
c. Virus
d. Transciptasa reversa

9. Marque la alternativa que contenga la hebra complementaria de un segmento de ADN


con la siguiente secuencia:
5´AGCGCATAGCAA 3´
a. 3´AGCGCAUAGCAA5´
b. 5´ TCGCGTATCGTT 3´
c. 3´ AACGATACGCGA 5´
d. 3´TCGCGTATCGTT 5´

10. ¿Cuál de las afirmaciones siguientes no es verdadera para el procesamiento y


maduración del mARN?
a. Los exones se cortan antes de que el mARN abandone el núcleo
b. Los nucleótidos se pueden añadir en ambos extremos del ARN
c. Las ribozimas pueden actuar en el corte y empalme del ARN
d. El corte y empalme del ARN puede ser catalizado por los esplicesomas
e. Un transcrito primario a menudo es más largo que la molécula final del ARN
que deja el núcleo

11. ¿Cuál de las siguientes opciones ilustra mejor el dogma central de la biología en
términos de cómo una célula produce proteínas? Encierre en un círculo

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