La Matriz de La Vida

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Resumen La matriz de la vida: Interacciones dbiles en un medio acuoso Las macromolculas de la vida son estructuras inmensas que se mantienen

unidas mediante enlaces covalentes fuertes. El enlace covalente por si solo no puede describir la complejidad de la estructura molecular en la biologa. Fuerzas no covalentes o enlaces no covalentes, que se producen entre iones, molculas y partes de las molculas. El DNA se mantiene por enlaces covalentes, tiene tambin una estructura tridimensional muy especifica . Cada protena esta formada por aminocidos unidos covalentemente, las protenas interactan con otras o con el DNA para formar las clulas, tejidos y los organismos complejos. Los enlaces no covalentes relevantes en biologa son de 10 a 100 veces ms dbiles. Si queremos entender la vida, debemos conocer las interacciones no covalentes, debemos saber cmo se comportan estas interacciones en un medio acuoso. El agua es el componente principal de los organismos: en la mayora de los casos representa el 70% o mas de su peso total. Naturaleza de las interacciones no covalentes. Las molculas y los iones pueden interactuar de forma no covalente de varios modos, son fundamentalmente de naturaleza electrosttica. Interacciones carga-carga. La interacciones no covalente mas sencilla es la interaccin electrosttica entre un par de partculas cargadas. El DNA y las protenas, tienen una carga neta. Clases de interacciones no covalentes: a) El dipolo inducido b) Las fuerzas de dispersin La ley de Coulomb expresa que una fuerza, es decir, es una descripcin cuantitativa de una interseccin, la energa de interseccin se trata de la energa necesaria para separar dos partculas cargadas desde una distancia r a una distancia infinita, superando la fuerza electroesttica. Interacciones de dipolos permanentes e inducidos. Las molculas que no tienen carga neta pueden tener una distribucin interna asimtrica de la carga, una molcula as se denomina polar, o dipolo permanente. En las molculas con una forma mas compleja, como el agua, el momento dipolar es una suma de vectores de los momentos a lo largo de los enlaces. En el entorno acuoso de una clula, un dipolo permanente puede ser atrado por un ion cercano, para que la interaccin sea fuerte, un par de dipolos permanentes deben estar bastante cerca. Las molculas que no tienen momentos dipolares permanentes pueden transformarse en dipolares si se encuentran en un campo elctrico, este puede producirse

mediante una partcula cercana con carga o dipolar, se dice que es polarizable cuando se le puede inducir un dipolo del modo descrito. Incluso dos molculas son carga neta ni momento dipolar permanente pueden atraerse mutuamente si estn lo bastante cerca, cuando dos molculas se acercan mucho, sincronizan las fluctuaciones de sus cargas produciendo una fuerza de atraccin neta, estas se denominan fuerzas de dispersin, estas solo son a muy corto alcance, Las fuerzas intermoleculares e intermoleculares bastante dbiles suelen designarse como fuerzas de van del Waals. Repulsin molecular en distancias muy reducidas: radio de Van Der Waals Cuando las molculas o los tomos que no tienen enlaces covalentes entre ellos se acercan tanto que sus orbitales electrnicos mas externos empiezan a solaparse, existe una repulsin mutua. Esta repulsin aumenta muy rpidamente a mediad que la distancia entre sus centros. Si combinamos esta energa de repulsin con una o mas de las clases de energa de atraccin descritas anteriormente, vemos que la energa total de la interaccin no covalente de una pareja de tomos, molculas o iones cambiara segn la distancia que los separa. Esta distancia define el denominado radio de van der Waals, R, el radio eficaz para el empaquetamiento molecular mas cercano. Las molculas reales, por supuesto, no son objetos esfricos, puesto que las molculas biolgicas grandes tienen todas formas complejas. Enlaces de hidrogeno El enlace de H, tiene una gran importancia en bioqumica. La estructura y las propiedades de muchas molculas biolgicas as como las del agua, el disolvente biolgico universal, estn determinadas en gran medida por este tipo de enlace. Un enlace de H es una interaccin entre un tomo de H unido covalentemente a un grupo donador y un par de electrones libres perteneciente a un grupo aceptor. La capacidad de un tomo para actuar como donador de enlace de H depende en gran medida a su electronegatividad. Cuanto ms electronegativo es el tomo donador, mas carga negativa extrae del H al cual esta enlazado. Solo el O y el N las electronegatividades adecuadas para comportarse como donadores fuertes. El enlace de H comparte algunas propiedades tanto con las interacciones covalentes como con las no covalentes. En parte, es como una interaccin carga-carga entre carga positiva parcial del H y la carga negativa del par de electrones. El enlace de H completo, incluyendo el enlace covalente con el N, tiene una longitud aproximada de 0.29 nm. La energa de los enlaces de H es notablemente superior a la de la mayora de los otros enlaces no covalentes. Los enlaces de H, al igual que los enlaces covalentes, son altamente direccionales: el enlace de H donador tiende a apuntar directamente hacia el par de electrones aceptadores. Las diferentes clases de integraciones no covalente que hemos descrito son dbiles de forma individual, pero cuando se encuentran presentes muchas de ellas en una determinada macromolcula, sus energas pueden dar una suma total impresionante. De esta forma, estas interacciones pueden explicar la estabilidad de las estructuras macromoleculares. Misin del agua en los procesos biolgicos

Los procesos qumicos y fsicos de la vida requieren que las molculas puedan desplazarse, encontrarse e intercambiar parejas continuamente en los procesos complicados del metabolismo y de la sntesis. Un entorno lquido permite una movilidad molecular. Estructura y propiedades del agua El agua se trata de una sustancia muy particular, otros compuestos de similar peso molecular, muestra un hecho destacable. La mayora de estos compuestos de peso molecular bajo son gases a temperatura ambiente y tienen puntos de ebullicin muy inferiores al agua. Dos de los seis electrones de los orbitales mas externos del tomo de oxigeno intervienen en los enlaces covalentes como los H. los cuatro electrones restantes estn en pares no enlazados, que son excelentes aceptadores de enlaces de H. En consecuencia, la evaporacin del agua requiere una cantidad de energa excepcional para una molcula de su tamao. Por consiguiente, el calor de evaporacin como el punto de ebullicin del agua es excepcionalmente elevado. Cuando el agua se congela, los enlaces de H entre las molculas de agua pasan a ser ms regulares y mejor definidos. Se ha descrito la estructura del agua lquida como agrupaciones parpadeantes de enlaces de H, el agua en estado liquido tiene mayor densidad que en estado slido. Si el agua lquida a 0 grados centgrados fuera un 9% menos densa de lo que es, la vida difcilmente hubiera podido evolucionar, puesto que en este caso el hielo se hundira. El agua como disolvente Los procesos vitales requieren que una gran variedad de iones y molculas se muevan en proximidad, es decir, que sean solubles en un medio comn. El agua funciona como disolvente universal en los medios intracelular y extracelular. Las molculas hidrfilas en una disolucin acuosa Las molculas con grupos capaces de formar enlaces de H tienden a unirse con el agua con este tipo de enlace, el agua es un disolvente excelente para los compuestos inicos. Las interacciones de los dipolos del agua con los cationes y los aniones en una disolucin acuosa hacen que los iones se hidraten. La naturaleza dipolar de la molcula de agua favorece tambin la capacidad del agua para disolver las molculas orgnicas no inicas. Las molculas hidrfobas en una disolucin acuosa La solubilidad de las sustancias hidrfilas depende de su interaccin energticamente favorable con las molculas de agua. Por lo tanto, no es extrao que las sustancias como los hidrocarburos, que son no polares y no inicos y que no pueden formar enlaces de H, muestren solo una limitada solubilidad en el agua. Las molculas anfipaticas en una disolucin acuosa

Existe una clase de molculas muy interesantes e importantes que muestra propiedades hidrfilas e hidrfobas al mismo tiempo. Las molculas anfipaticas tienen un grupo de cabeza muy hidrfilo, acoplado a una cola hidrfoba, generalmente un hidrocarburo.

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