La saison 1940 du Championnat du Pérou de football est la douzième édition du championnat de première division au Pérou. Les huit clubs participants sont regroupés au sein d'une poule unique où ils s'affrontent deux fois au cours de la saison, à domicile et à l'extérieur. À la fin de la compétition, les deux derniers du classement disputent un mini-tournoi de promotion-relégation (Liguilla de promoción) avec les deux premiers du championnat de 2e division. Les deux premiers de cette Liguilla de promoción accèdent à l'élite, les deux derniers sont relégués.
C'est le Deportivo Municipal qui remporte la compétition après avoir terminé en tête du classement final du championnat, avec deux points d'avance sur un duo composé du tenant du titre, Universitario de Deportes et du promu, Alianza Lima. C'est le deuxième titre de champion du Pérou de l'histoire du club après celui obtenu en 1938.
Un mini-championnat est organisé entre les deux derniers au classement général du championnat et les deux premiers du championnat de 2e division. Les deux premiers de cette Liguilla de promoción accèdent à l'élite (ou se maintiennent suivant le cas).