พับเมด
ฐานข้อมูลชีวการแพทย์ออนไลน์

พับเมด
ติดต่อ
ศูนย์วิจัยห้องสมุดการแพทย์แห่งชาติของสหรัฐอเมริกา (NLM)
วันที่วางจำหน่ายมกราคม 2539 ; 28 ปีที่ผ่านมา ( 1996-01 )
เข้าถึง
เว็บไซต์สำนักพิมพ์ pubmed.ncbi.nlm.nih.gov

PubMedเป็นฐานข้อมูล ฟรีซึ่งประกอบไปด้วย ฐานข้อมูลMEDLINE เป็นหลัก ซึ่ง เป็นฐานข้อมูลอ้างอิงและบทคัดย่อเกี่ยวกับวิทยาศาสตร์ชีวภาพและหัวข้อทางชีวการแพทย์ ห้องสมุดการแพทย์แห่งชาติของสหรัฐอเมริกา (NLM) ที่สถาบันสุขภาพแห่งชาติดูแลฐานข้อมูลนี้เป็นส่วนหนึ่งของระบบค้นหาข้อมูลEntrez [1]

ตั้งแต่ปีพ.ศ. 2514 ถึงพ.ศ. 2540 การเข้าถึงฐานข้อมูล MEDLINE ทางออนไลน์นั้นทำได้โดยผ่านสถานที่ของ สถาบันเช่นห้องสมุดมหาวิทยาลัย เป็นหลัก [2] PubMed เปิดตัวครั้งแรกในเดือนมกราคม พ.ศ. 2539 โดยเป็นจุดเริ่มต้นของยุคแห่งการค้นหาข้อมูล MEDLINE ที่บ้านและที่ทำงานโดยอิสระและเป็นส่วนตัว[3]ระบบ PubMed เปิดให้สาธารณชนใช้งานได้ฟรีตั้งแต่เดือนมิถุนายน พ.ศ. 2540 [2]

เนื้อหา

นอกจาก MEDLINE แล้ว PubMed ยังให้การเข้าถึง:

  • เอกสารอ้างอิงเก่าจากฉบับพิมพ์ของIndex Medicusย้อนหลังไปถึงปี 1951 และก่อนหน้านั้น
  • การอ้างอิงถึงวารสารบางฉบับก่อนที่จะมีการทำดัชนีใน Index Medicus และ MEDLINE เช่นScience , BMJและAnnals of Surgery
  • รายการล่าสุดในบันทึกสำหรับบทความก่อนที่จะถูกจัดทำดัชนีด้วยหัวข้อเรื่องทางการแพทย์ (MeSH) และเพิ่มใน MEDLINE
  • คอลเลกชันหนังสือที่มีทั้งเนื้อหาเต็มและชุดย่อยอื่นๆ ของบันทึก NLM [4]
  • การอ้างอิงPMC
  • ชั้นวางหนังสือ NCBI

บันทึก PubMed จำนวนมากมีลิงก์ไปยังบทความฉบับเต็ม ซึ่งบางส่วนสามารถเข้าถึงได้ฟรี มักจะอยู่ในPubMed Central [5]และมิเรอร์ท้องถิ่น เช่นEurope PubMed Central [ 6]

ข้อมูลเกี่ยวกับวารสารที่ทำดัชนีใน MEDLINE และเข้าถึงได้ผ่าน PubMed สามารถพบได้ใน NLM Catalog [7]

ณ วันที่ 23 พฤษภาคม 2023 [อัปเดต]PubMed มีการอ้างอิงและบทคัดย่อมากกว่า 35 ล้านรายการย้อนหลังไปถึงปี 1966 เฉพาะเจาะจงถึงปี 1865 และเฉพาะเจาะจงถึงปี 1809 ณ วันที่เดียวกัน[อัปเดต]บันทึกของ PubMed จำนวน 24.6 ล้านรายการแสดงรายการพร้อมบทคัดย่อ และบันทึก 26.8 ล้านรายการมีลิงก์ไปยังเวอร์ชันข้อความเต็ม (ซึ่งมีบทความ 10.9 ล้านบทความที่พร้อมให้ใช้งาน โดยเป็นข้อความเต็มฟรี) [8]ในช่วง 10 ปีที่ผ่านมา (สิ้นสุดวันที่ 31 ธันวาคม 2019) มีการเพิ่มบันทึกใหม่เฉลี่ยเกือบหนึ่งล้านรายการในแต่ละปี

ในปี 2559 NLM ได้เปลี่ยนระบบการจัดทำดัชนีเพื่อให้ผู้จัดพิมพ์สามารถแก้ไขข้อผิดพลาดในการพิมพ์และข้อผิดพลาดในบทความที่อยู่ในดัชนี PubMed ได้โดยตรง[9]

มีรายงานว่า PubMed รวมบทความบางบทความที่ตีพิมพ์ในวารสารล่าเหยื่อ นโยบายของ MEDLINE และ PubMed สำหรับการคัดเลือกวารสารเพื่อรวมไว้ในฐานข้อมูลนั้นแตกต่างกันเล็กน้อย จุดอ่อนในเกณฑ์และขั้นตอนสำหรับการสร้างดัชนีวารสารใน PubMed Central อาจทำให้สิ่งพิมพ์จากวารสารล่าเหยื่อรั่วไหลเข้าสู่ PubMed ได้[10]

ลักษณะเฉพาะ

การออกแบบเว็บไซต์

อินเทอร์เฟซ PubMed ใหม่เปิดตัวในเดือนตุลาคม 2009 และสนับสนุนการใช้การค้นหาแบบรวดเร็วคล้าย Google ซึ่งเรียกอีกอย่างว่าการค้นหาแบบ "โทรเลข" [11]ตามค่าเริ่มต้น ผลลัพธ์จะเรียงลำดับตามล่าสุด แต่สามารถเปลี่ยนเป็นตรงกันมากที่สุด วันที่ตีพิมพ์ ผู้เขียนคนแรก ผู้เขียนคนสุดท้าย วารสาร หรือชื่อเรื่องได้[12]

การออกแบบเว็บไซต์และโดเมนของ PubMed ได้รับการอัปเดตในเดือนมกราคม 2020 และกลายเป็นค่าเริ่มต้นในวันที่ 15 พฤษภาคม 2020 พร้อมด้วยฟีเจอร์ที่อัปเดตและใหม่[13]มีปฏิกิริยาเชิงวิพากษ์วิจารณ์จากนักวิจัยจำนวนมากที่ใช้เว็บไซต์นี้บ่อยครั้ง[14]

PubMed สำหรับเครื่องพกพา/อุปกรณ์เคลื่อนที่

สามารถเข้าถึง PubMed/MEDLINE ได้ผ่านอุปกรณ์พกพา โดยใช้ ตัวเลือก "PICO" (สำหรับคำถามทางคลินิกที่เจาะจง) ที่สร้างขึ้นโดย NLM เป็นต้น[15]นอกจากนี้ยังมีตัวเลือก "PubMed Mobile" ซึ่งให้การเข้าถึง PubMed เวอร์ชันที่ใช้งานง่ายและใช้งานบนมือถือได้[16]

การค้นหาแบบง่ายบน PubMed สามารถทำได้โดยการป้อนประเด็นสำคัญของหัวเรื่องลงในหน้าต่างค้นหาของ PubMed

PubMed แปลสูตรการค้นหาเบื้องต้นนี้และเพิ่มชื่อฟิลด์ เงื่อนไข MeSH (หัวข้อเรื่องทางการแพทย์) ที่เกี่ยวข้อง คำพ้องความหมาย ตัวดำเนินการบูลีน และ "ซ้อน" เงื่อนไขที่ได้อย่างเหมาะสม ทำให้สูตรการค้นหาดีขึ้นอย่างมาก โดยเฉพาะอย่างยิ่งโดยรวมคำในข้อความและเงื่อนไข MeSH เข้าด้วยกัน (โดยใช้ตัวดำเนินการ OR) เป็นประจำ[ จำเป็นต้องอ้างอิง ]

ตัวอย่างที่ให้ไว้ในบทช่วยสอน PubMed [17]แสดงให้เห็นถึงวิธีการทำงานของกระบวนการอัตโนมัตินี้:

สาเหตุที่ทำให้เกิดการเดินละเมอแปลว่า ("สาเหตุ"[หัวข้อย่อย] หรือ "สาเหตุ"[ทุกฟิลด์] หรือ "สาเหตุ"[ทุกฟิลด์] หรือ "ความเป็นเหตุเป็นผล"[เงื่อนไข MeSH] หรือ "ความเป็นเหตุเป็นผล"[ทุกฟิลด์]) และ ("อาการหลับไหล"[เงื่อนไข MeSH] หรือ "อาการหลับไหล"[ทุกฟิลด์] หรือ ("การนอนหลับ"[ทุกฟิลด์] และ "การเดิน"[ทุกฟิลด์]) หรือ "การเดินละเมอ"[ทุกฟิลด์])

เช่นเดียวกัน,

การป้องกันการโจมตีด้วยแอสไพรินแบบอ่อนแปลว่า ("กล้ามเนื้อหัวใจตาย"[เงื่อนไข MeSH] หรือ ("กล้ามเนื้อหัวใจ"[ทุกช่อง] และ "กล้ามเนื้อหัวใจตาย"[ทุกช่อง]) หรือ "กล้ามเนื้อหัวใจตาย"[ทุกช่อง] หรือ ("หัวใจ"[ทุกช่อง] และ "การโจมตี"[ทุกช่อง]) หรือ "หัวใจวาย"[ทุกช่อง])และ("แอสไพริน"[เงื่อนไข MeSH] หรือ "แอสไพริน"[ทุกช่อง])และ("การป้องกันและการควบคุม"[หัวข้อย่อย] หรือ ("การป้องกัน"[ทุกช่อง] และ "การควบคุม"[ทุกช่อง]) หรือ "การป้องกันและการควบคุม"[ทุกช่อง] หรือ "การป้องกัน"[ทุกช่อง])

ในการค้นหาที่เหมาะสมที่สุดใน PubMed จำเป็นต้องเข้าใจส่วนประกอบหลักของ PubMed ซึ่งก็คือ MEDLINE และโดยเฉพาะอย่างยิ่งคำศัพท์ที่ควบคุมโดย MeSH (Medical Subject Headings) ซึ่งใช้ในการสร้างดัชนีบทความ MEDLINE นอกจากนี้ ยังอาจต้องใช้กลยุทธ์การค้นหาที่ซับซ้อน การใช้ชื่อฟิลด์ (แท็ก) การใช้ข้อจำกัดอย่างเหมาะสม และคุณลักษณะอื่นๆ บรรณารักษ์อ้างอิงและผู้เชี่ยวชาญด้านการค้นหาให้บริการค้นหา[18] [19]

ขอแนะนำให้ค้นหาในหน้าต่างค้นหาของ PubMed เฉพาะสำหรับการค้นหาหัวข้อที่ชัดเจนหรือการแทรกแซงใหม่ๆ ที่ยังไม่มีการสร้างหัวข้อ MeSH รวมถึงการค้นหายาและคำนามเฉพาะในเชิงพาณิชย์ นอกจากนี้ยังมีประโยชน์เมื่อไม่มีหัวข้อที่เหมาะสมหรือตัวระบุแสดงถึงลักษณะบางส่วน การค้นหาโดยใช้พจนานุกรมคำพ้องความหมาย MeSH นั้นมีความแม่นยำมากกว่าและจะให้ผลลัพธ์ที่ไม่เกี่ยวข้องน้อยลง นอกจากนี้ยังช่วยประหยัดข้อเสียของการค้นหาข้อความอิสระซึ่งต้องคำนึงถึงการสะกดคำ เอกพจน์/พหูพจน์ หรือความแตกต่างแบบย่อ ในทางกลับกัน จะไม่พบบทความที่เพิ่งรวมเข้าในฐานข้อมูลซึ่งยังไม่ได้กำหนดตัวระบุ ดังนั้น เพื่อรับประกันการค้นหาที่ครอบคลุม จึงต้องใช้การรวมหัวเรื่องภาษาที่ควบคุมและเงื่อนไขข้อความอิสระ[20]

พารามิเตอร์บทความวารสาร

เมื่อบทความในวารสารได้รับการจัดทำดัชนี พารามิเตอร์ของบทความจำนวนมากจะถูกแยกออกมาและจัดเก็บเป็นข้อมูลที่มีโครงสร้าง พารามิเตอร์ดังกล่าวได้แก่ ประเภทบทความ (คำศัพท์ MeSH เช่น "การทดลองทางคลินิก") ตัวระบุรอง (คำศัพท์ MeSH) ภาษา ประเทศของวารสารหรือประวัติการตีพิมพ์ (วันที่ตีพิมพ์ทางอิเล็กทรอนิกส์ วันที่ตีพิมพ์วารสารฉบับพิมพ์)

ประเภทสิ่งพิมพ์: การสอบถามทางคลินิก/การทบทวนอย่างเป็นระบบ

พารามิเตอร์ประเภทสิ่งพิมพ์ช่วยให้สามารถค้นหาตามประเภทของสิ่งพิมพ์รวมถึงรายงานการวิจัยทางคลินิกหลายประเภท[21]

รหัสรอง

ตั้งแต่เดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2548 กระบวนการจัดทำดัชนีบทความของ MEDLINE จะดึงข้อมูลระบุตัวตนจากบทคัดย่อของบทความและนำไปใส่ไว้ในฟิลด์ที่เรียกว่า Secondary Identifier (SI) ฟิลด์ Secondary Identifier จะใช้เก็บหมายเลขเข้าถึงฐานข้อมูลต่างๆ ของข้อมูลลำดับโมเลกุล การแสดงออกของยีน หรือสารประกอบเคมี และ ID ของการทดลองทางคลินิก สำหรับการทดลองทางคลินิก PubMed จะดึงข้อมูล ID ของการทดลองจากทะเบียนการทดลองที่ใหญ่ที่สุดสองแห่ง ได้แก่ ClinicalTrials.gov (ตัวระบุ NCT) และ International Standard Randomized Controlled Trial Number Register (ตัวระบุ IRCTN) [22]

ดูเพิ่มเติม

สามารถทำเครื่องหมายอ้างอิงที่ได้รับการพิจารณาว่ามีความเกี่ยวข้องเป็นพิเศษและระบุ "บทความที่เกี่ยวข้อง" ได้ หากมีความเกี่ยวข้อง สามารถเลือกการศึกษาวิจัยหลาย ๆ เรื่องและสร้างบทความที่เกี่ยวข้องกับการศึกษาวิจัยทั้งหมดได้ (บน PubMed หรือฐานข้อมูล NCBI Entrez อื่น ๆ) โดยใช้ตัวเลือก "ค้นหาข้อมูลที่เกี่ยวข้อง" จากนั้นบทความที่เกี่ยวข้องจะถูกแสดงรายการตามลำดับ "ความเกี่ยวข้อง" เพื่อสร้างรายการบทความที่เกี่ยวข้องเหล่านี้ PubMed จะเปรียบเทียบคำจากชื่อเรื่องและบทคัดย่อของการอ้างอิงแต่ละรายการ รวมถึงหัวข้อ MeSH ที่กำหนด โดยใช้อัลกอริทึมถ่วงน้ำหนักคำที่มีประสิทธิภาพ[23]ฟังก์ชัน "บทความที่เกี่ยวข้อง" ได้รับการพิจารณาว่าแม่นยำมากจนผู้เขียนบทความเสนอให้ใช้แทนการค้นหาแบบเต็มได้[24]

การแมปไปยัง MeSH

PubMed จะเชื่อมโยงไปยังเงื่อนไขและหัวข้อย่อยของ MeSH โดยอัตโนมัติ ตัวอย่างเช่น "กลิ่นปาก" จะเชื่อมโยงไปยัง (และรวมไว้ในการค้นหา) "กลิ่นปาก" "หัวใจวาย" จะเชื่อมโยงไปยัง "กล้ามเนื้อหัวใจตาย" "มะเร็งเต้านม" จะเชื่อมโยงไปยัง "เนื้องอกเต้านม" เมื่อเหมาะสม เงื่อนไข MeSH เหล่านี้จะ "ขยาย" โดยอัตโนมัติ นั่นคือ รวมเงื่อนไขที่เฉพาะเจาะจงมากขึ้น เงื่อนไขเช่น "พยาบาล" จะเชื่อมโยงไปยัง "พยาบาล [MeSH]" หรือ "พยาบาล [หัวข้อย่อย]" โดยอัตโนมัติ คุณสมบัตินี้เรียกว่าการแมปเงื่อนไขอัตโนมัติ และเปิดใช้งานตามค่าเริ่มต้นในการค้นหาข้อความอิสระ แต่ไม่ใช่การค้นหาวลีที่แน่นอน (กล่าวคือ การใส่เครื่องหมายคำพูดคู่รอบคำค้นหา) [25]คุณสมบัตินี้ทำให้การค้นหา PubMed มีความละเอียดอ่อนมากขึ้นและหลีกเลี่ยงการค้นหาผลลัพธ์ที่ผิดพลาด (พลาด) โดยชดเชยความหลากหลายของคำศัพท์ทางการแพทย์[25]

PubMed จะไม่ใช้การแมปอัตโนมัติของคำศัพท์ในสถานการณ์ต่อไปนี้: โดยการเขียนวลีที่ถูกอ้างอิง (เช่น "การปลูกถ่ายไต") เมื่อถูกตัดทอนลงในเครื่องหมายดอกจัน (เช่น การปลูกถ่ายไต*) และเมื่อค้นหาด้วยป้ายกำกับฟิลด์ (เช่น มะเร็ง [ti]) [20]

NCBI ของฉัน

สิ่งอำนวยความสะดวกเสริมของ PubMed "My NCBI" (พร้อมการลงทะเบียนฟรี) มีเครื่องมือสำหรับ

  • การบันทึกการค้นหา
  • การกรองผลลัพธ์การค้นหา
  • การตั้งค่าการอัพเดทอัตโนมัติส่งทางอีเมล์
  • การบันทึกชุดการอ้างอิงที่ดึงมาเป็นส่วนหนึ่งของการค้นหา PubMed
  • การกำหนดค่ารูปแบบการแสดงผลหรือการเน้นคำค้นหา

และตัวเลือกอื่นๆ อีกมากมาย[26]สามารถเข้าถึงพื้นที่ "My NCBI" ได้จากคอมพิวเตอร์เครื่องใดก็ได้ที่สามารถเข้าถึงเว็บได้ "My NCBI" เวอร์ชันก่อนหน้านี้เรียกว่า "PubMed Cubby" [27]

ลิงค์เอาท์

LinkOut เป็นสิ่งอำนวยความสะดวกของ NLM เพื่อเชื่อมโยงและทำให้วารสารท้องถิ่นฉบับเต็มพร้อมใช้งาน[28]มีไซต์ประมาณ 3,200 แห่ง (ส่วนใหญ่เป็นสถาบันทางวิชาการ) ที่เข้าร่วมในสิ่งอำนวยความสะดวกของ NLM นี้ (ณ เดือนมีนาคม 2010 [อัปเดต]) ตั้งแต่มหาวิทยาลัย Aalborgในเดนมาร์กไปจนถึงZymoGeneticsในซีแอตเทิล[29]ผู้ใช้ในสถาบันเหล่านี้จะเห็นโลโก้ของสถาบันของตนในผลการค้นหา PubMed (หากวารสารนั้นจัดทำขึ้นในสถาบันนั้น) และสามารถเข้าถึงฉบับเต็มได้ Linkout กำลังถูกรวมเข้ากับ Outside Tool เมื่อมีการอัปเดตแพลตฟอร์มหลักในช่วงฤดูร้อนปี 2019 [30]

พับเมดคอมมอนส์

ในปี 2016 PubMed อนุญาตให้ผู้เขียนบทความแสดงความคิดเห็นเกี่ยวกับบทความที่จัดทำดัชนีโดย PubMed คุณลักษณะนี้ได้รับการทดสอบเบื้องต้นในโหมดนำร่อง (ตั้งแต่ปี 2013) และกลายเป็นคุณลักษณะถาวรในปี 2016 [31]ในเดือนกุมภาพันธ์ 2018 PubMed Commons ถูกยกเลิกเนื่องจาก "การใช้งานยังคงน้อยมาก" [32] [33]

สอบถามMEDLINE

askMEDLINE เครื่องมือค้นหาข้อความอิสระและภาษาธรรมชาติสำหรับ MEDLINE/PubMed พัฒนาโดย NLM เหมาะสำหรับอุปกรณ์พกพาด้วยเช่นกัน[34]

ตัวระบุ PubMed

PMID (ตัวระบุ PubMed หรือตัวระบุเฉพาะ PubMed) [35]คือค่าจำนวนเต็มเฉพาะที่เริ่มต้น ที่ ถูกกำหนดให้ กับแต่ละระเบียน PubMed PMID ไม่เหมือนกับPMCID (ตัวระบุ PubMed Central) ซึ่งเป็นตัวระบุสำหรับงานทั้งหมดที่เผยแพร่ใน PubMed Centralที่เข้าถึงได้ฟรี[36]1

การกำหนด PMID หรือ PMCID ให้กับสิ่งพิมพ์ไม่ได้แจ้งให้ผู้อ่านทราบเกี่ยวกับประเภทหรือคุณภาพของเนื้อหา PMID ถูกกำหนดให้กับจดหมายถึงบรรณาธิการความคิดเห็นของบรรณาธิการ คอลัมน์บทความ วิจารณ์และบทความอื่นๆ ที่บรรณาธิการเลือกที่จะรวมไว้ในวารสาร รวมถึงบทความที่ผ่านการตรวจสอบโดยผู้ทรงคุณวุฒิ การมีอยู่ของหมายเลขประจำตัวก็ไม่ใช่หลักฐานว่าบทความเหล่านั้นไม่ได้ถูกเพิกถอนเนื่องจากการฉ้อโกง ความไร้ความสามารถ หรือการประพฤติมิชอบ การประกาศเกี่ยวกับการแก้ไขบทความต้นฉบับใดๆ อาจได้รับการกำหนด PMID

โดยค่าเริ่มต้นแล้ว หมายเลขแต่ละรายการที่ป้อนในหน้าต่างค้นหา PubMed จะถือเป็น PMID ดังนั้นการอ้างอิงใดๆ ใน PubMed จะสามารถค้นหาได้โดยใช้ PMID

อินเทอร์เฟซทางเลือก

MEDLINE เป็นฐานข้อมูลหนึ่งที่สามารถเข้าถึงได้ผ่าน PubMed บริษัทหลายแห่งให้การเข้าถึง MEDLINE ผ่านแพลตฟอร์มของตน

ห้องสมุดการแพทย์แห่งชาติให้เช่าข้อมูล MEDLINE แก่ผู้ให้บริการเอกชนหลายราย เช่นEmbase , Ovid , Dialog , EBSCO , Knowledge Finder และผู้ให้บริการเชิงพาณิชย์ ไม่เชิงพาณิชย์ และทางวิชาการอื่นๆ อีกมากมาย[37]ณ เดือนตุลาคม 2008 [อัปเดต]มีใบอนุญาตมากกว่า 500 ใบที่ออกให้ โดยมากกว่า 200 ใบออกให้กับผู้ให้บริการนอกสหรัฐอเมริกา เนื่องจากใบอนุญาตสำหรับใช้ข้อมูล MEDLINE นั้นให้บริการฟรี NLM จึงให้พื้นที่ทดสอบฟรีสำหรับอินเทอร์ เฟซทางเลือกและส่วน เสริมของบุคคลที่สามใน PubMed ซึ่งเป็นหนึ่งในฐานข้อมูลขนาดใหญ่ไม่กี่แห่งที่จัดทำโดยผู้เชี่ยวชาญซึ่งเสนอตัวเลือกนี้

Lu ระบุตัวอย่างเวอร์ชัน PubMed บนเว็บฟรีปัจจุบันจำนวน 28 เวอร์ชัน ซึ่งไม่ต้องติดตั้งหรือลงทะเบียน โดยจัดกลุ่มเป็น 4 หมวดหมู่ดังนี้: [38]

  1. การจัดอันดับผลลัพธ์การค้นหา เช่น: eTBLAST ; MedlineRanker; [39] MiSearch; [40]
  2. ผลการจัดกลุ่มตามหัวข้อ ผู้เขียน วารสาร ฯลฯ เช่น: Anne O'Tate ; [41] ClusterMed; [42]
  3. การปรับปรุงความหมายและการมองเห็น เช่น EBIMed; [43] MedEvi [44]
  4. ปรับปรุงอินเทอร์เฟซการค้นหาและประสบการณ์การดึงข้อมูล เช่น askMEDLINE [45] [46] BabelMeSH; [47]และ PubCrawler [48]

เนื่องจากทางเลือกเหล่านี้และทางเลือกอื่นๆ ส่วนใหญ่พึ่งพาข้อมูล PubMed/MEDLINE ที่เช่าภายใต้ใบอนุญาตจาก NLM/PubMed จึงมีการแนะนำให้ใช้คำว่า "อนุพันธ์ของ PubMed" [38]โดยไม่จำเป็นต้องจัดเก็บชุดข้อมูล PubMed ดั้งเดิมประมาณ 90 GB ใครๆ ก็สามารถเขียนแอปพลิเคชัน PubMed โดยใช้ส่วนต่อประสานโปรแกรมแอปพลิเคชัน eutils ตามที่อธิบายไว้ใน "The E-utilities In-Depth: Parameters, Syntax and More" โดย Eric Sayers, PhD [49]ตัวสร้างรูปแบบการอ้างอิงต่างๆ ซึ่งรับหมายเลข PMID เป็นอินพุต เป็นตัวอย่างของแอปพลิเคชันเว็บที่ใช้ส่วนต่อประสานโปรแกรมแอปพลิเคชัน eutils ตัวอย่างหน้าเว็บ ได้แก่ Citation Generator – Mick Schroeder, Pubmed Citation Generator – Ultrasound of the Week, PMID2cite และ Cite this for me

การขุดข้อมูลของ PubMed

วิธีอื่นในการขุดข้อมูลใน PubMed จะใช้สภาพแวดล้อมการเขียนโปรแกรม เช่นMatlab , PythonหรือRในกรณีเหล่านี้ แบบสอบถามของ PubMed จะถูกเขียนเป็นบรรทัดโค้ดและส่งไปยัง PubMed จากนั้นการตอบสนองจะถูกประมวลผลโดยตรงในสภาพแวดล้อมการเขียนโปรแกรม โค้ดสามารถทำงานอัตโนมัติเพื่อสอบถามข้อมูลอย่างเป็นระบบด้วยคำสำคัญต่างๆ เช่น โรค ปี อวัยวะ เป็นต้น

นอกเหนือจากบทบาทดั้งเดิมของ PubMed ในฐานะฐานข้อมูลชีวการแพทย์แล้ว PubMed ยังกลายเป็นแหล่งข้อมูลทั่วไปสำหรับการฝึกอบรมโมเดลภาษา ชีวการแพทย์อีกด้วย [50]ความก้าวหน้าล่าสุดในสาขานี้ได้แก่ การพัฒนาโมเดลต่างๆ เช่น PubMedGPT ซึ่งเป็นโมเดลพารามิเตอร์ 2.7B ที่ฝึกด้วยข้อมูล PubMed โดย Stanford CRFM และ BiomedCLIP-PubMedBERT ของ Microsoft ซึ่งใช้คู่ภาพ-คำบรรยายจาก PubMed Central สำหรับการประมวลผลภาพ-ภาษา โมเดลเหล่านี้แสดงให้เห็นถึงศักยภาพที่สำคัญของข้อมูล PubMed ในการเพิ่มขีดความสามารถของ AI ในการวิจัยทางการแพทย์และแอปพลิเคชันด้านการดูแลสุขภาพ ความก้าวหน้าดังกล่าวเน้นย้ำถึงความสัมพันธ์ที่เพิ่มขึ้นระหว่างการขุดข้อมูลขนาดใหญ่และการพัฒนา AI ในสาขาชีวการแพทย์

ข้อมูลที่เข้าถึงได้โดย PubMed สามารถทำมิเรอร์ในระดับท้องถิ่นโดยใช้เครื่องมือที่ไม่เป็นทางการ เช่น MEDOC [51]

บันทึก PubMed หลายล้านรายการเสริมชุดข้อมูลเปิด ต่างๆ เกี่ยวกับ การเข้าถึงแบบเปิดเช่นUnpaywallเครื่องมือวิเคราะห์ข้อมูล เช่นUnpaywall Journalsถูกใช้โดยห้องสมุดเพื่อช่วยใน การยกเลิก ข้อตกลงใหญ่ๆ ห้องสมุดสามารถหลีกเลี่ยงการสมัครสมาชิกสำหรับสื่อที่ให้บริการ การเข้าถึงแบบเปิดทันทีผ่านคลังข้อมูลแบบเปิดเช่น PubMed Central [52]

ดูเพิ่มเติม

อ้างอิง

  1. ^ "PubMed". เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 13 ธันวาคม 2020 . สืบค้นเมื่อ22 กุมภาพันธ์ 2019 .
  2. ^ ab Lindberg DA (2000). "การเข้าถึงอินเทอร์เน็ตไปยังห้องสมุดการแพทย์แห่งชาติ" (PDF) . การปฏิบัติทางคลินิกที่มีประสิทธิผล . 3 (5): 256–60. PMID  11185333. เก็บถาวรจากแหล่งเดิม(PDF)เมื่อวันที่ 2 พฤศจิกายน 2013
  3. ^ "PubMed Celebrates its 10th Anniversary". Technical Bulletin . United States National Library of Medicine . 5 ตุลาคม 2006. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 23 เมษายน 2018. สืบค้นเมื่อ22 มีนาคม 2011 .
  4. ^ "PubMed: การสืบค้น MEDLINE บน World Wide Web". Fact Sheet . ห้องสมุดการแพทย์แห่งชาติสหรัฐอเมริกา. 7 มิถุนายน 2002. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 1 กันยายน 2018. สืบค้นเมื่อ 22 มีนาคม 2011 .
  5. ^ Roberts RJ (มกราคม 2001). "PubMed Central: GenBank ของวรรณกรรมที่ตีพิมพ์" Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 98 (2): 381–2. Bibcode :2001PNAS...98..381R. doi : 10.1073/pnas.98.2.381 . PMC 33354 . PMID  11209037. 
  6. ^ McEntyre JR, Ananiadou S, Andrews S, Black WJ, Boulderstone R, Buttery P, et al. (มกราคม 2011). "UKPMC: แหล่งข้อมูลบทความฉบับเต็มสำหรับวิทยาศาสตร์ชีวภาพ" Nucleic Acids Research . 39 (ปัญหาฐานข้อมูล): D58-65 doi :10.1093/nar/gkq1063 PMC 3013671 . PMID  21062818 
  7. ^ "NLM Catalogue: Journals referenced in the NCBI Databases". NCBI. 2011. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 13 ตุลาคม 2023 . สืบค้นเมื่อ 8 กันยายน 2017 .
  8. ^ "PubMed". PubMed . เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 6 มกราคม 2022 . สืบค้นเมื่อ 5 มกราคม 2023 .คำค้นหา "1800:2100[dp]" จะดึงผลลัพธ์ทั้งหมดที่มีวันที่เผยแพร่ระหว่างปี 1800 ถึง 2100 รวม
  9. ^ "MEDLINE/PubMed Production Improvements Underway". NLM Technical Bulletin (411): e1. กรกฎาคม–สิงหาคม 2016. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 29 มีนาคม 2023 . สืบค้นเมื่อ29 กรกฎาคม 2016 .
  10. ^ Manca A, Moher D, Cugusi L, Dvir Z, Deriu F (กันยายน 2018). "วารสารล่าเหยื่อรั่วไหลเข้าสู่ PubMed ได้อย่างไร" CMAJ . 190 (35): E1042–E1045. doi :10.1503/cmaj.180154. PMC 6148641 . PMID  30181150 
  11. ^ Clarke J, Wentz R (กันยายน 2000). "แนวทางเชิงปฏิบัติได้ผลดีในการดูแลสุขภาพตามหลักฐาน" BMJ . 321 (7260): 566–7. doi :10.1136/bmj.321.7260.566/a. PMC 1118450 . PMID  10968827 
  12. ^ Fatehi F, Gray LC, Wootton R (มกราคม 2014). "วิธีปรับปรุงการค้นหา PubMed/MEDLINE ของคุณ: 2. การตั้งค่าการแสดงผล คำค้นหาที่ซับซ้อน และการค้นหาหัวข้อ" Journal of Telemedicine and Telecare . 20 (1): 44–55. doi :10.1177/1357633X13517067. PMID  24352897. S2CID  43725062.
  13. ^ Trawick B (21 มกราคม 2020). "A New and Improved PubMed®". NLM Musings From the Mezzanine . เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 7 ตุลาคม 2023. สืบค้นเมื่อ23 พฤษภาคม 2020 .
  14. ^ Price M (22 พฤษภาคม 2020). "They redesigned PubMed, a favorite website. It doesn't go well." วิทยาศาสตร์ . เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 21 พฤษภาคม 2022 . สืบค้นเมื่อ 30 มิถุนายน 2022 .
  15. ^ "PubMed via handhelds (PICO)". Technical Bulletin . United States National Library of Medicine. 2004. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 30 พฤษภาคม 2023 . สืบค้นเมื่อ 7 เมษายน 2016 .
  16. ^ "PubMed Mobile Beta". Technical Bulletin . United States National Library of Medicine. 2011. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 11 เมษายน 2023 . สืบค้นเมื่อ 7 เมษายน 2016 .
  17. ^ "การค้นหาวิชาแบบง่ายด้วยแบบทดสอบ" NCBI. 2010. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 11 พฤษภาคม 2020 . สืบค้นเมื่อ 7 เมษายน 2016 .
  18. ^ Jadad AR, McQuay HJ (กรกฎาคม 1993). "การค้นคว้าวรรณกรรม จงเป็นระบบในการค้นคว้า" BMJ . 307 (6895): 66. doi :10.1136/bmj.307.6895.66-a PMC 1678459 . PMID  8343701 
  19. ^ Allison JJ, Kiefe CI, Weissman NW, Carter J, Centor RM (ฤดูใบไม้ผลิ 1999). "ศิลปะและวิทยาศาสตร์ในการค้นหา MEDLINE เพื่อตอบคำถามทางคลินิก การค้นหาจำนวนบทความที่เหมาะสม" International Journal of Technology Assessment in Health Care . 15 (2): 281–96. doi :10.1017/S0266462399015214. PMID  10507188. S2CID  11023273. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 19 กุมภาพันธ์ 2022 . สืบค้นเมื่อ13 ธันวาคม 2019 .
  20. ↑ อับ กั มโปส-อาเซนซิโอ ซี (2018) "Cómo elaborar una estrategia de búsqueda bibliográfica". Enfermería Intensiva (ภาษาสเปน) 29 (4): 182–186. ดอย :10.1016/j.enfi.2018.09.001. PMID  30291015. S2CID  188132546.
  21. ^ คำอธิบายเงื่อนไขตัวกรองแบบสอบถาม ทางคลินิก NCBI 2010 เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 29 พฤศจิกายน 2022 สืบค้นเมื่อ8 กันยายน 2017
  22. ^ Huser V, Cimino JJ (มิถุนายน 2013). "การประเมินการปฏิบัติตามนโยบายของคณะกรรมการบรรณาธิการวารสารการแพทย์ระหว่างประเทศเกี่ยวกับการขึ้นทะเบียนการทดลองทางคลินิกที่บังคับและทันเวลา" วารสารของสมาคมการแพทย์สารสนเทศแห่งอเมริกา . 20 (e1): e169-74. doi :10.1136/amiajnl-2012-001501 PMC 3715364 . PMID  23396544 
  23. ^ "คำอธิบายการคำนวณบทความที่เกี่ยวข้อง" NCBI เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 18 ธันวาคม 2008 สืบค้นเมื่อ8 กันยายน 2017
  24. ^ Chang AA, Heskett KM, Davidson TM (กุมภาพันธ์ 2006). "การสืบค้นเอกสารโดยใช้หัวเรื่องทางการแพทย์เทียบกับคำในข้อความด้วย PubMed" (PDF) . The Laryngoscope . 116 (2): 336–40. doi : 10.1097/01.mlg.0000195371.72887.a2 . PMID  16467730. S2CID  42510351 . สืบค้นเมื่อ11 กันยายน 2018 .
  25. ^ ab Fatehi F, Gray LC, Wootton R (มีนาคม 2014) "วิธีปรับปรุงการค้นหา PubMed/MEDLINE ของคุณ: 3. การค้นหาขั้นสูง MeSH และ My NCBI" Journal of Telemedicine and Telecare . 20 (2): 102–12. doi :10.1177/1357633X13519036 PMID  24614997 S2CID  9948223
  26. ^ "ความช่วยเหลือ NCBI ของฉัน" คำอธิบาย NCBI ของฉัน NCBI 13 ธันวาคม 2010 เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 26 กรกฎาคม 2023 สืบค้นเมื่อ8 กันยายน 2017
  27. ^ "PubMed Cubby". Technical Bulletin . United States National Library of Medicine. 2000. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 20 กุมภาพันธ์ 2023 . สืบค้นเมื่อ 7 เมษายน 2016 .
  28. ^ "ภาพรวม LinkOut" NCBI. 2010. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 10 กันยายน 2023 สืบค้นเมื่อ8 กันยายน 2017
  29. ^ "LinkOut Participants 2011". NCBI. 2011. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 14 ตุลาคม 2017 . สืบค้นเมื่อ 8 กันยายน 2017 .
  30. ^ "PubMed ที่ได้รับการปรับปรุงใหม่กำลังมา" เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 16 พฤษภาคม 2023 สืบค้นเมื่อ1เมษายน2019
  31. ^ ทีมงาน PubMed Commons (17 ธันวาคม 2558). "การแสดงความคิดเห็นเกี่ยวกับ PubMed: โครงการนำร่องที่ประสบความสำเร็จ". เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 25 ตุลาคม 2560 . สืบค้นเมื่อ 29 กรกฎาคม 2559 .
  32. ^ "PubMed Commons จะยุติการให้บริการ" NCBI Insights . 1 กุมภาพันธ์ 2018. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 28 สิงหาคม 2023 . สืบค้นเมื่อ 2 กุมภาพันธ์ 2018 .
  33. ^ "PubMed ปิดฟีเจอร์ความคิดเห็น PubMed Commons" Retraction Watch . 2 กุมภาพันธ์ 2018. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 28 มิถุนายน 2022 . สืบค้นเมื่อ 2 กุมภาพันธ์ 2018 .
  34. ^ "askMedline". NCBI. 2005. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 17 กรกฎาคม 2013 . สืบค้นเมื่อ 3 เมษายน 2011 .
  35. ^ "คำอธิบายและแท็ กของเขตข้อมูลการค้นหา" ศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 11 กรกฎาคม 2013 สืบค้นเมื่อ15 กรกฎาคม 2013
  36. ^ Keener M. "PMID vs. PMCID: What's the difference?" (PDF) . University of Chicago. เก็บถาวรจากแหล่งเดิม(PDF)เมื่อ 6 กรกฎาคม 2014 . สืบค้นเมื่อ19 มกราคม 2014 .
  37. ^ "การเช่าการอ้างอิงวารสารจาก PubMed/Medline". NLM. 2011. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 9 กรกฎาคม 2023 . สืบค้นเมื่อ7 เมษายน 2016 .
  38. ^ abc Lu Z (2011). "PubMed และอื่น ๆ: การสำรวจเครื่องมือเว็บสำหรับการค้นหาเอกสารทางชีวการแพทย์". Database . 2011 : baq036. doi :10.1093/database/baq036. PMC 3025693 . PMID  21245076. 
  39. ^ Fontaine JF, Barbosa-Silva A, Schaefer M, Huska MR, Muro EM, Andrade-Navarro MA (กรกฎาคม 2009). "MedlineRanker: การจัดอันดับวรรณกรรมชีวการแพทย์ที่ยืดหยุ่น" Nucleic Acids Research . 37 (ปัญหา Web Server): W141-6 doi :10.1093/nar/gkp353 PMC 2703945 . PMID  19429696 
  40. ^ States DJ, Ade AS, Wright ZC, Bookvich AV, Athey BD (เมษายน 2009). "MiSearch adaptive pubMed search tool". Bioinformatics . 25 (7): 974–6. doi :10.1093/bioinformatics/btn033. PMC 2660869. PMID  18326507 . 
  41. ^ Smalheiser NR, Zhou W, Torvik VI (กุมภาพันธ์ 2008). "Anne O'Tate: เครื่องมือรองรับการสรุปข้อมูลโดยผู้ใช้ การเจาะลึกรายละเอียด และการเรียกดูผลการค้นหา PubMed" Journal of Biomedical Discovery and Collaboration . 3 : 2. doi : 10.1186/1747-5333-3-2 . ​​PMC 2276193 . PMID  18279519 
  42. ^ "ClusterMed". Vivisimo Clustering Engine. 2011. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 11 สิงหาคม 2011 . สืบค้นเมื่อ 3 กรกฎาคม 2011 .
  43. ^ Rebholz-Schuhmann D, Kirsch H, Arregui M, Gaudan S, Riethoven M, Stoehr P (มกราคม 2550). "EBIMed--text crunching to gather facts for proteins from Medline". Bioinformatics . 23 (2): e237-44. doi : 10.1093/bioinformatics/btl302 . PMID  17237098.
  44. ^ Kim JJ, Pezik P, Rebholz-Schuhmann D (มิถุนายน 2008). "MedEvi: ดึงหลักฐานข้อความของความสัมพันธ์ระหว่างแนวคิดทางชีวการแพทย์จาก Medline" Bioinformatics . 24 (11): 1410–2. doi :10.1093/bioinformatics/btn117. PMC 2387223 . PMID  18400773. 
  45. ^ Fontelo P, Liu F, Ackerman M, Schardt CM, Keitz SA (2006). "askMEDLINE: รายงานประสบการณ์หนึ่งปี". AMIA ... รายงานการประชุมประจำปี. AMIA Symposium . 2006 : 923. PMC 1839379. PMID  17238542 . 
  46. ^ Fontelo P, Liu F, Ackerman M (2005). "MeSH Speller + askMEDLINE: เติมคำใน MeSH โดยอัตโนมัติแล้วค้นหา MEDLINE/PubMed ผ่านทางข้อความอิสระและการค้นหาด้วยภาษาธรรมชาติ" AMIA ... Annual Symposium Proceedings. AMIA Symposium . 2005 : 957. PMC 1513542 . PMID  16779244. 
  47. ^ Fontelo P, Liu F, Leon S, Anne A, Ackerman M (2007). "PICO Linguist and BabelMeSH: development and partial evaluation of evidence-based multilanguage search tools for MEDLINE/PubMed". Studies in Health Technology and Informatics . 129 (Pt 1): 817–21. PMID  17911830. เก็บถาวรจากแหล่งดั้งเดิมเมื่อ 18 ตุลาคม 2023 . สืบค้นเมื่อ 31 พฤษภาคม 2014 .
  48. ^ Hokamp K, Wolfe KH (กรกฎาคม 2004). "PubCrawler: การติดตาม PubMed และ GenBank อย่างสบายๆ" Nucleic Acids Research . 32 (ปัญหาเว็บเซิร์ฟเวอร์): W16-9 doi :10.1093/nar/gkh453 PMC 441591 . PMID  15215341 
  49. ^ Eric Sayers, PhD (24 ตุลาคม 2018). การวิเคราะห์เชิงลึกเกี่ยวกับยูทิลิตี้ทางอิเล็กทรอนิกส์: พารามิเตอร์ ไวยากรณ์ และอื่นๆ NCBI. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 23 มิถุนายน 2023 . สืบค้นเมื่อ 8 กันยายน 2017 .
  50. ^ Singhal K, Azizi S, Tu T, Mahdavi SS, Wei J, Chung HW และคณะ (3 สิงหาคม 2023). "แบบจำลองภาษาขนาดใหญ่เข้ารหัสความรู้ทางคลินิก" Nature . 620 (7972): 172–180. arXiv : 2212.13138 . Bibcode :2023Natur.620..172S. doi :10.1038/s41586-023-06291-2. PMC 10396962 . PMID  37438534 
  51. ^ MEDOC บนGitHub
  52. ^ Denise Wolfe (7 เมษายน 2020). "SUNY Negotiates New, Modified Agreement with Elsevier – Libraries News Center University at Buffalo Libraries". library.buffalo.edu . University at Buffalo . เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 6 ธันวาคม 2020 . สืบค้นเมื่อ18 เมษายน 2020 .
วิกิเดตามีคุณสมบัติดังนี้:
  • รหัสสิ่งพิมพ์ PubMed (P698) (ดูการใช้งาน )
  • เว็บไซต์อย่างเป็นทางการ
  • แท็กการค้นหา PubMed และตัวระบุฟิลด์

[[หมวดหมู่:ห้องสมุดการแพทย์แห่งชาติสหรัฐอเมริกา|PubMed]

ดึงข้อมูลจาก "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=PubMed&oldid=1249682955#PubMed_identifier"