Nella stagione 2008-2009 la Ternana disputa il girone B del torneo di Prima Divisione, con 49 punti ottiene il sesto posto, il torneo ha promosso in Serie B la sorpresa Portogruaro diretto ed il Pescara che ha vinto i Play-off. La Ternana è rimasta a guardare, perché con un punto in più avrebbe disputato i Play-off e chissà...., con gli stessi 49 punti agli spareggi è andata la Reggiana che in campionato ha battuto le fere due volte. La favorita del torneo l'Hellas Verona, ha perso la finale Play-off contro il Pescara. Tre gli allenatori che si sono alternati sulla panca rossoverde, dopo un'ottima partenza con quattro vittorie, la Ternana è rientrata nei ranghi, ha chiuso in terza posizione il girone di andata con 28 punti, cedendo posizioni nel girone di ritorno, chiuso con solo 21 punti. Con 7 reti in campionato e 3 in Coppa Italia il romano Romano Tozzi Borsoi è stato il miglior marcatore ternano di stagione. Nella Coppa Italia maggiore la Ternana ripescata dopo l'esclusione dai campionati di Pisa, Treviso ed Avellino dalla 62.ma edizione, nel primo turno ha superato il Renate, in una gara giocata a Pavullo dove le Fere erano in ritiro, mentre nel secondo turno esce dalla competizione superata dal Cesena ai calci di rigore. Nella Coppa Italia di Lega Pro rossoverdi subito eliminati dal Gubbio, che si impone (0-1) al Liberati.
^Sulla panchina ternana il nuovo allenatore Manuele Domenicali, che in settimana ha sostituito Gabriele Baldassarri. Peraltro ha esordito con una espulsione al minuto 90+1.
^Sulla panchina rossoverde il nuovo tecnico Francesco Giorgini, che ha rilevato Manuele Domenicali.