Revisão:

MECANISMOS DE EXPRESSÃO GÊNICA EM EUCARIOTOS

Emerson A. Castilho Martins*, Paulo Roberto Maciel Filho
Departamento de Fisiologia, Instituto de Biociências, USP
Apoio: FAPESP; CAPES; CNPq
Recebido 19out09 / Aceito 14jan10 / Publicação inicial 15abr10
[email protected]

Resumo. Com raras exceções, as células de eucariotos pluricelulares apresentam o mesmo material
genético. Porém, com o decorrer das fases de desenvolvimento do organismo ou em diferentes tecidos, as
exigências metabólicas são diferenciadas, e diferentes genes são ligados e desligados, expressando um
conjunto distinto de proteínas. Existem vários mecanismos responsáveis por controlar a ativação e
desativação de genes (controle da expressão gênica), em diferentes momentos da vida celular.
Apresentamos nesta revisão alguns passos que são passíveis de controle, bem como uma breve descrição
e exemplos ilustrativos de mecanismos de regulação de expressão gênica.
Palavras-chave. Controle de expressão, regulação gênica, adaptação fisiológica

MECHANISMS OF GENE EXPRESSION IN EUKARYOTES

Abstract. With rare exceptions, all cells of multicellular eukaryotes have the same genetic material.
However, metabolic requirements are different over the stages of their development or in different tissues.
These requirements are satisfied by gene expression control in these organisms. In the present review we
discuss some steps that are likely to be controlled, and a brief description and examples of mechanisms of
gene expression.
Keywords. Expression control, gene regulation, physiological adaptation

Introdução nitrogenadas (Watson e Crick, 1953). Quando

Basicamente, expressão gênica pode ser analisamos a sequência de bases nitrogenadas
descrita como o conjunto de processos que de uma fita, encontramos regiões que
ocorrem para que um organismo, tecido ou célula determinarão a sequência de aminoácidos. Essa
inicie, aumente, diminua ou cesse a produção de região é, portanto, codificante. Como não se
produtos finais de seus genes, proteínas e/ou conhece produtos (RNA ou proteínas) de uma
RNAs. No início dos anos 60, o grupo de parte do genoma, se poderia pensar que essas
Nirenberg começou a decifrar o código genético, não codificam nada, não têm função. Sabemos,
permitindo correlacionar a sequência de no entanto, que não é o que acontece. Essas
aminoácidos das moléculas proteicas com as sequências são importantes porque nelas
sequências de nucleotídeos do RNA mensageiro encontramos sinais pelos quais é possível regular
(mRNA), que por sua vez é determinada pela a expressão, uma vez que apresentam
sequência dos nucleotídeos no DNA. No entanto, sequências específicas para interação de
os mecanismos e estímulos que levam à proteínas que fazem a transcrição (no DNA) ou
produção das diferentes proteínas e RNAs, em tradução (no mRNA). Há ainda espaçadores onde
diferentes células, são tão importantes quanto a a sequência em sí não é importante, mas seu
própria sequência codificadora. tamanho torna acessível as regiões a serem
Com raras exceções, o material genético expressas.
dos eucariotos pluricelulares é idêntico em todas
as células. Isso decorre do fato de todas serem A organização nuclear
originadas da única célula-ovo. Os mecanismos O núcleo apresenta um domínio
de controle de expressão devem, então, começar cromossômico com alta concentração de genes,
por aí: as exigências das células, durante seu chamado domínio central, e uma região chamada
desenvolvimento, mudam. Consequentemente, os domínio periférico, com concentração menor de
produtos de seu metabolismo devem responder a genes. Esse tipo de organização, contudo, não é
essas mudanças. Além disso, as células se estática, já que há reorganização dos
diferenciarão em diferentes tecidos, que cromossomos nas células de acordo com o nível
responderão a diferentes estímulos e de expressão dos seus genes (Verschure, 2004).
apresentarão atividades específicas. Com isso, é Dessa forma, uma maneira de se controlar a
possível notar quão importante é a regulação própria expressão seria endereçar o cromossomo
gênica. em regiões onde seus genes poderiam ser mais
A molécula de DNA é um polímero de ou menos expressos (Singer e Green, 1997; Elias
nucleotídeos, unidades essas constituídas de e col., 2002)
uma molécula de açúcar (desoxirribose), um
grupo fosfato e uma base nitrogenada, que pode Aumentando o número de genes
ser adenina, guanina, timina ou citosina. A Um mecanismo que garante o aumento da
molécula é formada por uma fita dupla em hélice, expressão de um determinado gene é aumentar o
unidas por pontes de hidrogênio entre as bases número de suas cópias no genoma. Dessa forma,

REVISTA DA BIOLOGIA – www.ib.usp.br/revista – volume 4 – junho de 2010 1

maior quantidade de DNA molde, ao sofrer conhecidamente altera a sua atividade. Além
transcrição, gera uma quantidade maior de mRNA disso, alguns desses fatores são capazes de
e, consequentemente, da respectiva proteína. Em reconhecer sequências à montante do sítio de
alguns raros casos, acontece a amplificação ligação da enzima - região conhecida como
gênica: a dupla fita de DNA se abre no gene e em Espaçador Intergênico (IGS) - fazendo com que a
seguida, a DNA polimerase sintetiza as fitas eficiência da atividade enzimática aumente na
complementares, resultando então em duas presença de sequência específica na região não
duplas-fitas de DNA no local do gene. O processo transcrita anterior ao sítio promotor (de Andrade
pode se repetir, obtendo-se o crescimento Stempliuk e Floeter-Winter, 2002).
exponencial do número de cópias do mesmo: de Sabe-se ainda que essa enzima apresenta
2 para 4, 8 e assim por diante. A amplificação associação com as proteínas motoras actina e
acontece somente naquelas células e não será miosina nucleares, o que interfere no
transmitida para as gerações futuras. Alguns funcionamento da mesma. A miosina nuclear
genes de produção de células foliculares de participa do início da transcrição, enquanto a
Drosophila são um exemplo desse tipo de actina participa do elongamento do transcrito. No
estratégia (Claycomb e col., 2004). entanto, aparentemente o processo não depende
Outro mecanismo que garante o aumento de atividades motoras dessas proteínas, já que se
do número de genes é chamado de duplicação consegue observar a importância das mesmas
gênica. A sequência do gene é incorporada tanto in vitro quanto in vivo (Philimonenko e col.,
novamente ao genoma ou através de 2004).
recombinação desigual, na qual o pareamento Os mRNA são transcritos pela RNA
não é completamente homólogo, fazendo com polimerase II, chamada de RNA polII. Essa
que parte do cromossomo seja duplicada, ou enzima também apresenta fatores ligados a ela
através da ação de elementos transponíveis ou que permitem sua atividade. Além disso, é fato
retrotransponíveis, que podem levar consigo parte conhecido, a interferência na atividade da RNA
da informação do hospedeiro e incorporá-lo em polII por proteínas que se ligam à montante do
outra parte do genoma. Com isso, a cópia do promotor e podem aumentar ou diminuir sua
gene poderá ficar incorporada ao genoma atividade (Kadonaga, 2004).
definitivamente. Quando mantida, essa cópia
pode mutar, ou manter a estrutura original e ser Splicing
transmitida aos descendentes. Apresenta a Chamamos de "splicing" o processamento
vantagem de conferir maior plasticidade ao do pré-mRNA em que sua sequência é alterada,
organismo. Uma das cópias do gene se mantém seja pela retirada de partes da molécula, seja
sem alterações funcionais enquanto a outra pode pela adição de sequências específicas. No
sofrer mutações que podem levar ao primeiro caso, denominamos de "cis-splicing" ou
aparecimento de novas formas da proteína com somente "splicing", porque todo o processo
diferenças funcionais vantajosas ao organismo. envolve uma única molécula. Quando se adiciona
Um caso de sucesso é observado em peixes uma sequência transcrita a partir de outro gene a
antárticos da espécie Trematomus bernacchii, um pré-mRNA, denominamos o processo de
que apresentam três cópias do gene de pepsina "trans-splicing" (Alberts e col., 2002).
A, decorrentes de dois eventos de duplicação.
Esses genes passaram por mutações que Cis-splicing
geraram três formas diferentes de pepsina, Durante a transcrição, ainda no núcleo, um
proporcionando melhor funcionamento da complexo chamado spliceossomo liga-se ao pré-
digestão dos peixes na temperatura baixa em que mRNA. Esse complexo lê a sequência do pré-
vivem (Carginale e col., 2004). mRNA e, caso encontre marcações para isso,
retira parte da molécula, liga a parte anterior ao
A atividade das polimerases resto da mesma e continua o processo. As partes
A transcrição dos genes é catalisada por retiradas são chamadas de íntrons, enquanto que
enzimas chamadas RNA polimerases. Essas as regiões que farão parte do mRNA maduro e
enzimas reconhecem sequências no DNA às que, portanto, serão expressas, são chamadas de
quais se ligam, chamadas de regiões promotoras, exons. As marcações para a retirada de íntrons
ou simplesmente promotores. No entanto, são bastante variáveis, embora apresentem
diferentes complexos proteicos podem estar algumas características conservadas. Essa
ligados a esses promotores, interferindo variabilidade confere ao sistema uma maior
indiretamente na expressão de genes. plasticidade de ação no processamento do mRNA
Os genes que codificam o RNA ribossômico (Abril e col., 2005).
(rRNA), o RNA que constitui o ribossomo, Por algum tempo, acreditou-se que os
organela responsável pela tradução, são íntrons não continham informações, e que faziam
transcritos pela enzima RNA polimerase I, parte de resquícios evolutivos que perderam a
comumente chamada de RNA polI. Essa enzima função com o tempo. No entanto, hoje se
apresenta uma série de fatores das quais seu reconhece que esse pensamento era equivocado:
funcionamento depende, e a presença desses é sabido que a expressão pode depender da

REVISTA DA BIOLOGIA – www.ib.usp.br/revista – volume 4 – junho de 2010 2

presença de íntrons, e ainda que esses íntrons forma de proteínas plasmáticas. (Wilson e col.,
têm sítios de ligação para reconhecimento 1995). Outro exemplo conhecido é a expressão
indireto de condições ambientais. É o caso, por do gene de beta-tropomiosina do músculo
exemplo, do gene para a produção de esquelético, que ocorre de maneira diferenciada
arylalkylamina N-acetiltransferase (AA-NAT), que em fibroblastos e músculo liso por meio de
controla a produção do hormônio melatonina. "splicing" alternativo (Helfman e col., 1988).
Uma região no íntron 1 desse gene apresenta O "splicing" alternativo também pode ser a
sítio de ligação de um elemento responsivo a chave para processos patológicos, dando origem
AMP cíclico (AMPc). Esse elemento é chamado a transcritos que não são funcionais ou tem
de CREB e aumenta a tradução do mRNA função exacerbada. É o caso, por exemplo, do
quando ocorre um aumento do AMPc, ou seja, insulinoma humano, onde o mRNA da insulina
quando a célula é estimulada. Quando estímulos apresenta como variante de "splicing" uma forma
chegam às células da glândula pineal, ocorre um com a inclusão de parte do primeiro íntron na
aumento do AMPc, que permitirá a ligação do região 5`UTR. Com isso, tanto o RNA sem o
CREB no íntron 1 e levará a um aumento de mais íntron, variante mais comum, quanto o RNA com
de 5 vezes na quantidade de melatonina o íntron darão origem à mesma proteína viável,
produzida na glândula. O mesmo efeito é muito no entanto, a variante do mensageiro da insulina
diminuído com a retirada do íntron 1, como ocorre com a parte do íntron 1 é traduzida mais vezes do
nas outras células do corpo (Baler e col., 1999). que a variedade nativa. Em células pancreáticas
Com isso, a glândula pineal pode regular a normais, a quantidade de variante com íntron não
produção de melatonina por responder de chega a 0,5%. No entanto, em insulinomas, as
maneira indireta à presença de luz, o que torna células do tumor aumentam significativamente a
possível regular o ritmo circadiano através de porcentagem de variantes do mensageiro com o
condições luminosas do ambiente. íntron 1, chegando a produzir mais de 13% dos
mRNA de insulina com o íntron conservado. Com
Acoplamento de fatores de transcrição isso, essas moléculas, por serem mais
Outra característica interessante da RNA traduzidas, acabam gerando muito mais insulina
polII é a presença de estruturas que permitem o por célula, gerando o quadro de hiperinsulinemia
acoplamento de fatores que agirão pós- e, consequentemente, hipoglicemia (Minn e col.,
transcrição, chamados fatores de processamento 2004).
do RNA. Esse processamento transforma o
mRNA recém transcrito em mRNA maduro, sem Trans-splicing
introns, com cauda de poli-A e CAP, que ajudam a O "trans-splicing" consiste na união de
manter a molécula mais estável. O CAP é uma exons de diferentes transcritos em um único
guanidina metilada adicionada na extremidade 5' mRNA. Alguns organismos apresentam
do mRNA, e a cauda de poli-A é a adição de transcrição policistrônica, isto é, apresentam um
dezenas de adenosinas na extremidade 3' da promotor no cromossomo e em seguida a ele
molécula (Alberts e col., 2002). A estrutura da diversos genes. Esses organismos precisam,
RNA polII aumenta a eficiência de todos esse então, individualizar a informação, ou seja,
processos porque concentra os fatores processar o pré-mRNA em RNA com informação
necessários para o processamento próximo ao para a síntese de proteína. Assim, o "trans-
local da transcrição (Maniatis e Reed, 2002; Zorio splicing" permite a formação desses mRNA
e Bentley, 2004). maduros. Esse tipo de "trans-splicing" é
conhecido como SL "trans-splicing", porque
Splicing alternativo adiciona uma sequência líder (SL) no início dos
O número de genes encontrado no genoma mRNA. Essa sequência vem acompanhada do
humano foi estimado em cerca de 25.000 genes, CAP, o que permite a proteção dessas moléculas
no entanto, esses guardam informações para a altamente instáveis. Esse mecanismo é
produção de um número muito maior de proteínas responsável pelo controle de expressão em
(Venter e col., 2001). Uma das explicações para organismos com transcrição policistrônica,
essa discrepância está na flexibilidade dos sítios quando a individualização da informação só é
de reconhecimento de "splicing", o que permite ao possível com a adição da sequência SL. Embora
sistema de processamento a criação de o mecanismo seja comum em protozoários, o
diferentes formas de proteínas a partir de uma processo é também encontrado em metazoários,
mesma sequência de DNA. É o evento chamado como em cnidários, platelmintos, nemátodes,
"splicing" alternativo. Segundo Sharp (2009), mais insetos e inclusive em mamíferos (Mayer e
da metade do DNA de células de vertebrados é Floeter-Winter, 2005).
expresso segundo diferentes formas de "splicing".
É o caso, por exemplo, da imunoglobulina M, que, Edição de RNA
em peixes, tem a sequência de DNA expressa em Outro processo pós-transcricional é a
linfócitos B no início de desenvolvimento sob a edição do RNA, também chamado de RNA
forma de proteína de membrana, enquanto que editing. O processo consiste na modificação do
nos linfócitos B maduros o gene é expresso sob a transcrito, e foi descrito em protozoários

REVISTA DA BIOLOGIA – www.ib.usp.br/revista – volume 4 – junho de 2010 3

cinetoplastídeos. Esses organismos apresentam Cada vez mais se reconhece a importância
uma única mitocôndria, com seu material genético de diversas regiões do genoma, de sistemas
organizado na forma circular, concatenados em enzimáticos de controle de transcrição e tradução
minicírculos e maxicírculos. Os maxicírculos e de sistemas pós-transcricionais de edição.
contém a informação primária para a produção Conceitos como o DNA “lixo”, de que sequências
das proteínas mitocondriais, enquanto que os não codificadoras seriam apenas resquício
minicírculos codificam os chamados gRNA, que evolutivo sem função nenhuma, estão, senão
se associados aos transcritos dos maxicírculos e, acabando completamente, ao menos diminuindo
junto com uma maquinaria chamada editiossomo, em grande escala com relação ao que se
farão o processo de edição. acreditava ainda há poucos anos, e o estudo da
Basicamente, esse processo consiste na expressão gênica vem contribuindo para
inserção e ocasionalmente na retirada de uridinas entendermos processos fisiológicos e suas
(U) dos pré-mRNA ou na troca de uma citidina (C) variantes patológicas.
por uridina. Essas alterações provocam, muitas
vezes, a alteração da fase de leitura do RNA, de Bibliografia
forma que apenas os mRNA que passarem por Abril J.F., Castelo R. e Guigó R. (2005). Comparison of splice
sites in mammals and chicken. Genome Research. 15,
esse editing serão lidos corretamente. Com isso,
111-119.
as moléculas de mRNA formadas são, na Alberts, B., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K. e
verdade, híbridos de sequência transcritas a partir Walter, P. Molecular Biology of the Cell. 4ed., Nova
de DNA de maxicírculos com sequências Iorque, Garland Sciences, 2004.
Baler R., Covington S. e Klein D.C. (1999). Rat arylalkylamine
transcritas dos minicírculos (Simpson e col.,
N-acetyltransferase gene: upstream and intronic
2000). components of a bipartite promoter. Biology of the Cell
/ Under the Auspices of the European Cell Biology
Estabilidade do mRNA Organization. 91, 699-705.
Carginale V., Trinchella F., Capasso C., Scudiero R. e Parisi E.
As moléculas de mRNA apresentam, como
(2004). Gene amplification and cold adaptation of
citado, estruturas nas extremidades 5' e 3' não pepsin in Antarctic fish. A possible strategy for food
traduzidas que aumentam sua estabilidade. No digestion at low temperature. Gene. 336, 195-205.
entanto, há uma ciclagem dessas moléculas na Claycomb J.M., Benasutti M., Bosco G., Fenger D.D. e Orr-
Weaver T.L. (2004). Gene amplification as a
célula, através de degradação controlada por
developmental strategy: isolation of two developmental
marcas presentes na própria molécula. Dentre os amplicons in Drosophila. Developmental Cell. 6, 145-
mecanismos para degradação, encontramos 155.
complexos enzimáticos capazes de detectar RNA de Andrade Stempliuk V. e Floeter-Winter L.M. (2002).
Functional domains of the rDNA promoter display a
dupla-fita. Esses complexos reconhecem as
differential recognition in Leishmania. International
duplas-fitas de RNA e as cortam em fragmentos Journal for Parasitology. 32, 437-447.
com aproximadamente 21 bases. Esses Elias, M.C., Marques-Porto, R., Freymüller, E. e Schenkman,
fragmentos são, então, usados como moldes na S. (2001). Transcription rate modulation through the
Trypanosoma cruzi life cycle occurs in parallel with
detecção de moléculas complementares de RNA.
changes in nuclear organisation. Molecular
Quando uma molécula de mRNA se hibrida a Biochemstry Parasitology., 112, 79-90.
esses fragmentos, ocorre sua degradação. Com Fjose A., Ellingsen S., Wargelius A. e Seo H.C. (2001). RNA
isso, é possível inibir a expressão de um gene interference: mechanisms and applications.
Biotechnology Annual Review. 7, 31-57.
através da expressão de sua sequência
Helfman D.M., Ricci W.M. e Finn L.A. (1988). Alternative
complementar. Esse processo vem sendo splicing of tropomyosin pre-mRNAs in vitro and in vivo.
explorado atualmente para o knockdown de Genes & Development. 2, 1627-1638.
genes em fases específicas do organismo (Fjose Kadonaga J.T. (2004). Regulation of RNA polymerase II
transcription by sequence-specific DNA binding factors.
e col., 2001; Shoji e col., 2005).
Cell. 116, 247-257.
Lewin B.. Genes VII. Oxford University (Ed.)., 2000.
Considerações finais Maniatis T. e Reed R. (2002). An extensive network of
A disposição de se obter o sequenciamento coupling among gene expression machines. Nature.
416, 499-506.
do genoma humano estava baseada na ideia de
Mayer M.G. e Floeter-Winter L.M. (2005). Pre-mRNA trans-
que o conhecimento do conjunto de bases que splicing: from kinetoplastids to mammals, an easy
compõem o DNA humano seria revelador de language for life diversity. Memorias do Instituto
grande parte de seu funcionamento. Com o Oswaldo Cruz. 100, 501-513.
Minn A.H., Kayton M., Lorang D., Hoffmann S.C., Harlan D.M.,
anúncio da composição do genoma, no entanto,
Libutti S.K. e Shalev A. (2004). Insulinomas and
se percebeu que, na verdade, a complexidade expression of an insulin splice variant. Lancet. 363,
fisiológica envolvia muito mais do que apenas a 363-367.
predição de produtos codificados na sequência de Neumann M., Sampathu D.M., Kwong L.K., Truax A.C.,
Micsenyi M.C., Chou T.T., Bruce J., Schuck T.,
bases. A regulação da expressão desses
Grossman M., Clark C.M., McCluskey L.F., Miller B.L.,
produtos e o entendimento da relação dos Masliah E., Mackenzie I.R., Feldman H., Feiden W.,
produtos e mecanismos alternativos associados à Kretzschmar H.A., Trojanowski J.Q. e Lee V.M. (2006).
regulação são os pontos que fazem dos seres Ubiquitinated TDP-43 in frontotemporal lobar
degeneration and amyotrophic lateral sclerosis.
vivos em geral, incluindo o homem, organismos
Science. 314, 130-133.
com diversos níveis de organização e Philimonenko V.V., Zhao J., Iben S., Dingová H., Kyselá K.,
complexidade. Kahle M., Zentgraf H., Hofmann W.A., de Lanerolle P.,

REVISTA DA BIOLOGIA – www.ib.usp.br/revista – volume 4 – junho de 2010 4

 Hozák P. e Grummt I. (2004). Nuclear actin and myosin Verschure P.J. (2004). Positioning the genome within the
I are required for RNA polymerase I transcription. nucleus. Biology of the Cell / Under the Auspices of the
Nature Cell Biology. 6, 1165-1172. European Cell Biology Organization. 96, 569-577.
Sharp P.A. (2009). The centrality of RNA. Cell. 136, 577-580. Waton, J.D. E Crick, F.H.C. (1953) Molecular structure of
Shoji M., Chuma S., Yoshida K., Morita T. e Nakatsuji N. nucleic acids. Nature. 171, 737-738.
(2005). RNA interference during spermatogenesis in Wilson M.R., Ross D.A., Miller N.W., Clem L.W., Middleton
mice. Developmental Biology. 282, 524-534. D.L. e Warr G.W. (1995). Alternate pre-mRNA
Simpson L., Thiemann O.H., Savill N.J., Alfonzo J.D. e Maslov processing pathways in the production of membrane
D.A. (2000). Evolution of RNA editing in trypanosome IgM heavy chains in holostean fish. Developmental and
mitochondria. Proceedings of the National Academy of Comparative Immunology. 19, 165-177.
Sciences of the United States of America. 97, 6986- Zorio D.A.R. e Bentley D.L. (2004). The link between mRNA
6993. processing and transcription: communication works
Singer R.H. e Green M.R. (1997). Compartmentalization of both ways. Experimental Cell Research. 296, 91-97.
eukaryotic gene expression: causes and effects. Cell.
91, 291-294.
Venter J.C., Adams M.D., Myers E.W., Li P.W., Mural R.J.,
Sutton G.G. e cols. (2001). The sequence of the human
genome. Science. 291, 1304-1351.

REVISTA DA BIOLOGIA – www.ib.usp.br/revista – volume 4 – junho de 2010 5