Predloga:Infopolje Encim
| Infopolje Encim | |
|---|---|
| Številka EC | {{{EC_number}}} |
 | Uporablja Lua: |
Ta predloga je namenjena konsistentnemu prikazu uporabnih povezav do zapisov o nekem encimu v bazah podatkov.
Uporaba
[uredi kodo]Da bi vključili to predlogo v članek, skopirajte spodnjo kodo na vrh članka o encimu. Zaželjeno je, da izpolnite čim več polj, niso pa vsa obvezna. Vendar pa mnogo povezav temelji na EC številu, zato je koristno, da vnesete vsaj tega (parameter "EC number"). Za zgled uporabe v članku glej superoksid-dismutaza.
{{Infopolje Encim
| name =
| AltNames =
| image =
| image_size =
| caption =
| EC_number =
| CAS_number =
| GO_code =
}}
Razlaga parametrov
[uredi kodo]- Name
- v stroki sprejeto ime za encim.
- EC_number
- EC število po klasifikaciji encimov Mednarodne zveze za biokemijo in molekularno biologijo (IUBMB). Glej IUBMB.
- AltNames
- Alternativna imena
- CAS_number
- identifikator CAS.
- IUBMB_EC_number
- isto kot EC število, le da so pike med številkami zamenjane s poševnicami (npr. 1.1.1.1 → 1/1/1/1).
- GO_code
- Koda Gene Ontology (GO) za reakcijo, ki jo encim katalizira, seznam je na spletni strani GO.
- Image
- ime datoteke s sliko tridimenzionalne strukture, največkrat ustvarjene na podlagi podatkov iz PDB. Če je slika definirana, lahko s parametrom caption vnesemo napis pod njo, z width pa določimo širino v pikslih (privzeto: 220px).
Zgled
[uredi kodo]Spodaj zapisana koda prikaže infopolje na desni:
| alkohol dehidrogenaza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatorji | |||||||||
| Številka EC | 1.1.1.1 | ||||||||
| Številka CAS | 9031-72-5 | ||||||||
| Podatkovne baze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz view | ||||||||
| BRENDA | BRENDA entry | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme view | ||||||||
| KEGG | KEGG entry | ||||||||
| MetaCyc | metabolic pathway | ||||||||
| PRIAM | profile | ||||||||
| PDB strukture | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Gene Ontology | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
{{Infopolje Encim
| Name = alkohol dehidrogenaza
| EC_number = 1.1.1.1
| CAS_number= 9031-72-5
| IUBMB_EC_number = 1/1/1/1
| GO_code = 0004022
| image =
| width =
| caption =
}}
TemplateData
[uredi kodo]TemplateData za Infopolje Encim
Used to create an enzyme infobox, based on the basic infobox format.
| Parameter | Opis | Vrsta | Stanje | |
|---|---|---|---|---|
| Name | name | This field lists the accepted name for this enzyme class, ideally from the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB) Enzyme Nomenclature authority
| Niz | zahtevano |
| Image | image | This field specifies an image file that displays a two-dimensional view of the three-dimensional structure, typically created from a PDB file.
| Niz | neobvezno |
| image_size | image_size | If an image is specified, then the display width in pixels can optionally be specified (default = 220px)
| Številka | neobvezno |
| caption | caption | If an image is specified, then the caption parameter should be used to specify the structure used to generate the image, preferably using the {{PDB2}} template.
| Niz | neobvezno |
| EC_number | EC_number | The EC number which is numerical classification scheme for enzymes developed by the IUBMB Enzyme Nomenclature authority (again see IUBMB).
| Številka | zahtevano |
| CAS_number | CAS_number | The CAS registry number, a unique chemical numerical identifier.
| Niz | zahtevano |
| GO_code | GO_code | The Gene Ontology (GO) code for the enzymatic reaction ideally obtained from the GO website.
| Niz | zahtevano |