Аполіпопротеїн E

Аполіпопротеїн E
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1B68, 1BZ4, 1EA8, 1GS9, 1H7I, 1LE2, 1LE4, 1LPE, 1NFN, 1NFO, 1OEF, 1OEG, 1OR2, 1OR3, 2KC3, 2KNY, 2L7B
Ідентифікатори
Символи	APOE, AD2, APO-E, LDLCQ5, LPG, apolipoprotein E, ApoE4
Зовнішні ІД	OMIM: 107741 MGI: 88057 HomoloGene: 30951 GeneCards: APOE
Пов'язані генетичні захворювання
	хвороба Альцгеймера, мікроцефалія, Alzheimer disease 2, sea-blue histiocyte syndrome, lipoprotein glomerulopathy, ішемічна хвороба серця, familial dysbetalipoproteinemia
Онтологія гена
Молекулярна функція	• heparin binding; • very-low-density lipoprotein particle receptor binding; • low-density lipoprotein particle receptor binding; • lipoprotein particle binding; • phosphatidylcholine-sterol O-acyltransferase activator activity; • phospholipid binding; • GO:0017127 cholesterol transfer activity; • protein homodimerization activity; • amyloid-beta binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • tau protein binding; • metal chelating activity; • lipid transporter activity; • cholesterol binding; • antioxidant activity; • identical protein binding; • lipid binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • chylomicron; • extracellular region; • клітинне ядро; • extracellular vesicle; • endocytic vesicle lumen; • very-low-density lipoprotein particle; • extracellular fluid; • ендоплазматичний ретикулум; • екзосома; • комплекс Ґольджі; • blood microparticle; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • клітинна мембрана; • soma; • early endosome; • low-density lipoprotein particle; • дендрит (нейробіологія); • high-density lipoprotein particle; • intermediate-density lipoprotein particle;
Біологічний процес	• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process; • response to dietary excess; • negative regulation of lipid transport across blood-brain barrier; • lipid transport; • positive regulation of lipid biosynthetic process; • regulation of axon extension; • positive regulation of postsynaptic membrane organization; • positive regulation of cholesterol esterification; • phospholipid efflux; • cholesterol catabolic process; • positive regulation of dendritic spine development; • рецептор-опосередкований ендоцитоз; • retinoid metabolic process; • positive regulation of amyloid-beta formation; • lipid homeostasis; • lipoprotein biosynthetic process; • cholesterol homeostasis; • negative regulation of inflammatory response; • triglyceride metabolic process; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • negative regulation of dendritic spine maintenance; • negative regulation of blood vessel endothelial cell migration; • NMDA glutamate receptor clustering; • GO:0001315 response to reactive oxygen species; • negative regulation of blood coagulation; • GO:0001306 response to oxidative stress; • positive regulation of nitric-oxide synthase activity; • negative regulation of phospholipid efflux; • positive regulation of cholesterol efflux; • negative regulation of MAP kinase activity; • artery morphogenesis; • very-low-density lipoprotein particle remodeling; • regulation of neuronal synaptic plasticity; • negative regulation of dendritic spine development; • negative regulation of cholesterol biosynthetic process; • positive regulation of dendritic spine maintenance; • positive regulation of phospholipid efflux; • negative regulation of presynaptic membrane organization; • negative regulation of neuron death; • high-density lipoprotein particle clearance; • long-chain fatty acid transport; • lipoprotein metabolic process; • regulation of tau-protein kinase activity; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • chylomicron remnant clearance; • cellular calcium ion homeostasis; • cholesterol metabolic process; • very-low-density lipoprotein particle clearance; • virion assembly; • negative regulation of lipid biosynthetic process; • cGMP-mediated signaling; • triglyceride catabolic process; • positive regulation of presynaptic membrane organization; • positive regulation of neurofibrillary tangle assembly; • AMPA glutamate receptor clustering; • positive regulation of low-density lipoprotein particle receptor catabolic process; • positive regulation of lipid transport across blood-brain barrier; • fatty acid homeostasis; • nitric oxide mediated signal transduction; • GO:0015915 транспорт; • cholesterol efflux; • регуляція експресії генів; • negative regulation of cholesterol efflux; • regulation of amyloid-beta clearance; • neuron projection regeneration; • negative regulation of postsynaptic membrane organization; • steroid metabolic process; • regulation of Cdc42 protein signal transduction; • lipid metabolism; • negative regulation of amyloid-beta formation; • positive regulation of membrane protein ectodomain proteolysis; • вазодилатація; • intracellular transport; • synaptic transmission, cholinergic; • positive regulation of neuron death; • high-density lipoprotein particle assembly; • protein import; • high-density lipoprotein particle remodeling; • negative regulation of endothelial cell proliferation; • maintenance of location in cell; • negative regulation of platelet activation; • low-density lipoprotein particle remodeling; • positive regulation by host of viral process; • cytoskeleton organization; • regulation of neuron death; • reverse cholesterol transport; • lipoprotein catabolic process; • triglyceride homeostasis; • cellular oxidant detoxification; • lipid transport involved in lipid storage;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	348
	11816
	ENSG00000130203
	ENSMUSG00000002985
	P02649
	P08226
	NM_001302691; NM_000041; NM_001302688; NM_001302689; NM_001302690
	NM_009696; NM_001305819; NM_001305843; NM_001305844
	NP_000032; NP_001289617; NP_001289618; NP_001289619; NP_001289620
	NP_001292748; NP_001292772; NP_001292773; NP_033826
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Аполіпопротеїн E (англ. Apolipoprotein E) – білок, який кодується геном APOE, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 317 амінокислот, а молекулярна маса — 36 154^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKVLWAALLV	TFLAGCQAKV	EQAVETEPEP	ELRQQTEWQS	GQRWELALGR
FWDYLRWVQT	LSEQVQEELL	SSQVTQELRA	LMDETMKELK	AYKSELEEQL
TPVAEETRAR	LSKELQAAQA	RLGADMEDVC	GRLVQYRGEV	QAMLGQSTEE
LRVRLASHLR	KLRKRLLRDA	DDLQKRLAVY	QAGAREGAER	GLSAIRERLG
PLVEQGRVRA	ATVGSLAGQP	LQERAQAWGE	RLRARMEEMG	SRTRDRLDEV
KEQVAEVRAK	LEEQAQQIRL	QAEAFQARLK	SWFEPLVEDM	QRQWAGLVEK
VQAAVGTSAA	PVPSDNH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм ліпідів, транспорт, метаболізм холестеролу, транспорт ліпідів, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mahley R.W. (1988). Apolipoprotein E: cholesterol transport protein with expanding role in cell biology. Science. 240: 622—630. PMID 3283935 DOI:10.1126/science.3283935
Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h
Wilson C., Wardell M.R., Weisgraber K.H., Mahley R.W., Agard D.A. (1991). Three-dimensional structure of the LDL receptor-binding domain of human apolipoprotein E. Science. 252: 1817—1822. PMID 2063194 DOI:10.1126/science.2063194
de Knijff P., van den Maagdenberg A.M.J.M., Frants R.R., Havekes L.M. (1994). Genetic heterogeneity of apolipoprotein E and its influence on plasma lipid and lipoprotein levels. Hum. Mutat. 4: 178—194. PMID 7833947 DOI:10.1002/humu.1380040303
Zannis V.I., McPherson J., Goldberger G., Karathanasis S.K., Breslow J.L. (1984). Synthesis, intracellular processing, and signal peptide of human apolipoprotein E. J. Biol. Chem. 259: 5495—5499. PMID 6325438