CAPN2

CAPN2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1KFU, 1KFX, 2NQA
Ідентифікатори
Символи	CAPN2, CANP2, CANPL2, CANPml, mCANP, calpain 2
Зовнішні ІД	OMIM: 114230 MGI: 88264 HomoloGene: 1326 GeneCards: CAPN2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • cysteine-type peptidase activity; • зв'язування з іоном металу; • cytoskeletal protein binding; • GO:0070122 peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • hydrolase activity; • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity; • enzyme binding;
Клітинна компонента	• комплекс Ґольджі; • Псевдоподія; • мембрана; • focal adhesion; • perinuclear endoplasmic reticulum; • внутрішньоклітинний; • дендрит (нейробіологія); • ендоплазматичний ретикулум; • cortical actin cytoskeleton; • membrane raft; • Хроматин; • лізосома; • екзосома; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • цитоплазма; • клітинна мембрана; • мітохондріальний міжмембранний простір; • external side of plasma membrane; • cell projection; • soma;
Біологічний процес	• response to hypoxia; • protein autoprocessing; • протеоліз; • cellular response to amino acid stimulus; • myoblast fusion; • proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • regulation of cytoskeleton organization; • blastocyst development; • extracellular matrix disassembly; • жіноча вагітність; • positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process; • regulation of interleukin-6 production; • cellular response to interferon-beta; • response to hydrogen peroxide; • behavioral response to pain; • cellular response to lipopolysaccharide; • positive regulation of neuron death; • positive regulation of myoblast fusion; • positive regulation of phosphatidylcholine biosynthetic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	824
	12334
	ENSG00000162909
	ENSMUSG00000026509
	P17655
	O08529
	NM_001146068; NM_001748
	NM_009794
	NP_001139540; NP_001739
	NP_033924
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CAPN2 (англ. Calpain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 700 амінокислот, а молекулярна маса — 79 995^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGIAAKLAK	DREAAEGLGS	HDRAIKYLNQ	DYEALRNECL	EAGTLFQDPS
FPAIPSALGF	KELGPYSSKT	RGIEWKRPTE	ICADPQFIIG	GATRTDICQG
ALGDCWLLAA	IASLTLNEEI	LARVVPLNQS	FQENYAGIFH	FQFWQYGEWV
EVVVDDRLPT	KDGELLFVHS	AEGSEFWSAL	LEKAYAKING	CYEALSGGAT
TEGFEDFTGG	IAEWYELKKP	PPNLFKIIQK	ALQKGSLLGC	SIDITSAADS
EAITFQKLVK	GHAYSVTGAE	EVESNGSLQK	LIRIRNPWGE	VEWTGRWNDN
CPSWNTIDPE	ERERLTRRHE	DGEFWMSFSD	FLRHYSRLEI	CNLTPDTLTS
DTYKKWKLTK	MDGNWRRGST	AGGCRNYPNT	FWMNPQYLIK	LEEEDEDEED
GESGCTFLVG	LIQKHRRRQR	KMGEDMHTIG	FGIYEVPEEL	SGQTNIHLSK
NFFLTNRARE	RSDTFINLRE	VLNRFKLPPG	EYILVPSTFE	PNKDGDFCIR
VFSEKKADYQ	AVDDEIEANL	EEFDISEDDI	DDGFRRLFAQ	LAGEDAEISA
FELQTILRRV	LAKRQDIKSD	GFSIETCKIM	VDMLDSDGSG	KLGLKEFYIL
WTKIQKYQKI	YREIDVDRSG	TMNSYEMRKA	LEEAGFKMPC	QLHQVIVARF
ADDQLIIDFD	NFVRCLVRLE	TLFKIFKQLD	PENTGTIELD	LISWLCFSVL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

Ye Z., Connor J.R. (2000). cDNA cloning by amplification of circularized first strand cDNAs reveals non-IRE-regulated iron-responsive mRNAs. Biochem. Biophys. Res. Commun. 275: 223—227. PMID 10944468 DOI:10.1006/bbrc.2000.3282
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Sanchez-Sanchez F., Martinez-Redondo F., Aroca-Aguilar J.D., Coca-Prados M., Escribano J. (2007). Characterization of the intracellular proteolytic cleavage of myocilin and identification of calpain II as a myocilin-processing protease. J. Biol. Chem. 282: 27810—27824. PMID 17650508 DOI:10.1074/jbc.M609608200
Hata A., Ohno S., Akita Y., Suzuki K. (1989). Tandemly reiterated negative enhancer-like elements regulate transcription of a human gene for the large subunit of calcium-dependent protease. J. Biol. Chem. 264: 6404—6411. PMID 2539381

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1479 (англ.) . Архів оригіналу за 23 квітня 2016. Процитовано 25 серпня 2017. [Архівовано 2016-04-23 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P17655 (англ.) . Архів оригіналу за 14 січня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1479 (англ.) . Архів оригіналу за 23 квітня 2016. Процитовано 25 серпня 2017. [Архівовано 2016-04-23 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P17655 (англ.) . Архів оригіналу за 14 січня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

CAPN2

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук