EXOSC4

EXOSC4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2NN6
Ідентифікатори
Символи	EXOSC4, RRP41, RRP41A, Rrp41p, SKI6, Ski6p, hRrp41p, p12A, Exosome component 4
Зовнішні ІД	OMIM: 606491 MGI: 1923576 HomoloGene: 6017 GeneCards: EXOSC4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • exoribonuclease activity • 3'-5'-exoribonuclease activity • RNA binding • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding Клітинна компонента • cytoplasmic exosome (RNase complex) • nuclear exosome (RNase complex) • цитоплазма • Екзосома • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • intermediate filament cytoskeleton Біологічний процес • defense response to virus • rRNA 3'-end processing • rRNA catabolic process • polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing • U4 snRNA 3'-end processing • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5' • positive regulation of cell growth • nuclear-transcribed mRNA catabolic process • DNA deamination • maturation of 5.8S rRNA • regulation of mRNA stability • GO:0071049, GO:0071048, GO:0071033 nuclear mRNA surveillance • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • histone mRNA catabolic process • rRNA processing • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54512	109075
Ensembl	ENSG00000178896	ENSMUSG00000034259
UniProt	Q9NPD3	Q921I9
RefSeq (мРНК)	NM_019037	NM_175399
RefSeq (білок)	NP_061910	NP_780608
Локус (UCSC)	Хр. 8: 144.08 – 144.08 Mb	Хр. 15: 76.21 – 76.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EXOSC4 (англ. Exosome component 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 245 амінокислот, а молекулярна маса — 26 383.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGLELLSDQ		GYRVDGRRAG		ELRKIQARMG		VFAQADGSAY		IEQGNTKALA
VVYGPHEIRG		SRARALPDRA		LVNCQYSSAT		FSTGERKRRP		HGDRKSCEMG
LQLRQTFEAA		ILTQLHPRSQ		IDIYVQVLQA		DGGTYAACVN		AATLAVLDAG
IPMRDFVCAC		SAGFVDGTAL		ADLSHVEEAA		GGPQLALALL		PASGQIALLE
MDARLHEDHL		ERVLEAAAQA		ARDVHTLLDR		VVRQHVREAS		ILLGD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесінг рРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• van Dijk E.L., Schilders G., Pruijn G.J. (2007). Human cell growth requires a functional cytoplasmic exosome, which is involved in various mRNA decay pathways. RNA. 13: 1027—1035. PMID 17545563 DOI:10.1261/rna.575107
• Mullen T.E., Marzluff W.F. (2008). Degradation of histone mRNA requires oligouridylation followed by decapping and simultaneous degradation of the mRNA both 5' to 3' and 3' to 5'. Genes Dev. 22: 50—65. PMID 18172165 DOI:10.1101/gad.1622708
• Slomovic S., Fremder E., Staals R.H., Pruijn G.J., Schuster G. (2010). Addition of poly(A) and poly(A)-rich tails during RNA degradation in the cytoplasm of human cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 7407—7412. PMID 20368444 DOI:10.1073/pnas.0910621107
• Miyashita M., Oshiumi H., Matsumoto M., Seya T. (2011). DDX60, a DEXD/H box helicase, is a novel antiviral factor promoting RIG-I-like receptor-mediated signaling. Mol. Cell. Biol. 31: 3802—3819. PMID 21791617 DOI:10.1128/MCB.01368-10
• Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2006). Reconstitution, activities, and structure of the eukaryotic RNA exosome. Cell. 127: 1223—1237. PMID 17174896 DOI:10.1016/j.cell.2006.10.037

Див. також

• Хромосома 8