NCOR2

NCOR2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2RT5, 4OAR, 2L5G, 2LTP, 1KKQ, 3R2A, 2ODD, 4A69, 3R29, 1XC5, 1R2B,%%s1KKQ, 1R2B, 1XC5, 2GPV, 2LTP, 3R29, 3R2A, 4A69, 2L5G, 2ODD, 2RT5, 4OAR
Ідентифікатори
Символи	NCOR2, CTG26, N-CoR2, SMAP270, SMRT, SMRTE, SMRTE-tau, TNRC14, TRAC, TRAC-1, TRAC1, nuclear receptor corepressor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600848 MGI: 1337080 HomoloGene: 31370 GeneCards: NCOR2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001106 transcription corepressor activity • protein N-terminus binding • histone deacetylase binding • Notch binding • DNA binding • transcription factor binding • nuclear receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • sequence-specific DNA binding • glucocorticoid receptor binding • retinoic acid receptor binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • retinoid X receptor binding Клітинна компонента • transcription repressor complex • ядерні тільця • мембрана • histone deacetylase complex • nuclear matrix • нуклеоплазма • клітинне ядро • Хроматин Біологічний процес • negative regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of lipid metabolic process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of androgen receptor signaling pathway • лактація • response to organonitrogen compound • response to estradiol • еструс Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9612	20602
Ensembl	ENSG00000196498	ENSMUSG00000029478
UniProt	Q9Y618	Q9WU42
RefSeq (мРНК)	NM_006312 NM_001077261 NM_001206654	NM_001253904 NM_001253905 NM_011424
RefSeq (білок)	NP_001070729 NP_001193583 NP_006303 NP_001193583.1	NP_001240833 NP_001240834 NP_035554
Локус (UCSC)	Хр. 12: 124.32 – 124.57 Mb	Хр. 5: 125.02 – 125.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NCOR2 (англ. Nuclear receptor corepressor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 525 амінокислот, а молекулярна маса — 274 804.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGSTQPVAQ		TWRATEPRYP		PHSLSYPVQI		ARTHTDVGLL		EYQHHSRDYA
SHLSPGSIIQ		PQRRRPSLLS		EFQPGNERSQ		ELHLRPESHS		YLPELGKSEM
EFIESKRPRL		ELLPDPLLRP		SPLLATGQPA		GSEDLTKDRS		LTGKLEPVSP
PSPPHTDPEL		ELVPPRLSKE		ELIQNMDRVD		REITMVEQQI		SKLKKKQQQL
EEEAAKPPEP		EKPVSPPPIE		SKHRSLVQII		YDENRKKAEA		AHRILEGLGP
QVELPLYNQP		SDTRQYHENI		KINQAMRKKL		ILYFKRRNHA		RKQWEQKFCQ
RYDQLMEAWE		KKVERIENNP		RRRAKESKVR		EYYEKQFPEI		RKQRELQERM
QSRVGQRGSG		LSMSAARSEH		EVSEIIDGLS		EQENLEKQMR		QLAVIPPMLY
DADQQRIKFI		NMNGLMADPM		KVYKDRQVMN		MWSEQEKETF		REKFMQHPKN
FGLIASFLER		KTVAECVLYY		YLTKKNENYK		SLVRRSYRRR		GKSQQQQQQQ
QQQQQQQQQQ		PMPRSSQEEK		DEKEKEKEAE		KEEEKPEVEN		DKEDLLKEKT
DDTSGEDNDE		KEAVASKGRK		TANSQGRRKG		RITRSMANEA		NSEEAITPQQ
SAELASMELN		ESSRWTEEEM		ETAKKGLLEH		GRNWSAIARM		VGSKTVSQCK
NFYFNYKKRQ		NLDEILQQHK		LKMEKERNAR		RKKKKAPAAA		SEEAAFPPVV
EDEEMEASGV		SGNEEEMVEE		AEALHASGNE		VPRGECSGPA		TVNNSSDTES
IPSPHTEAAK		DTGQNGPKPP		ATLGADGPPP		GPPTPPPEDI		PAPTEPTPAS
EATGAPTPPP		APPSPSAPPP		VVPKEEKEEE		TAAAPPVEEG		EEQKPPAAEE
LAVDTGKAEE		PVKSECTEEA		EEGPAKGKDA		EAAEATAEGA		LKAEKKEGGS
GRATTAKSSG		APQDSDSSAT		CSADEVDEAE		GGDKNRLLSP		RPSLLTPTGD
PRANASPQKP		LDLKQLKQRA		AAIPPIQVTK		VHEPPREDAA		PTKPAPPAPP
PPQNLQPESD		APQQPGSSPR		GKSRSPAPPA		DKEAEKPVFF		PAFAAEAQKL
PGDPPCWTSG		LPFPVPPREV		IKASPHAPDP		SAFSYAPPGH		PLPLGLHDTA
RPVLPRPPTI		SNPPPLISSA		KHPSVLERQI		GAISQGMSVQ		LHVPYSEHAK
APVGPVTMGL		PLPMDPKKLA		PFSGVKQEQL		SPRGQAGPPE		SLGVPTAQEA
SVLRGTALGS		VPGGSITKGI		PSTRVPSDSA		ITYRGSITHG		TPADVLYKGT
ITRIIGEDSP		SRLDRGREDS		LPKGHVIYEG		KKGHVLSYEG		GMSVTQCSKE
DGRSSSGPPH		ETAAPKRTYD		MMEGRVGRAI		SSASIEGLMG		RAIPPERHSP
HHLKEQHHIR		GSITQGIPRS		YVEAQEDYLR		REAKLLKREG		TPPPPPPSRD
LTEAYKTQAL		GPLKLKPAHE		GLVATVKEAG		RSIHEIPREE		LRHTPELPLA
PRPLKEGSIT		QGTPLKYDTG		ASTTGSKKHD		VRSLIGSPGR		TFPPVHPLDV
MADARALERA		CYEESLKSRP		GTASSSGGSI		ARGAPVIVPE		LGKPRQSPLT
YEDHGAPFAG		HLPRGSPVTT		REPTPRLQEG		SLSSSKASQD		RKLTSTPREI
AKSPHSTVPE		HHPHPISPYE		HLLRGVSGVD		LYRSHIPLAF		DPTSIPRGIP
LDAAAAYYLP		RHLAPNPTYP		HLYPPYLIRG		YPDTAALENR		QTIINDYITS
QQMHHNAATA		MAQRADMLRG		LSPRESSLAL		NYAAGPRGII		DLSQVPHLPV
LVPPTPGTPA		TAMDRLAYLP		TAPQPFSSRH		SSSPLSPGGP		THLTKPTTTS
SSERERDRDR		ERDRDREREK		SILTSTTTVE		HAPIWRPGTE		QSSGSSGSSG
GGGGSSSRPA		SHSHAHQHSP		ISPRTQDALQ		QRPSVLHNTG		MKGIITAVEP
STPTVLRSTS		TSSPVRPAAT		FPPATHCPLG		GTLDGVYPTL		MEPVLLPKEA
PRVARPERPR		ADTGHAFLAK		PPARSGLEPA		SSPSKGSEPR		PLVPPVSGHA
TIARTPAKNL		APHHASPDPP		APPASASDPH		REKTQSKPFS		IQELELRSLG
YHGSSYSPEG		VEPVSPVSSP		SLTHDKGLPK		HLEELDKSHL		EGELRPKQPG
PVKLGGEAAH		LPHLRPLPES		QPSSSPLLQT		APGVKGHQRV		VTLAQHISEV
ITQDYTRHHP		QQLSAPLPAP		LYSFPGASCP		VLDLRRPPSD		LYLPPPDHGA
PARGSPHSEG		GKRSPEPNKT		SVLGGGEDGI		EPVSPPEGMT		EPGHSRSAVY
PLLYRDGEQT		EPSRMGSKSP		GNTSQPPAFF		SKLTESNSAM		VKSKKQEINK
KLNTHNRNEP		EYNISQPGTE		IFNMPAITGT		GLMTYRSQAV		QEHASTNMGL
EAIIRKALMG		KYDQWEESPP		LSANAFNPLN		ASASLPAAMP		ITAADGRSDH
TLTSPGGGGK		AKVSGRPSSR		KAKSPAPGLA		SGDRPPSVSS		VHSEGDCNRR
TPLTNRVWED		RPSSAGSTPF		PYNPLIMRLQ		AGVMASPPPP		GLPAGSGPLA
GPHHAWDEEP		KPLLCSQYET		LSDSE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Sande S., Privalsky M.L. (1996). Identification of TRACs (T3 receptor-associating cofactors), a family of cofactors that associate with, and modulate the activity of, nuclear hormone receptors. Mol. Endocrinol. 10: 813—825. PMID 8813722 DOI:10.1210/mend.10.7.8813722
• Chen J.D., Evans R.M. (1995). A transcriptional co-repressor that interacts with nuclear hormone receptors. Nature. 377: 454—457. PMID 7566127 DOI:10.1038/377454a0
• Zhang J., Kalkum M., Chait B.T., Roeder R.G. (2002). The N-CoR-HDAC3 nuclear receptor corepressor complex inhibits the JNK pathway through the integral subunit GPS2. Mol. Cell. 9: 611—623. PMID 11931768 DOI:10.1016/S1097-2765(02)00468-9
• Hauksdottir H., Farboud B., Privalsky M.L. (2003). Retinoic acid receptors beta and gamma do not repress, but instead activate target gene transcription in both the absence and presence of hormone ligand. Mol. Endocrinol. 17: 373—385. PMID 12554770 DOI:10.1210/me.2002-0340
• Goodson M.L., Jonas B.A., Privalsky M.L. (2005). Alternative mRNA splicing of SMRT creates functional diversity by generating corepressor isoforms with different affinities for different nuclear receptors. J. Biol. Chem. 280: 7493—7503. PMID 15632172 DOI:10.1074/jbc.M411514200

Див. також

• Хромосома 12