RTFDC1

RTF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2BZE, 2DB9, 3U1U, 4L1P, 4L1U
Ідентифікатори
Символи	15890 RTF1, RTF2, GTL7, KIAA0252, RTF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, RTF2, C20orf43, CDAO5, HSPC164, SHUJUN-3, replication termination factor 2 domain containing 1, replication termination factor 2, RTFDC1
Зовнішні ІД	OMIM: 611633 MGI: 1309480 HomoloGene: 133868 9501 GeneCards: RTF2 RTF1, RTF2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded DNA binding • DNA binding • RNA polymerase II C-terminal domain phosphoserine binding • RNA binding • молекулярна функція Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • Cdc73/Paf1 complex • нуклеоплазма • компонент клітини • replication fork • хромосома Біологічний процес • blastocyst growth • GO:0071110, GO:0036413, GO:0036414 histone modification • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter • histone H3-K4 trimethylation • positive regulation of histone H3-K4 methylation • transcription, DNA-templated • Wnt signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • stem cell population maintenance • endodermal cell fate commitment • transcription by RNA polymerase II • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • Убіквітин-залежний протеоліз • mitotic DNA replication termination • site-specific DNA replication termination at RTS1 barrier • GO:0022610 життєдіяльність • cellular response to hydroxyurea • regulation of DNA stability Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
51507/ Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23168,51507 23168,51507	76246
Ensembl	ENSG00000137815 ENSG00000022277	ENSMUSG00000027304
UniProt	Q92541 Q9BY42	A2AQ19
RefSeq (мРНК)	NM_015138 NM_001283035 NM_001283036 NM_001283037 NM_016407	NM_030112
RefSeq (білок)	NP_055953 NP_001269964 NP_001269965 NP_001269966 NP_057491	NP_084388
Локус (UCSC)	Хр. 15: 41.41 – 41.48 Mb	Хр. 2: 119.68 – 119.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RTFDC1 (англ. Replication termination factor 2 domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 306 амінокислот, а молекулярна маса — 33 887.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGCDGGTIPK		RHELVKGPKK		VEKVDKDAEL		VAQWNYCTLS		QEILRRPIVA
CELGRLYNKD		AVIEFLLDKS		AEKALGKAAS		HIKSIKNVTE		LKLSDNPAWE
GDKGNTKGDK		HDDLQRARFI		CPVVGLEMNG		RHRFCFLRCC		GCVFSERALK
EIKAEVCHTC		GAAFQEDDVI		MLNGTKEDVD		VLKTRMEERR		LRAKLEKKTK
KPKAAESVSK		PDVSEEAPGP		SKVKTGKPEE		ASLDSREKKT		NLAPKSTAMN
ESSSGKAGKP		PCGATKRSIA		DSEESEAYKS		LFTTHSSAKR		SKEESAHWVT
HTSYCF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20