SNIP1

SNIP1
Ідентифікатори
Символи	SNIP1, PMRED, Smad nuclear interacting protein 1, PML1, NEDHCS
Зовнішні ІД	OMIM: 608241 MGI: 2156003 HomoloGene: 110886 GeneCards: SNIP1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • U2-type precatalytic spliceosome Біологічний процес • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • Сайленсинг генів • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79753	76793
Ensembl	ENSG00000163877	ENSMUSG00000050213
UniProt	Q8TAD8	Q8BIZ6
RefSeq (мРНК)	NM_024700	NM_175246 NM_001356560
RefSeq (білок)	NP_078976	NP_780455 NP_001343489
Локус (UCSC)	Хр. 1: 37.53 – 37.55 Mb	Хр. 4: 124.96 – 124.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNIP1 (англ. Smad nuclear interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 396 амінокислот, а молекулярна маса — 45 778.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKAVKSERER		GSRRRHRDGD		VVLPAGVVVK		QERLSPEVAP		PAHRRPDHSG
GSPSPPTSEP		ARSGHRGNRA		RGVSRSPPKK		KNKASGRRSK		SPRSKRNRSP
HHSTVKVKQE		REDHPRRGRE		DRQHREPSEQ		EHRRARNSDR		DRHRGHSHQR
RTSNERPGSG		QGQGRDRDTQ		NLQAQEEERE		FYNARRREHR		QRNDVGGGGS
ESQELVPRPG		GNNKEKEVPA		KEKPSFELSG		ALLEDTNTFR		GVVIKYSEPP
EARIPKKRWR		LYPFKNDEVL		PVMYIHRQSA		YLLGRHRRIA		DIPIDHPSCS
KQHAVFQYRL		VEYTRADGTV		GRRVKPYIID		LGSGNGTFLN		NKRIEPQRYY
ELKEKDVLKF		GFSSREYVLL		HESSDTSEID		RKDDEDEEEE		EEVSDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як РНК-залежне заглушення генів. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Roche K.C., Wiechens N., Owen-Hughes T., Perkins N.D. (2004). The FHA domain protein SNIP1 is a regulator of the cell cycle and cyclin D1 expression. Oncogene. 23: 8185—8195. PMID 15378006 DOI:10.1038/sj.onc.1208025
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 1