TRPC4

TRPC4
Ідентифікатори
Символи	TRPC4, HTRP-4, HTRP4, TRP4, transient receptor potential cation channel subfamily C member 4
Зовнішні ІД	OMIM: 603651 MGI: 109525 HomoloGene: 22955 GeneCards: TRPC4
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Реагує на сполуку
2-aminoethoxydiphenylborate
Онтологія гена Молекулярна функція • beta-catenin binding • store-operated calcium channel activity • cadherin binding • inositol 1,4,5 trisphosphate binding • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium channel activity Клітинна компонента • integral component of membrane • Кальцієві канали • мембрана • cell-cell junction • cortical cytoskeleton • клітинна мембрана • cell surface • basolateral plasma membrane • caveola • membrane raft • integral component of plasma membrane • GO:0009327 protein-containing complex • cation channel complex Біологічний процес • regulation of cytosolic calcium ion concentration • calcium ion import • oligodendrocyte differentiation • ion transport • calcium ion transmembrane transport • manganese ion transport • gamma-aminobutyric acid secretion • calcium ion transport • трансмембранний транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7223	22066
Ensembl	ENSG00000133107	ENSMUSG00000027748
UniProt	Q9UBN4	Q9QUQ5
RefSeq (мРНК)	NM_001135955 NM_001135956 NM_001135957 NM_001135958 NM_003306 NM_016179 NM_001354799 NM_001354806 NM_001372055	NM_001253682 NM_001253683 NM_016984
RefSeq (білок)	NP_001129427 NP_001129428 NP_001129429 NP_001129430 NP_003297 NP_057263 NP_001341728 NP_001341735 NP_001358984	NP_001240611 NP_001240612 NP_058680
Локус (UCSC)	Хр. 13: 37.63 – 37.87 Mb	Хр. 3: 54.06 – 54.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRPC4 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 977 амінокислот, а молекулярна маса — 112 101.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQFYYKRNV		NAPYRDRIPL		RIVRAESELS		PSEKAYLNAV		EKGDYASVKK
SLEEAEIYFK		ININCIDPLG		RTALLIAIEN		ENLELIELLL		SFNVYVGDAL
LHAIRKEVVG		AVELLLNHKK		PSGEKQVPPI		LLDKQFSEFT		PDITPIILAA
HTNNYEIIKL		LVQKGVSVPR		PHEVRCNCVE		CVSSSDVDSL		RHSRSRLNIY
KALASPSLIA		LSSEDPFLTA		FQLSWELQEL		SKVENEFKSE		YEELSRQCKQ
FAKDLLDQTR		SSRELEIILN		YRDDNSLIEE		QSGNDLARLK		LAIKYRQKEF
VAQPNCQQLL		ASRWYDEFPG		WRRRHWAVKM		VTCFIIGLLF		PVFSVCYLIA
PKSPLGLFIR		KPFIKFICHT		ASYLTFLFLL		LLASQHIDRS		DLNRQGPPPT
IVEWMILPWV		LGFIWGEIKQ		MWDGGLQDYI		HDWWNLMDFV		MNSLYLATIS
LKIVAFVKYS		ALNPRESWDM		WHPTLVAEAL		FAIANIFSSL		RLISLFTANS
HLGPLQISLG		RMLLDILKFL		FIYCLVLLAF		ANGLNQLYFY		YEETKGLTCK
GIRCEKQNNA		FSTLFETLQS		LFWSIFGLIN		LYVTNVKAQH		EFTEFVGATM
FGTYNVISLV		VLLNMLIAMM		NNSYQLIADH		ADIEWKFART		KLWMSYFEEG
GTLPTPFNVI		PSPKSLWYLI		KWIWTHLCKK		KMRRKPESFG		TIGRRAADNL
RRHHQYQEVM		RNLVKRYVAA		MIRDAKTEEG		LTEENFKELK		QDISSFRFEV
LGLLRGSKLS		TIQSANASKE		SSNSADSDEK		SDSEGNSKDK		KKNFSLFDLT
TLIHPRSAAI		ASERHNISNG		SALVVQEPPR		EKQRKVNFVT		DIKNFGLFHR
RSKQNAAEQN		ANQIFSVSEE		VARQQAAGPL		ERNIQLESRG		LASRGDLSIP
GLSEQCVLVD		HRERNTDTLG		LQVGKRVCPF		KSEKVVVEDT		VPIIPKEKHA
KEEDSSIDYD		LNLPDTVTHE		DYVTTRL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Mery L., Magnino F., Schmidt K., Krause K.-H., Dufour J.-F. (2001). Alternative splice variants of hTrp4 differentially interact with the C-terminal portion of the inositol 1,4,5-trisphosphate receptors. FEBS Lett. 487: 377—383. PMID 11163362 DOI:10.1016/S0014-5793(00)02362-0
• Schaefer M., Plant T.D., Stresow N., Albrecht N., Schultz G. (2002). Functional differences between TRPC4 splice variants. J. Biol. Chem. 277: 3752—3759. PMID 11713258 DOI:10.1074/jbc.M109850200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hofmann T., Schaefer M., Schultz G., Gudermann T. (2002). Subunit composition of mammalian transient receptor potential channels in living cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 7461—7466. PMID 12032305 DOI:10.1073/pnas.102596199
• Odell A.F., Scott J.L., Van Helden D.F. (2005). Epidermal growth factor induces tyrosine phosphorylation, membrane insertion, and activation of transient receptor potential channel 4. J. Biol. Chem. 280: 37974—37987. PMID 16144838 DOI:10.1074/jbc.M503646200
• Lussier M.P., Lepage P.K., Bousquet S.M., Boulay G. (2008). RNF24, a new TRPC interacting protein, causes the intracellular retention of TRPC. Cell Calcium. 43: 432—443. PMID 17850865 DOI:10.1016/j.ceca.2007.07.009

Див. також

• Хромосома 13