ARMCX6
ARMCX6| ARMCX6 | |||||||||||||||||||||||||
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| 식별자 | |||||||||||||||||||||||||
| 별칭 | ARMCX6, GUPS10, 아르마딜로 반복 포함, X 링크된 6, X 링크된 아르마딜로 반복 포함 | ||||||||||||||||||||||||
| 외부 ID | MGI: 2147993 호몰로진: 10373 GeneCard: ARMCX6 | ||||||||||||||||||||||||
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| 직교체 | |||||||||||||||||||||||||
| 종 | 인간 | 마우스 | |||||||||||||||||||||||
| 엔트레스 | |||||||||||||||||||||||||
| 앙상블 | |||||||||||||||||||||||||
| 유니프로트 | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(단백질) | |||||||||||||||||||||||||
| 위치(UCSC) | Cr X: 101.62 – 101.62Mb | Cr X: 133.65 – 133.65Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed 검색 | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| 위키다타 | |||||||||||||||||||||||||
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X-연계 6을 함유한 아르마딜로 반복은 인간에서 X-크로모솜에 위치한 ARMCX6 유전자에 의해 인코딩되는 단백질이다.[5]
X연계단백질(ARMCX1, ARMCX2, ARMCX3, ARMCX4, ARMCX5, ARMCX6(이 단백질)을 포함한 6개의 아르마딜로 반복중 하나이다.
이 단백질의 기능은 현재로서는 알 수 없다.
단백질순서
1 MGRAREVGWM AAGLMIGAGA CYCVYKLTIG RDDSEKLEEE 41 GEEEWDDDQE LDEEEPDIWF DFETMARPWT EDGDWTEPGA 81 PGGTEDRPSG GGKANRAHPI KQRPFPYEHK NTWSAQNCKN 121 GSCVLDLSKC LFIQGKLLFA EPKDAGFPFS QDINSHLASL 161 SMARNTSPTP DPTVREALCA PDNLNASIES QGQIKMYINE 201 VCRETVSRCC NSFLQQAGLN LLISMTVINN MLAKSASDLK 241 FPLISEGSGC AKVQVLKPLM GLSEKPVLAG ELVGAQMLFS 301 FMSLFIRNG REILETPAP
호몰로지
ARMCX6는 많은 진핵생물에 보존되어 있다.
직교체
| 분류 이름 | 통칭 | 엔씨비 엔트리 | 시퀀스 유사성 백분율 | 길이(AA) | 평. |
| 호모 사피엔스 | 인간 | [1] | 100% | 300 | X 연결 6을 포함하는 아르마딜로 반복 |
| 마카카 물라타 | 레수스원숭이 | [2] | 97.0% | 300 | 예측됨: X-Linked 6(H. sapiens)과 유사한 ISO 양식 1을 포함하는 암마딜로 반복과 유사 |
| 에쿠스 카발루스 | 말 | [3] | 90.0% | 300 | 예측됨: X-Linked 6을 포함하는 아르마딜로 반복과 유사함 |
| 다니오 레리오 | 제브라피쉬 | [4] | 84.0% | 301 | RIKEN cDNA 0610039K22와 유사 |
| 무스 무스쿨루스 | 하우스 마우스 | [5] | 97.7% | 393 | X-Linked 6(H. 사피엔스) 유사 아르마딜로 반복 포함 |
| 보스 황소자리 | 소를 몰다 | [6] | 83.0% | 301 | 아르마딜로 반복 포함, X 연결 6 |
| 무스 무스쿨루스 | 마우스 | [7] | 82.0% | 301 | 아르마딜로 반복 포함, X 연결 6 |
| 타키푸구 루브리페스 | 테트라돈토상과 | [8] | 66.0% | 818 | 아릴 탄화수소 수용체 2C |
| 새너하브디트 엘레강아지 | 엘레건스 | [9] | 50.0% | 332 | 서펜타인 수용체, H급 가족 구성원(srh-216) |
| 사카로마이오스 세레비시아아과 | 효모 | [10] | 70.0% | 910 | 헐5p |
| 갈루스 갈루스 | 치킨 | [11] | 52.0% | 317 | 예측: 가설 단백질 |
이차 구조
ARMCX6의 2차 구조는 시안아제와 유사할 것으로 예측된다.두 시퀀스의 비교는 아래와 같다.[6][7]
10 20 30 40 ....*.... ....*.... ....*.... ....*.... ....*..ARMCX6 231 MLAKSASDLKFPLISEGSGCAKVQVLKPLMGLSEKPVLAGELVGAQM 277 1DW9_A 19 LLSKAKKDLSFAEIADGTGLAEAFVTAALLGQQALPADAARLVGAKL 65 + + ++ + + + + + + + + + + ++++
표현
마이크로 어레이 데이터는 ARMCX6가 마우스에서 초기 정조세포 단계에서 고도로 표현된다는 것을 보여준다.[8][9][10]
참조
- ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000198960 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000050394 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: armadillo repeat containing".
- ^ SDSC Biology Workbench 2.0
- ^ "CBlast service is retiring".
- ^ EST 프로파일 뷰어 - 인간
- ^ EST 프로파일 뷰어 - 마우스
- ^ Su AI, Wiltshire T, Batalov S, Lapp H, et al. (April 2004). "A gene atlas of the mouse and human protein-encoding transcriptomes". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 101 (16): 6062–7. doi:10.1073/pnas.0400782101. PMC 395923. PMID 15075390.
외부 링크
- UCSC 게놈 브라우저의 인간 ARMCX6 유전자 위치 및 ARMCX6 유전자 세부 정보 페이지.
추가 읽기
- Ross MT, Grafham DV, Coffey AJ, et al. (2005). "The DNA sequence of the human X chromosome". Nature. 434 (7031): 325–37. doi:10.1038/nature03440. PMC 2665286. PMID 15772651.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
