프레임시프트 돌연변이
Frameshift mutation프레임시프트 변이(Frame error 또는 reading frame shift라고도 함)는 3으로 나누어지지 않는 DNA 서열에서 다수의 뉴클레오티드를 인델(삽입 또는 삭제)하여 생기는 유전적 돌연변이다. 코돈에 의한 유전자 발현이라는 3중 특성 때문에 삽입이나 삭제로 판독 틀(코돈의 그룹화)이 바뀔 수 있어 원본과 전혀 다른 번역이 가능하다. 삭제나 삽입이 조기에 발생할수록 단백질이 더 많이 변하게 된다.[1] 프레임시프트 돌연변이는 삽입이나 삭제보다는 뉴클레오티드가 대체되는 단일 뉴클레오티드 다형성과는 다르다. 프레임시프트 돌연변이는 일반적으로 돌연변이 후 코돈의 판독을 다른 아미노산에 대한 코딩으로 유발한다. 프레임시프트 돌연변이는 또한 순서에서 만나는 첫 번째 정지 코돈("UAA", "UGA" 또는 "UAG")을 변경한다. 생성되는 폴리펩타이드의 길이가 비정상적으로 짧거나 비정상적으로 길 수 있으며, 대부분 작동하지 않을 수 있다.[2]
프레임시프트 변이는 Tay-Sachs 질병과 같은 심각한 유전적 질병에서 명백하다; 그것들은 특정 암과 가족성 초콜레스테롤라혈증에 대한 민감성을 증가시킨다; 1997년에 프레임시프트 변이는 HIV 레트로 바이러스에 의한 감염에 대한 저항성과 연관되었다.[3] 나일론화효소 생성 주장과 마찬가지로 일시적인 변이가 생물학적 참신함의 원천으로 제시됐지만, 이 해석은 논란이 되고 있다. 네고로 외 연구진(2006)[4]의 연구에 따르면 프레임시프트 돌연변이가 원인일 가능성이 낮으며, 오히려 조상 에스테라제의 활성 부위에서 두 개의 아미노산 치환으로 나일론화효소가 발생했다고 한다.
배경
DNA에 포함된 정보는 모든 유기체의 세포에서 단백질 기능을 결정한다. 필사과 번역을 통해 이 정보가 단백질을 만드는 데 전달될 수 있다. 그러나 이 통신문을 잘못 읽으면 세포에 여러 가지 교정조치가 들어가도 단백질 기능이 부정확해지고 결국 질병을 일으킬 수 있다.

센트럴 도그마
1956년 프랜시스 크릭은 단백질을 중심 도그마로 만들기 위해 DNA에서 특정 아미노산 배열로 유전정보의 흐름을 설명했다.[1] 세포가 제대로 기능하기 위해서는 구조와 촉매 작용을 위해 단백질이 정확하게 생성되어야 한다. 잘못 만들어진 단백질은 세포 생존성에 해로운 영향을 미칠 수 있고 대부분의 경우 비정상적인 세포 기능에 의해 더 높은 유기체가 건강하지 못하게 한다. 게놈의 정보를 성공적으로 전달하기 위해, 외부 핵물질과 불일치 수리 시스템과 같은 교정 메커니즘이 DNA 복제에 통합된다.[1]
전사 및 번역

DNA 복제 후, 유전자 정보의 선택된 부분을 전사함으로써 판독한다.[1] 유전 정보를 포함하는 뉴클레오티드는 현재 mRNA라고 불리는 단일 가닥 메신저 템플릿에 있다. mRNA는 리보솜의 서브유닛과 통합되어 rRNA와 상호작용한다. mRNA의 코돈에 실려 있는 유전 정보는 현재 tRNA의 안티코돈에 의해 판독(디코딩)되고 있다. 각 코돈(트리플릿)을 읽으면서 정지 코돈(UAG, UGA 또는 UAA)에 도달할 때까지 아미노산이 함께 결합되고 있다. 이때 폴리펩타이드(단백질)가 합성되어 분비된다.[1] 단백질에 포함된 1000개의 아미노산마다, 1개 이상은 틀리지 않는다. 적절한 판독 프레임의 중요성을 유지하는 코돈 인식의 충실성은 리보솜 A 사이트에서 적절한 베이스 페어링, 운동 안정성의 한 형태인 EF-Tu의 GTP 가수 분해 활동 및 EF-Tu로서의 교정 메커니즘을 통해 달성된다.[1]
프레임 쉬프팅은 또한 프로 페이즈 번역 중에 발생할 수 있으며, 개그-폴-엔브 레트로바이러스 단백질과 같이 겹치는 개방형 독서 프레임으로부터 다른 단백질을 생성한다. 이것은 바이러스에서도 상당히 흔하며 박테리아와 효모에서도 발생한다(Farabaugh, 1996). RNA 중합효소 II와는 반대로 역대포화효소는 프레임시프트 돌연변이가 발생하는 더 강한 원인으로 생각된다. 실험에서 RNA 중합효소 II로 인해 발생한 모든 프레임-임계 돌연변이의 3~13%에 불과했다. prokaryotes에서 프레임시프트 돌연변이를 유도하는 오류율은 .0001과 .00001의 범위에 있다.[5]
틀에 박힌 돌연변이를 예방하는 데 도움이 되는 생물학적 과정이 몇 가지 있다. 변형된 시퀀스를 원래 야생형 시퀀스로 다시 변경하는 역변이가 발생한다. 돌연변이 교정의 또 다른 가능성은 억제기 돌연변이의 사용이다. 이것은 2차 돌연변이를 일으켜서 원래의 돌연변이의 효과를 상쇄시키고, 정확한 아미노산을 읽을 수 있도록 순서를 바꾸게 한다. 가이드 RNA는 또한 전사 후 우리딘을 mRNA에 삽입하거나 삭제하는데 사용될 수 있는데, 이것은 정확한 판독 프레임을 가능하게 한다.[1]
코돈-트리플릿 중요도

코돈은 세 개의 뉴클레오티드로 이루어진 집합체인데, 특정 아미노산을 위한 세 개의 코드다. 첫 번째 코돈은 새로운 코돈에 의해 읽기 프레임을 설정한다. 단백질의 아미노산 백본 염기서열은 연속적인 세 쌍둥이에 의해 정의된다.[6] 코돈은 단백질 합성을 위한 유전자 정보의 번역의 핵심이다. 읽기 프레임은 mRNA 번역이 시작될 때 설정되며, 다음 3중으로 읽힐 때 유지된다. 유전자 코드의 판독은 mRNA에서 모니터 코돈의 세 가지 규칙을 따른다. 첫째, 코돈은 5에서 3의 방향으로 읽힌다. 둘째, 코돈은 겹치지 않고 메시지에는 간격이 없다. 위에 언급된 바와 같이, 메시지가 고정된 읽기 틀에서 번역된다는 마지막 규칙.[1]
메커니즘
프레임시프트 돌연변이는 무작위로 발생하거나 외부 자극에 의해 발생할 수 있다. 프레임-변형 검출은 여러 가지 다른 방법을 통해 발생할 수 있다. 프레임쉬프트는 불완전하거나 부정확한 단백질을 유발할 수 있는 돌연변이의 한 종류에 불과하지만, DNA에서 오류의 상당한 비율을 차지한다.
유전적 또는 환경적
이것은 뉴클레오티드 염기 수준의 유전적 돌연변이다. 왜 그리고 어떻게 일시적인 돌연변이가 발생하는지 계속해서 찾고 있다. 환경 연구, 특히 3㎛ → 5㎛ 엑소누클리스 활성이 부족한 DNA 중합체들에 의한 UV 유도 프레임시프트 돌연변이의 생산이 이루어졌다. 정상 시퀀스 5′ GTC GTT TTA CAA 3′은 프레임 전환을 연구하기 위해 GTC GTT C TTA CAA(MIDC)의 GTC GTT TTA CAA(MIDT)로 변경되었다. 대장균 pol I Kf와 T7 DNA 중합효소 돌연변이 효소 3 3 → 5′ exonuclease 활성도가 없는 효소는 exonuclease 숙련된 exonuclease보다 더 높은 주파수에서 UV 유도 회귀를 생성한다. 이 자료는 교정활동의 손실이 UV로 인한 프레임 전환 빈도를 증가시킨다는 것을 보여준다.[7]
탐지
형광
프레임시프트 변이 빈도를 검출하기 위한 인접 베이스와 2차 구조의 영향은 형광을 이용해 심층적으로 조사되었다. 형광 태그가 붙은 DNA는 염기 유추에 의해 DNA 서열의 국부적 변화를 연구할 수 있게 한다.[8] 프라이머 스트랜드 길이의 영향에 관한 연구에서는 템플릿 베이스가 돌출된 경우, 즉 이중 DNA에 의해 양쪽에 측면으로 배치된 구조물이 4개의 혼합형 적합성의 평형 혼합이 관찰되었음을 밝혀냈다. 이와는 대조적으로 돌출된 베이스를 프라이머-템플릿 접합부에 배치했을 때 다운스트림 가장자리에 비정상적으로 분할된 DNA 정합성을 가진 이중 루프 구조가 관찰되었으며, 이는 잘못된 정렬이 인접한 DNA 2차 구조에 의해 수정될 수 있음을 보여준다.[9]
시퀀싱

생어 시퀀싱과 파이로시퀀싱은 프레임시프트 돌연변이를 감지하는 데 사용된 두 가지 방법이지만 생성된 데이터가 최고 품질은 아닐 가능성이 높다. 그럼에도 다른 데이터베이스와 겹치지 않는 상어 염기서열을 통해 확인된 인델은 196만개에 이른다. 프레임시프트 돌연변이가 관찰되면 인간 게놈 돌연변이 데이터베이스(HGMD)와 비교하여 돌연변이가 해로운 영향을 미치는지 판단한다. 이것은 네 가지 특징을 살펴봄으로써 이루어진다. 첫째, 영향을 받는 DNA와 보존된 DNA 사이의 비율, 둘째, 대본에 대한 돌연변이의 위치, 셋째로 보존된 아미노산과 영향을 받는 아미노산의 비율, 마지막으로 외손 끝까지의 비거리.[10]
대량 병렬 시퀀싱은 돌연변이를 감지하는 데 사용할 수 있는 새로운 방법이다. 이 방법을 사용하면 생거 염기서열은 약 1킬로베이스에 한정된 범위와 달리 최대 17기가베이스의 염기서열이 한 번에 가능하다. 이 테스트를 수행하기 위해 몇 가지 기술을 사용할 수 있으며 임상 애플리케이션에서 사용될 것으로 검토되고 있다.[11] 다른 발암에 대해 검사할 때, 현재 방법은 한 번에 하나의 유전자만 볼 수 있다. 대량 병렬 시퀀싱은 여러 가지 특정 테스트와는 달리 돌연변이를 일으키는 다양한 암에 대해 한 번에 테스트할 수 있다.[12] 이 새로운 염기서열 분석법의 정확성을 알아내기 위한 실험은 21개의 유전자를 대상으로 테스트되었으며 프레임-트랜스포트 돌연변이에 대한 거짓 양성 호출이 없었다.[13]
진단
1999년 류웬의 미국 특허(595만8684개)는 체세포 돌연변이가 발생하여 프레임-변이를 일으키는 유전자에 의해 발생하거나 관련되는 질병의 진단 방법과 시약에 대해 상세히 기술하고 있다. 방법에는 조직이나 유체 샘플을 제공하고 프레임시프트 돌연변이 또는 이러한 유형의 돌연변이에 따른 단백질을 위한 유전자 분석을 수행하는 것이 포함된다. 의심스러운 유전자의 뉴클레오티드 시퀀스는 발표된 유전자 시퀀스 또는 의심스러운 유전자의 복제와 염기서열에서 제공된다. 그리고 유전자에 의해 암호화된 아미노산 염기서열이 예측된다.[14]
빈도
유전자 코드를 지배하는 규칙과 DNA 복제 과정뿐만 아니라 번역 과정에서도 유전 정보의 정확한 전달을 보장하기 위해 세포에 존재하는 다양한 메커니즘에도 불구하고, 돌연변이가 발생한다; 프레임-변이가 유일한 유형은 아니다. 적어도 두 가지 유형의 인식된 포인트 돌연변이가 있는데, 특히 오식 돌연변이와 말도 안 되는 돌연변이가 그것이다.[1] 프레임시프트 돌연변이는 메시지의 코딩 능력(유전자 정보)을 획기적으로 변화시킬 수 있다.[1] 작은 삽입이나 삭제(20 염기쌍 미만)는 현재 알려진 유전병에서 나타나는 돌연변이의 24%를 차지한다.[10]
프레임시프트 돌연변이는 DNA의 반복 영역에서 더 흔하게 발견된다. 그 이유는 중합효소 효소가 반복적으로 미끄러져 변이가 순서에 들어갈 수 있기 때문이다.[15] 미리 설정된 뉴클레오티드의 수를 추가하거나 제거하여 프레임시프트 돌연변이의 빈도를 결정하는 실험을 실행할 수 있다. 실험은 +4 실험이라고 불리는 4개의 베이스페어를 추가해 실시했지만 에모리 대학의 한 팀은 베이스 페어를 추가하고 삭제하는 방식으로 돌연변이의 빈도 차이를 살펴보았다. 기본 쌍의 추가와 삭제 빈도에 차이가 없는 것으로 나타났다. 그러나 단백질의 최종 결과에는 차이가 있다.[15]
헌팅턴병은 폴리글루타민 확장 돌연변이에 의해 발생하는 9가지 코돈 반복 장애 중 하나로 스피노-세레벨라 아탁시아(SCA)1, 2, 6, 7, 3, 스피노불바 근위축증과 치네토불-팔리돌리돌리시안성 위축증 등이 있다. 원래 SCA3 유전자 제품 인코딩 CAG/폴리글루타민 인코딩을 CCA/폴리글루타민으로 프레임 이동함에 따라 폴리글루타민과 폴리아닌 팽창 돌연변이로 인한 질병 사이에는 연관성이 있을 수 있다. SCA3 단백질의 번역 중 리보솜 미끄러짐은 폴리글루타민에서 폴리알라닌 인코딩 프레임으로 이동하는 메커니즘으로 제안되었다. A dinucleotide deletion or single nucleotide insertion within the polyglutamine tract of huntingtin exon 1 would shift the CAG, polyglutamineen coding frame by +1 (+1 frame shift) to the GCA, polyalanine-encoding frame and introduce a novel epitope to the C terminus of Htt exon 1 (APAAAPAATRPGCG).[16]
질병.
몇몇 질병은 적어도 그 원인의 일부로서 일시적인 돌연변이를 가지고 있다. 널리 퍼진 돌연변이를 아는 것도 병의 진단에 도움이 될 수 있다. 현재 아미노산의 판독 프레임을 바꾸면서 질병 치료에 유익하게 프레임 변형법을 사용하려는 시도가 있다.
암
프레임시프트 돌연변이는 대장암뿐만 아니라 미세위성 불안정을 동반한 다른 암의 원인이 되는 것으로 알려져 있다. 앞에서 설명한 대로 프레임-변형은 반복 시퀀스 영역에서 발생할 가능성이 더 높다. DNA 불일치 수리가 베이스의 추가나 삭제를 고정시키지 않는 경우, 이러한 돌연변이는 병원성일 가능성이 더 높다. 이것은 부분적으로 종양이 성장을 멈추라는 말을 듣지 않았기 때문일 것이다. 효모와 박테리아에 대한 실험은 결함이 있는 DNA 불일치 수리의 원인이 될 수 있는 미세 위성들의 특성을 보여주는 데 도움이 된다. 이것들은 미세 위성들의 길이, 유전 물질의 구성, 그리고 그 반복들이 얼마나 순수한지를 포함한다. 실험 결과에 따르면, 더 긴 미세 위성들은 프레임 변형률이 더 높다. 옆구리의 DNA는 또한 액자에 의한 돌연변이를 일으킬 수 있다.[17] 전립선암에서 프레임시프트 돌연변이는 열린 판독틀(ORF)을 변경하고 사멸을 방지한다. 이것은 종양의 조절되지 않은 성장을 이끈다. 전립선암의 진행에 기여하는 환경적 요인이 있는 반면, 유전적 요소도 있다. 돌연변이를 식별하기 위한 코딩 영역을 테스트하는 과정에서 프레임-변형 61개 등 116개의 유전자 변형이 발견됐다.[18] 17번 염색체에는 BRCA1 유전자의 유방암과 난소암 발생에 역할을 하는 것으로 보이는 돌연변이가 500개가 넘는데, 그 중 상당수는 프레임시프트다.[19]
크론병
크론병은 NOD2 유전자와 관련이 있다. 이 돌연변이는 3020 위치에 시토신을 삽입한 것이다. 이것은 코돈의 조기 중단으로 이어져, 옮겨져야 할 단백질을 단축시킨다. 단백질이 정상적으로 형성될 수 있을 때 박테리아 지방 당분에 반응하는데, 여기서 3020insC 돌연변이는 단백질이 반응하지 못하게 한다.[20]
낭포성 섬유증
낭포성 섬유증(CF)은 CFTR 유전자의 돌연변이를 기반으로 한 질환이다. 1500개 이상의 돌연변이가 확인되었지만, 모든 돌연변이가 질병을 일으키는 것은 아니다.[21] 낭포성 섬유증의 경우는 대부분 아미노산 전체를 삭제하는 ∆F508 돌연변이의 결과물이다. CF, CF1213delT 및 CF1154-ins 진단 시 두 가지 프레임-변형이 관심사임TC. 이 두 돌연변이는 일반적으로 적어도 하나의 다른 돌연변이와 함께 발생한다. 그것들은 둘 다 폐의 기능을 약간 감소시키고 검사된 환자의 약 1%에서 발생한다. 이러한 돌연변이는 상어 염기서열을 통해 확인되었다.[22]
HIV
CCR5는 에이즈 환자와는 달리 에이즈 환자들에게 가장 많이 관여하는 에이즈 환자들에게 가장 잘 나타나는 HIV와 관련된 세포 진입 공동 인자 중 하나이다. CCR5에서 32개의 염기쌍을 삭제한 것이 HIV 감염 가능성을 부정하는 돌연변이로 확인되었다. 개방 판독 프레임 ORF의 이 영역에는 프레임-변형이 포함되어 있어 조기 정지 코돈으로 이어진다. 이것은 체외에서 HIV-핵심수용체 기능을 상실하게 한다. CCR5-1은 야생형으로 간주되며 CCR5-2는 돌연변이 알레르기로 간주된다. CCR5에 대한 이질 변이를 가진 사람들은 HIV의 발달에 덜 취약했다. 한 연구에서, HIV 바이러스에 높은 노출에도 불구하고, HIV 양성반응을 보인 CCR5 돌연변이에 대한 동질성은 단 한 명도 없었다.[3]
타이-삭스병
Tay-Sachs 병은 중추신경계에 영향을 미치는 치명적인 질병이다. 그것은 유아와 어린 아이들에게서 가장 많이 발견된다. 질병의 진행은 자궁에서 시작되지만 증상은 생후 약 6개월이 될 때까지 나타나지 않는다. 그 병에 대한 치료법은 없다.[23] β-헥소사미디아제 A(헥스 A) 유전자의 돌연변이는 테이-삭스의 발병에 영향을 미치는 것으로 알려져 있으며, 이 중 67개가 질병을 일으키는 것으로 알려져 있다. 관찰된 돌연변이(65/78)는 대부분 단일 염기 대체 또는 SNP, 삭제 11개, 대형 1개, 소형 10개, 삽입 2개 등이다. 관찰된 돌연변이 중 8개는 프레임시프트, 6개는 삭제, 2개는 삽입이다. 11번 exon에서 4개의 염기쌍 삽입은 아슈케나지 유대인 인구의 80%에서 Tay-Sachs 질병 존재에서 관찰된다. 일시적인 돌연변이는 유아에게 질병에 영향을 미치는 것으로 알려진 코돈의 조기 중단으로 이어진다. 지연 발병은 4개의 다른 돌연변이에 의해 발생하는 것으로 보이며, 하나는 3개의 기본 쌍을 삭제하는 것이다.[24]
스미스-매거니스 증후군
스미스-마게니스 증후군(SMS)은 지적 장애, 수면 장애, 행동 장애, 다양한 두개골, 골격, 내장 이상 등이 수반되는 복합 증후군이다. 대부분의 SMS 사례에는 레티노산 유도-1(RAI1) 유전자를 포함하는 약 3.5Mb의 공통 삭제를 포함하고 있다. 다른 사례들은 청각 손실, 자기 학대 행동의 부재, 가벼운 글로벌 지연을 포함하여 RAI1 돌연변이에 대해 이전에 보여지지 않았던 SMS 표현 유형의 가변성을 보여준다. RAI1의 시퀀싱 결과 exon 3에서 헵탄 C-트랙트(CCCCCCCC) 돌연변이가 발견되어 프레임-변이가 발생했다. RAI1의 폴리 C-트랙에서 발생한 7건의 프레임-변형 중 4건(약 57%)이 이 헵틱 C-tract에서 발생한다. 결과는 이 헵탄 C-tract가 선호 재조합 핫스팟 삽입/탈착(SNINDels)이며 따라서 RAI1에서 돌연변이가 의심되는 환자의 주요 분석 대상임을 나타낸다.[25]
비대성심근증
비대성 심근증은 훈련된 운동선수를 포함한 젊은 층에서 급사하는 가장 흔한 원인으로 심장 사커의 단백질을 인코딩하는 유전자의 돌연변이에 의해 발생한다. 트로포닌 C유전자(TNNC1)의 돌연변이는 비대성 심근증의 희귀한 유전적 원인이다. 최근 연구에 따르면 프레임-임계 돌연변이(c.363dupG 또는 p)가 나타났다.트로포닌 C의 Gln122AlafsX30)은 19세 남성의 비대성 심근병증(그리고 갑작스러운 심장사)의 원인이었다.[26]
치료제
일시적인 돌연변이로 인한 질병의 치료법을 찾는 것은 드문 일이다. 이것에 대한 연구는 진행 중이다. 한 예로 1차 면역결핍증(PID)을 들 수 있는데, 이는 감염증 증가를 초래할 수 있는 유전적 질환이다. 일차적인 면역효능에 역할을 하는 120개의 유전자와 150개의 돌연변이가 있다. 표준 치료법은 현재 유전자 치료법이지만 이는 위험성이 높은 치료법이며 백혈병 등 다른 질병으로 이어질 수 있는 경우가 많다. 유전자 치료 절차에는 아연 프링거 누클레스 핵융합 단백질을 수정하여 돌연변이의 양쪽 끝을 잘라내는 과정이 포함되며, 이는 다시 염기서열에서 이를 제거한다. 항이센스-올리곤뉴클레오티드 매개 엑손 스킵도 듀케네 근위축증에 또 다른 가능성이다. 이 과정은 돌연변이를 통과시켜 나머지 염기서열이 프레임에 남아 있고 단백질의 기능이 그대로 유지되도록 한다. 그러나 이것은 병을 고치지 않고 증상만 치료하며 구조적인 단백질이나 다른 반복적인 유전자에만 실용적이다. 세 번째 수리 형태는 리턴트 모자이즘으로, 판독 프레임을 교정하는 두 번째 부위에서 역 돌연변이나 돌연변이를 일으켜 자연적으로 발생하고 있다. 이러한 반전은 유전체 내 재결합, 유사체 유전자 변환, 두 번째 부위의 DNA가 미끄러지거나 부위별 반전에 의해 발생할 수 있다. 이는 X 연계 중증결핍병합병면역결핍증(SCID), 위스코트-알드리히 증후군, 블룸 증후군 등 여러 질환에서 가능하다. PID에 도움이 되는 약물이나 다른 약리유전학적 방법은 없다.[27]
2003년 Bork의 유럽 특허(EP1369126A1)는 암의 예방과 DNA-미스매치 수리 결핍증(MMR) 산발적인 종양 및 HNPCC 관련 종양과 같은 암 및 예찰자의 치료 치료에 사용된 방법을 기록한다. 그 아이디어는 종양 세포에 대해 특별히 지시된 세포독성 T세포 반응을 이끌어내기 위해 종양 특유의 프레임-변형 돌연변이-유래펩타이드의 결합제 혼합물을 이용한 면역요법을 사용하는 것이다.[28]
참고 항목
참조
- ^ a b c d e f g h i j Losick, Richard; Watson, James D.; Baker, Tania A.; Bell, Stephen; Gann, Alexander; Levine, Michael W. (2008). Molecular biology of the gene (6th ed.). San Francisco: Pearson/Benjamin Cummings. ISBN 978-0-8053-9592-1.
- ^ "DNA Is Constantly Changing through the Process of Mutation". Nature. Retrieved 17 May 2019.
- ^ a b Zimmerman PA, Buckler-White A, Alkhatib G, Spalding T, Kubofcik J, Combadiere C, Weissman D, Cohen O, Rubbert A, Lam G, Vaccarezza M, Kennedy PE, Kumaraswami V, Giorgi JV, Detels R, Hunter J, Chopek M, Berger EA, Fauci AS, Nutman TB, Murphy PM (January 1997). "Inherited resistance to HIV-1 conferred by an inactivating mutation in CC chemokine receptor 5: studies in populations with contrasting clinical phenotypes, defined racial background, and quantified risk". Molecular Medicine (Cambridge, Mass.). 3 (1): 23–36. PMC 2230106. PMID 9132277.
- ^ Negoro S, Ohki T, Shibata N, Mizuno N, Wakitani Y, Tsurukame J, Matsumoto K, Kawamoto I, Takeo M, Higuchi Y (November 2005). "X-ray crystallographic analysis of 6-aminohexanoate-dimer hydrolase: molecular basis for the birth of a nylon oligomer-degrading enzyme". J Biol Chem. 280 (47): 39644–52. doi:10.1074/jbc.m505946200. PMID 16162506.
- ^ Zhang, J (August 2004). "Host RNA polymerase II makes minimal contributions to retroviral frame-shift mutations". The Journal of General Virology. 85 (Pt 8): 2389–95. doi:10.1099/vir.0.80081-0. PMID 15269381.
- ^ Cox, Michael; Nelson, David R.; Lehninger, Albert L (2008). Lehninger principles of biochemistry. San Francisco: W.H. Freeman. ISBN 978-0-7167-7108-1.
- ^ Sagher, Daphna; Turkington, Edith; Acharya, Sonia; Strauss, Bernard (July 1994). "Production of UV-induced Frameshift Mutations in Vitro by DNA Polymerases Deficient in 3′ → 5′ Exonuclease Activity". Journal of Molecular Biology. 240 (3): 226–242. doi:10.1006/jmbi.1994.1437. PMID 8028006.
- ^ Johnson, Neil P.; Walter A. Baase; Peter H. von Hippel (March 2004). "Low-energy circular dichroism of 2-aminopurine dinucleotide as a probe of local conformation of DNA and RNA". Proc Natl Acad Sci U S A. 101 (10): 3426–31. Bibcode:2004PNAS..101.3426J. doi:10.1073/pnas.0400591101. PMC 373478. PMID 14993592.
- ^ Baase, Walter A.; Davis Jose; Benjamin C. Ponedel; Peter H. von Hippel; Neil P. Johnson (2009). "DNA models of trinucleotide frameshift deletions: the formation of loops and bulges at the primer–template junction". Nucleic Acids Research. 37 (5): 1682–9. doi:10.1093/nar/gkn1042. PMC 2655659. PMID 19155277.
- ^ a b Hu, J; Ng, PC (9 February 2012). "Predicting the effects of frameshifting indels". Genome Biology. 13 (2): R9. doi:10.1186/gb-2012-13-2-r9. PMC 3334572. PMID 22322200.
- ^ Tucker, Tracy; Marra, Marco; Friedman, Jan M. (2009). "Massively Parallel Sequencing: The Next Big Thing in Genetic Medicine". The American Journal of Human Genetics. 85 (2): 142–154. doi:10.1016/j.ajhg.2009.06.022. PMC 2725244. PMID 19679224.
- ^ Walsh, T.; Casadei, S.; Lee, M. K.; Pennil, C. C.; Nord, A. S.; Thornton, A. M.; Roeb, W.; Agnew, K. J.; Stray, S. M.; Wickramanayake, A.; Norquist, B.; Pennington, K. P.; Garcia, R. L.; King, M.-C.; Swisher, E. M. (2011). "From the Cover: Mutations in 12 genes for inherited ovarian, fallopian tube, and peritoneal carcinoma identified by massively parallel sequencing". Proc Natl Acad Sci U S A. 108 (44): 18032–7. Bibcode:2011PNAS..10818032W. doi:10.1073/pnas.1115052108. PMC 3207658. PMID 22006311.
- ^ Walsh, T.; Lee, M. K.; Casadei, S.; Thornton, A. M.; Stray, S. M.; Pennil, C.; Nord, A. S.; Mandell, J. B.; Swisher, E. M.; King, M.-C. (2010). "Detection of inherited mutations for breast and ovarian cancer using genomic capture and massively parallel sequencing". Proc Natl Acad Sci U S A. 107 (28): 12629–33. Bibcode:2010PNAS..10712629W. doi:10.1073/pnas.1007983107. PMC 2906584. PMID 20616022.
- ^ 미국 특허 5,958,684 (1999년 9월 28일) Leeuwen 외 연구진 "신경퇴행성질환 진단"
- ^ a b Harfe, BD; Jinks-Robertson, S (July 1999). "Removal of frameshift intermediates by mismatch repair proteins in Saccharomyces cerevisiae". Molecular and Cellular Biology. 19 (7): 4766–73. doi:10.1128/MCB.19.7.4766. PMC 84275. PMID 10373526.
- ^ Davies, J E; Rubinsztein, D C (2006). "Polyalanine and polyserine frameshift products in Huntington's disease". Journal of Medical Genetics. 43 (11): 893–896. doi:10.1136/jmg.2006.044222. PMC 2563184. PMID 16801344.
- ^ Schmoldt, A; Benthe, HF; Haberland, G (1 September 1975). "Digitoxin metabolism by rat liver microsomes". Biochemical Pharmacology. 24 (17): 1639–41. doi:10.1016/0006-2952(75)90094-5. PMID 10.
- ^ Xu, XiaoLin; Zhu, KaiChang; Liu, Feng; Wang, Yue; Shen, JianGuo; Jin, Jizhong; Wang, Zhong; Chen, Lin; Li, Jiadong; Xu, Min (May 2013). "Identification of somatic mutations in human prostate cancer by RNA-Seq". Gene. 519 (2): 343–7. doi:10.1016/j.gene.2013.01.046. PMID 23434521.
- ^ "Cancer Genomics". National Cancer Institute at the National Institute of Health. Retrieved 24 March 2013.
- ^ Ogura Y, Bonen DK, Inohara N, Nicolae DL, Chen FF, Ramos R, Britton H, Moran T, Karaliuskas R, Duerr RH, Achkar JP, Brant SR, Bayless TM, Kirschner BS, Hanauer SB, Nuñez G, Cho JH (May 31, 2001). "A frameshift mutation in NOD2 associated with susceptibility to Crohn's disease" (PDF). Nature. 411 (6837): 603–6. Bibcode:2001Natur.411..603O. doi:10.1038/35079114. hdl:2027.42/62856. PMID 11385577. S2CID 205017657.
- ^ Farrell PM, Rosenstein BJ, White TB, Accurso FJ, Castellani C, Cutting GR, Durie PR, Legrys VA, Massie J, Parad RB, Rock MJ, Campbell PW (2008). "Guidelines for Diagnosis of Cystic Fibrosis in Newborns through Older Adults: Cystic Fibrosis Foundation Consensus Report". The Journal of Pediatrics. 153 (2): S4–S14. doi:10.1016/j.jpeds.2008.05.005. PMC 2810958. PMID 18639722.
- ^ Iannuzzi, MC; Stern, RC; Collins, FS; Hon, CT; Hidaka, N; Strong, T; Becker, L; Drumm, ML; White, MB; Gerrard, B (February 1991). "Two frameshift mutations in the cystic fibrosis gene". American Journal of Human Genetics. 48 (2): 227–31. PMC 1683026. PMID 1990834.
- ^ "Learning About Tay-Sachs Disease". National Human Genome Research Institute. Retrieved 24 March 2013.
- ^ Myerowitz, R (1997). "Tay-Sachs disease-causing mutations and neutral polymorphisms in the Hex A gene". Human Mutation. 9 (3): 195–208. doi:10.1002/(SICI)1098-1004(1997)9:3<195::AID-HUMU1>3.0.CO;2-7. PMID 9090523.
- ^ Truong, Hoa T; Dudding, Tracy; Blanchard, Christopher L.; Elsea, Sarah H (2010). "Frameshift mutation hotspot identified in Smith-Magenis syndrome: case report and review of literature". BMC Medical Genetics. 11 (1): 142. doi:10.1186/1471-2350-11-142. PMC 2964533. PMID 20932317.
- ^ Chung WK, Kitner C, Maron BJ (June 2011). "Novel frameshift mutation in Troponin C ( TNNC1) associated with hypertrophic cardiomyopathy and sudden death". Cardiol Young. 21 (3): 345–8. doi:10.1017/S1047951110001927. PMID 21262074. S2CID 46682245.
- ^ Hu, Hailiang; Gatti, Richard A (2008). "New approaches to treatment of primary immunodeficiencies: fixing mutations with chemicals". Current Opinion in Allergy and Clinical Immunology. 8 (6): 540–6. doi:10.1097/ACI.0b013e328314b63b. PMC 2686128. PMID 18978469.
- ^ 유럽특허[1] (2003년 12월 10일) 보크 외 연구진 "암 치료에 마이크로 위성 부위 프레임시프트 돌연변이 유도 펩타이드 코딩 사용"
추가 읽기
- Farabaugh PJ (1996). "Programmed translational frameshifting". Annu. Rev. Genet. 30 (1): 507–28. doi:10.1146/annurev.genet.30.1.507. PMC 239420. PMID 8982463.
- Lewis, Ricki (2005). Human Genetics: Concepts and Applications (6th ed.). Boston MA: McGraw Hill. pp. 227–8. ISBN 978-0-07-111156-0.
- "Nylonase Enzymes". 20 April 2004. Retrieved 2 June 2009.
외부 링크
![]() | 위키미디어 커먼스는 프레임시프트 돌연변이와 관련된 미디어를 보유하고 있다. |