방사성 유전체학

Radiogenomics

방사선유전체학이라는 용어는 두 가지 맥락에서 사용된다: 방사선에 대한 반응과 관련된 유전자 변이의 연구(방사선 유전체학) 또는 암 이미징 특성과 유전자 발현 사이의 상관 관계(이미징 유전체학)를 참조하기 위해서이다.

방사선 유전체학

방사선 유전체학에서 방사선 유전체학은 방사선 치료에 대한 반응과 관련된 유전자 변이의 연구를 참조하기 위해 사용된다.단일 뉴클레오티드 다형과 같은 유전자 변이는 방사선 치료 [1][2][3]후 암 환자의 독성 발생 위험과 관련하여 연구된다.방사선 [4][5]치료에 대한 종양 반응의 유전체학 연구에도 사용된다.

방사선유전체학이라는 용어는 18년 이상 전에 Andreassen 등에 의해 만들어졌다.약물 [6]반응과 관련된 유전자 변이를 연구하는 약제유전체학(pharmacogenomics)과 유사하다.「West 등」을 참조해 주세요.(2005)[7] 및 Bentzen(2006)입니다.[8]

방사성 유전체 컨소시엄

2009년에는 [9][10]방사선 치료에 대한 반응과 유전자 변형을 연결하는 연구자들의 다원적 협업을 촉진하고 촉진하기 위해 방사선유전체학 컨소시엄(RGC)이 설립되었다.방사선유전학 컨소시엄(http://epi.grants.cancer.gov/radiogenomics/))은 국립보건원 국립암연구소(http://epi.grants.cancer.gov/radiogenomics/))[11]의 역학 및 유전학 연구 프로그램에서 지원하는 암 역학 컨소시엄이다.RGC 연구진은 최근 전립선암 [12]환자의 방사선 독성과 관련된 유전자 변형을 식별하는 메타 분석을 완료했다.

이미징게노믹스

방사선 이미지는 질병을 대규모로 진단하는 데 사용됩니다. 조직 이미징은 조직 병리학과 관련이 있습니다.DNA 마이크로어레이, miRNA, RNA-Seq를 포함한 게놈 데이터의 추가는 세포 게놈과 조직 스케일 이미징 사이에 새로운 상관관계를 만들 수 있게 한다.

이미징게노믹스의 실천과 응용

영상유전체학에서 방사선유전체학은 생검을 사용하지 않고도 질병, 특히 암의 유전체를 식별할 수 있는 영상바이오마커를 만드는 데 사용될 수 있다.MRI, CT 및 PET 영상 기능과 SAM, VAMPE 및 GSEA를 포함한 질병의 유전체 사이의 통계적으로 유의한 상관관계를 찾기 위해 고차원 데이터를 다루는 다양한 기술이 사용됩니다.

영상방사선유전학적 접근방식은 예후가 낮은 매우 공격적인 뇌종양인 교아세포종의 MRI 표현형 관련 유전학을 결정하는 데 성공적이라는[13] 것이 입증되었다.GBM의 첫 번째 대규모 MR 영상 마이크로RNA-mRNA 상관 연구는 2011년 진 외[14] 연구진에 의해 발표되었다. 간암에 대한 유사한 연구는 비침습 영상 특징에서 [15]간암 게놈의 상당 부분을 성공적으로 규명했다.스탠포드 대학의 Gevaert 등 연구진은 CT 스캔에서 비소세포 폐결절의 이미지 특징을 연결하여 공개적으로 이용 가능한 유전자 발현 [16]데이터를 활용하여 생존을 예측할 수 있는 가능성을 보여주었다.이 출판물은 영상과 유전체학 [17]간의 시너지를 논하는 사설과 함께 나왔다.최근 스탠포드 대학의 Mu Zhou 외 연구진은 의미 이미지 특징과 표준 분자 경로를 나타내는 메타겐 사이의 다중 연관성을 보여주었고, 이는 비소세포 [18]폐암의 분자 특성을 비침습적으로 식별할 수 있다는 것을 보여주었다.

현재 전립선암에 [19][20][21]대해 몇 가지 방사선 유전학 연구가 수행되고 있으며, 일부에서는 MRI 신호와 관련된 유전적 특징도 종종 더 공격적인 [22]전립선암과 관련이 있다고 지적하고 있다.MRI의 보다 가시적인 병변에서 발견된 유전적 특징에 대한 체계적 검토는 종양 억제제 PTEN의 상실을 발견한 여러 연구를 확인했으며, 세포-ECM [23]상호작용뿐만 아니라 세포 증식과 관련된 유전자 발현을 증가시켰다.이는 특정 유전적 특징이 MRI에서 볼 수 있는 궁극적으로 유체 이동에 영향을 미치는 세포 변화를 촉진한다는 것을 나타낼 수 있으며 이러한 특성은 주로 [23]예후 불량과 관련이 있다.mpMRI에서 볼 수 있는 전립선 종양 환자의 보다 위험한 유전자 변화, 조직학 및 임상 결과의 조합은 '임상적으로 유의한 암'의 정의가 적어도 부분적으로 mpMRI [24]발견에 기초해야 한다는 제안으로 이어졌다.

방사선 유전학적 접근법은 유방암에도 성공적으로 적용되었다.2014년, Mazurowski [25]등은 컴퓨터 비전 알고리즘을 사용하여 계산한 MRI의 증강 역학은 유방암 환자의 유전자 발현 기반 종양 분자 서브타입과 관련이 있음을 보여주었다.

방사선학과 유전체학 사이의 연관성을 연구하는 프로그램은 펜실베니아 대학 UCLA, MD Anderson 암 센터, 스탠포드 대학 및 텍사스 휴스턴의 베일러 의과대학에서 활발히 진행되고 있습니다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

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