Elucidacion Estructuras Quimicas

1) DETERMINACIN DE LA FRMULA MOLECULAR.
Vamos a considerar las distintas posibilidades que se nos plantean:
A) Conocemos dicha frmula molecular.
Ya sea porque la hemos determinado por mtodos qumicos (anlisis elemental

cualitativo y cuantitativo seguido de determinacin del peso molecular por mtodos
fsicos), como porque se haya determinado utilizando Espectrometra de Masas de Alta
Resolucin (HRMS). En ambos casos pasaramos al paso 2.
B) Conocemos slo el peso molecular.
En primer lugar debemos saber si la sustancia a estudiar posee algn

oligoelemento distinto de C, H, O, N. en cuyo caso procederamos a restar a
dicho peso la masa correspondiente a dichos elementos.
Vamos a considerar, sin embargo, que la sustancia no posea ninguno de tales
oligoelementos :
F, Cl, Br, I, S, P, etc.. o sabemos exactamente el nmero de ellos.
En dicho caso utilizaremos una regla simple conocida como regla del 13,
consistir en dividir el peso molecular por 13 y de la observacin de dicha
operacin deduciremos una primera frmula emprica asignable al hidrocarburo:
CcocienteHcociente + resto
Ejemplo: PM = 128 128/13 = 9; Resto = 11 C9H20
A continuacin debemos observar el valor del peso molecular, si dicho valor es

par podemos pensar se trata de un producto orgnico que o bien no posee
Nitrgeno en su estructura o bien posee un nmero par de tomos del mismo.
Procederemos a continuacin a introducir en la frmula anterior tomos de
Oxgeno y/o Nitrgeno de acuerdo con la siguiente premisa: La introduccin de
un tomo de Oxgeno implica retirar de la misma CH4, de igual forma la
introduccin de un tomo de Nitrgeno implica retirar de la misma CH 2, as
para el caso considerado anteriormente tendramos: Sin Nitrgeno: C 9H20 + O
CH4 = C8H16O y sucesivamente C7H12O2; C6H8O3; Con Nitrgeno: Al ser par el
peso molecular debe poseer un nmero par de ellos, por lo que: C 9H20 + 2 N
2 CH2 = C7H16N2, a continuacin introduciendo Oxgeno obtendramos:
C9H16N2 + O CH4 = C6H12N2O y as sucesivamente C5H8N2O2,
La cuestin de cul de esas frmulas empricas es la frmula molecular debemos

hacerlo con ayuda de tcnicas espectroscpicas como IR, UV,1H-RMN 13C-RMN.
C) Conocemos la distribucin isotpica del pico molecular por EM
Si el compuesto slo posee C, H, N, O, F, P y I. La frmula molecular puede estimarse

a partir de las intensidades relativas de los picos de masas M+1 y M+2 respecto de M,
cumplindose:
% (M+1)/M = 1.1 n C + 0.36 n N

% (M+2)/M = (1.1 n C)2/200 + 0.20 n O
Con ambas expresiones podemos calcular la frmula molecular.
La limitacin viene dada por el hecho de que debemos saber el nmero de

oligoelementos presentes y que elementos como Cl, Br, S, Si, etc.. no son
monoisotpicos y desvirtuaran las intensidades de ambos picos, por lo que
impiden aplicar las frmulas anteriores.
Es necesario observar as mismo la paridad del pico molecular para poder
estimar la presencia o ausencia de nitrgeno.
D) No poseemos ninguno de los datos anteriores.
En tal caso debemos estimar la frmula molecular mediante un procedimiento indirecto

consistente en la observacin de todos los espectros del producto:
Del espectro de masas podemos sacar el fragmento de mayor masa y proceder

con el como si fuese el pico molecular (aunque no lo sea).
Del espectro de RMN de Carbono-13 podemos estimar una frmula mnima
observando en nmero de carbonos diferentes existentes. Y tambin el nmero
de protones si tenemos el off resonance" o el DEPT.
De los espectros de UV y visible podemos estimar la presencia de
oligoelementos presentes en la molcula.
Finalmente del espectro de RMN protnica podemos estimar el nmero de
hidrgenos.
2) DETERMINACION DEL INDICE O NMERO DE INSATURACIONES.
Dicho parmetro nos va a dar una idea bastante aproximada del tipo de producto que
estudiamos. Partimos para ello de la frmula molecular.
Para calcular dicho parmetro utilizaremos la expresin:
N.I. = {(2 .n C n H + n N)/2} + 1
Como podemos observar en la expresin no interviene el nmero de tomos de

oxgeno, ni otros oligoelementos.
Si en la frmula aparece S no se considera aunque el nmero de instauraciones

puede desvirtuarse: puede haber ms instauraciones pero estas estarn sobre
el tomo de azufre.
Si hay halgenos se consideraran equivalentes a tomos de hidrogeno
Si hay P (fsforo) se considerar equivalente a Nitrgeno pero debemos hacer
la misma consideracin que para el azufre.
Si hubiera Si, se considera equivalente al Carbono.
No se consideran otros oligoelementos
Ejemplos: Una frmula molecular de C12H14O4 dar
N.I. = (12.2-14)/2 + 1 = 6
Una frmula molecular de C7H5NO3 dar
N.I. = (7.2-5 + 1)/2 + 1 = 6
Una vez obtenido el nmero de instauraciones debemos tener en cuenta las siguientes
consideraciones:
Un ciclo equivale a una instauracin.

Un anillo bencnico o heterociclo aromtico hexagonal equivale a 4
insaturaciones: (tres dobles enlaces ms un ciclo).
Un heterociclo aromtico pentagonal equivale a tres instauraciones: (dos dobles
enlaces ms ciclo).
Un triple enlace equivale a dos instauraciones.
Un doble enlace equivale a una instauracin.
3) IDENTIFICACION DE LOS GRUPOS FUNCIONALES.
Una vez determinado el nmero de instauraciones debemos buscar a continuacin los

grupos funcionales presentes en nuestra molcula. Para ello las posibilidades a
considerar son muy diversas pero en la mayora de los casos es suficiente con observar
los espectros de UV e IR, principalmente este ltimo. Slo se van a resear algunas
cuestiones puntuales sobre grupos puntuales:
Si tenemos el espectro de UV, suele ser conveniente determinar el de las

absorciones, para ello utilizamos la Ley de Lambert-Beer:
= Absorbancia/longitudconcentracin
Los hidrocarburos aromticos y sus derivados suelen presentar una absorcin
en el UV en torno a los 250-270 nm que aparece como una serie de picos muy
juntos y con un pequeo. Si se trata de un producto conjugado no suele
observarse por aparecer una absorcin intensa ( > 10000) que hace a aquella
casi insignificante. En el IR suelen presentar una distribucin caracterstica del
tipo de sustitucin en la zona de 1600-2000 cm-1 que suele ser difcil de ver
debido a su baja intensidad. En torno a los 700 cm -1 tambin suelen dar
algunas absorciones caractersticas.
De todos los grupos carbonilos observables en el IR (~1700 cm -1), slo los
aldehdos y cetonas presentan absorcin en el UV (~290 nm, muy pequeo).
Algunas veces podemos asegurarnos del tipo de carbonilo observando el
espectro de C-13: mientras que aldehdos y cetonas resuenan en torno a 190-
210 ppm, los cidos y sus derivados lo hacen en torno a 170 ppm.
Los grupos hidroxilo (OH) suelen aparecer en el IR en torno a los 3300 cm -
1
como una banda ancha e intensa, en el caso de los cidos carboxlicos dicha
banda baja su frecuencia situndose en torno a los 3000 cm -1 englobando la
zona de los CH, adems la absorcin del carbonilo suele ser ms ancha de lo
habitual.
Los grupos amino(NH y NH2) en el caso de alifticos suele aparecer de una
forma similar a los OH comentados con anterioridad en el caso de productos
aromticos y en el de las amidas (R-CONH2), suelen aparecer como dos picos
distinguibles para el caso de los primarios (NH 2) y como una banda aguda para
los secundarios (-NH-). Los aminocidos suelen dar espectros de IR poco
resueltos y con bandas muy anchas.
4) IDENTIFICACION DE SUBESTRUCTURAS Y CONECTIVIDADES EN LA

MOLECULA.
Una vez determinado el nmero de instauraciones y los grupos funcionales presentes

en nuestra molcula el camino a recorrer se asemeja a la resolucin de un
rompecabezas, cada persona suele tener o adquirir su propia tcnica. Pero no por ello
podemos dejar de dar una serie de sugerencias:
Se observa en primer lugar el espectro de RMN de C-13 :y en el principalmente

tres factores:
o El nmero total de Carbonos diferentes existentes.
o Su desplazamiento qumico ().
o La existencia de subespectros (DEPT, off resonance, APT, etc..)
De ellos podemos deducir algunas caractersticas reseables como:
o Del recuento del nmero total de carbonos podemos deducir la simetra

de la molcula o en su caso las relaciones de equivalencia entre algunos
grupos.
o Dividindolo en zonas podemos obtener subestructuras:
De 160-210 ppm: Grupos carbonilo (CO)
De 100-160 ppm: Carbonos sp2 (etilnicos y aromticos)
De 0-100 ppm: Carbonos sp3 (alifticos)
o A su vez dependiendo del desplazamiento qumico podemos deducir
donde se encuentran anclados los grupos funcionales.
o Del la secuencia DEPT, del off resonance o las intensidades relativas
podemos deducir posibles tipos de sustitucin en anillos, subestructuras,
etc..
A continuacin en el espectro de RMN de protones tres son los parmetros a
destacar:
o El desplazamiento qumico de las seales ().
o Las integrales relativas.
o La multiplicidad de las seales.
Del desplazamiento qumico se deduce principalmente el entorno y tipo de los

diferentes tipos de hidrgenos.
De las integrales la equivalencia qumica de los diferentes grupos as como
importantes consecuencias sobre la simetra de la molcula.
De la multiplicidad de las seales se van a obtener principalmente informacin
sobre la conectividad, relaciones espaciales, subestructuras, estereoqumica,
etc..
Finamente observaremos el espectro de Masas (generalmente obtenido por la
tcnica de Impacto electrnico) y en el tambin tres factores:
o Intensidades de los picos y relacin m/e de los picos mas intensos
o Diferencias de masas entre dichos picos.
o La posible existencia de picos metaestables.
Las intensidades nos van a indicar la existencia determinadas agrupaciones o

subestructuras muy caractersticas, por ejemplo los picos de masa 91 (bencilo),
43 (acetilo), 31 (metoxilo), etc...
Las diferencias de masas deben de ser lgicas desde el punto de vista qumico y
de alguna manera nos indican las secuencias y/o conectividades existentes en
la molcula
La existencia de picos metaestables est asociada a la secuencia de
fragmentacin de la molcula y nos indican igualmente conectividades en ella.
5) IDENTIFICACION DE LA ESTRUCTURA.
Una vez determinado todo lo anterior lo que nos resta es proponer una o varias
posibles estructuras ismeras de la molcula y decidir cual de ellas se ajusta ms a
todos los datos espectroscpicos que poseemos.
Para ello volveremos a repasar con cada una de ellas todos y cada uno de los datos
espectroscpicos, normalmente en sentido inverso al utilizado para la eleccin,
eligiendo aquella que ms se ajuste a ellos. Suele ser de mucha utilidad para ello la
utilizacin de Tablas para la elucidacin estructural como las que se recogen en la
mayora de los manuales de problemas de elucidacin estructural. 2
6) JUSTIFICACIN TEORICA DE LOS DATOS ESPECTROSCPICOS DE LA

MOLCULA.
Una vez asignada podramos pasar a justificar todos los datos espectroscpicos de
acuerdo con los manuales existentes para cada una de las tcnicas. Y si es posible
asignar configuraciones o conformaciones a la molcula.

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1) DETERMINACIN DE LA FRMULA MOLECULAR.

Vamos a considerar las distintas posibilidades que se nos plantean:

A) Conocemos dicha frmula molecular.

Ya sea porque la hemos determinado por mtodos qumicos (anlisis elemental

B) Conocemos slo el peso molecular.

En primer lugar debemos saber si la sustancia a estudiar posee algn

Ejemplo: PM = 128 128/13 = 9; Resto = 11 C9H20

A continuacin debemos observar el valor del peso molecular, si dicho valor es

La cuestin de cul de esas frmulas empricas es la frmula molecular debemos

C) Conocemos la distribucin isotpica del pico molecular por EM

Si el compuesto slo posee C, H, N, O, F, P y I. La frmula molecular puede estimarse

% (M+1)/M = 1.1 n C + 0.36 n N

Con ambas expresiones podemos calcular la frmula molecular.

La limitacin viene dada por el hecho de que debemos saber el nmero de

D) No poseemos ninguno de los datos anteriores.

En tal caso debemos estimar la frmula molecular mediante un procedimiento indirecto

Del espectro de masas podemos sacar el fragmento de mayor masa y proceder

2) DETERMINACION DEL INDICE O NMERO DE INSATURACIONES.

N.I. = {(2 .n C n H + n N)/2} + 1

Como podemos observar en la expresin no interviene el nmero de tomos de

Si en la frmula aparece S no se considera aunque el nmero de instauraciones

Ejemplos: Una frmula molecular de C12H14O4 dar

N.I. = (7.2-5 + 1)/2 + 1 = 6

Un ciclo equivale a una instauracin.

3) IDENTIFICACION DE LOS GRUPOS FUNCIONALES.

Una vez determinado el nmero de instauraciones debemos buscar a continuacin los

Si tenemos el espectro de UV, suele ser conveniente determinar el de las

4) IDENTIFICACION DE SUBESTRUCTURAS Y CONECTIVIDADES EN LA

Una vez determinado el nmero de instauraciones y los grupos funcionales presentes

Se observa en primer lugar el espectro de RMN de C-13 :y en el principalmente

De ellos podemos deducir algunas caractersticas reseables como:

o Del recuento del nmero total de carbonos podemos deducir la simetra

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