Aminoacidos & Proteinas (Parte A-Marzo 2020)
Aminoacidos & Proteinas (Parte A-Marzo 2020)
Aminoacidos & Proteinas (Parte A-Marzo 2020)
1. Introducción
Las proteínas, del griego proteios (que significa primero), son una clase de com-
puestos orgánicos que están presentes y son esenciales en cada célula viva. Las
proteínas que constituyen la piel, cabello,, cartílagos, músculos, tendones y liga-
mentos proporcionan la estructura al cuerpo de un organismo multicelular mante-
níendolo unido y protegido.
Por otro lado, las proteínas pueden actuar como enzimas, hormonas, anticuerpos,
y globulinas, catalizando, regulando y protegiendo la química de cuerpo. En la for-
ma de hemoglobina, mioglobina y varias lipoproteínas, ellas efectúan el transporte
del oxígeno y otras sustancias dentro de un organismo.
Son además las moléculas orgánicas mas abundantes en los animales, jugando
papeles importantes en todos los aspectos de la estructura celular.
c)
↓ ↓ ↓ ↓ ↓
d)
Con la excepción de la prolina (P), todos ellos son aminas 1rias. y todos son qui-
rales excepto la glicina (G).
Siete de los 20 a.a. naturales contienen una porción hidrocarburo como el susti-
tuyente R.
Dos α. a. ácido aspártico (D) y acido glutámico (E) contienen grupos carboxili-
cos en la cadena lateral o sustituyente R y a continuación les siguen la aspara-
gina (N) y la glutamina (Q) que son sus amidas correspondientes.
Al contener un grupo acídico y un grupo básico, presentan una reacción interna
ácido-base que los transforma en una estructura amonio carboxilato: ion dipolar
o zwitterion ( alemán, zwitter = “híbrido”).
En efecto, la parte acida del amino ácido es el grupo +NH3, no el grupo –COOH.
La parte básica es el carboxilato: –COO- y no el grupo amino libre -NH2 .
Debido a que los amino ácidos contienen tanto el grupo amonio ácido (- +NH3 )
como el carboxilato (–COO- ) básico, ellos son anfóteros (porque reaccionan
como ácidos y como bases). La forma predominante depende del pH de la solu-
ción.
“ En el rango del pH fisiológico, tanto los grupos carboxílicos como los amino
de los a-amino ácidos están completamente ionizados”
A pH > 10 , el grupo amino existe como base neutra y el carboxilo como su base
conjugada (anión carboxilato), así que la alanina tiene carga neta negativa.
Ejemplos:
Cisteína:
los grupos ácidos similares son: la función carboxilo a (pKa = 2.1) y la función
carboxilo de la cadena lateral (β al grupo amino, con pKa = 3.9) , por lo cual el
pI = (2.1 + 3.9)/2 = 3.0.
Por ejemplo, en la arginina los ácidos similares son el grupo amonio de la parte
guanidinio de la cadena lateral (pKa = 12.5) y la función amonio α (pKa = 9.0),
así que el pI calculado = (12.5 + 9.0)/2 = 10.75.
Para tales experimentos una solución buffer ionica se incorpora en una matriz sólida,
compuesta de papel o una sustancia gelatinosa (e.g. capa de acrilamida entrecru-
zada). Así, una pequeña cantidad de muestra del a.a. , péptido o proteina se colo-
ca cerca del centro de la tira de la matriz y entonces se aplica un potencial eléctrico
a los extremos de la tira (a través de dos electrodos) como se muestra en el diagra-
ma (Fig. 3).
5. 1 Aminación reductiva
Este método considerado uno de los mejores para obtener aminas de aldehídos y
cetonas, también puede aplicarse en la obtención de amino ácidos, si se parte de
α-cetoácidos, los cuales se tratan con amoniaco y luego se aplica un proceso re-
ductivo.
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Luz Marina Jaramillo Gómez
Ejemplo:
Uno de los mejores métodos para sintetizar α-amino ácidos es una combinación
de la síntesis de Gabriel para aminas, con la síntesis del éster malónico.
La ftalimida de potasio (o sodio) reacciona con el bromo malonato de dietilo a tra-
vés de una reacción SN2. El derivado es posteriormente alquilado mediante otra
reacción SN2 y el producto se hidroliza en medio básico formando ftalato de potasio
y un dicarboxilato α-amonio que bajo tratamiento ácido y calentamiento,
descarboxila al α-amino ácido. Todo este proceso se muestra a continuación:
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Luz Marina Jaramillo Gómez
Mecanismo:
En medio alcalino de NaOH, el ion OH- ataca uno de los grupos carbonilo de la funcion imido,
del ftalimido alquilmalonato de dietilo Q, se rompe uno de los enlaces C-N y se desprende par-
cialmente el apendice alquilmalonato de dietilo. Tambien hay ataque de otro OH- sobre una las
funciones ester para formar carboxilato de sodio. Un segundo ataque del ion OH- sobre el
carbonilo de la function amido y rompimiento posterior formara un anion amiduro, ademas de
la saponificacion del otro grupo ester hasta liberar el alquilmalonato con la incorporacion del
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grupo amino.
Luz Marina Jaramillo Gómez
Mecanismo: Liberacion del α-aminoacido T desde el grupo ftalimido:
Un segundo ataque del ion OH- sobre el carbonilo de la function amido y rompimiento posterior
formara un anion amiduro, ademas de la saponificacion del otro grupo ester hasta liberar el al-
quilmalonato con la incorporacion del grupo amino formando S, ftalato de sodio y etanol. El tra
tamiento acidico en caliente de S y ftalato de sodio forma el α-aminoacido T y acido ftalico.
Mecanismo:
Etapa 1:
Los amino ácidos sufren las reacciones estándar tanto de las aminas como de
los ácidos carboxílicos. Pueden seleccionarse cuidadosamente las condiciones
para algunas de estas reacciones, de tal forma que el grupo amino no interfiera
con las reacciones del grupo carboxílico y viceversa. Se considerarán las reaccio-
nes mas útiles: esterificación del grupo -COOH y acilación del grupo –NH2.
Con ello estaríamos protegiendo uno u otro de estos grupos para modificar o aco-
plar el otro grupo con otro amino ácido. Los amino ácidos también sufren reaccio-
nes que son específicas a la estructura del α-amino acido. Uno de tales reaccio-
nes es la formación de un producto coloreado bajo tratamiento con ninhidrina.
Ejemplos:
Los esteres de los amino ácidos se usan a menudo como derivados protegidos
de los mismos, los cuales previenen al α. a. de reaccionar en forma indeseada por
la parte del carboxilo. Lo esteres de metilo, etilo y bencilo son los mas comunes.
Al acilar el grupo amino resulta el grupo protector mejor conocido como t-butil-
carbonilo (t-BOC) ampliamente usado en síntesis de péptidos, el cual es fácil de
remover posteriormente.
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6.3 Reacción con Ninhidrina
El compuesto hidrato de tricetohidrindeno (ó ninhidrina) es un reactivo especifi-
co para α-amino ácidos (excepto la prolina), que genera un derivado imino de co-
lor púrpura el cual es un anión estabilizado por resonancia denominado púrpura de
Ruhemann, y un aldehído (RCHO). Este color se observa con los α-amino ácidos
independiente de la estructura del amino ácido, constituyéndose en una prueba de
reconocimiento de α-amino ácidos.
4. Acoplamiento Oxidativo
-
R COO- [O] OOC R R COO-
H-S S S
+ NH3 [H] + NH3
+ NH3