BioMol Lab Sesion 6 - Electroforesis

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Laboratorio de Biología Molecular – Biología UPTC

Grupo de lab​: _______,


Integrantes Código
Julieth Andrea Niño Mendoza 201524044
Sandra Lucía Góngora Monzón 201721854
Edith Johana Pinilla GiL 201721913
Roberto Muñoz S. 201721760

ELECTROFORESIS

1. OBJETIVOS

● Conocer los principios de la electroforesis


● Identificar las dos principales técnicas de electroforesis que se realizan en biología molecular
● Reconocer las diferencias entre las electroforesis de ácidos nucleicos y de proteínas

2. PROCEDIMIENTO

2.1. PARTE 1: Durante esta parte de la sesión se presentarán los siguientes videos
(subtitulados) ilustrativos:

● Science education: “DNA gel electrophoresis”


● Science education: “Separating Protein with SDS-PAGE”

2.2. PARTE 2​: Durante esta parte de la sesión los estudiantes revisaran los siguientes videos
(disponibles en el aula virtual o en YouTube):

● Easy method for separating charged molecules Gel Electrophoresis - Science Snacks:
https://www.youtube.com/watch?v=OPMPAx1obIo&t=326s
● DIY Biology: Build a gel electrophoresis kit and conduct experiments with step-by-step
instructions: ​https://www.youtube.com/watch?v=NYLgCq0HiH4&t=413s

a. Diríjase al siguiente enlace: ​https://learn.genetics.utah.edu/content/labs/gel/ y realice la


simulación de una electroforesis siguiendo las instrucciones de la página.

b. Conteste el siguiente cuestionario a partir de la información de esta guía, la sesión de clase y


otras fuentes.

a. ¿Cuál es la finalidad de la electroforesis en gel?

La electroforesis en gel es una técnica utilizada para separar fragmentos de DNA (u


otras macromoléculas, como RNA y proteínas) por su tamaño y carga.
b. Determine las cantidades de agarosa que necesitaría pesar para preparar un gel de
agarosa a las siguientes concentraciones e consulte el rango en pares de bases (bp)
óptimo para cada concentración

g de agarosa Porcentaje final Volumen final Rango bp


1 0,35 0.7 % 50 ml 800-12,000
2 0,5 2% 25 ml 50-2,000
3 2,4 3% 80 ml <100

c. La siguiente imagen corresponde a un gel de agarosa al 3% en el que se separaron


fragmentos de DNA obtenidos de una digestión enzimática. Con base al patrón de peso
molecular (MP, que corresponde al Hyperladder V), determine los posibles tamaños de
los fragmentos en las muestras 2, 4, 8 y 9.

Muestra Tamaño en pares de bases (pb)


Carril 2 500 250
Carril 4 500 300 200
Carril 8 400 300 200
Carril 9 400 300 200

d. En la electroforesis, el tamaño, la forma y la conformación de la molécula influye en el


corrido electroforético. La siguiente imagen corresponde a una electroforesis que se
corrió para confirmar la extracción de un plásmido (DNA circular de menor tamaño que
el DNA genómico) que tiene un peso de 3200 pb. La misma muestra se sembró en dos
pozos (P1 y P2) junto con un marcador de peso (MP) ¿Por qué se ven 3 diferentes
bandas en el gel, si la muestra corresponde a un solo plásmido

RTA: En la banda se observan tres bandas de diferente intensidad y tamaño, que


corresponden a las tres formas principales de enrollamiento del DNA plasmídico.

e. La siguiente imagen corresponde a un SDS-PAGE. Se observa una banda a 25 kDa


(señalada con fechas rojas) que es la banda esperada de la proteína que se está
analizando. Sin embargo, también se observa una banda que tiene un peso de 50 kDa (el
doble de la banda esperada) y de mayor grosor. ¿A qué cree usted correspondería esta
banda, si la muestra que se corrió en la electroforesis corresponde a una única proteína?

RTA: que la carga, el tamaño y la forma de la proteìna afecta a todas sus tasas de
migraciòn electroforéticas.

3. REFERENCIAS
Fritsch, R.J. Krause. I. (2003). ​Electrophoresis. Encyclopedia of Food Sciences and Nutrition (Second
Edition), Academic Press, Editor(s): Benjamin Caballero. Pages 2055-2062. ISBN
9780122270550.

Espinosa-Asuar L. (2007). Capítulo 17: Guía practica sobre la tecnica de PCR. Ecología molecular
Editor: México: Secretaría de Medio Ambiente y Recursos Naturales, Instituto Nacional de
Ecología: Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad. Páginas 517-539.
ISBN 9789688178393

Garfin DE. (2009). ​One-dimensional gel electrophoresis​. Methods Enzymol 463: 497–513

Scull. J.C. (2014). ​Nucleic Acid Extraction Techniques. Pathobiology of Human Disease,​ Academic
Press, Editor(s): Linda M. McManus, Richard N. Mitchell. Pages 4059-4063. ISBN
9780123864574,

BIO-RAD. ​A Guide to Polyacrylamide Gel Electrophoresis and Detection​. Bio-Rad Laboratories, Inc.
[Citado: 2020/07/05]. ​https://www.bio-rad.com/webroot/web/pdf/lsr/literature/Bulletin_6040.pdf

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