Clase #3 Sistema Amortiguador y Aminoácidos
Clase #3 Sistema Amortiguador y Aminoácidos
Clase #3 Sistema Amortiguador y Aminoácidos
Cuando hablamos de estos compuestos nos vamos más hacia la química orgánica y
entendemos entonces:
En nuestro organismo existen líquidos corporales, somos 70 % agua pero ¿Cómo está
influenciado ese medio acuoso por todos los solutos? Nuestro medio acuoso tiene un medio
intracelular que tiene compuestos básicos y compuestos ácidos y estos solutos necesitan
estar en equilibrio, dicho equilibrio se llama o factor que nos dice como está el ácido y la
base es el pH (pH fisiológico de la sangre 7.35 para la sangre venosa y 7.45 para la sangre
arterial, es decir, este umbral o limite es estrecho porque esos H que se liberan en el ácido
pueden ser captados por diversas moléculas, no solo por el sodio, nuestras moléculas
biológicas que son: proteínas, lípidos, carbohidratos, ácidos nucleicos, etc que pueden ser
sencillas como pueden ser los aminoácidos, de los monosacáridos o azucares simples o
pueden ser complejas en el caso del ADN que es un polinucleotido, en el caso de la
proteína que es un polipeptido.
Las enfermedades tienen origen molecular.. ya que si hay un derrame de sangre por
ejemplo, se están secretando proteínas etc, y estas son moléculas… por ende el tratamiento
va a depender de como responda el organismo o células a lo que se aplique.
H2CO3 HCO3- + H+
Es una reacción química reversible que se da en todos los líquidos corporales para
amortiguar (amortiguamiento: equilibrio o mantenimiento del PH), captar, mantener el
equilibrio de los hidrogeniones en la producción de líquidos corporales. El hidrogenión se
une con el bicarbonato y forma acido carbónico ¿pero qué pasa con esa reacción?
¿Qué pasa en los líquidos corporales? Fíjense que, en esta tabla en donde tenemos el pH
neutro que es 7, por debajo de 7 hay acidez y por encima de 7 hay alcalines y alrededor de
este valor (7) se encuentran todos los líquidos corporales (la saliva la leche materna el
sudor las lágrimas). Del 7 para abajo en líquidos corporales solamente el jugo gástrico
francamente acido.
Los liquidos corporales (jugo pancreático, sangre, orina, saliva, liquido cefalorraquídeo,
pericárdico, billis, liquido sinovial, la linfa, el peritoneo). Ningún órgano es seco. La
medula ósea es un líquido, es el tejido que genera a las células sanguíneas, es uno de los
pocos tejidos pluripotenciales, es decir, que puede generar muchos tipos de células.
Nuestra composición es acuosa, por ende no podemos dejar de recordar que el agua
también puede ionizarse (cargarse de forma positiva o negativa). El agua no tiene carga
neta, pero si carga parcial NO HAY ORBITALES DESAPAREADOS pero si hay una
bipolaridad en donde hay un polo cargado parcialmente positivo y un polo cargado
parcialmente negativo porque el agua es un DIPOLO.
Ka: constante de disociación del ácido. Este valor nos dice si es un componente o
un ácido fuerte o débil. Pero, este se puede relacionar con el pH y surge la
definición del pKa.
pKa: es el valor del pH al cual el acido se encuentra disociado en un 50 % y eso es
importante porque para nuestros liquidos corporales tenemos que tener una
proporción equitativa de acido y de base para amortiguar el producto del
metabolismo. Si se produce mucho acido tenemos un 50 % de base que va a captar
el hidrogenión pero si, por el contrario, estamos produciendo poco acido, el acido
que sea de ese 50-50 va a poder liberar hidrogeniones. Por ende decimos, que es una
molecula que puede estar disociada o asociada y su pKa me dice que hay un punto
en el pH en que el 50% de su molecula esta comportándose como acido y el otro 50
% como base.
Las moléculas que tengan su pKa cerca del pH fisiológico van a ser los amortiguadores
que son moléculas que pueden comportarse como ácidos o como bases a un pH
determinado (pKa) y esas moleculas que tengan un pKa cercano al pH fisiológico (7.4) en
los liquidos corporales van a estar 50-50 o 40-60 pero en una proporción significativa que
permita el amortiguamiento.
- (ka) se saca con: la molecula sin disociar, la molecula como acido (disociada) y los
hidrogeniones libres. Se puede observar la base conjugada porque esta unido,
asociado al hidrogenión.
- (pKa) es el –log del ka.
Lo que pondrá en el parcial es: si tienes un pKa de tanto y el pH es tal ¿Cómo se comporta
el compuesto?
Dependiendo de la molécula, puede disociarse de distintas maneras, puede estar como base
conjugada (puede estar cargada positiva, neutra o negativa dependiendo de la naturaleza de
los átomos que la componen) y al disociarse (esa base conjugada) puede disociarse en
hidrogeniones y el átomo o el resto de la molécula sin carga, puede disociarse y las dos
partes de la molécula estar cargadas, o puede disociarse y tener el hidrogenión libre y
cargarse negativamente con doble electrón sin aparear(esto lo veremos mejor en aa).
Aquellos grupos funcionales que tengan capacidad de disociación van a tener un pKa, sea
de la molécula: proteínas, carbohidratos, en el caso de los lípidos, son moléculas apolares
por lo tanto no tienen un valor de KA porque como tienen mucho carbono este se estabiliza
con el H y no se disocia. Por eso para romper los enlaces de los ácidos grasos se necesita
CALOR. Ejemplo: al calentar la mantequilla, estamos modificando su forma.
El HCL es un ácido fuerte, que tiene forma disociada y asociada, pero se favorece su forma
disociada en los líquidos corporales. Solo se encuentra en el jugo gástrico. Esta el hidróxido
de sodio que no está en el cuerpo.
La sal tiene una constante de disociación, y al estar en un medio acuoso se disuelve, igual
pasa con ese HCL y otros solutos en los líquidos corporales, se favorece su disociación
porque existen moléculas como el agua que tienen carga electronegativa que van a
asociarse con el sodio y cargas positivas que van a asociarse con el cloro. (NaCl).
Pares de amortiguadores
En los líquidos corporales son aquellos que tengan pKa cerca del pH fisiológico.
Proteínas. Como la hemoglobina que está dentro del eritrocito circulando en la sangre es
Vital para mantener el amortiguamiento de los hidrogeniones.
2-. Fosfato – ácido fosfórico. . Importante función en parte intracelular y tubos renales.
Tienen la capacidad de amortiguar en pH acido por ende funciona como amortiguador en
los túbulos renales. Este acido tiene 3 hidrogeniones y al disociarse al pKa 2 pierde uno y
así puede ir perdiendo hidrogeniones dependiendo del requerimiento. Estas moléculas que
tienen más de un hidrogeno para donar son muy importantes en los líquidos corporales
porque pueden funcionar en distintos pH dependiendo del lugar anatómico en el que se
encuentren. El glomérulo que está en los riñones, se encarga de hacer filtrado del plasma
sanguíneo. En los tubos renales se produce la orina que tiene un pH acido porque es un
producto del metabolismo y porque nuestra dieta generalmente está centrada en proteínas y
estas generan productos de desecho ácidos. Puede ser acido el pH de la orina en un estado
patológico o condición nutricional donde consumas mayor cantidad de productos que
generen metabolitos alcalinos. En estos tubos tienen capacidad de disminuir o aumentar el
volumen de la orina y tienen la capacidad de secretar hidrogeniones, ya que, si nuestro
medio es acido debemos buscar la manera de deshacernos de eso, esto es logrado a través
de tres vías: mediante amortiguamiento, liberándolos con la respiración o mediante la orina.
3-. Bicarbonato – ácido carbónico. Tenemos dióxido de carbono, agua, ácido carbónico,
bicarbonato, hidrogeno. Es una reacción totalmente reversible, ¿Para qué sirve, que se
produce en la célula?. Productos acidos (Hidrogeniones), que son amortiguados por el
bicarbonato que está en el líquido extracelular ¿el hidrogenión pasa por la membrana? SI, al
igual que el CO2 porque es muy pequeño, este es amortiguado por el bicarbonato el cual se
transforma en un ácido débil que es disociado de manera distinta por un enzima que está en
todos los tejidos llamada ANHIDRASA CARBONICA (las enzimas son catalizadores
que aumentan la velocidad de reacción y son capaces de transformar el sustrato en
producto. Ellas NO regulan la reacción, son reguladas por otros factores).
Esta enzima modifica o cataliza la disociación del ácido en dos moléculas totalmente
distintas y cargadas, el hidrogeno altera el pH y el bicarbonato es su amortiguador, pero
cuando vamos al otro lado de la reacción tenemos un CO2 que tiene naturaleza GASEOSA
en nuestro organismo y el H2O que es un componente de los líquidos corporales (solvente
universal de nuestras células), entonces, ¿se puede decir que estos compuestos modifican
a ese acido? NO, debido a que el CO2 no posee hidrogeno y es liberado por la respiración,
y que el agua a pesar de poseerlos tiene una constante de disociación prácticamente nula, se
disocia muy poco, es decir no tiene un poder acido. Entonces esta será la primera forma de
amortiguar los hidrogeniones, hay un producto que se libera (CO2) y un producto que
mantiene el medio acuoso (H2O).
Los trastornos del equilibrio acido base tiene que ver con sus componentes, si se retiene
CO2 (cuando hay enfermedad obstructiva, infección) por impedimento de su salida, se
producirá bicarbonato e hidrogeno porque la reacción se va hacia ese lado, entonces si
estoy produciendo hidrogeno en mi sistema amortiguador y en la célula va a existir una una
ACIDOSIS RESPIRATORIA.
Si por el contrario hay mucha producción hidrogenión en la célula la reacción se irá hacia
la producción de CO2 y H2O, si NO hay problema respiratorio, el CO2 puede salir y se
habla de una ACIDOSIS METABOLICA.
Los otros componentes como el hidrogeno y el bicarbonato tienen un control renal, porque
en esta reacción al obtener agua la regulación del hidrogeno y la recuperación de
bicarbonato es vital en el riñón el que es capaz de reabsorber el bicarbonato que se filtra y
regenerarlo, por tanto, el control del pH no solo depende de los amortiguadores sino
también de una buena funcionabilidad respiratoria y renal ya que si hay afección renal se
presentaran problemas en el equilibrio acuoso.
Por tanto a esos componentes se les llama componentes metabólicos y son responsables al
alterarse su concentración, producción, reabsorción de la acidosis (acumulación exagerado
de la producción de H o problemas en producción de bicarbonato) y alcalosis (disminución
de hidrogeniones PRINCIPAL, o mayor concentración de bicarbonato).
Hay que tomar en cuenta de que la sangre no siempre tendrá un pH de 7.4, porque en el
momento en el sitio donde se encuentran los capilares que están recibiendo gran cantidad
de grupos ácido que salen a la circulación, en ese sitio inmediato el cual NO se puede
medir, no hay un pH de 7.4 sino más bajo porque las células están saliendo a la superficie y
en ese momento es fundamental el funcionamiento del sistema amortiguador bicarbonato
acido carbónico. Por lo tanto no debe alarmarnos el hecho de que su capacidad
amortiguadora este por debajo de 7, más bien es una ventaja o favorece la captación de los
hidrogeniones en el sitio de interacción gaseosa que es el capilar.
BIOMOLECULAS.
Las biomoleculas tienen grupos funcionales (amino, fosfato, carboxilo) aquellos que
presentan alguno de estos 3 grupos funcionales que pueden cargarse, pueden disociarse
tienen capacidad amortiguadora dependiendo de su naturaleza atómica, hay ciertos
compuestos que tienen hidrogeno poseen capacidad amortiguadora alcalina (GRUPOS
BASICOS), aquellos que tengan un grupo funcional con fosfato tendrán capacidad
amortiguadora cercana al pH fisiológico (AMORTIGUADORES/NEUTRO). Y aquellos
que tengan grupos carboxílicos tendrán cualidades amortiguadoras acidas (GRUPOS
ACIDOS).
Curva de titulación, para saber el comportamiento de una molécula que libera o capta
hidrogeniones. Dependiendo de su capacidad (el grupo carboxilo es acido por tanto va a
asociarse a pH ácido y a disociarse a pH alcalino. Ocurre lo mismo con el grupo fosfato, se
asocia a pH más bajo y se disocia a pH más alto. El grupo básico tiene la capacidad de
asociarse y disociarse dependiendo del rango de pH en que lo coloquemos:
El primer pKa es el del grupo acido, debajo de ese pKa el grupo acido estará
conjugado, unido al hidrogenión
El segundo pKa es del grupo amino, está lejos de su pkA está tratando de llegar al
mismo, tiene sus hidrógenos con el y ese estado hace que se cargue positivamente
porque tiene exceso de carga positiva al estar unido a hidrogeniones.
Jugo
gástrico
Esto pasa en una titulación simple de un solo aminoácido, es mucho más complejo
cuando hablamos de una proteína que puede tener 50, 100, 200 hasta 2000 aminoácidos, no
podemos decir que el aminoácido 600 de la proteína tal tiene un pKa de tal, ahí se hace un
cálculo y se llega a determinar el pka de la proteína en conjunto que no es más que la
acción de cada grupo funcional unido por la proteína ¿Por qué? , porque no es lo mismo el
aminoácido SÓLO que puede comportarse de una manera porque no está asociado a una
molécula, a que estuviese unido covalentemente con una cadena poli peptídica, porque ahí
la manera de comportarse cambia porque a pesar de ser el mismo grupo funcional por
ejemplo carboxilo, no es lo mismo su pKa en cada uno de los diferentes aminoacidos
porque son moléculas distintas.
AMINOACIDOS.
De hecho, las enzimas que interactúan con una proteína, lo pueden hacer solamente
si la proteína tiene configuración de Aminoácidos L. Si ese aminoácido tiene configuración
distinta la proteína no lo reconoce porque estructuralmente tiene una forma en el espacio
diferente.
Los 20 aminoácidos son:
Alifáticos: Tienen una cadena lateral compuesta por Carbono, la cual no tiene
elementos que sean polares. No forman enlaces de carga con otro compuesto y
generalmente van a estar ubicados en la parte HIDROFOBICA de las proteínas, es
decir, aquella parte de las proteínas que no está en contacto con el agua
Glicina (Gly) [G]
Alanina (Ala) [A]
Valina (Val) [V]
Leucina (Leu) [L]
Isoleucina (Ile) [I]
Con Hidroxilo o Azufre: Por tener compuestos diferentes al Carbono, pueden ser
protagonistas de que ese grupo funcional sea reactivo o de catálisis enzimáticas,
enlaces que formen estructura de fijación.
Serina (Ser) [S]
Cisteína (Cys) [C]
Treonina (Thr) [T]
Metionina (Met) [M]
Cíclicos: La cadena lateral no termina en forma lineal sino que se cicla o permite
una unión para formar un anillo con un sustituyente del Carbono Alfa. Esta
característica le brinda el hecho de ser muy pequeña.
Prolina (Pro) [P]
Existen ciertas Propiedades que presentan los aminoácidos debido a esos grupos
funcionales que forman parte tanto de su Carbono Alfa como de su cadena lateral,
hablamos de un término que se llama Pka, el cual se define como el valor de PH, al cual un
compuesto esta 50% en forma asociada al Hidrogeno y 50% en forma disociada al
Hidrogeno y por lo tanto puede tener carga
El Pka del Grupo Carboxilo del carbono alfa esta alrededor de 2, es decir es ácido,
cuando el PH aumenta por encima de dos el grupo carboxilo se disocia, libera el hidrogeno
El Pka del grupo Amino del carbono alfa esta alrededor de 9, es decir es Básico,
cuando el PH aumenta por encima de nueve el grupo amino se disocia, libera el hidrogeno
Cuando los aminoácidos forman parte de una proteína forman enlaces y los grupos
precedentes desaparecen funcionalmente, es decir, ya no van a sufrir ionización o
disociación. La función del Pka pasa a la cadena lateral
Los AMINOACIDOS AFINES AL AGUA, son aquellos que tienen carga neta en su
cadena lateral como los aminoácidos básicos y ácidos y aquellos que tienen en su cadena
lateral un elemento que les pueda brindar la capacidad de interactuar con el agua formando
puentes de Hidrogeno. Por ejemplo la cisteína puede interactuar con el Oxigeno del agua,
haciendo que esa molécula sea polar mas no cargada. Cuando son muy estables los
carbonos se dice que el aminoácido es netamente Hidrofobico.
La Cisteína puede interactuar con otra Cisteína en vez de con el agua, con la cadena
lateral de la misma y puede formar ENLACES DISULFURO. Cuando dos Cisteínas se
oxidan, es decir, pierden protones forman un enlace covalente, fuerte. Si ocurre una
reducción, es decir donde se ganan los hidrógenos puede romperse este enlace Disulfuro
por acción de enzimas.
Es un enlace rígido que no permite giros muy amplios. Esto se debe a que el doble
enlace del oxígeno con el carbono es capaz de cambiar de posición entre el Carbono y el
Nitrógeno y luego entre el Carbono y el Oxigeno de donde es originario. Este fenómeno se
llama RESONANCIA, ya que puede ocurrir que ese doble enlace se desplace entre uno y
otro átomo, lo que le brinda a la cadena una rigidez en su estructura central y le da cierta
libertad a las cadenas laterales para interactuar. También Los enlaces peptídicos pueden
tener configuraciones TRANS o CIS.
Los PEPTIDOS son aquellas cadenas polipeptidicas Simples que tienen desde 2
hasta 50 restos de aminoácidos. Son factores liberadores de Hormonas, que estimulan a la
célula para generar la exocitosis de las hormonas que producen.
Entre un giro y otro hay 3,6 aminoácidos. Cuando hay una estructura terciaria por
ejemplo dos Alfa – Hélice, existe un pedazo que no forma parte de ninguna llamado GIRO
O BUCLE que no es más que un pedazo de cadena polipeptidica que permite doblar la
estructura para adquirir una configuración tridimensional. Las cadenas laterales que
interactúan unas con otras; las que están en el núcleo central necesitan ser Hidrofobicas,
Apolares por lo tanto serán aquellas que no tienen carga, alifáticas o aromáticas, sin
oxígeno, azufre, nitrógeno. Aquellas que están en la parte externa van a ser Hidrófilas,
Polares porque van a favorecer la solubilidad de la molécula dentro de la fase acuosa
(citoplasma, líquido extracelular, plasma sanguíneo, líquido cefalorraquídeo etc.)
Si esa proteína en vez de estar en un medio acuoso está conformando una membrana
(Proteína Integral) generalmente están compuestas por varias alfa – Hélices, formando un
canal, puede también estar formada por 2 sub unidades o más dependiendo del tipo de
proteína que sea. En la parte de afuera interactuando con los fosfolípidos están los
Hidrófobos, Apolares, Alifáticos con la finalidad de que la estructura terciaria no se pierda
porque si están los Hidrófilos, tienden a buscar el medio acuoso y la estructura se voltearía.
En el canal están los Hidrófilos, Polares, específicamente los que le brinden la especificidad
para el tipo de ion o molécula que van a transportar, Por ejemplo si se va a transportar una
molécula cargada negativamente, en el canal se disponen aminoácidos Polares con carga
positiva para atraer dicha molécula.
Como un ejemplo está el COLAGENO, Proteína que tiene una estructura secundaria
algo compleja porque esta formado por una triple hélice, de allí viene la resistencia que le
confiere al tejido conectivo. Está formada básicamente por repetición de tres aminoácidos:
Prolina, aminoácido que se cicla con el mismo grupo amino del Carbono Alfa, la Glicina
que es el aminoácido más pequeño y la Hidroxi – Prolina que es una modificación de la
Prolina porque se tiene un grupo OH que proviene de una hidroxilacion después de que la
molécula se sintetiza. Parte de esta hidroxilacion depende de la presencia de la vitamina C
ya que le brinda Hidrogeno a la enzima que realiza dicho proceso. Esas fibras colágenas
están formadas por polímeros (Agrupaciones numerosas) de esas 3 hélices que se
concatenan, Formando estructuras fibrosas que ofrecen resistencia o una fibra colágena que
ejerce la misma acción.
Otro ejemplo son la ACTINA Y MIOSINA, Dos tipos de proteínas, la miosina que
es una especie de bastón que es el que sirve de cremallera. La estructura proteica de esas
proteínas, en el caso de la actina, sus monómeros son globulares, pero cuando esos
monómeros se unen para formar el filamento se forma una estructura más compleja
denominada estructura fibrosa. La miosina por su parte está compuesta por una cabeza
proteica y filamentos de hélice concatenados. Para que se pueda dar la interacción entre
ambas se necesita de la activación de la cabeza de la miosina por parte del ATP. En la
cabeza hay un bolsillo y cuando ocurre su introducción se libera el filamento de miosina del
sitio donde se encontraba interactuando con la actina en reposo. Luego se da el movimiento
por hidrolisis y la miosina se ubica en otro sitio de interacción, luego por afinidad
interactúa en el siguiente sitio activo. Para regular esta interacción participan la
Tropomiosina, que le brinda sitios de unión a la Troponina, una especie de freno que tiene
este sistema.
Las LÁMINAS - BETA forman parte de proteínas fibrosas en las proteínas
animales y también forman parte de las estructuras terciarias. Estas laminas generalmente
son bastante hidrofobicas porque los aminoácidos hidrófobos le permiten adoptar esta
configuración. Pueden ser PARALELAS si en el mismo extremo tienen el mismo grupo
terminal, los dos amino terminal de un lado y los dos carboxilo terminal del otro o
ANTIPARALELAS si ambos grupos interaccionan en el mismo extremo. Las cadenas
laterales salen a os extremos. Por la distribución de estas cadenas, generalmente hay
compuestos que son ANFIPATICOS, es decir una misma molécula tiene una carga que es
polar y otra que es apolar.