Ada 5 (BCM)
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Ada 5 (BCM)
Generalidades
Las proteínas se sintetizan en ribosomas libres o bien en ribosomas unidos al retículo endoplásmico (RE). Los
orgánulos reconocen las características estructurales de la propia proteína, lo que facilita su transporte. Estas
características estructurales se denominan secuencias señal, y dirigen la proteína hacia lugares donde se
modificarán adecuadamente para convertirse en su forma funcional. Las secuencias actúan como etiqueta
localizadora que dirige la nueva proteína a su destino correcto. Las proteínas que funcionan cuando se
encuentran en el núcleo, en las mitocondrias o en los peroxisomas, se sintetizan en ribosomas libres. Estas
proteínas también contienen distintivos estructurales que les permite ser captadas por los orgánulos donde
ejercen su función.
Proteínas en el núcleo
El núcleo posee un gran número de proteínas. Por supuesto las histonas (tipo de proteína que se une al ADN
para dar forma y proporcionar soporte estructural al cromosoma) y las no histonas de la cromatina; sin
embargo, también están presentes enzimas y proteínas encargadas de las funciones nucleares, así como
diferentes proteínas estructurales1.
Entre el núcleo y el citosol hay importación y exportación de proteínas, como por ejemplo la DNA polimerasa,
RNA polimerasa, reguladores génicos o factores de transcripción, proteínas de Splycing, histonas, proteínas
ribosómicas, entre otras2.
La envoltura nuclear es la barrera entre el núcleo y el citoplasma, y los poros nucleares son las compuertas
para cruzar esta barrera. A diferencia de la membrana citoplásmica, que previene el paso de macromoléculas
entre el citoplasma y el espacio extracelular, la envoltura nuclear es un punto de actividad para el movimiento
de RNA y proteínas en ambas direcciones entre el núcleo y el citoplasma.
Las proteínas atraviesan los poros nucleares mediante transporte regulado. Un poro nuclear es un espacio de
comunicación entre el nucleoplasma y el citoplasma. En conjunto forman complejos del polo nuclear NPC
(Nucleo Pore Complex), son proteínas de diferentes familias que atraviesan la envoltura nuclear y proveen
diferentes vías de paso regulado para el transporte hacia el núcleo y desde este hacia el citoplasma 3.
El material encontrado en el núcleo celular es distinto de los materiales que se encuentran en el citoplasma. Y
estos poros nucleares, cuyo tamaño está regulado, permiten este un transporte selectivo de ácidos nucleicos y
proteínas dentro y fuera del núcleo de la célula 4.
- Permite el paso de proteínas pequeñas (<14 kDa, kilo Daltons, ej. histonas) por difusión pasiva.
- Bloquea el paso de proteínas grandes, las cuales deben pasar por transporte activo y selectivo.
- Se permite el paso de proteínas completamente plegadas.
- Transporta proteínas en ambos sentidos
Entre las nucleoporinas hay un subgrupo de proteínas que tienen una gran cantidad de repeticiones
fenilalanina-glicina (FG, según su nombre de una sola letra) en secuencia de aminoácidos. Las repeticiones FG
se aglomeran en una región particular de cada molécula llamada dominio FG. Por si composición inusual de
aminoácidos, los dominios FG tienen una estructura desordenada que les confiere una organización extendida
y flexible.
Se cree que las nucleoporinas que contienen repetición FG recubren el conducto NPC con sus dominios FG
filamentosos que se extienden hasta el corazón del conducto de 20 a 30 nm de ancho. Los dominios FG forman
una red o tamiz hidrófobo que impide la difusión de macromoléculas más grandes (mayores de 40 000 Da,
Daltons, el cual es equivalente a 6.6421x10 -20 gr, aproximadamente) entre el núcleo y citoplasma. 9
Tráfico de proteínas
Para que las proteínas lleguen a su destino final (independientemente de cuál sea) necesitan:
Los poros nucleares permiten un transporte bidireccional de proteínas y de RNAs entre el núcleo y el
citoplasma (los cuales son topológicamente equivalentes).
- ¿Qué entra del citoplasma al núcleo? Histonas, DNA y RNA polimerasas, reguladores de transcripción,
proteínas de procesamiento de ARN, proteínas ribosomales, etc
- ¿Qué sale? Casi todos los ARNs, ARNm (mensajeros), ARNr (ribosomales), ARNt (de transferencia), miARN
(micro), snARN (small nuclear), subunidades ribosomales
Las proteínas que tienen que ser transportadas del núcleo al citoplasma o viceversa portan señales que las
identifican como sustratos de ese transporte y que permiten su reconocimiento por parte de las proteínas
transportadoras o de un adaptador 6.
Las proteínas destinadas al núcleo, aquellas producidas en ribosomas libres, poseerán una señal llamada NSL
(Nuclear Signal Localization). Dependiendo de cual NSL contiene, la molecula podra interactuar con una familia
de proteínas solubles denominadas improtinas, de manera que las nucleoporinas, proteinas del NPC, hacen el
reconocimiento para se puedan acoplar al pasar 6.
Por otra parte, las proteínas Ran son GTPasas nucleares monoméricas pequeñas, se pueden encontrar unidas a
GTP o GDP (molécula energética con similar al ATP en cuanto a su valor energético y estructura). Se regulan por
si mismas mediante factores de intercambio de nucleótido guanina (GEF), localizados en el núcleo, y proteínas
activadoras de guanina (GAP) Ran, mayormente en el citoplasma 6.
El estado de Ran unido a GTP se favorece en el núcleo, y el estado unido a GDP, en el citoplasma. La
conformación y actividad de una proteína Ran depende si se une a una molécula de GTP o GDP; será la
diferencia de concentración de uno u otro entre el núcleo y citoplasma es crucial para el transporte a través del
NPC. En general, RAN-GTP está más concentrada en el núcleo y tiende a salir RAN-GDP en el citoplasma y
tiende a entrar. Se crea así un gradiente que facilita el pasaje 6.
Las exportinas participan en la exportación de macromoléculas, entre ellas proteínas, desde el núcleo al
citoplasma. Las moléculas de carga para exportación, quienes dan señales para realizar este proceso son las
NES. Cabe mencionar, las Ran se involucran en este proceso, por lo que se ha establecido que la importación y
exportación comparten varias características6.
La familia de las importinas y las exportinas se denomina carioferinas. El pasaje es activo, con gasto de energía.
Las proteínas que salen del núcleo lo hacen unidas a un péptido llamado NES (Nuclear Exporting Signal). Las
importinas entran y salen constantemente 7.
Las proteínas que van a ser transportadas al núcleo cuentan con una señal de localización celular o secuencia
señal NLS (Nuclear Localization Signal), la cual es una secuencia de localización interna que permite el paso de
proteínas al núcleo, es rica en aminoácidos básicos y no se elimina tras pasar la proteína al núcleo. Se
encuentra mediado por importinas.
Proceso general de importación
1. Unión de la proteína a la secuencia de localización nucleola NSL.
2. Reconocimiento del sustrato a transportar por una importina para direccionarse al NPC.
3. Translocación a través del NPC.
4. Liberación de la proteína por medio de la formación del complejo Importina-Ran-GTP
5. Movimiento del complejo Importina-Ran-GTP a través del NPC.
6. Regreso de la importina al citoplasma tras la hidrolisis del Ran-GTP a Ran-GDP.
7. Entrada del Ran-GDP al núcleo para ser fosforilado a Ran-GTP.
8. Reciclaje de los factores para realizar nuevamente el proceso de improtación.
También existe señales de exportación nuclear (NES, Nuclear Export Signal), que permite el paso del núcleo al
citosol y está mediado por exportinas.
Esquema de Importación
Dato: Las dos anteriores son proteínas solubles en el citoplasma que se unen a señal NLS o NES en la
proteína a ser transportada y a nucleoporinas
2. Se une a las nucleoporinas del poro y pasan a través del complejo del poro nuclear
Este transporte es dependiente de GTP, en particular de la proteina Ran que es una GTPasa y es la que
dirige el transporte nuclear. La Ran es un switch molecular y puede estar en dos conformaciones
dependiendo si esta unida a GTP o GDP
3. Separación de las importinas
Ciclo de Importación
En muchos casos las células controlan el transporte a través de la regulación de las señales de
importación y exportación ya sea exponiéndolas o apagándolas generalmente por fosforilación de los
aminoácidos cercanos a las secuencias señal.
Después de esta activación dada por un antígeno, cuando disminuyen los niveles de Ca, la Calcineurina se
separa de del NFAT, permitiendo que el NFAT se fosforile nuevamente y se exponga la señal de exportación
nuclear, con lo cual esta proteina vuelve al citoplasma
Dogma Central de la Biología Molecular: La información genética contenida en el ADN se mantiene mediante
su capacidad de replicación. La información contenida en el ADN se expresa dando lugar a proteínas, mediante
los procesos de transcripción, paso por el que la información se transfiere a una molécula de ARN mensajero
(ARN-m) y, mediante el proceso de la traducción el mensaje transportado por el ARN-m se traduce a proteína.
El sistema de síntesis proteica de la célula está compuesto por el retículo endoplasmático rugoso y por los
ribosomas.
El ADN tiene tres funciones: Guardar la información genética, la replicación y la síntesis de proteína.
Además de requerir la participación del ARN (ácido ribonucleico). En la síntesis de proteína: el mensajero, el de
transferencia y el ribosómIco.
http://pre
pa.chapingo.mx/wp-content/uploads/2019/01/TEMA7.pdf
- Estructura del ribosoma:
ARN
- En la síntesis de la proteína actúa el ácido ribonucleico (ARN).
- En las células eucariotas, todo el ARN monocatenario se produce por transcripción a partir del ADN.
- Se sintetiza predominantemente en el núcleo, pero generalmente sale al citoplasma para desempeñar
su función.
ARN Mensajero: transmite la información genética desde el núcleo al citoplasma. Se forma en el núcleo de la
célula de acuerdo con la secuencia de bases que tiene el ADN, entonces es el encargado de hacer la
transcripción.
ARN Ribosomal:
El ribosoma tiene como componente principal al ARN formando dos subunidades. En una célula eucariota, cada
ribosoma está formado por dos subunidades desiguales, constituidas por proteínas y ARN, denominadas
subunidad S (pequeña) y L (grande)
PROTEÍNAS:
Una proteína es una cadena de aminoácidos (polipéptidos) con secuencias exactas, que se van formando
mediante un patrón escrito en el ADN. Cualquier alteración en uno solo de los aminoácidos o en la secuencia
de los mismos, genera una nueva proteína. Existen 20 aminoácidos básicos que componen a cualquier
proteína.
El ADN está dentro de la membrana nuclear (el núcleo), pero este debe llegar a los ribosomas para que se
puedan crear o sintetizar las proteínas, sin embargo, el ADN no puede salir de la membrana, y es por ello que
deben ocurrir dos pasos:
- Transcripción: La transcripción es el proceso por el que se sintetiza ARN a partir de un molde de ADN.
1. El ADN se encuentra en el núcleo y este será “cortado” a la mitad por unas enzimas llamadas helicasas,
las cuales se encargan de romper los puentes de H que unen a las dos hebras.
2. Una vez separadas, antes de que vuelvan a pegarse, llegan unas proteínas estabilizadoras y estas no
van a dejar que se peguen, manteniéndolo abierto, de modo que pueda llegar una enzima denominada
ARN polimerasa, la cual se colocará en una de las dos hebras y va a copiar la información que esta
contiene, está copia será llamada ARN mensajero o transcrito (ARNm).
3. Una vez que haya copiado la información se va a ir del ADN, y una vez que se haya despegado del ADN,
quedará el ARNm solo.
4. Las proteínas estabilizadoras que se encontraban en el ADN salen para que las dos hebras del ADN
puedan juntarse nuevamente.
El ARNm debe pasar por el proceso de maduración para que este pueda salir de la membrana nuclear, este
proceso consta de tres etapas:
1. Corte y empalme (o Splicing)
El ARNm cuenta con un pedazo de información el cual no le será útil, por lo cual se debe deshacer de
ella, esta parte es llamada “Intrón” (región no codificante), ubicada en la parte central. Además cuenta
con dos “Exones”, que son partes del ARNm que servirán para sintetizar proteínas (región codificante).
La eliminación del Intrón y unión de los exones se lleva a cabo gracias a las enzimas de restricción, en
específico de moléculas llamadas snRNP (small nuclear ribonucleoproteins, ribonucleoproteínas
nucleares pequeñas) que forman un complejo denominado espliceosoma (el cual esta conformado por
5 snRNP).
2. Adición de caperuza o Cap (Caping, de capuchón)
Es un grupo de moléculas (7-metilguanosina) que se encargará de proteger al ARNm en su trayecto
brindándole estabilidad, está unido al ARNm mediante tres grupos fosfato (unión trifosfatada). Ocurre
en 5’
3. Adición de cola PolyA (Poliadenilación)
Es la adición de una larga fila de nucleótidos de poliadenilato, es decir, aquellos cuya base nitrogenada
es la adenina.
El grado de poliadenilación se correlaciona con la semivida de la molécula de ARNm. Por lo general,
cuanto más larga es dicha cola, más estable es el ARNm y mayor será su semivida. Ocurre en 3’
- Traducción
Debemos recordar que el ARN este hecho de bases nitrogenadas (A=Adenina, G=Guanina, C=Citosina,
T=Timina, U=Uracilo) y que las proteínas están hechas de aminoácidos.
El ARNm llega al ribosoma, el cual se encuentra dividido en dos partes: el sitio a y el sitio p. El ARNm llega al
sitio a, donde se encuentran los ARN de transferencia (ARNt) los cuales únicamente cuentan con tres bases
nitrogenadas por el contrario del ARNm que es muy extenso.
Cada uno de los ARNt trae consigo un código de aminoácido, y es por ello por lo que las bases nitrogenadas
cambian a aminoácidos. Existen 22 aminoácidos por lo cual también existen 22 códigos.
El ARNm y el ARNt se comienzan a ensamblar por las bases nitrogenadas contrarias. Las bases nitrogenadas
del ARNm se llaman codón y las del ARNt son el anticodón.
Una vez ensamblados, pasan al sitio p del ribosoma, donde el ARN ribosomal (ARNr) junto con otras
enzimas, comienzan a ensamblar los aminoácidos y una vez que los aminoácidos están unidos salen del
ribosoma, de modo que las cadenas de ARN se van por un lado y las de aminoacidos por otro lado.
Las cadenas de ARN son hidrolizadas por enzimas ARNasas y reutilizadas para repetir el proceso