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Molecularizando la historia natural. Revista de la Sociedad Española de

Bioquímica y Biología Molecular (SEBBM) 194 (2017) 6-8

Article · January 2018

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Luis Boto
The National Museum of Natural Sciences
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 DOSIER CIENTÍFICO

Molecularizando la historia natural

Luis Boto López
Dpto. Biodiversidad y Biología Evolutiva. Museo Nacional de Ciencias Naturales. CSIC

Desde los tiempos de Aristóteles se han venido uti- Woese a establecer las bases de la filogenia molecu-
lizando diferentes caracteres morfológicos (forma, ta- lar al utilizar la molécula de la subunidad pequeña
maño, color, etcétera) para tratar de agrupar y clasificar del ARN ribosómico, altamente conservada durante
a los organismos vivos. Estos caracteres fenotípicos han el curso de la evolución, como marcador de las re-
venido siendo la base de la taxonomía biológica duran- laciones filogenéticas entre organismos distantes y,
te dos siglos, desde que Linneo propusiera su sistema de forma colateral, al descubrimiento de las Archaea
binomial para la clasificación de los seres vivos en el como un nuevo dominio biológico diferente de las
siglo XVIII. Sin embargo, la introducción de la teoría bacterias.
evolutiva de Wallace y Darwin en la segunda mitad del
siglo XIX introduce un nuevo factor a la hora de plan- La aparición de técnicas de secuenciación de ADN en
tearse las relaciones entre plantas y animales: el tiempo. 1977, en particular la de Sanger, junto con el desa-
Frente a la visión prevalente de una naturaleza inmuta- rrollo de técnicas de clonación, va a suponer un nuevo
ble, a partir de este momento es claro que las relaciones hito en la medida que va a facilitar la comparación de
de parentesco evolutivo entre los seres vivos van a ser diferentes tipos de secuencias entre diferentes orga-
fundamentales para entender cómo los organismos se nismos y va a abrir la puerta a la utilización de nuevos
relacionan entre sí y con su ambiente. marcadores.

El gran desarrollo de la biología molecular a mediados Por otra parte, la introducción de la técnica de ampli-
del siglo XX, con el hito del descubrimiento del ADN ficación en cadena por polimerasa (PCR) a finales de
como molécula portadora de la información genética y los años ochenta dinamizó la penetración de las téc-
de los mecanismos que permiten trasladar esta infor- nicas de biología molecular en estudios de Ciencias
mación a las proteínas, que en definitiva sustentan las Naturales, al permitir amplificar secuencias a partir
morfologías de los organismos, condujo pronto a plan- de un material biológico hasta entonces inaccesible
tearse la utilización directa de moléculas como marca- al estudio molecular: plumas, pelos, heces, muestras
dores complementarios a los rasgos morfológicos para conservadas en museos, etcétera, haciendo posible ac-
establecer relaciones entre los diferentes grupos bioló- ceder al estudio de especies amenazadas o incluso
gicos y a diferentes niveles. extintas en la naturaleza.

Así, ya en 1965 Zuckerland y Pauling proponen a las De este modo, se extiende el estudio del ADN mi-
moléculas como documentos de la historia evolutiva de tocondrial y plastídico como marcadores que pueden
los organismos, y muy pronto se empiezan a utilizar es- proporcionar información alternativa a la que propor-
tas como herramientas para tratar de estudiar variabi- cionan los genes nucleares (analizados hasta entonces
lidad genética entre poblaciones y establecer relaciones a través dela electroforesis de aloenzimas y la secuen-
de parentesco entre grupos biológicos. Desde media- ciación del gen de la subunidad pequeña del ARN
dos de los años sesenta del pasado siglo y durante una ribosómico). La alta tasa de mutación del ADN mi-
buena parte de los setenta (e incluso posteriormente) tocondrial y su herencia generalmente por vía exclu-
el análisis de aloenzimas por electroforesis en gel y los sivamente materna le hace idóneo para el estudio de
estudios de hibridación de ácidos nucleicos se convier- organismos que han divergido recientemente (pobla-
ten en herramientas para muchos naturalistas. En este ciones de una especie, procesos de especiación, etcéte-
contexto, en el año 1971 aparece la primera revista de- ra), mientras que los genes nucleares nos informarían
dicada exclusivamente al estudio de la evolución mole- de procesos de divergencia más antiguos (relaciones
cular (Journal of Molecular Evolution). a nivel de especie, de género, etcétera). En plantas, el
ADN plastídico constituye un marcador alternativo
Al mismo tiempo, la utilización de las primeras téc- (ver artículo de Javier Fuertes e Irene Villa-Machío
nicas de secuenciación de ARN va a llevar a Carl en este número)

6 SE BBM 194 / DICIEMBRE 2017

 DOSIER CIENTÍFICO

Introducción del ADN mitocondrial y

Introducción de plastídico como marcador diiferenciado
técnicas del ADN nuclear. Estudios de paternidad
moleculares en con mini y microsatélites Genómica, Filogenómica, análisis de
estudios Fundamentos de las filogenias múltiples secuencias, microsatélites,
Transcriptómica, proteómica y
poblacionales moleculares SNPs
otras -ómicas

Acceso al estudio de
material biológico
previamente inaccesible
Secuenciación Sanger.
Trabajo de Zuckerland Identificación de las Archaea Secuenciación
y Pauling Amplificación Secuenciación
como grupo independiente de nueva
enzimática de ADN automática
generación

1965 1977 1985 2000 2017

Aloenzimas
Hibridación de ácidos nucleicos

Secuenciación directa de RNAs ribosómicos

Secuenciación masiva de ácidos nucleicos

PCR

Figura 1
Cronograma mostrando la penetración Biología Molecular en las Ciencias Naturales en relación al desarrollo de
diferentes técnicas.
Cronograma mostrando la penetración Biología Molecular en las Ciencias
Naturales en relación al desarrollo de diferentes técnicas
El desarrollo de secuenciadores automáticos a principios sarrollo de potentes herramientas bioinformáticas,
de los noventa permitió reducir considerablemente el promete una nueva revolución en el estudio de la
tiempo dedicado a la obtención de secuencias (y mejo- naturaleza introduciendo todas las –ómicas como
rar la calidad de estas) lo que permitió a su vez abordar herramientas para desentrañar cómo los organismos
la secuenciación de genomas enteros dando entrada a vivos se relacionan entre sí tanto desde el punto de
la denominada era genómica, a la vez que alimentó las vista histórico, clasificatorio o ecológico, lo que va a
bases de datos de secuencia como el GenBank con se- contribuir a aproximarnos (solo aproximarnos, pues-
cuencias procedentes de múltiples organismos y de di- to que la destrucción de especies procede actual-
ferentes tipos de genes, lo que posibilita la comparación mente a un ritmo superior al de su descubrimiento)
de la variabilidad contenida en ellas, que es la base de los a la catalogación de la biodiversidad planetaria y a
análisis filogenéticos y filogenómicos. los patrones y procesos que la han modulado, algo
que espero que el lector descubra a través de la lec-
A la vez, el desarrollo de secuenciadores automáticos tura de los trabajos contenidos en el presente dossier.
permitió colateralmente el análisis individualizado de
múltiples microsatélites (analizados hasta entonces por La controvertida propuesta de utilizar cortas secuen-
técnicas lentas de huella genética multilocus y utilizados cias de genes mitocondriales (en particular Citocro-
casi exclusivamente en un contexto de estudios de pa- mo Oxidasa I) como un código de barras para identi-
ternidad) y polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) ficar a los diferentes organismos, la introducción de la
y su utilización como marcadores de alta tasa de evolu- evolución microbiana en el contexto de la evolución
ción, que junto con genes de ADN mitocondrial (o el en general y el papel que la transferencia horizontal
propio genoma mitocondrial en su conjunto) permiten de genes juega en esta, la utilización de las distintas
aproximaciones fiables al estudio de procesos de diver- técnicas de genómica ambiental o metagenómica para
sificación reciente y aproximaciones filogeográficas a los desentrañar la biodiversidad microbiana o la puesta
propios procesos de divergencia, a la vez que constituyen en evidencia del papel de los mecanismos epigené-
importantes herramientas para la conservación. ticos en el ciclo de vida de los organismos, son solo
algunos ejemplos extremos de lo que la biología mo-
El desarrollo reciente de métodos de secuenciación lecular ha aportado o puede aportar a los estudios de
de segunda y tercera generación, junto con el de- la naturaleza.

194 / DICIEMBRE 2017 SE BBM 7

 DOSIER CIENTÍFICO

La colección de artículos recogidos en el presente Por otro lado, Jose Antonio Godoy, Elena Marme-
dossier espero que dé al lector una buena panorámica sat, Maria Lucena-Pérez y Daniel Kleinman-Ruiz
del diálogo que se está dando entre biología molecu- nos proporcionan una narrativa de la contribución
lar y Ciencias Naturales en las agendas investigadoras de la biología molecular a la conservación de una
de diferentes grupos de nuestro país. especie emblemática como es el lince ibérico, desde
la utilización de marcadores tradicionales al uso de
Así, el primer artículo de esta colección, firmado por las modernas técnicas genómicas, que ha llevado a la
Rafael Zardoya, Alejandro Sánchez-Gracia y Julio recuperación de poblaciones remanentes y a la rein-
Rozas nos presenta los fundamentos de la filogenó- troducción de la especie en diferentes sitios.
mica y como de la reconstrucción de relaciones filoge-
néticas entre especies a partir de la información con- El artículo de Eduardo Roldán es un bonito ejem-
tenida en genomas y transcriptomas se derivan im- plo de cómo abordar las relaciones entre diversidad
portantes claves para entender los procesos de adap- genotípica y fenotípica en el caso de la formación
tación. La inclusión de un listado de los programas de espermatozoides en mamíferos, células alta-
informáticos más relevantes utilizados en este tipo de mente especializadas y de una especial relevancia
estudios supone una valiosa información adicional. teniendo en cuenta su papel en el proceso repro-
ductor. El artículo nos muestra como
divergencia en secuencia codificante
y/o divergencia en secuencias regulado-
EL GRAN DESARROLLO de la biología ras en genes de protamina, junto con la
molecular a mediados del siglo XX, con el hito del presión selectiva que supone la compe-
descubrimiento del ADN, condujo a plantearse la utilización tición espermática deriva en múltiples
directa de moléculas como marcadores complementarios a formas de espermatozoides en diferen-
los rasgos morfológicos para establecer relaciones entre los tes especies.
diferentes grupos biológicos y a diferentes niveles.
Finalmente, y para concluir el dos-
sier de este número, Juli Peretó nos
muestra como el diálogo entre biología
El artículo de Javier Fuertes e Irene Villa-Machío pre- molecular y Ciencias Naturales es fértil en ambos
senta el impacto de la Biología Molecular en el estudio sentidos, presentándonos como la biología evolu-
de la biodiversidad vegetal y nos ilustra acerca de cómo tiva puede informar acerca de ciertos aspectos del
las peculiaridades de las plantas con respecto al resto de metabolismo utilizando dos bellos ejemplos: la in-
organismos (alto grado de hibridación interespecífica, novación metabólica por simbiogénesis en insectos
presencia de plastos, gran tamaño genómico, etcétera) y la presencia de una estequiometría subóptima en
han determinado que tanto los diseños experimentales la ruta metabólica de síntesis de lípidos a partir de
como las técnicas de análisis tengan rasgos propios. hexosas.

8 SE BBM 194 / DICIEMBRE 2017

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