DOI: 10.26820/recimundo/4.(3).julio.2020.

128-137
URL: http://recimundo.com/index.php/es/article/view/856
EDITORIAL: Saberes del Conocimiento
REVISTA: RECIMUNDO
ISSN: 2588-073X
TIPO DE INVESTIGACIÓN: Artículo de Revisión
CÓDIGO UNESCO: 3205 Medicina Interna
PAGINAS: 128-137

Diagnóstico del virus SARS-CoV-2 mediante PCR

Diagnosis of the SARS-CoV-2 virus by PCR
Diagnóstico do vírus SARS-CoV-2 por PCR
Libia Lizeth Garzón Ospina1; Leidy Viviana Mirama Calderon2; Lina Maria Charry Salazar3;
Carlos Andrés Freire Torres4

RECIBIDO: 10/04/2020 ACEPTADO: 26/05/2020 PUBLICADO: 01/07/2020

1. Médico General Asistencial en la UCI Dumian Medical de los Chorros en Cali; Colombia; [email protected]; https://
orcid.org/0000-0002-3376-8863
2. Médica General; Hospitalización Ginecología y Obstetricia Clínica Proinsalud; Pasto; Colombia; [email protected];
https://orcid.org/0000-0002-3676-5596
3. Médico General; Virrey Solis IPS Bogota D.C.; Colombia; [email protected]; https://orcid.org/0000-0003-4216-
5762
4. Médico General en Centro de Salud Tipo B Mira; Ibarra, Ecuador; [email protected]; https://orcid.org/0000-0001-
7278-0016

CORRESPONDENCIA
Libia Lizeth Garzón Ospina
[email protected]

Cali; Colombia

© RECIMUNDO; Editorial Saberes del Conocimiento, 2020

128 RECIMUNDO VOL. 4 Nº 3 (2020)

 RESUMEN
Una epidemia de enfermedad respiratoria causada por el coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo seve-
ro (SARS-CoV-2) comenzó en China y se ha extendido a otros países. La reacción en cadena de la transcrip-
tasa inversa-polimerasa en tiempo real (rRT-PCR) de los hisopos nasofaríngeos generalmente se ha utilizado
para confirmar el diagnóstico clínico. Sin embargo, se desconoce si el virus puede detectarse en muestras de
otros sitios y, por lo tanto, potencialmente transmitirse de otras maneras que no sean por gotitas respiratorias.
La enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) causada por el coronavirus 2 del síndrome respiratorio agu-
do severo (SARS-CoV-2) se ha convertido en una amenaza global para la salud pública. Con el objetivo de
construir un patrón de detección eficiente, se evalúa exhaustivamente el rendimiento de RT-PCR y CT de tórax
en el diagnóstico de COVID-19.La combinación de RT-PCR y CT con la sensibilidad más alta es un patrón
óptimo para detectar COVID-19. RT-PCR es superior a la TC en el diagnóstico de infecciones leves. La RT-PCR
en heces debe considerarse como un elemento para mejorar la tasa de descubrimiento y el alta hospitalaria.
Este estudio arroja luz para optimizar el esquema de detección y monitoreo de la infección por SARS-CoV-2.

Palabras clave: COVID-19, SARS-CoV-2, RT-PCR, CT de tórax.

ABSTRACT
An epidemic of respiratory disease caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
began in China and has spread to other countries. The real-time reverse transcriptase polymerase chain reac-
tion (rRT-PCR) of nasopharyngeal swabs has generally been used to confirm the clinical diagnosis. However, it
is unknown whether the virus can be detected in samples from other sites and therefore potentially transmitted
in ways other than by respiratory droplets. Coronavirus disease 2019 (COVID-19) caused by severe acute
respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has become a global threat to public health. In order to
build an efficient detection pattern, the performance of chest RT-PCR and CT in the diagnosis of COVID-19 is
comprehensively evaluated. The combination of RT-PCR and CT with the highest sensitivity is an optimal stan-
dard for detecting COVID-19. RT-PCR is superior to CT in diagnosing mild infections. Stool RT-PCR should be
considered as an element to improve the discovery rate and discharge from hospital. This study sheds light to
optimize the detection and monitoring scheme of SARS-CoV-2 infection.
Keywords: COVID-19, SARS-CoV-2, RT-PCR, chest CT.

RESUMO

Uma epidemia de doença respiratória causada pelo coronavírus 2 da síndrome respiratória aguda grave
(SARS-CoV-2) começou na China e se espalhou para outros países. A reação em cadeia da polimerase
por transcriptase reversa em tempo real (rRT-PCR) de zaragatoas nasofaríngeas tem sido geralmente usada
para confirmar o diagnóstico clínico. No entanto, não se sabe se o vírus pode ser detectado em amostras de
outros locais e, portanto, potencialmente transmitido de outras maneiras que não por gotículas respiratórias.
A doença de coronavírus 2019 (COVID-19) causada pela síndrome respiratória aguda grave coronavírus 2
(SARS-CoV-2) tornou-se uma ameaça global à saúde pública. Para construir um padrão de detecção eficien-
te, o desempenho da RT-PCR e TC no tórax no diagnóstico de COVID-19 é avaliado de forma abrangente. A
combinação de RT-PCR e CT com a maior sensibilidade é um padrão ideal para a detecção de COVID-19. A
RT-PCR é superior à CT no diagnóstico de infecções leves. O RT-PCR das fezes deve ser considerado como
um elemento para melhorar a taxa de descoberta e a alta hospitalar. Este estudo lança luz para otimizar o
esquema de detecção e monitoramento da infecção por SARS-CoV-2.

Palavras-chave: COVID-19, SARS-CoV-2, RT-PCR, TC de tórax.

RECIMUNDO VOL. 4 Nº 3 (2020) 129

GARZÓN OSPINA, L., MIRAMA CALDERON, L., CHARRY SALAZAR, L., & FREIRE TORRES, C.

Introducción torios de virología clínica no intenten el ais-

lamiento viral de las muestras recolectadas
A principios de diciembre de 2019, se iden- de los pacientes con COVID-19 bajo inves-
tificaron los primeros casos de neumonía de tigación.
origen desconocido en la ciudad de Wuhan,
provincia de Hubei, China. El 7 de enero, se Debido a que el SARS-CoV-2 es un virus re-
descubrió un nuevo coronavirus utilizando cientemente descubierto, el espectro de las
un alto rendimiento desecuenciación en la herramientas de diagnóstico disponibles es
muestra de hisopo de garganta de un pa- limitado. En la etapa inicial, el SARS-CoV-2
ciente, y actualmente se llama SARS-CoV-2 se detectó en muestras clínicas humanas
(previamente conocido como 2019-nCoV) mediante secuenciación de próxima gene-
el 11 de febrero de 2020 por ICTV2 (Huang, ración, cultivo celular y microscopía electró-
Wang, & Li, 2020). nica.(Zhu, Zhang, & Wang, 2020). Todavía
se necesita un mayor desarrollo de méto-
Los casos iniciales definidos de COVID-19, dos precisos y rápidos para identificar este
fueron epidemiológicamente vinculado al patógeno respiratorio de emergencia.
mercado humano de mariscos en Wuhan,
aunque más tarde se descubrió más y más Luego, la secuencia completa del genoma
COVID-19 sin exposición al mercado, pero del SARS-CoV-2 (29870 pb, excluyendo la
con un historial de Wuhan o contacto con el cola poli (A)) en GenBank (número de ac-
paciente de neumonía COVID-19 confirma- ceso MN908947) se lanzó rápidamente el
do. Los datos epidemiológicos actuales in- 10 de enero de 2020, que es más del 82%
dican la transmisión de persona a persona idéntico a los de SARS-CoV y coronavi-
del SARS-CoV-2 en entornos hospitalarios y rus murciélago tipo SARS (SL-CoV) (Zhou,
familiares. Hasta el 17 de febrero de 2020, Yang, & Wang, 2020). Sobre la base del
se han documentado más de 71,000 casos análisis de este genoma completo obtenido
confirmados por laboratorio y 1,770 casos en este estudio, varios laboratorios desarro-
de muerte en China y en otros países del llaron herramientas de detección molecular
mundo (incluidos EE. UU., Alemania, Japón basadas en ORF1ab, el gen N de la ARN
y Corea del Sur)(WHO, 2020). polimerasa dependiente de ARN (RdRp) y
La tasa de mortalidad de SARS-CoV-2 fue las regiones E de genes de espiga viral. Y
de alrededor del 2%. La OMS ha declara- luego, la rápida identificación de este nue-
do recientemente que el SARS-CoV-2 es vo coronavirus se atribuye a los avances
una emergencia de salud pública de interés recientes en la detección de SARS-CoV-2,
internacional. Por lo tanto, se necesitan ur- incluyendo RT-PCR, PCR de transcripción
gentemente pruebas de diagnóstico espe- inversa en tiempo real (rRT-PCR), amplifi-
cíficas para esta infección para confirmar cación isotérmica mediada por bucle de
casos sospechosos, evaluar a los pacientes transcripción inversa (RT) -LAMP), y ensa-
y realizar la vigilancia del virus. yos basados en microarrays. En la actuali-
dad, RT-PCR es una técnica de detección
La identificación de patógenos incluye prin- ampliamente utilizada para el SARS-CoV-2
cipalmente el aislamiento del virus y la de- y varios kits de detección de ácido nucleico
tección de ácido nucleico viral. Según los comercializados para usar en la clínica.
postulados tradicionales de Koch, el aisla-
miento del virus es el estándar de oro para Actualmente, el estándar de referencia para
el diagnóstico de virus en el laboratorio. Por el diagnóstico de neumonía COVID-19 es
lo tanto, según el SARS-CoV-2 posee una un resultado positivo en el análisis de de-
gran capacidad para infectar a los huma- tección de ácido nucleico para las mues-
nos, los CDC recomiendan que los labora- tras del tracto respiratorio superior e inferior

130 RECIMUNDO VOL. 4 Nº 3 (2020)

DIAGNÓSTICO DEL VIRUS SARS-COV-2 MEDIANTE PCR

y sangre, las muestras del tracto respirato- Tipo de Investigación

rio incluían muestras de torunda nasal y fa-
ríngea, esputo y líquido de lavado bronco Dentro de toda práctica investigativa, se
alveolar. Y los pacientes confirmados con precisan acciones de carácter metodológi-
la neumonía COVID-19 tuvieron 2 o 3 resul- co mediante las cuales, se logra conocer y
tados de RT-PCR negativos continuos para proyectar los eventos posibles que la deter-
muestras de torunda nasofaríngea y de hi- minan, así como las características que ha-
sopo que pueden dar de alta del hospital. cen del acto científico un proceso interac-
Sin embargo, el experto en China indicó tivo ajustado a una realidad posible de ser
que los casos de COVID-19 que tenían 2 o 3 interpretada. En este sentido, se puede de-
resultados de RT-PCR negativos continuos cir, que la presente investigación correspon-
para muestras de torunda nasofaríngea y de al tipo documental, definido por Castro
de garganta antes de ser finalmente confir- (2016), “se ocupa del estudio de problemas
mados por laboratorio (Chen, Liu, & Zhang, planteados a nivel teórico, la información
2020). Y actualmente, varios informes han requerida para abordarlos se encuentra bá-
informado los resultados positivos de RT- sicamente en materiales impresos, audiovi-
PCR para las heces de pacientes con CO- suales y /o electrónicos”. (p.41).
VID-19 (Zhang, Du, & Li, 2020). Con base
en los pacientes infectados, potencialmente En consideración a esta definición, la orien-
pueden arrojar el SARS-CoV2 a través de tación metodológicapermitió la oportunidad
las vías respiratorias y fecales-orales. de cumplir con una serie de actividades in-
herentes a la revisión y lectura de diversos
Metodología documentos donde se encontraron ideas
explicitas relacionadas con los tópicos en-
Para el desarrollo de este proceso investi- cargados de identificar a cada caracterís-
gativo, se plantea como metodología la en- tica insertada en el estudio. Por lo tanto, se
caminada hacia una orientación científica realizaron continuas interpretaciones con
particular que se encuentra determinada el claro propósito de revisar aquellas apre-
por la necesidad de indagar en forma preci- ciaciones o investigaciones propuestas por
sa y coherente una situación, en tal sentido diferentes investigadores relacionadas con
(Davila, 2015) define la metodología “como el tema de interés, para luego dar la respec-
aquellos pasos previos que son seleccio- tiva argumentación a los planteamientos, en
nados por el investigador para lograr resul- función a las necesidades encontradas en
tados favorables que le ayuden a plantear la indagación.
nuevas ideas”.(p.66)
Fuentes Documentales
Lo citado por el autor, lleva a entender que
el desarrollo de la acción investigativa bus- El análisis correspondiente a las caracterís-
ca simplemente coordinar acciones enmar- ticas que predomina en el tema selecciona-
cadas en una revisión bibliográfica con el fin do, llevan a incluir diferentes fuentes docu-
de complementar ideas previas relaciona- mentales encargadas de darle el respectivo
das al Diagnóstico del virus del SARS-CoV-2 apoyo y en ese sentido cumplir con la valo-
mediante PCR a través de una revisión de ración de los hechos a fin de generar nue-
literatura, para así finalmente elaborar un vos criterios que sirven de referencia a otros
cuerpo de consideraciones generales que procesos investigativos. Para (Castro, 2016)
ayuden a ampliar el interés propuesto. las fuentes documentales incorporadas en
la investigación documental o bibliográfica,
“representa la suma de materiales sistemá-
ticos que son revisados en forma rigurosa

RECIMUNDO VOL. 4 Nº 3 (2020) 131

GARZÓN OSPINA, L., MIRAMA CALDERON, L., CHARRY SALAZAR, L., & FREIRE TORRES, C.

y profunda para llegar a un análisis del fe- la dinámica de aplicar diversos elementos
nómeno”.(p.41). Por lo tanto, se procedió encargados de determinar el camino a re-
a cumplir con la realización de una lectura correr por el estudio, según, (Bolívar, 2015)
previa determinada para encontrar aquellos las técnicas de procesamiento de datos en
aspectos estrechamente vinculados con el los estudios documentales “son las encar-
tema, con el fin de explicar mediante un de- gadas de ofrecer al investigador la visión o
sarrollo las respectivas apreciaciones gene- pasos que debe cumplir durante su ejerci-
rales de importancia. cio, cada una de ellas debe estar en corres-
pondencia con el nivel a emplear” (p. 123).
Técnicas para la Recolección de la Infor- Esto indica, que para llevar a cabo el pro-
mación cesamiento de los datos obtenidos una vez
aplicado las técnicas seleccionadas, tales
La conducción de la investigación para ser como: fichas de resumen, textual, registros
realizada en función a las particularidades descriptivos entre otros, los mismos se de-
que determinan a los estudios documenta- ben ajustar al nivel que ha sido selecciona-
les, tiene como fin el desarrollo de un con- do.
junto de acciones encargadas de llevar a
la selección de técnicas estrechamente vin- Resultados
culadas con las características del estudio.
En tal sentido, (Bolívar, 2015), refiere, que Fiebre, tos y disnea fueron los síntomas más
es “una técnica particular para aportar ayu- comunes en pacientes con neumonía por
da a los procedimientos de selección de las COVID-19. Una manifestación similar a las
ideas primarias y secundarias”. (p. 71). de otras dos enfermedades causadas por
coronavirus, síndrome respiratorio agudo
Por ello, se procedió a la utilización del sub- severo (SARS) y síndrome respiratorio de
rayado, resúmenes, fichaje, como parte Medio Oriente (MERS). La TC es un méto-
básica para la revisión y selección de los do importante en el diagnóstico de lesio-
documentos que presentan el contenido nes pulmonares y se han caracterizado los
teórico. Es decir, que mediante la aplicación cambios radiológicos en los pulmones de
de estas técnicas se pudo llegar a recoger los pacientes con COVID-19. (Zhang, Du, &
informaciones en cuanto a la revisión biblio- Li, 2020) informaron que de 840 pacientes
gráfica de los diversos elementos encarga- con COVID-19 que se sometieron a CT al
dos de orientar el proceso de investigación. ingreso, alrededor del 76.4% manifestaron
Tal como lo expresa, (Bolívar, 2015) “las características anormales de imágenes de
técnicas documentales proporcionan las CT y generalmente exhibieron hallazgos ra-
herramientas esenciales y determinantes diológicos típicos de la opacidad del vidrio
para responder a los objetivos formulados esmerilado (50%) o el sombreado parchea-
y llegar a resultados efectivos” (p. 58). Es do bilateral (46%). Con base en la "Guía de
decir, para responder con eficiencia a las diagnóstico y tratamiento para la neumonía
necesidades investigativas, se introdujeron por coronavirus nueva (la quinta edición),
como técnica de recolección el método in- China", la tomografía computarizada se utili-
ductivo, que hizo posible llevar a cabo una zó como criterio de diagnóstico clínico para
valoración de los hechos de forma particu- la neumonía por COVID-19, pero estricta-
lar para llegar a la explicación desde una mentelimitado en la provincia de Hubei. Sin
visión general. embargo, la especificidad de la TC de tórax
es relativamente baja,solo no pudo distin-
Asimismo, se emplearon las técnicas de guir bien la infección por SARS-CoV-2 de
análisis de información para la realización otros patógenos.
de la investigación que fue ejecutada bajo

132 RECIMUNDO VOL. 4 Nº 3 (2020)

DIAGNÓSTICO DEL VIRUS SARS-COV-2 MEDIANTE PCR

El SARS-CoV-2 causa un brote extensivo en Un valor de Ct entre 37-40 es indetermina-

invierno. En esta temporada, muchos otros do. Se requiere confirmación repitiendo. Si,
patógenos que causan neumonía también cuando se repite, el valor de Ct es <37, la
se vuelven frecuentes, incluso incluyendo muestra es positiva, de lo contrario, es ne-
muchos agentes virales. Las enfermedades gativa.
infecciosas comparten algunas característi-
cas comunes en los signos, síntomas y ha- Según un estudio llevado a cabo por (Xiaos-
llazgos de laboratorio. Por lo tanto, es difícil huai & Yan, 2020) los pacientes involucra-
diferenciar COVID-19 de otros pacientes dos sumaron 568, incluidos 87 COVID-19
con neumonía únicamente dependiendo de y 481 no COVID19. Todos ellos eran resi-
la manifestación o examen de rutina. Por lo dentes locales de Wuhan, tuvieron un via-
tanto, es urgente emplear un esquema de je reciente a Wuhan o se contactaron con
detección de precisión. La prueba de alta personas de Wuhan. Y todos eran elegibles
sensibilidad es fundamental para evitar la para los criterios epidemiológicos de casos
transmisión secundaria por casos diagnos- sospechosos, y recibieron más aislamiento
ticados perdidos. Mientras tanto, el valor médico, examen y diagnóstico. Entre los
predictivo positivo también debe contarse, pacientes, 58.2% eran hombres. En todo el
ya que una cantidad de falsos positivos ge- espectro de edad, el grupo de 15 a 59 años
neraría no solo la ocupación y el costo de genera el 60,6% de todas las poblaciones
los recursos de atención médica, sino que en este estudio, y el 5,7% de los pacientes
también aumentaría el riesgo de infección tenían menos de 15 años (tabla 1). En la
de casos sospechosos aislados en el hos- gravedad de la enfermedad, el 83,9% (73
pital. de 87 pacientes) fueron leves y el 16,1% (14
de 87 pacientes) fueron graves.
Extracción de ARN y RT-PCR

Los ensayos de laboratorio de SARS-Cov-2

se basan en la recomendación previa de la
OMS. Las muestras de las vías respiratorias
superiores (hisopos faríngeos y nasales) y
las heces se obtienen de todos los casos.
Asegúrese de que cada muestra recolecta-
da tenga el nombre, sexo y edad del pa-
ciente, así como un número de serie; cual-
quier anormalidad en la muestra debe ser
notada.

El ARN se extrae y se prueba mediante RT-

PCR en tiempo real con cebadores y sondas
específicos de SARS-Cov-2 de acuerdo con
las instrucciones del Kit. La RT-PCR en tiem-
po real se realiza en instalaciones de nivel 2
de bioseguridad en el laboratorio clínico. Si
dos objetivos (RdRp +, E o N +) dan positi-
vo por RT-PCR específica, los pacientes se
considerarían confirmados por laboratorio.

• Negativo: sin valor de Ct o Ct = 40

• Positivo: un valor de Ct<37.

RECIMUNDO VOL. 4 Nº 3 (2020) 133

GARZÓN OSPINA, L., MIRAMA CALDERON, L., CHARRY SALAZAR, L., & FREIRE TORRES, C.

Tabla 1. Las características comunes de los pacientes y las muestras involucradas en

este estudio

Fuente: (Xiaoshuai & Yan, 2020)

En la etapa temprana del brote de COVID, tarizada ingresaron al hospital quejándose
la RT-PCR y la tomografía computarizada de contacto epidemiológico. Aunque final-
fueron la medida principal para detectar la mente fueron diagnosticados, solo tuvieron
infección por SARS-CoV-2. Por lo tanto, se síntomas leves de infección del tracto respi-
recopilaron los resultados de los dos mé- ratorio superior al ingreso y en el curso de
todos en los más de 568 pacientes. En el la infección, y no se realizó una tomografía
período del 17 de enero hasta el 11 de fe- computarizada.
brero, se detectaron 1674 muestras totales
de los 568 pacientes por RT-PCR, que in- La evaluación del rendimiento de RT-PCR,
cluyó 1415 faringe y 259 heces (Tabla 1). tomografía computarizada y patrones de
Todos los pacientes después del ingreso combinación en el diagnóstico de COVID-19
recibieron al menos una detección de RT-
PCR para hisopos faríngeos, y 341 pacien- Al comienzo del brote de SARS-CoV-2, la
tes fueron sometidos a la segunda prueba RT-PCR para la faringe y la tomografía com-
RTPCR para hisopos faríngeos. Las heces putarizada es la principal estrategia de de-
detectadas por RT-PCR representaron 259, tección. Con el objetivo de evaluar la propie-
81 de las cuales eran de pacientes con CO- dad de los dosmétodos para diagnosticar
VID-19. Entre los 568 pacientes, 364 pa- la infección por SARS-CoV-2, se calcularon
cientes fueron sometidos a tomografía com- los índices de rendimiento de la detección
putarizada, 81 de los cuales eran pacientes de RTPCR y la tomografía computarizada,
con COVID-19. Se revisaron los datos del respectivamente. Los resultados se mues-
caso de forma retrospectiva y se encontra- tran en la Tabla 2. La sensibilidad y especifi-
ron que 5 pacientes sin tomografía compu- cidad de RT-PCR para faringe fueron 78,2%

134 RECIMUNDO VOL. 4 Nº 3 (2020)

DIAGNÓSTICO DEL VIRUS SARS-COV-2 MEDIANTE PCR

y 98,8%. El valor predictivo positivo y el va- mer lugar como un método de diagnóstico
lor predictivo negativo fueron 91.9% y 96.2. por imagen. Según el estándar anterior, se
y el índice de Youden fue de 0.770, lo que evaluaron los datos sobre el rendimiento de
indica un rendimiento general. En la evalua- la TC. La sensibilidad y especificidad fue-
ción metodológica de la tomografía compu- ron 66.7% y 68.2%, inferiores a RT-PCR de
tarizada, los criterios se definieron en pri- faringe.

Tabla 2. Realización de la prueba de RT-PCR y la tomografía computarizada en el diag-

nóstico de infección por SARS-CoV2

Fuente: (Xiaoshuai & Yan, 2020)

SARS-CoV-2, un nuevo betacoronavirus es prueba de hisopos orales y de heces que
una causa importante de infección sinto- podrían mejorar en gran medida la tasa de
mática del tracto respiratorio en todos los detección positiva.
grupos de edad en todo el mundo(Rothe,
Schunk, & Sothmann, 2020). El diagnósti- En los falsos negativos puede ser causada
co oportuno y preciso del virus permite el por la mala calidad de la muestra, como las
tratamiento adecuado de las infecciones. muestras del tracto respiratorio recogidas
RT-PCR se implementa ampliamente en vi- de la orofaringe; colección que es demasia-
rología diagnóstica. En el caso de una emer- do temprana o tardía en la progresión de la
gencia de salud pública, los laboratorios de enfermedad, en las primeras etapas, la can-
diagnóstico competentes pueden confiar tidad de virus en el cuerpo no es suficiente
en esta tecnología robusta para establecer para ser detectada. muestras que no se
nuevas pruebas de diagnóstico dentro de han almacenado, transportado o procesa-
sus servicios de rutina antes de que los en- do adecuadamente, el coronavirus SARS-
sayos preformulados estén disponibles. CoV-2 es un virus ARN, que es propenso a
la muerte y la degradación. En el proceso
Em los diferentes estudios se ha demostra- de recolectar muestras y transportarlas al
do que la estrategia para la detección de laboratorio para su análisis, lleva mucho
ARN viral en hisopos faríngeos y nasales tiempo y el ácido nucleico es fácil de de-
utilizados para el diagnóstico de SARS- gradar, por lo que no es fácil detectar posi-
CoV-2 no es perfecta. También se ha des- tivo. Por último, factores técnicos, como la
cubierto que el virus está presente en varias mutación del virus y la inhibición de la PCR.
muestras de heces de pacientes cuando la
detección de muestras de faringe y nasales Hasta la fecha, dos equipos de China in-
es negativa. Con base en que los pacientes formaron haber logrado aislar SARS-CoV-2
infectados pueden potencialmente eliminar vivo en heces de pacientes con COVID-19
este patógeno a través de las vías respira- (datos no publicados). Según estos estu-
torias y fecales-orales, se debe aplicar una dios, algunas de las disposiciones se han

RECIMUNDO VOL. 4 Nº 3 (2020) 135

GARZÓN OSPINA, L., MIRAMA CALDERON, L., CHARRY SALAZAR, L., & FREIRE TORRES, C.

complementado sobre el manejo estricto infección por SARS-CoV-2.

de las secreciones del paciente. Muchos
coronavirus pueden ser transmitido por vía Tomando en consideración que se pueden
oral-fecal al infectar los intestinos. SARS- utilizar dos detecciones de RT-PCR farín-
CoV-2 pertenece al linaje B, betacoronavi- geas con mayor especificidad para excluir
rus (β-CoV) género. El otro miembro de este el diagnóstico. Sin embargo, la RT-PCR tie-
linaje es SARS-CoV, responsable del brote ne la mayor ventaja en la detección de in-
de SARS en 2003 en China, puede detec- fección leve en comparación con la TC de
tarse en las heces de los pacientes (Chan, tórax. La RT-PCR de las heces debe adop-
Poon, & Cheng, 2020). MERS, linaje Cβ-Co- tarse para mejorar la tasa de descubrimien-
Vs, se ha demostrado que existe en las he- to y contarse como un elemento para el alta
ces. Porque no es demasiado sorprendente hospitalaria. Finalmente se puede concluir
detectar el SARS-CoV-2 en las heces. Se in- que estos estudios arrojan luz sobre el es-
forma que se ha detectado ARN del SARS- quema opcional del diagnóstico clínico y el
CoV-2 en las heces de un paciente en los monitoreo de la infección por SARS-CoV-2.
EE. UU. (Zhang, Du, & Li, 2020). Sin em-
bargo, losestudios realizados dan una pista Bibliografía
importante de que en una gran parte de las
Bolívar, J. (2015). Investigación Documental. México.
heces de los pacientes con COVID-19 hay Pax.
ARN del SARS-CoV-2, lo que indica que el
nucleótido de las heces tiene potencial pa- Castro, J. (2016). Técnicas Documentales. México.
Limusa.
pel en el monitoreo de la infección como un
elemento suplementario. Además, lo que Chan, K., Poon, L., & Cheng, V. (2020). Detection
merece más atención son los pacientes que of SARS coronavirus in patients with suspected
SARS. Emerging infectious diseases, 294-9.
no tuvieron hisopos faríngeos positivos en
todas las etapas de la infección, sino heces Chen, L., Liu, W., & Zhang, Q. (2020). RNA based
positivas. Hasta el final de la observación, el mNGS approach identifies a novel human corona-
paciente debe estar bajo tratamiento. Aun- virus from two individual pneumonia cases in 2019
Wuhan outbreak. Emerg Microbes Infect, 313-319.
que no se puede excluir por completo que
la faringe presenta falso negativo o cambio Davila, A. (2015). Diccionario de Términos Científi-
positivo más tarde, al menos la detección cos. . Caracas: Editorial Oasis.
de heces debe estar involucrada en el exa- Huang, C., Wang, Y., & Li, X. (2020). Clinical features
men de las personas altamente sospecho- of patients infected with 2019 novel coronavirus in
sas con hisopo faríngeo negativo. Además Wuhan, China. Lancet, 497-506.
de eso, las heces siguen siendo positivas Rothe, C., Schunk, M., & Sothmann, P. (2020). Trans-
en una etapa posterior de la infección su- mission of 2019-nCoV Infection from an Asympto-
giere que la conversión negativa de ácido matic Contact in Germany. N Engl J Med.
nucleico fecal debe incluirse en los criterios WHO. (23 de 01 de 2020). Novel coronavirus—Re-
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A pesar de que el diagnostico del virus optimization of RT-PCR in diagnosis of SARS-
SARS-CoV-2 es relativamente reciente se CoV-2 infection. The Fifth Affiliated Hospital.
observó mediante el análisis de varios es- Zhang, W., Du, R., & Li, B. (2020). Molecular and
tudios relacionados con el tema, que la serological investigation of 2019-nCoV infected
combinación de RT-PCR faríngea y CT de patients: implication of multiple shedding routes.
tórax con mayor sensibilidad es una opción Emerg Microbes Infect, 386-389.
razonable para evaluar a los pacientes con Zhou, P., Yang, X., & Wang, X. (2020). A pneumonia

136 RECIMUNDO VOL. 4 Nº 3 (2020)

DIAGNÓSTICO DEL VIRUS SARS-COV-2 MEDIANTE PCR

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Engl J Med, 727-33.

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CITAR ESTE ARTICULO:

Garzón Ospina, L., Mirama Calderon, L., Charry Salazar, L., & Freire Torres, C.
(2020). Diagnóstico del virus SARS-CoV-2 mediante PCR. RECIMUNDO, 4(3),
128-137. doi:10.26820/recimundo/4.(3).julio.2020.128-137

RECIMUNDO VOL. 4 Nº 3 (2020) 137