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    Faculté de Médecine Module : Biochimie

    Département de Médecine Chapitre 4 : Enzymologie


    1ère année. Dr. Bensafi-Gheraïbia H.

    TD: Enzymologie

    Exercice 1 :
    Une enzyme bactérienne catalyse l’hydrolyse du maltose: maltose + H2O → 2 glucose.
    En un temps d’une minute, la concentration du maltose diminue de 65mM .
    Quelle est la vitesse de disparition du maltose dans cette réaction enzymatique ?

    Exercice 2 :
    Quelle relation existe-t-il entre le Km et [S] quand une réaction enzymatique s’effectue à:
    A- 75% de Vmax ?
    B- 90% de Vmax ?

    Exercice 3 :
    Voici les valeurs de Km pour la réaction catalysée par la chymotrypsine avec 2 substrats
    différents.

    Substrats Km (M)

    N-Acétylvaline éthyl ester 8,8 X 10-2

    N-Acétyltyrosine éthyl ester 6,6 X 10-4

    Quel est le substrat ayant la plus forte affinité apparente pour l’enzyme ?

    Exercice 4 :
    Des inhibiteurs de l’acétylcholinestérase comme l’édrophonium sont utilisés dans le
    traitement de la maladie d’Alzheimer. L’acétylcholine est le substrat de
    l’acétylcholinestérase.

    A- Quelle sorte d’inhibiteur est l’édrophonium ?


    B- L’inhibition par l’édrophonium peut –elle être vaincue par une augmentation de la
    concentration en substrat ?
    C- Cet inhibiteur se fixe-t-il à l’enzyme de façon réversible ou irréversible ?
    Exercice 5 :
    La glucose-6-phosphate déshydrogénase catalyse la réaction suivante:
    glucose-6-phosphate + NADP+ → 6-phosphogluconolactone + NADPH
    Le Km pour le glucose-6-phosphate chez la levure est de 2,0 X 10-5 M. Le Km pour le
    NADP+ est de 2,0 X 10-6 M
    La glucose-6-phosphate déshydrogénase peut être inhibée par divers agents cellulaires:

    Inhibiteur Ki (M)

    Phosphate inorganique 1,0 x 10-1

    Glucosamine-6-phosphate 7,2x 10-4

    NADPH 2,7x 10-5

    A- Quel est l’inhibiteur le plus efficace ?


    B- Quel(s) inhibiteur(s) risque(nt) d’être complètement inefficace(s) dans les conditions
    cellulaires normales ?

    Exercice 6:
    L’aspartate transcarbamylase (ATCase) catalyse la formation de N-carbamyl aspartate à
    partir de carbamyl phosphate et d’aspartate, c’est une des étapes du processus
    multienzymatique de la synthèse de la cytidine triphosphate (CTP).

    ATCase
    carbamyl phosphate + aspartate → N-carbamyl aspartate → → → UMP →
    →UTP→ CTP

    Les études cinétiques de l’activité de l’ATCase en fonction de la concentration en


    aspartate produisent les résultats montrés dans ce graphe :

    A- l’ATCase est-elle une enzyme allostérique ?


    Faculté de Médecine Module : Biochimie
    Département de Médecine Chapitre 4 : Enzymologie
    1ère année. Dr. Bensafi-Gheraïbia H.

    B- Quelle sorte d’effecteur est le CTP ? Quelle est la signification biologique de l’action
    du CTP sur l’ATCase ?
    C- Quelle sorte d’effecteur est l’ATP ? Quelle est la signification biologique de l’action
    d’ATP sur l’ATCase ?
    TD: Enzymologie

    Solution :
    Exercice 1 :
    V=-d[S]/dt
    V=-0,065M / 60 s
    V= - 1,1 X 10-3 M . s-1

    Exercice 2 :
    A- V₀ = 0,75 Vmax (on l’introduit dans l’équation):
    0,75 Vmax = Vmax [S] / [S] + Km (on simplifie par Vmax des deux côtés de l’équation):
    0,75 = [S] / [S] + Km
    0,75 ([S] + Km ) = [S]
    0,75 Km = 0,25 [S]
    3 Km = [S] la concentration en substrat est 3 fois supérieure au Km.

    B- V₀ = 0,9 Vmax (on l’introduit dans l’équation):


    0,9 Vmax = Vmax [S] / [S] + Km (on simplifie par Vmax des deux côtés de l’équation):
    0,9 = [S] / [S] + Km
    0,9 ([S] + Km ) = [S]
    0,9 Km = 0,1 [S]
    9 Km = [S] la concentration en substrat est 9 fois supérieure au Km.

    Exercice 3 :
    Le N-Acétyltyrosine éthyl ester avec sa valeur la plus basse de Km, a la plus haute affinité
    pour la chymotrypsine.
    (le résidu aromatique de tyrosine s’insère mieux dans la « poche » non polaire de
    l’enzyme que le résidu aliphatique plus petit de valine).

    Exercice 4 :
    A- Puisque les 2 structures sont similaires (les 2 ont des groupes de choline), l’inhibiteur
    est compétitif.(les inhibiteurs compétitifs sont en compétition avec le substrat pour la
    fixation au site actif, les structures doivent donc être similaires).
    B- Oui, l’inhibition peut être surmontée si l’on ajoute de grandes quantités de substrat, il
    sera capable d’une compétition efficace avec l’inhibiteur de sorte que très peu d’inhibiteur
    se fixera au site actif. (le substrat « gagne » la compétition lorsqu’il est en excès).
    C- Comme tous les inhibiteurs compétitifs, l’inhibiteur se fixe de façon réversible.

    Exercice 5 :
    A- NADPH est l’inhibiteur le plus efficace car il a la valeur de Ki la plus basse.
    B- Le Phosphate inorganique sera complètement inefficace car sa valeur de Ki est
    tellement plus grande que la valeur de Km de chacun des 2 substrats.
    Cela indique que l’enzyme a une affinité bien plus forte pour son substrat et qu’elle se
    fixera au substrat plutôt qu’à l’inhibiteur (donc l’inhibiteur sera inefficace).
    Faculté de Médecine Module : Biochimie
    Département de Médecine Chapitre 4 : Enzymologie
    1ère année. Dr. Bensafi-Gheraïbia H.

    Exercice 6:
    A- l’ATCase est une enzyme allostérique. Puisque la courbe de son activité en fonction de
    [S] est de forme sigmoïde.

    B- Le CTP est un effecteur négatif ou inhibiteur.


    Puisque lors de l’addition de CTP, le Km augmente et donc l’affinité de l’enzyme pour le
    substrat diminue.
    Le CTP est le produit final de la voie de biosynthèse des pyrimidines. Lorsque la
    concentration en CTP est suffisante pour les besoins de la cellule, le CTP inhibe une
    enzyme du début de la voie de biosynthèse « l’ATCase » par rétroinhibition.
    C- L’ATP est un effecteur positif ou activateur.
    Puisque lors de l’addition d’ATP, le Km diminue et donc l’affinité de l’enzyme pour le
    substrat augmente.
    L’ATP est un réactif dans la séquence de réactions, il sert donc d’activateur.
    L’ ATP est aussi un nucléotide purique tandis que le CTP est un nucléotide pyrimidique.
    La stimulation de l’ATCase par l’ATP favorise la synthèse de CTP quand il y a beaucoup
    d’ATP équilibrant ainsi les pools cellulaires de nucléotides puriques et pyrimidiques.

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