เปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์
กลุ่มของเปปไทด์ที่มีฤทธิ์ต้านจุลินทรีย์

โครงสร้างต่างๆ ของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์

เปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ ( AMPs ) เรียกอีกอย่างว่าเปปไทด์ป้องกันโฮสต์ ( HDPs ) เป็นส่วนหนึ่งของการตอบสนองภูมิคุ้มกันโดยกำเนิดที่พบในสิ่งมีชีวิตทุกชั้น ความแตกต่างพื้นฐานมีอยู่ระหว่าง เซลล์ โพรคาริโอตและยูคาริโอตที่อาจเป็นเป้าหมายของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ เปปไทด์ เหล่านี้เป็น สารต้านจุลินทรีย์ที่มีประสิทธิภาพและครอบคลุมสเปกตรัมกว้างซึ่งแสดงให้เห็นถึงศักยภาพในการเป็นตัวแทนการรักษาใหม่ เปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าสามารถฆ่าแบคทีเรียแกรมลบและแกรมบวก[1]ไวรัสที่มีเยื่อหุ้ม เชื้อรา และแม้แต่เซลล์ที่เปลี่ยนรูปร่างหรือมะเร็ง[2]ซึ่งแตกต่างจากยาปฏิชีวนะทั่วไปส่วนใหญ่ ดูเหมือนว่าเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์มักจะทำให้เยื่อหุ้มชีวภาพ ไม่เสถียร สามารถสร้างช่องผ่านเยื่อหุ้มและอาจมีคุณสมบัติในการเพิ่มภูมิคุ้มกันโดยทำหน้าที่เป็นตัวปรับภูมิคุ้มกัน

โครงสร้าง

เปปไทด์ต้านจุลินทรีย์จากสัตว์ พืช และเชื้อรา จัดเรียงตามเนื้อหาโครงสร้างรอง ขนาดวงกลมระบุถึงน้ำหนักโมเลกุลโดยรวมของเปปไทด์แต่ละตัว

เปปไทด์ต้านจุลชีพเป็นกลุ่มโมเลกุลที่มีเอกลักษณ์และหลากหลาย ซึ่งแบ่งออกเป็นกลุ่มย่อยตามองค์ประกอบและโครงสร้างของกรดอะมิโน[3]เปปไทด์ต้านจุลชีพโดยทั่วไปมีกรดอะมิโนระหว่าง 12 ถึง 50 กรดอะมิโน เปปไทด์เหล่านี้ประกอบด้วยสารตกค้างที่มีประจุบวก 2 ชนิดขึ้นไปที่ได้จากอาร์จินีนไลซีนหรือในสภาพแวดล้อมที่เป็นกรดฮีสทิดีนและสารตกค้างที่ไม่ชอบน้ำในสัดส่วนที่มาก (โดยทั่วไป >50%) [4] [5] [6]โครงสร้างรองของโมเลกุลเหล่านี้เป็นไปตาม 4 ประเด็น ได้แก่ i) α-helical ii) β-strandedเนื่องจากมีพันธะไดซัลไฟด์ 2 พันธะขึ้นไป iii) β-hairpinหรือ loop เนื่องจากมีพันธะไดซัลไฟด์เพียงพันธะเดียวและ/หรือการสร้างวงแหวนของโซ่เปปไทด์ และ iv) ขยาย[7]เปปไทด์เหล่านี้หลายชนิดไม่มีโครงสร้างในสารละลายอิสระ และพับเป็นโครงร่างสุดท้ายเมื่อแบ่งส่วนเป็นเยื่อหุ้มเซลล์ของสิ่งมีชีวิต เปปไทด์ประกอบด้วยกรดอะมิโนที่ชอบน้ำซึ่งเรียงตัวกันตามด้านหนึ่งและกรดอะมิโนที่ชอบน้ำซึ่งเรียงตัวกันตามด้านตรงข้ามของโมเลกุลเกลียว[3]ความเป็นกรดด่างของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์นี้ทำให้สามารถแยกตัวออกเป็นชั้นไขมันสองชั้นของเยื่อหุ้มเซลล์ได้ ความสามารถในการเชื่อมโยงกับเยื่อหุ้มเซลล์เป็นคุณสมบัติที่ชัดเจนของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์[8] [9]แม้ว่าการทำให้ซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ไม่จำเป็นก็ตาม เปปไทด์เหล่านี้มีกิจกรรมต่อต้านจุลินทรีย์หลากหลายตั้งแต่การทำให้ซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ไปจนถึงการกระทำกับเป้าหมายในไซโตพลาสซึมต่างๆ[ จำเป็นต้องอ้างอิง ]

พิมพ์ลักษณะเฉพาะแอมป์
เปปไทด์แอนไอออนิกอุดมไปด้วยกรดกลูตามิกและกรดแอสปาร์ติกMaximin H5 จากสัตว์สะเทินน้ำสะเทินบก, Dermcidinจากมนุษย์
เปปไทด์อัลฟาเฮลิกซ์แบบเชิงเส้นที่มีประจุบวกขาดซีสเตอีนเซโครปินส์ แอนโดรพิน โมริซินเซราโตทอกซิน และเมลิตตินจากแมลงมาเกนนินเดอร์มาเซปติน บอมโบนิน เบรวินิน-1 เอสคิวเลนติน และบูโฟริน II จากสัตว์ครึ่งบกครึ่งน้ำ CAP18 จากกระต่ายLL37จากมนุษย์
เปปไทด์ประจุบวกที่เสริมกรดอะมิโนเฉพาะอุดมไปด้วยโพรลีน อาร์จินีน ฟีนิลอะลานีน ไกลซีน ทริปโตเฟนอะบาเอซินและโดรโซซิน , อะพิเดซิน, ดิปเทอริ ซิน และแอตตาซินจากแมลง, โพรเฟนิน จากหมู, อินโดลิซิดินจากวัว
เปปไทด์แอนไอออนิก/แคตไอออนิกที่สร้างพันธะไดซัลไฟด์มีพันธะไดซัลไฟด์ 1~3

กิจกรรม

โหมดการออกฤทธิ์ของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์

โหมดการออกฤทธิ์ที่เปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ฆ่าจุลินทรีย์นั้นมีความหลากหลาย[10]และอาจแตกต่างกันไปในแบคทีเรียแต่ละสายพันธุ์[11]เปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์บางชนิดฆ่าทั้งแบคทีเรียและเชื้อรา เช่น สะเก็ดเงินฆ่าอีโคไลและเชื้อราที่มีเส้นใยหลายชนิด[12]เยื่อหุ้มเซลล์เป็นเป้าหมายที่มักพบบ่อย แต่เปปไทด์อาจรบกวน การสังเคราะห์ DNAและโปรตีนการพับโปรตีน และการสังเคราะห์ผนังเซลล์[10]การสัมผัสครั้งแรกระหว่างเปปไทด์และสิ่งมีชีวิตเป้าหมายเป็นแบบไฟฟ้าสถิต เนื่องจากพื้นผิวของแบคทีเรียส่วนใหญ่เป็นแบบแอนไออนิกหรือไม่ชอบน้ำ เช่น ในเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์อย่างพิสซิดิน องค์ประกอบของกรดอะมิโน ความเป็นแอมฟิพาทิซิตี้ ประจุบวก และขนาดทำให้เปปไทด์สามารถยึดติดและแทรกเข้าไปในไบเลเยอร์ของเยื่อหุ้มเซลล์เพื่อสร้างรูพรุนโดยกลไก 'แท่งทรงกระบอก' 'พรม' หรือ 'รูพรุนรูปวงแหวน' นอกจากนี้ พวกมันอาจแทรกซึมเข้าไปในเซลล์เพื่อจับโมเลกุลภายในเซลล์ซึ่งมีความสำคัญต่อการดำรงอยู่ของเซลล์[13]รูปแบบการจับภายในเซลล์รวมถึงการยับยั้งการสังเคราะห์ผนังเซลล์ การเปลี่ยนแปลงของเยื่อหุ้มไซโตพลาสซึม การกระตุ้นออโตไลซิน การยับยั้ง DNA, RNA และการสังเคราะห์โปรตีน และการยับยั้งเอนไซม์บางชนิด ในหลายกรณี กลไกการฆ่าที่แน่นอนยังไม่เป็นที่ทราบ เทคนิคใหม่ที่เพิ่งเกิดขึ้นสำหรับการศึกษากลไกดังกล่าวคือ อินเตอร์เฟอโร มิเตอร์แบบโพลาไรเซชันคู่[14] [15]ต่างจากยาปฏิชีวนะทั่วไปหลายชนิด เปปไทด์เหล่านี้ดูเหมือนจะฆ่าเชื้อแบคทีเรียได้[2]แทนที่จะเป็น แบบ ยับยั้งแบคทีเรียโดยทั่วไป กิจกรรมต่อต้านจุลินทรีย์ของเปปไทด์เหล่านี้จะถูกกำหนดโดยการวัดความเข้มข้นที่ยับยั้งขั้นต่ำ (MIC) ซึ่งเป็นความเข้มข้นต่ำสุดของยาที่ยับยั้งการเติบโตของแบคทีเรีย[16]

AMP สามารถมีกิจกรรมหลายอย่างได้ เช่น ต้านแบคทีเรียแกรมบวก ต้านแบคทีเรียแกรมลบ ต้านเชื้อรา ต้านไวรัส ต้านปรสิต และต้านมะเร็ง การวิเคราะห์การทำงานของ AMP ครั้งใหญ่ระบุว่าในบรรดากิจกรรมของ AMP ทั้งหมด แอมฟิพาทิซิตี้และประจุ ซึ่งเป็นคุณสมบัติหลักสองประการของ AMP สามารถแยกแยะระหว่าง AMP ที่มีและไม่มีกิจกรรมของแบคทีเรียแกรมลบได้ดีที่สุด[17]ซึ่งหมายความว่าการเป็น AMP ที่มีกิจกรรมของแบคทีเรียแกรมลบอาจต้องการหรืออาจต้องการแอมฟิพาทิซิตี้และประจุบวกสุทธิที่เข้มข้น[ จำเป็นต้องอ้างอิง ]

การปรับภูมิคุ้มกัน

นอกจากการฆ่าเชื้อแบคทีเรียโดยตรงแล้ว ยังได้มีการพิสูจน์แล้วว่าสารเหล่านี้มี หน้าที่ ปรับภูมิคุ้มกัน หลายอย่าง ที่อาจเกี่ยวข้องกับการกำจัดการติดเชื้อ ได้แก่ ความสามารถในการเปลี่ยนแปลงการแสดงออกของยีนโฮสต์ ทำหน้าที่เป็นคีโมไคน์ และ/หรือกระตุ้น การผลิต คีโมไคน์ยับยั้ง การผลิต ไซโตไคน์ที่กระตุ้นการอักเสบ จาก ไลโป โพลีแซ็กคาไรด์ ส่งเสริมการสมานแผล และปรับการตอบสนองของเซลล์เดนไดรต์และเซลล์ของการตอบสนองภูมิคุ้มกันแบบปรับตัว แบบจำลองสัตว์บ่งชี้ว่าเปปไทด์ป้องกันโฮสต์มีความสำคัญทั้งในการป้องกันและการกำจัดการติดเชื้อ ดูเหมือนว่าเปปไทด์จำนวนมากที่แยกออกมาในตอนแรกและเรียกว่า "เปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์" ได้รับการพิสูจน์แล้วว่ามีหน้าที่ทางเลือกที่สำคัญกว่าในร่างกาย (เช่น เฮปซิดิน[18] ) ตัวอย่างเช่น ดุสเกไทด์เป็นสารปรับภูมิคุ้มกันที่ออกฤทธิ์ผ่าน p62 ซึ่งเป็นโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการส่งสัญญาณการติดเชื้อแบบ Toll ขณะนี้เปปไทด์กำลังได้รับการทดสอบในการทดลองทางคลินิกในระยะที่ III โดย Soligenix (SGNX) เพื่อดูว่าสามารถช่วยซ่อมแซมความเสียหายต่อเยื่อบุช่องปากอันเกิดจากการฉายรังสีที่เกิดขึ้นระหว่างการฉายรังสีรักษามะเร็งบริเวณศีรษะและคอได้หรือไม่[19]

กลไกการออกฤทธิ์

ภาพ จากกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบส่องกราด (กำลังขยาย 50,000 เท่า) แสดงการทำงานของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ในการทดลอง (NN2_0050) บนเยื่อหุ้มเซลล์ของE. coli (K12 MG1655) [1] ด้านบน: เยื่อหุ้มเซลล์ที่สมบูรณ์ในกลุ่มควบคุม ด้านล่าง: เยื่อหุ้มเซลล์ที่ถูกทำลายและการรั่วไหลของโครโมโซมแบคทีเรีย (สีเขียว) ในกลุ่มที่ได้รับการรักษา

โดยทั่วไปแล้วเปปไทด์ต้านจุลชีพจะมีประจุบวกสุทธิ ซึ่งทำให้สามารถโต้ตอบกับโมเลกุลที่มีประจุลบที่สัมผัสกับแบคทีเรียและพื้นผิวเซลล์มะเร็งได้ เช่น ฟอสโฟลิปิดฟอสฟาติดิลเซอรีน มิวซินที่ไกลโคไซเลตด้วยโอ แกลกลิโอไซด์ที่ถูกไซเอลิเลต และเฮปารินซัลเฟต กลไกการทำงานของเปปไทด์เหล่านี้มีความหลากหลาย แต่สามารถแบ่งย่อยได้เป็นสองประเภท ได้แก่ เปปไทด์ต้านจุลชีพที่ทำลายเยื่อหุ้มเซลล์และไม่ทำลายเยื่อหุ้มเซลล์[20]การแตกของเยื่อหุ้มเซลล์โดยเปปไทด์ต้านจุลชีพที่ทำลายเยื่อหุ้มเซลล์สามารถอธิบายได้ด้วยสี่รูปแบบดังต่อไปนี้[20]

  • แบบจำลองแท่งทรงกระบอก: แบบจำลองแท่งทรงกระบอกเสนอว่า AMP จะโต้ตอบกับชั้นไขมันสองชั้นของเยื่อหุ้มเซลล์จุลินทรีย์เพื่อสร้างช่องข้ามเยื่อหุ้มเซลล์หรือ "แท่งทรงกระบอก" ช่องเหล่านี้จะทำลายความสมบูรณ์ของเยื่อหุ้มเซลล์ ส่งผลให้จุลินทรีย์ตาย
  • แบบจำลองพรม: แบบจำลองพรมเสนอว่า AMP จะดูดซับบนชั้นไขมันสองชั้นของเยื่อหุ้มเซลล์จุลินทรีย์ ทำให้เกิดชั้นหนาแน่นที่ทำให้เยื่อหุ้มเซลล์ซึมผ่านได้ แบบจำลองนี้เสนอว่า AMP ทำหน้าที่เป็น "พรม" ที่ปกคลุมพื้นผิวของเซลล์ ป้องกันไม่ให้จุลินทรีย์ทำงานได้อย่างถูกต้อง
  • แบบจำลองวงแหวน: แบบจำลองวงแหวนเสนอว่า AMP จะโต้ตอบกับชั้นไขมันสองชั้นของเยื่อหุ้มเซลล์จุลินทรีย์เพื่อสร้างโครงสร้างวงแหวน ซึ่งเชื่อกันว่าจะทำให้ส่วนของเยื่อหุ้มเซลล์ถูกบีบออกและทำให้เกิดการสร้างเวสิเคิล กระบวนการนี้เชื่อกันว่าจะไปทำลายความสมบูรณ์ของเยื่อหุ้มเซลล์และทำให้จุลินทรีย์ตาย
  • แบบจำลองรูพรุนรูปวงแหวนที่ผิดปกติ: ตามแบบจำลองนี้ AMP ที่ผิดปกติจะห่อหุ้มชั้นไขมันสองชั้นและสร้างรูพรุน ซึ่งจะทำลายความสมบูรณ์ของเยื่อหุ้มเซลล์และนำไปสู่การตายของจุลินทรีย์ ซึ่งแตกต่างจากแบบจำลองวงแหวนซึ่งแนะนำว่า AMP สร้างโครงสร้างวงแหวนที่เสถียร แบบจำลองรูพรุนรูปวงแหวนที่ผิดปกติแนะนำว่า AMP มีความยืดหยุ่นและไม่สร้างโครงสร้างวงแหวนที่เสถียร คอมเพล็กซ์รูพรุนเปปไทด์-ลิปิดจะเกิดความผิดปกติในตัวโดยที่การวางแนวของเปปไทด์ไม่ชัดเจน[21]
แผนผังแสดงกลไกการทำงานของ AMP เมื่อทำลายเยื่อหุ้มเซลล์[22]

มีการใช้หลายวิธีเพื่อกำหนดกลไกการทำงานของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์[11] [13]โดยเฉพาะอย่างยิ่ง การศึกษา NMR แบบโซลิดสเตตได้ให้คำอธิบายการแตกของเยื่อหุ้มเซลล์โดยเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ในระดับอะตอม[23] [24]ในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมา มีการใช้ การวิเคราะห์ผลึกด้วยรังสีเอกซ์เพื่อระบุรายละเอียดในระดับอะตอมว่ากลุ่มดีเฟนซินของพืชทำให้เยื่อหุ้มเซลล์แตกได้อย่างไร โดยระบุฟอสโฟลิปิดที่สำคัญในเยื่อหุ้มเซลล์ของเชื้อก่อโรค[25] [26]เชื่อกันว่าดีเฟนซินของมนุษย์ทำงานผ่านกลไกที่คล้ายคลึงกัน โดยกำหนดเป้าหมายไปที่ลิปิดเยื่อหุ้มเซลล์เป็นส่วนหนึ่งของหน้าที่ ในความเป็นจริง ปัจจุบันเบตาดีเฟนซิน 2 ของมนุษย์ ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าสามารถฆ่าเชื้อราแคนดิดาอัลบิแคนส์ ที่ทำให้เกิดโรคได้ โดยการโต้ตอบกับฟอสโฟลิปิดเฉพาะ[27]จากมุมมองของการคำนวณ การจำลองพลวัตของโมเลกุลสามารถให้ข้อมูลโดยละเอียดเกี่ยวกับโครงสร้างและพลวัตของปฏิสัมพันธ์ระหว่างเปปไทด์กับเยื่อหุ้มเซลล์ รวมถึงการวางแนว การจัดโครงสร้าง และการแทรกของเปปไทด์ในเยื่อหุ้มเซลล์ ตลอดจนปฏิสัมพันธ์ระหว่างเปปไทด์เฉพาะกับไขมัน ไอออน และตัวทำละลาย[28]

วิธีการแอปพลิเคชั่น
กล้องจุลทรรศน์เพื่อแสดงภาพผลของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ต่อเซลล์จุลินทรีย์
สเปกโตรสโคปีการแผ่รังสีอะตอมเพื่อตรวจหาการสูญเสียโพแทสเซียมภายในเซลล์ (ซึ่งบ่งชี้ว่าความสมบูรณ์ของเยื่อหุ้มแบคทีเรียถูกทำลาย)
สีย้อมเรืองแสงเพื่อวัดความสามารถของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ในการซึมผ่านเวสิเคิลของเยื่อหุ้มเซลล์
การก่อตัวของช่องไอออนเพื่อประเมินการก่อตัวและเสถียรภาพของรูพรุนที่เกิดจากเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์
ไดโครอิซึมแบบวงกลมและไดโครอิซึมแบบวงกลมที่มีทิศทางเพื่อวัดการวางแนวและโครงสร้างรองของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ที่ผูกกับชั้นไขมันสองชั้น
อินเตอร์เฟอโรมิเตอร์โพลาไรเซชันแบบคู่เพื่อวัดกลไกที่แตกต่างกันของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์
สเปกโตรสโคปี NMR แบบโซลิดสเตตเพื่อวัดโครงสร้างรอง การวางแนว และการแทรกซึมของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์เข้าไปในชั้นไขมันสองชั้นในสถานะผลึกเหลวที่เกี่ยวข้องทางชีวภาพ
การเลี้ยวเบนของนิวตรอนและรังสีเอกซ์เพื่อวัดรูปแบบการเลี้ยวเบนของรูพรุนที่เกิดจากเปปไทด์ภายในเมมเบรนในชั้นหลายชั้นหรือของเหลวที่มีการวางแนว
การจำลองพลวัตเชิงโมเลกุลเพื่อศึกษาพฤติกรรมของโมเลกุลและค้นหาปฏิสัมพันธ์ระหว่างเปปไทด์และลิพิดที่เฉพาะเจาะจง
การตรวจสเปกตรัมมวลเพื่อวัดการตอบสนองของโปรตีโอมิกส์ของจุลินทรีย์ต่อเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์

การวิจัยและการใช้ยาเพื่อการรักษา

เปปไทด์ต้านจุลชีพถูกใช้เป็นตัวแทนการรักษา โดยทั่วไปการใช้จะจำกัดเฉพาะการให้ทางเส้นเลือดหรือการใช้ภายนอกเนื่องจากเปปไทด์มีอายุครึ่งชีวิตสั้น ณ เดือนมกราคม 2018 เปปไทด์ต้านจุลชีพต่อไปนี้ถูกใช้ในทางคลินิก: [29]

กิจกรรมที่เกินกว่าหน้าที่ต่อต้านแบคทีเรีย

พบว่า AMP มีหน้าที่อื่นนอกเหนือจากการฆ่าเชื้อแบคทีเรียและเชื้อรา กิจกรรมเหล่านี้รวมถึงผลต้านไวรัส แต่ยังมีบทบาทในการป้องกันโฮสต์ เช่น ฟังก์ชันต่อต้านมะเร็งและบทบาทในระบบประสาท[30]สิ่งนี้ทำให้เกิดการเคลื่อนไหวเพื่อเปลี่ยนชื่อ AMP เป็น "เปปไทด์ป้องกันโฮสต์" เพื่อให้ครอบคลุมขอบเขตกิจกรรมที่กว้างขวางของ AMP [31]

สรรพคุณต้านมะเร็ง

เซโครพินบางชนิด (เช่น เซโครพิน เอ และเซโครพิน บี) มีคุณสมบัติต้านมะเร็งและเรียกว่าเปปไทด์ต้านมะเร็ง (ACP) [32] : 3  ACP ลูกผสมที่ใช้เซโครพิน เอ ได้รับการศึกษาวิจัยเกี่ยวกับคุณสมบัติต้านมะเร็ง[32] : 7.1 ดีเฟนซินจากแมลงวันผลไม้ป้องกันการเติบโตของเนื้องอก ซึ่งคาดว่าจะจับกับเซลล์เนื้องอกเนื่องจากการดัดแปลงเยื่อหุ้มเซลล์ที่มักพบในเซลล์มะเร็งส่วนใหญ่ เช่นการสัมผัส กับ ฟอสฟาติดิลเซอ รีน [33]

คุณสมบัติต่อต้านไบโอฟิล์ม

Cecropin A สามารถทำลาย เซลล์ E. coliที่สร้าง ไบโอฟิล์มและ พยาธิสภาพทางเดินปัสสาวะ (UPEC) ที่เป็นแพลงก์ตอนและติดเชื้อแบคทีเรียได้ ไม่ว่าจะใช้เพียงอย่างเดียวหรือเมื่อใช้ร่วมกับกรดนาลิดิ ซิกซึ่งเป็นยาปฏิชีวนะ โดยจะกำจัดการติดเชื้อในร่างกายได้อย่างมีประสิทธิภาพ (ในแมลงที่เป็นพาหะGalleria mellonella ) โดยไม่เกิดพิษต่อเซลล์นอกเป้าหมาย กลไกการออกฤทธิ์หลายเป้าหมายเกี่ยวข้องกับการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ภายนอกตามด้วยการทำลายไบโอฟิล์มซึ่งเกิดจากการยับยั้งกิจกรรมของปั๊มขับของเหลวและปฏิกิริยากับกรดนิวคลีอิกนอกเซลล์และภายในเซลล์[34]

การวิจัยอื่น ๆ

เมื่อไม่นานนี้ มีการวิจัยบางส่วนเพื่อระบุเปปไทด์ต้านจุลินทรีย์ที่มีศักยภาพจากโพรคาริโอต[35]สิ่งมีชีวิตในน้ำ เช่น ปลา[36] [37]และหอย[38]และโมโนเทรมเช่น อีคิดนา[39] [40]

การเลือกสรร

ในการแข่งขันระหว่างเซลล์แบคทีเรียและเซลล์โฮสต์กับเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ เปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์จะโต้ตอบกับเซลล์แบคทีเรียกับเซลล์ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมโดยเฉพาะ ซึ่งทำให้สามารถฆ่าจุลินทรีย์ได้โดยไม่เป็นพิษต่อเซลล์ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมมากนัก[41]

ในส่วนของ เซลล์ มะเร็งเซลล์เหล่านี้ยังหลั่งเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ของมนุษย์ด้วย รวมทั้งดีเฟนซินและในบางกรณี รายงานว่าเซลล์เหล่านี้มีความต้านทานมากกว่าเซลล์ปกติโดยรอบ ดังนั้นเราจึงสรุปไม่ได้ว่าการคัดเลือกเซลล์จะสูงเสมอไป[42] [43]

ปัจจัยต่างๆ

มีปัจจัยบางประการที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับคุณสมบัติการเลือกสรรของเปปไทด์ต้านจุลินทรีย์ โดยคุณสมบัติประจุบวกมีส่วนสนับสนุนมากที่สุด เนื่องจากพื้นผิวของเยื่อหุ้มแบคทีเรียมีประจุลบมากกว่าเซลล์ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม เปปไทด์ต้านจุลินทรีย์จึงแสดงความสัมพันธ์ที่แตกต่างกันกับเยื่อหุ้มแบคทีเรียและเยื่อหุ้มเซลล์ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม[44]

นอกจากนี้ ยังมีปัจจัยอื่นๆ ที่จะส่งผลต่อการคัดเลือกอีกด้วย เป็นที่ทราบกันดีว่าโดยปกติแล้วคอเลสเตอรอล จะกระจายตัวอย่างกว้างขวางในเยื่อหุ้มเซลล์ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมในฐานะตัวแทนในการทำให้เยื่อหุ้มเซลล์มีเสถียรภาพ แต่จะไม่มีอยู่ในเยื่อหุ้มเซลล์ของแบคทีเรีย (ยกเว้นเมื่อถูกกักเก็บโดย H. pylori ) [45]และการมีอยู่ของคอเลสเตอรอลเหล่านี้จะลดกิจกรรมของเปปไทด์ที่ต่อต้านจุลินทรีย์โดยทั่วไป เนื่องมาจากการทำให้ไบเลเยอร์ของไขมันมีเสถียรภาพหรือปฏิสัมพันธ์ระหว่างคอเลสเตอรอลและเปปไทด์ ดังนั้น คอเลสเตอรอลในเซลล์ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมจะปกป้องเซลล์จากการโจมตีของเปปไทด์ที่ต่อต้านจุลินทรีย์[46]

นอกจากนี้ เป็นที่ทราบกันดีว่า ศักยภาพของเยื่อหุ้ม เซลล์ มีผลต่อปฏิสัมพันธ์ระหว่างเปปไทด์กับลิพิด[47]มีศักยภาพของเยื่อหุ้มเซลล์แบบลบด้านในอยู่ตั้งแต่แผ่นใบด้านนอกไปจนถึงแผ่นใบด้านในของเยื่อหุ้มเซลล์ และศักยภาพของเยื่อหุ้มเซลล์แบบลบด้านในนี้จะช่วยให้เยื่อหุ้มเซลล์ซึมผ่านได้ง่ายขึ้น โดยอาจช่วยให้สามารถแทรกเปปไทด์ที่มีประจุบวกเข้าไปในเยื่อหุ้มเซลล์ได้ เมื่อเปรียบเทียบกันแล้ว ศักยภาพของเยื่อหุ้มเซลล์ของเซลล์แบคทีเรียจะเป็นลบมากกว่าของเซลล์สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมทั่วไป ดังนั้นเยื่อหุ้มเซลล์ของแบคทีเรียจึงมีแนวโน้มที่จะถูกโจมตีโดยเปปไทด์ต้านจุลชีพที่มีประจุบวก[ จำเป็นต้องอ้างอิง ]

ในทำนองเดียวกัน เชื่อกันว่าการเพิ่มความแข็งแรงของไอออนิก[46]ซึ่งโดยทั่วไปจะลดกิจกรรมของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ส่วนใหญ่ มีส่วนช่วยในการคัดเลือกเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์บางส่วน โดยทำให้ ปฏิสัมพันธ์ ไฟฟ้าสถิตย์ที่จำเป็นสำหรับปฏิสัมพันธ์เริ่มต้น อ่อนแอลง

พื้นฐานโมเลกุลของการคัดเลือกเซลล์ของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์

กลไก

เยื่อหุ้มเซลล์ของแบคทีเรียอุดมไปด้วยฟอสโฟลิปิด ที่มีกรด เช่นฟอสฟาติดิลกลีเซอรอลและคาร์ดิโอลิพิน[41] [48]

ในทางตรงกันข้าม ส่วนนอกของเยื่อหุ้มเซลล์ของพืชและสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมประกอบด้วยไขมันเป็นส่วนใหญ่โดยไม่มีประจุสุทธิ เนื่องจากไขมันส่วนใหญ่ที่มีเฮดกรุ๊ปที่มีประจุลบจะถูกกักเก็บส่วนใหญ่ไว้ในแผ่นชั้นในของเยื่อหุ้มเซลล์พลาสมา[44]ดังนั้น ในกรณีของเซลล์ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม พื้นผิวด้านนอกของเยื่อหุ้มเซลล์มักประกอบด้วยฟอสฟาติดิลโคลีน ที่มีประจุลบ และสฟิงโกไมอีลินแม้ว่าพื้นผิวด้านนอกของเยื่อหุ้มเซลล์ส่วนเล็ก ๆ จะมีแกงกลิโอไซด์ ที่มีประจุ ลบอยู่บ้าง ดังนั้น ปฏิสัมพันธ์แบบไม่ชอบน้ำระหว่างพื้นผิวแบบไม่ชอบน้ำของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ที่มีแอมฟิพาทิกและฟอสโฟลิปิดที่มีประจุลบบนพื้นผิวเซลล์ของเยื่อหุ้มเซลล์ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมจึงมีบทบาทสำคัญในการก่อตัวของการจับกันระหว่างเปปไทด์กับเซลล์[49]

มีการใช้การรบกวนแบบโพลาไรเซชันคู่ในหลอดทดลองเพื่อศึกษาและระบุปริมาณความสัมพันธ์กับกลุ่มหัว การแทรกเข้าไปในไบเลเยอร์ การก่อตัวของรูพรุน และการหยุดชะงักในที่สุดของเมมเบรน[50] [51]

ควบคุม

มีการทุ่มเทความพยายามอย่างมากในการควบคุมการคัดเลือกเซลล์ ตัวอย่างเช่น มีการพยายามปรับเปลี่ยนและปรับพารามิเตอร์ทางฟิสิกเคมีของเปปไทด์ให้เหมาะสมเพื่อควบคุมการคัดเลือก รวมถึงประจุสุทธิความเป็นเกลียว ความเป็นไฮโดรโฟบิซิตี้ต่อกาก (H) โมเมนต์ไฮโดรโฟบิซิตี้ (μ) และมุมที่รับโดยหน้าเฮลิกซ์ขั้วที่มีประจุบวก (Φ) [47] เชื่อกัน ว่ากลไกอื่นๆ เช่น การนำกรดอะมิโน D และกรดอะมิโนฟลูออรีนเข้าสู่เฟสไฮโดรโฟบิซิตี้จะทำลายโครงสร้างรอง และลดปฏิสัมพันธ์ไฮโดรโฟบิซิตี้กับเซลล์ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม นอกจากนี้ยังพบอีกด้วยว่าการแทนที่ Pro→Nlys ในเปปไทด์ต้านจุลชีพที่มี β-turn เป็นกลยุทธ์ที่มีแนวโน้มดีสำหรับการออกแบบเปปไทด์ต้านจุลชีพขนาดเล็กที่เลือกใช้กับเซลล์แบคทีเรียชนิดใหม่ที่มีกลไกการออกฤทธิ์ภายในเซลล์[52]มีข้อเสนอแนะว่าการยึดติดโดยตรงของแมกกาอินกับพื้นผิวของสารตั้งต้นจะช่วยลดการจับกับเซลล์แบบไม่จำเพาะและทำให้ขีดจำกัดการตรวจจับสำหรับเซลล์แบคทีเรีย เช่นซัลโมเนลลาและอีโคไลดี ขึ้น [53]

ความต้านทานแบคทีเรีย

แบคทีเรียใช้กลยุทธ์การต้านทาน ต่างๆ เพื่อหลีกเลี่ยงการฆ่าเชื้อเปปไทด์ [13]

  • จุลินทรีย์บางชนิดจะเปลี่ยนประจุสุทธิบนพื้นผิวStaphylococcus aureusขนส่ง D-alanine จากไซโทพลาซึมไปยังกรด teichoic บนพื้นผิวซึ่งจะลดประจุลบสุทธิโดยการนำกลุ่มอะมิโนเบสเข้ามา[54] นอกจากนี้ S. aureusยังปรับเปลี่ยนเมมเบรนแอนไออนิกของมันผ่าน MprF ด้วย L-lysine ทำให้ประจุสุทธิบวกเพิ่มขึ้น[54]
  • ปฏิสัมพันธ์ระหว่างเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์กับเป้าหมายเยื่อหุ้มเซลล์สามารถจำกัดได้ด้วยแคปซูลโพลีแซ็กคาไรด์ของKlebsiella pneumoniae [ 55]
  • แบคทีเรีย ซัลโมเนลลาลดความลื่นไหลของเยื่อหุ้มชั้นนอกโดยเพิ่มปฏิสัมพันธ์แบบไม่ชอบน้ำระหว่างหางอะซิลลิปิดเอจำนวนเพิ่มขึ้น โดยการเติมไมริสเตตลงในลิปิดเอด้วย 2-ไฮดรอกซีไมริสเตต และสร้างลิปิดเอที่มีอะซิลเฮปตาโดยการเติมปาล์มิเตต เชื่อกันว่าโมเมนต์แบบไม่ชอบน้ำที่เพิ่มขึ้นจะทำให้การแทรกซึมของเปปไทด์ที่ต่อต้านจุลินทรีย์และการสร้างรูพรุนช้าลงหรือหายไป สารตกค้างจะเปลี่ยนแปลงไปในโปรตีนของเยื่อหุ้ม ในแบคทีเรียแกรมลบบางชนิด การเปลี่ยนแปลงในการผลิตโปรตีนของเยื่อหุ้มชั้นนอกมีความสัมพันธ์กับความต้านทานต่อการฆ่าโดยเปปไทด์ที่ต่อต้านจุลินทรีย์[56]
  • แบคทีเรีย Hemophilus influenzaeที่ไม่สามารถระบุชนิดได้จะขนส่ง AMP เข้าไปในส่วนภายในเซลล์ ซึ่งจะถูกย่อยสลาย นอกจากนี้แบคทีเรีย H. influenzaeยังปรับเปลี่ยนเยื่อหุ้มเซลล์เพื่อให้ดูเหมือนว่าแบคทีเรียดังกล่าวถูก AMP โจมตีสำเร็จแล้ว จึงป้องกันไม่ให้แบคทีเรียดังกล่าวถูก AMP โจมตีเพิ่มเติม[57]
  • ตัวขนส่งตลับจับ ATP นำเข้าเปปไทด์ต้านจุลินทรีย์และปั๊มส่งออกการแบ่งเซลล์แบบต้านทาน-ปมจะส่งออกเปปไทด์ต้านจุลินทรีย์[58]ตัวขนส่งทั้งสองมีความเกี่ยวข้องกับความต้านทานต่อเปปไทด์ต้านจุลินทรีย์
  • แบคทีเรียผลิตเอนไซม์โปรตีโอไลติกซึ่งอาจทำให้เปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์สลายตัว ส่งผลให้เกิดการดื้อยา[59]
  • แบคทีเรียแกรมลบสร้างเวสิเคิลเยื่อหุ้มชั้นนอกที่เวสิเคิลเยื่อหุ้มชั้นนอกจับกับเปปไทด์ที่ต่อต้านจุลินทรีย์และแยกออกจากเซลล์ จึงช่วยปกป้องเซลล์ได้[60]เวสิเคิลเยื่อหุ้มชั้นนอกยังทราบกันดีว่ามีโปรตีเอส เปปไทเดส และเอนไซม์ไลติกอื่นๆ ซึ่งอาจมีบทบาทในการย่อยสลายโมเลกุลของเปปไทด์และกรดนิวคลีอิกนอกเซลล์ ซึ่งหากปล่อยให้โมเลกุลเหล่านี้เข้าถึงเซลล์แบคทีเรีย อาจเป็นอันตรายต่อเซลล์ได้
  • การส่งสัญญาณ Cyclic-di-GMPยังเกี่ยวข้องกับการควบคุม ความต้านทาน เปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ในPseudomonas aeruginosa [61]

แม้ว่าตัวอย่างเหล่านี้จะแสดงให้เห็นว่าความต้านทานสามารถพัฒนาได้ตามธรรมชาติ แต่ก็มีข้อกังวลเพิ่มขึ้นเรื่อยๆ ว่าการใช้เปปไทด์ต้านจุลชีพที่คัดลอกมาจากผลิตภัณฑ์ทางเภสัชกรรมอาจทำให้เกิดความต้านทานได้บ่อยขึ้นและเร็วขึ้น ในบางกรณี ความต้านทานต่อเปปไทด์เหล่านี้ซึ่งใช้เป็นยาในการรักษาปัญหาทางการแพทย์อาจนำไปสู่การต้านทาน ไม่เพียงแต่ต่อการใช้เปปไทด์ในทางการแพทย์เท่านั้น แต่ยังรวมถึงการทำงานทางสรีรวิทยาของเปปไทด์เหล่านั้นด้วย[62] [63]

แนวทาง 'ม้าโทรจัน' ในการแก้ปัญหานี้ใช้ประโยชน์จากความต้องการธาตุเหล็กโดยธรรมชาติของเชื้อโรค การ "ลักลอบนำ" สารต้านจุลชีพเข้าไปในเชื้อโรคทำได้โดยเชื่อมสารต้านจุลชีพเข้ากับไซเดอโรฟอร์เพื่อการขนส่ง แม้จะมีแนวคิดที่เรียบง่าย แต่ต้องใช้เวลาหลายทศวรรษในการเอาชนะอุปสรรคที่ยากลำบากในการขนส่งสารต้านจุลชีพผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ของเชื้อโรค บทเรียนที่ได้เรียนรู้จากความสำเร็จและความล้มเหลวของยาไซเดอโรฟอร์คอนจูเกตที่ประเมินในระหว่างการพัฒนาตัวแทนใหม่โดยใช้แนวทาง 'ม้าโทรจัน' ได้รับการทบทวนแล้ว[64]

ตัวอย่าง

แมลงวันผลไม้ที่ติดเชื้อแบคทีเรียที่สร้าง GFP แมลงวันตาแดงที่ไม่มียีนเปปไทด์ต้านจุลินทรีย์จะไวต่อการติดเชื้อ ในขณะที่แมลงวันตาขาวมีภูมิคุ้มกันแบบธรรมชาติ

เปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ถูกผลิตขึ้นโดยสายพันธุ์ต่างๆ ทั่วทั้งต้นไม้แห่งชีวิต รวมถึง:

ในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมา มีการวิจัยเพิ่มมากขึ้นเพื่อพัฒนาสารเลียนแบบเปปไทด์ต้านจุลินทรีย์ เช่นSNAPPsซึ่งส่วนหนึ่งเป็นเพราะต้นทุนที่สูงเกินไปในการผลิต AMPs ที่ได้จากธรรมชาติ[69]ตัวอย่างคือเป ปไทด์ C18G ที่มีประจุ บวก ซึ่งออกแบบจาก โดเมน C-terminalของแฟกเตอร์ IV ของเกล็ดเลือดของมนุษย์[70]ปัจจุบัน เปปไทด์ต้านจุลินทรีย์ที่ใช้กันอย่างแพร่หลายที่สุดคือไนซินเนื่องจากเป็นเปปไทด์ต้านจุลินทรีย์ชนิดเดียว ที่ได้รับการอนุมัติ จาก FDAจึงมักใช้เป็นสารกันเสียเทียม[71]

ชีวสารสนเทศศาสตร์

มีฐานข้อมูลชีวสารสนเทศหลายแห่งที่จัดทำรายการเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์Antimicrobial Peptide Database ( APD ) เป็นฐานข้อมูลต้นแบบและแบบจำลองสำหรับเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ (https://aps.unmc.edu) โดยอิงตาม APD ฐานข้อมูลอื่นๆ ก็ถูกสร้างขึ้นเช่นกัน รวมถึง ADAM (ฐานข้อมูลเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์), [72] BioPD (ฐานข้อมูลเปปไทด์ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ), CAMP (คอลเลกชันของลำดับและโครงสร้างของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์), [73] DBAASP (ฐานข้อมูลของกิจกรรมต่อต้านจุลินทรีย์และโครงสร้างของเปปไทด์), DRAMP (ที่เก็บข้อมูลของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์) ยินดีต้อนรับสู่ฐานข้อมูล Dramp [74]และ LAMP (การเชื่อมโยง AMP)

ฐานข้อมูลเปปไทด์ต้านจุลชีพสามารถแบ่งได้เป็นสองประเภทตามแหล่งที่มาของเปปไทด์ที่บรรจุอยู่ ได้แก่ ฐานข้อมูลเฉพาะและฐานข้อมูลทั่วไป ฐานข้อมูลเหล่านี้มีเครื่องมือต่างๆ สำหรับการวิเคราะห์และทำนายเปปไทด์ต้านจุลชีพ ตัวอย่างเช่น APD มีอินเทอร์เฟซการคำนวณที่ใช้กันอย่างแพร่หลาย นอกจากนี้ยังมีลิงก์ไปยังเครื่องมืออื่นๆ อีกมากมาย CAMP ประกอบด้วยการทำนาย AMP เครื่องคำนวณคุณลักษณะ การค้นหา BLAST ClustalW VAST PRATT ล้อเกลียว ฯลฯ นอกจากนี้ ADAM ยังช่วยให้ผู้ใช้ค้นหาหรือเรียกดูความสัมพันธ์ของลำดับโครงสร้าง AMP เปปไทด์ต้านจุลชีพมักครอบคลุมหมวดหมู่ต่างๆ มากมาย เช่น เปปไทด์ต้านเชื้อรา ต้านแบคทีเรีย และต้านวัณโรค

dbAMP: [75]จัดทำแพลตฟอร์มออนไลน์เพื่อสำรวจเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ที่มีกิจกรรมการทำงานและคุณสมบัติทางเคมีฟิสิกส์ในข้อมูลทรานสคริปโทมและโปรตีโอม dbAMP เป็นแหล่งข้อมูลออนไลน์ที่กล่าวถึงหัวข้อต่างๆ เช่น คำอธิบายประกอบของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ (AMP) รวมถึงข้อมูลลำดับ กิจกรรมต่อต้านจุลินทรีย์ การดัดแปลงหลังการแปล (PTM) การสร้างภาพโครงสร้าง ศักยภาพในการต่อต้านจุลินทรีย์ สายพันธุ์เป้าหมายที่มีความเข้มข้นยับยั้งขั้นต่ำ (MIC) คุณสมบัติทางเคมีฟิสิกส์ หรือปฏิสัมพันธ์ระหว่าง AMP กับโปรตีน[ จำเป็นต้องอ้างอิง ]

เครื่องมือต่างๆ เช่น PeptideRanker, [76] PeptideLocator, [77]และ AntiMPmod [78] [79]ช่วยให้สามารถคาดการณ์เปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ได้ ในขณะที่เครื่องมืออื่นๆ ได้รับการพัฒนาขึ้นเพื่อคาดการณ์กิจกรรมต่อต้านเชื้อราและวัณโรค[80] [81]

ดูเพิ่มเติม

อ้างอิง

  1. ^ Ageitos JM, Sánchez-Pérez A, Calo-Mata P, Villa TG (มิถุนายน 2017). "เปปไทด์ต้านจุลชีพ (AMPs): สารประกอบโบราณที่เป็นอาวุธใหม่ในการต่อสู้กับแบคทีเรีย" Biochemical Pharmacology . 133 (6): 117–138. doi :10.1016/j.bcp.2016.09.018. PMID  27663838.
  2. ^ ab Reddy KV, Yedery RD, Aranha C (ธันวาคม 2004). "เปปไทด์ต้านจุลชีพ: สมมติฐานและคำมั่นสัญญา" วารสารนานาชาติว่าด้วยสารต้านจุลชีพ . 24 (6): 536–547. doi :10.1016/j.ijantimicag.2004.09.005. PMID  15555874
  3. ^ โดย Yeaman MR, Yount NY (มีนาคม 2003) "กลไกของการทำงานและการดื้อยาของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์" Pharmacological Reviews . 55 (1): 27–55. doi :10.1124/pr.55.1.2. PMID  12615953. S2CID  6731487
  4. ^ Papagianni M (กันยายน 2003). "เปปไทด์ที่สังเคราะห์ด้วยไรโบโซมที่มีคุณสมบัติต้านจุลินทรีย์: การสังเคราะห์ทางชีวภาพ โครงสร้าง ฟังก์ชัน และการใช้งาน" Biotechnology Advances . 21 (6): 465–499. doi :10.1016/S0734-9750(03)00077-6. PMID  14499150
  5. ^ Sitaram N, Nagaraj R (2002). "เปปไทด์ต้านจุลชีพป้องกันโฮสต์: ความสำคัญของโครงสร้างสำหรับกิจกรรม" Current Pharmaceutical Design . 8 (9): 727–742. doi :10.2174/1381612023395358. PMID  11945168
  6. ^ Dürr UH, Sudheendra US, Ramamoorthy A (กันยายน 2549). "LL-37 สมาชิกมนุษย์เพียงรายเดียวของตระกูล cathelicidin ของเปปไทด์ต้านจุลินทรีย์" Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes . 1758 (9): 1408–1425. doi : 10.1016/j.bbamem.2006.03.030 . PMID  16716248
  7. ^ Dhople V, Krukemeyer A, Ramamoorthy A (กันยายน 2549). "เบตาดีเฟนซิน-3 ของมนุษย์ ซึ่งเป็นเปปไทด์ต่อต้านแบคทีเรียที่มีหน้าที่ทางชีวภาพหลายประการ" Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes . 1758 (9): 1499–1512. doi :10.1016/j.bbamem.2006.07.007. PMID  16978580. S2CID  36461159
  8. ^ Hancock RE, Rozek A (มกราคม 2002). "บทบาทของเมมเบรนในกิจกรรมของเปปไทด์ประจุบวกต้านจุลินทรีย์" FEMS Microbiology Letters . 206 (2): 143–149. doi : 10.1111/j.1574-6968.2002.tb11000.x . PMID  11814654
  9. ^ Varkey J, Singh S, Nagaraj R (พฤศจิกายน 2549). "ฤทธิ์ต้านแบคทีเรียของเปปไทด์เชิงเส้นที่ครอบคลุมโดเมนเบตาชีตปลายคาร์บอกซีของดีเฟนซินในสัตว์ขาปล้อง" Peptides . 27 (11): 2614–2623. doi :10.1016/j.peptides.2006.06.010. PMID  16914230. S2CID  21104756.
  10. ^ โดย Nguyen LT, Haney EF, Vogel HJ (กันยายน 2011). "ขอบเขตที่ขยายตัวของโครงสร้างเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์และรูปแบบการออกฤทธิ์" Trends in Biotechnology . 29 (9): 464–472. doi :10.1016/j.tibtech.2011.05.001. PMID  21680034
  11. ^ โดย O'Driscoll NH, Labovitiadi O, Cushnie TP, Matthews KH, Mercer DK, Lamb AJ (มีนาคม 2013). "การผลิตและการประเมินสูตรเวเฟอร์ที่ประกอบด้วยเปปไทด์ต้านจุลชีพสำหรับการใช้เฉพาะที่" Current Microbiology . 66 (3): 271–278. doi :10.1007/s00284-012-0268-3. PMID  23183933. S2CID  18671683.
  12. ^ Hein KZ, Takahashi H, Tsumori T, Yasui Y, Nanjoh Y, Toga T, et al. (ตุลาคม 2015). "Disulphide-reduced psoriasin is a human apoptosis-inducing broad-spectrum fungicide". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 112 (42): 13039–13044. Bibcode :2015PNAS..11213039H. doi : 10.1073/pnas.1511197112 . PMC 4620902 . PMID  26438863. 
  13. ^ abc Brogden KA (มีนาคม 2548). "เปปไทด์ต้านจุลินทรีย์: ตัวสร้างรูพรุนหรือสารยับยั้งการเผาผลาญในแบคทีเรีย?" Nature Reviews. Microbiology . 3 (3): 238–250. doi :10.1038/nrmicro1098. PMID  15703760. S2CID  23625167.
  14. ^ Hirst DJ, Lee TH, Swann MJ, Unabia S, Park Y, Hahm KS, Aguilar MI (เมษายน 2011). "ผลของโครงสร้างโซ่อะซิลและสถานะเฟสของไบเลเยอร์ต่อการจับและการแทรกซึมของไบเลเยอร์ลิพิดที่รองรับโดย HPA3" European Biophysics Journal . 40 (4): 503–514. doi :10.1007/s00249-010-0664-1. PMID  21222117. S2CID  22514308.
  15. ^ Lee TH, Heng C, Swann MJ, Gehman JD, Separovic F, Aguilar MI (ตุลาคม 2010). "การวิเคราะห์เชิงปริมาณแบบเรียลไทม์ของความผิดปกติของไขมันโดย aurein 1.2 ในระหว่างการดูดซับของเยื่อหุ้มเซลล์ การทำให้ไม่เสถียร และการแตกสลาย" Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes . 1798 (10): 1977–1986. doi : 10.1016/j.bbamem.2010.06.023 . PMID  20599687.
  16. ^ Turnidge JD, Bell JM (1996). "การทดสอบความไวของสารต้านจุลชีพในสื่อของเหลว" ใน Lorian V (ed.) ยาปฏิชีวนะในเวชศาสตร์ห้องปฏิบัติการ (พิมพ์ครั้งที่ 4) บัลติมอร์, แมริแลนด์: วิลเลียมส์และวิลกินส์ หน้า 52–111 ISBN 978-0-683-05169-8. คณะกรรมการแห่งชาติด้านความปลอดภัยและมาตรฐานห้องปฏิบัติการ (NCLSS)
  17. ^ Wang CK, Shih LY, Chang KY (พฤศจิกายน 2017). "การวิเคราะห์กิจกรรมต้านจุลชีพในขนาดใหญ่ที่สัมพันธ์กับแอมฟิพาทิซิตี้และประจุเผยให้เห็นลักษณะเฉพาะใหม่ของเปปไทด์ต้านจุลชีพ" โมเลกุล . 22 (11): 2037 doi : 10.3390/molecules22112037 . PMC 6150348 . PMID  29165350 
  18. ^ Hunter HN, Fulton DB, Ganz T, Vogel HJ (ตุลาคม 2002). "โครงสร้างสารละลายของเฮปซิดินในมนุษย์ ซึ่งเป็นฮอร์โมนเปปไทด์ที่มีฤทธิ์ต้านจุลินทรีย์ซึ่งเกี่ยวข้องกับการดูดซึมธาตุเหล็กและโรคฮีโมโครมาโทซิสที่ถ่ายทอดทางพันธุกรรม" The Journal of Biological Chemistry . 277 (40): 37597–37603. doi : 10.1074/jbc.M205305200 . PMID  12138110
  19. ^ Kudrimoti M, Curtis A, Azawi S, Worden F, Katz S, Adkins D, et al. (ธันวาคม 2016). "Dusquetide: ตัวควบคุมการป้องกันโดยกำเนิดแบบใหม่ที่แสดงให้เห็นถึงการลดลงอย่างมีนัยสำคัญและสม่ำเสมอในระยะเวลาของภาวะเยื่อบุช่องปากอักเสบในข้อมูลก่อนทางคลินิกและการศึกษาทางคลินิกแบบสุ่มที่มีกลุ่มควบคุมด้วยยาหลอกในเฟส 2a" Journal of Biotechnology . 239 : 115–125. doi : 10.1016/j.jbiotec.2016.10.010 . PMID  27746305
  20. ^ โดย Guilhelmelli F, Vilela N, Albuquerque P, Derengowski L, Silva-Pereira I, Kyaw CM (ธันวาคม 2013). "ความท้าทายในการพัฒนายาปฏิชีวนะ: กลไกต่างๆ ของการออกฤทธิ์ของเปปไทด์ต้านจุลชีพและการดื้อยาของแบคทีเรีย" Frontiers in Microbiology . 4 (4): 353. doi : 10.3389/fmicb.2013.00353 . PMC 3856679 . PMID  24367355 
  21. ^ Sengupta D, Leontiadou H, Mark AE, Marrink SJ (2008-10-01). "รูพรุนรูปวงแหวนที่เกิดจากเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์แสดงความผิดปกติอย่างมีนัยสำคัญ" Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes . 1778 (10): 2308–2317. doi : 10.1016/j.bbamem.2008.06.007 . ISSN  0005-2736. PMID  18602889. S2CID  19387026.
  22. ^ Balatti GE, Martini MF, Pickholz M (17 กรกฎาคม 2018). "แนวทางแบบหยาบในการศึกษาปฏิสัมพันธ์ของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ aurein 1.2 และ maculatin 1.1 กับส่วนผสมของไขมัน POPG/POPE" Journal of Molecular Modeling . 24 (8): 208. doi :10.1007/s00894-018-3747-z. ISSN  0948-5023. PMID  30019106. S2CID  51678964
  23. ^ Hallock KJ, Lee DK, Ramamoorthy A (พฤษภาคม 2003). "MSI-78, an analogue of the magainin antimicrobial peptides, disrupts lipid bilayer structure via positive curvature strain". Biophysical Journal . 84 (5): 3052–3060. Bibcode :2003BpJ....84.3052H. doi : 10.1016/S0006-3495(03)70031-9 . PMC 1302867 . PMID  12719236. 
  24. ^ Henzler Wildman KA, Lee DK, Ramamoorthy A (มิถุนายน 2003). "กลไกการหยุดชะงักของชั้นไขมันสองชั้นโดยเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ของมนุษย์ LL-37" Biochemistry . 42 (21): 6545–6558. doi :10.1021/bi0273563. PMID  12767238
  25. ^ Järvå M, Lay FT, Phan TK, Humble C, Poon IK, Bleackley MR, et al. (พฤษภาคม 2018). "โครงสร้าง X-ray ของคอมเพล็กซ์การทำลายเยื่อหุ้มเซลล์แบบ defensin-phospholipid ที่มีฤทธิ์ต้านจุลชีพคล้ายพรม" Nature Communications . 9 (1): 1962. Bibcode :2018NatCo...9.1962J. doi : 10.1038/s41467-018-04434-y . PMC 5958116 . PMID  29773800 
  26. ^ Poon IK, Baxter AA, Lay FT, Mills GD, Adda CG, Payne JA และคณะ (เมษายน 2014). "การเกิดโอลิโกเมอร์ของดีเฟนซินที่เกิดจากฟอสโฟอิโนซิไทด์ทำให้เกิดการแตกของเซลล์" eLife . 3 : e01808. doi : 10.7554/elife.01808 . PMC 3968744 . PMID  24692446 
  27. ↑ จาร์โว เอ็ม, ฟาน ทีเค, เลย์ เอฟที, คาเรีย เอส, ควานสกุล เอ็ม, ฮิวเลตต์ เอ็มดี (กรกฎาคม 2018) "มนุษย์ β-defensin 2 ฆ่า Candida albicans ผ่านทาง phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate-mediatedเมมเบรนซึมผ่าน" ความก้าวหน้าทางวิทยาศาสตร์ . 4 (7): eaat0979. Bibcode :2018SciA....4..979J. ดอย : 10.1126/sciadv.aat0979 . PMC 6059731 . PMID  30050988. 
  28. ^ Balatti GE, Ambroggio EE, Fidelio GD, Martini MF, Pickholz M (ตุลาคม 2017). "ปฏิสัมพันธ์ที่แตกต่างกันของเปปไทด์ต้านจุลชีพกับโครงสร้างไขมันที่ศึกษาโดยการจำลองพลวัตโมเลกุลแบบเนื้อหยาบ" โมเลกุล . 22 (10): 1775 doi : 10.3390/molecules22101775 . PMC 6151434 . PMID  29053635 
  29. ^ Gomes B, Augusto MT, Felício MR, Hollmann A, Franco OL, Gonçalves S, Santos NC (9 มกราคม 2018). "การออกแบบเปปไทด์ที่ใช้งานได้ดีขึ้นสำหรับแนวทางการบำบัดต่อต้านโรคติดเชื้อ" Biotechnology Advances . 36 (2): 415–429. doi :10.1016/j.biotechadv.2018.01.004. hdl : 11336/98840 . PMID  29330093. S2CID  3873934.
  30. ^ Hanson MA, Lemaitre B (กุมภาพันธ์ 2020). "ข้อมูลเชิงลึกใหม่เกี่ยวกับการทำงานของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ของ Drosophila ในการป้องกันของโฮสต์และอื่น ๆ " Current Opinion in Immunology . 62 : 22–30. doi : 10.1016/j.coi.2019.11.008 . hdl : 10871/133705 . PMID  31835066
  31. ^ Mookherjee N, Anderson MA, Haagsman HP, Davidson DJ (พฤษภาคม 2020). "เปปไทด์ป้องกันโฮสต์ที่ต่อต้านจุลินทรีย์: ฟังก์ชันและศักยภาพทางคลินิก" (PDF) . Nature Reviews. Drug Discovery . 19 (5): 311–332. doi :10.1038/s41573-019-0058-8. hdl : 20.500.11820/1ec38809-e8f2-4684-8bbb-e908ecb5c66e . PMID  32107480. S2CID  211526624
  32. ^ ab Hoskin DW, Ramamoorthy A (กุมภาพันธ์ 2008). "การศึกษาเกี่ยวกับกิจกรรมต่อต้านมะเร็งของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์" Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes . 1778 (2): 357–375. doi :10.1016/j.bbamem.2007.11.008. PMC 2238813 . PMID  18078805. 
  33. ^ Parvy JP, Yu Y, Dostalova A, Kondo S, Kurjan A, Bulet P, et al. (กรกฎาคม 2019). "สารต้านจุลชีพเปปไทด์ defensin ทำงานร่วมกับปัจจัยการตายของเนื้องอกเพื่อขับเคลื่อนการตายของเซลล์เนื้องอกใน Drosophila" eLife . 8 . doi : 10.7554/eLife.45061 . PMC 6667213 . PMID  31358113 
  34. ^ Kalsy M, Tonk M, Hardt M, Dobrindt U, Zdybicka-Barabas A, Cytrynska M, et al. (กุมภาพันธ์ 2020). "The Insect Antimicrobial peptide cecropin A disrupts uropathogenic Escherichia coli biofilms". npj Biofilms and Microbiomes . 6 (1): 6. doi : 10.1038/s41522-020-0116-3 . PMC 7016129. PMID  32051417 . 
  35. ^ Hassan M, Kjos M, Nes IF, Diep DB, Lotfipour F (ตุลาคม 2012). "เปปไทด์ต้านจุลินทรีย์จากธรรมชาติจากแบคทีเรีย: ลักษณะเฉพาะและการประยุกต์ใช้ที่เป็นไปได้เพื่อต่อสู้กับการดื้อยา" Journal of Applied Microbiology . 113 (4): 723–736. doi :10.1111/j.1365-2672.2012.05338.x. PMID  22583565. S2CID  19503463
  36. ^ Kumaresan V, Bhatt P, Ganesh MR, Harikrishnan R, Arasu M, Al-Dhabi NA, et al. (ธันวาคม 2015). "เปปไทด์ต้านจุลชีพชนิดใหม่ที่ได้จากไลโซไซม์ชนิดปลาห่านทำลายเยื่อหุ้มของ Salmonella enterica" ​​Molecular Immunology . 68 (2 Pt B): 421–433. doi :10.1016/j.molimm.2015.10.001. PMID  26477736
  37. ^ Arasu A, Kumaresan V, Ganesh MR, Pasupuleti M, Arasu MV, Al-Dhabi NA, Arockiaraj J (มิถุนายน 2017). "กิจกรรมการฆ่าเชื้อแบคทีเรียของเปปไทด์ที่จับกับเยื่อหุ้มเซลล์ที่ได้จากกาแลกติน 4 ของปลาที่มีแท็กโอลิโกทริปโตเฟน" Developmental and Comparative Immunology . 71 : 37–48. doi :10.1016/j.dci.2017.01.019. PMID  28126555. S2CID  22374102.
  38. ^ Arockiaraj J, Chaurasia MK, Kumaresan V, Palanisamy R, Harikrishnan R, Pasupuleti M, Kasi M (เมษายน 2015). "Macrobrachium rosenbergii mannose binding lectin: synthesis of MrMBL-N20 ​​and MrMBL-C16 peptides and their antimicrobial characterization, bioinformatics and relative gene expression analysis". Fish & Shellfish Immunology . 43 (2): 364–374. doi :10.1016/j.fsi.2014.12.036. PMID  25575476.
  39. ^ Somasekhar M (24 เมษายน 2019). "ในนมของตัวกินมดหนามอาจเป็นทางเลือกแทนยาปฏิชีวนะ" . BusinessLine . เจนไน อินเดีย: Kasturi & Sons Ltd . สืบค้นเมื่อ 17 มกราคม 2021 .
  40. ^ "นมสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมที่วางไข่อาจช่วยสนับสนุนยาปฏิชีวนะชนิดใหม่" Deccan Herald . อินเดีย: The Printers Mysore. Press Trust of India 25 เมษายน 2019 . สืบค้นเมื่อ17 มกราคม 2021 .
  41. ^ ab Matsuzaki K (สิงหาคม 2009). "การควบคุมการคัดเลือกเซลล์ของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์" Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes (บทความวิจารณ์). 1788 (8): 1687–1692. doi :10.1016/j.bbamem.2008.09.013. PMID  18952049
  42. ^ Sawaki K, Mizukawa N, Yamaai T, Yoshimoto T, Nakano M, Sugahara T (2002). "ความเข้มข้นสูงของเบตา-ดีเฟนซิน-2 ในมะเร็งเซลล์สความัสช่องปาก" Anticancer Research . 22 (4): 2103–2107. PMID  12174890
  43. ^ Kida-Takaoka S, Yamaai T, Mizukawa N, Murakami J, Iida S (พฤศจิกายน 2014). "Surrounding cells affect the gene expression pattern of human beta-defensins in squamous cell carcinoma in vitro". Anticancer Research . 34 (11): 6443–6449. PMID  25368244 . สืบค้นเมื่อ7 กุมภาพันธ์ 2019 .
  44. ^ ab Hancock RE, Sahl HG (ธันวาคม 2549). "เปปไทด์ป้องกันจุลินทรีย์และป้องกันโฮสต์เป็นกลยุทธ์การบำบัดป้องกันการติดเชื้อรูปแบบใหม่" Nature Biotechnology (บทความวิจารณ์) 24 (12): 1551–1557. doi :10.1038/nbt1267. PMID  17160061. S2CID  22384207
  45. ^ Zhang L, Xie J (กันยายน 2023). "การสังเคราะห์ทางชีวภาพ โครงสร้าง และหน้าที่ทางชีวภาพของคอเลสเตอรอลกลูโคไซด์ในเชื้อ Helicobacter pylori: การทบทวน". Medicine (Baltimore) . 102 (36): e34911. doi :10.1097/MD.0000000000034911. PMC 10489377 . PMID  37682174. 
  46. ^ ab Zasloff M (มกราคม 2002). "เปปไทด์ต้านจุลชีพของสิ่งมีชีวิตหลายเซลล์" Nature (บทความวิจารณ์). 415 (6870): 389–395. Bibcode :2002Natur.415..389Z. doi :10.1038/415389a. PMID  11807545. S2CID  205028607.
  47. ^ ab Matsuzaki K, Sugishita K, Fujii N, Miyajima K (มีนาคม 1995). "พื้นฐานทางโมเลกุลสำหรับการเลือกเมมเบรนของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ magainin 2" Biochemistry . 34 (10): 3423–3429. doi :10.1021/bi00010a034. PMID  7533538
  48. ^ Chou HT, Kuo TY, Chiang JC, Pei MJ, Yang WT, Yu HC, et al. (สิงหาคม 2008). "การออกแบบและสังเคราะห์เปปไทด์ต้านจุลชีพที่มีประจุบวกพร้อมกิจกรรมและการคัดเลือกที่ดีขึ้นต่อ Vibrio spp". International Journal of Antimicrobial Agents . 32 (2): 130–138. doi :10.1016/j.ijantimicag.2008.04.003. PMID  18586467.
  49. ^ Tennessen JA (พฤศจิกายน 2548). "Molecular evolution of animal antimicrobial peptides: widespread moderate positive selection". Journal of Evolutionary Biology (บทความวิจารณ์). 18 (6): 1387–1394. doi : 10.1111/j.1420-9101.2005.00925.x . PMID  16313451.
  50. ↑ หยู แอล, กัว แอล, ติง เจแอล, โฮ บี, เฟิง เอสเอส, ป๊อปเพิลเวลล์ เจ และคณะ (กุมภาพันธ์ 2552). "ปฏิสัมพันธ์ของเปปไทด์ต้านจุลชีพเทียมกับเยื่อหุ้มไขมัน" Biochimica และ Biophysica Acta (BBA) - ชีวเมมเบรน . 1788 (2): 333–344. ดอย :10.1016/j.bbamem.2008.10.005. PMID19013127  .
  51. ^ Lee TH, Hall K, Mechler A, Martin L, Popplewell J, Ronan G, Aguilar MI (2009). "Molecular Imaging and Orientational Changes of Antimicrobial Peptides in Membranes". Peptides for Youth . Advances in Experimental Medicine and Biology. เล่มที่ 611. หน้า 313–315. Bibcode :2009peyo.book..313L. doi :10.1007/978-0-387-73657-0_140. ISBN 978-0-387-73656-3. หมายเลข PMID  19400207.
  52. ^ Zhu WL, Lan H, Park Y, Yang ST, Kim JI, Park IS และคณะ (ตุลาคม 2549). "ผลของการแทนที่โปร → เปปตอยด์ต่อการคัดเลือกเซลล์และกลไกการออกฤทธิ์ต้านเชื้อแบคทีเรียของเปปไทด์ต้านจุลชีพไตรเทรปติซิน-เอไมด์" Biochemistry . 45 (43): 13007–13017. doi :10.1021/bi060487+. PMID  17059217
  53. ^ Kulagina NV, Lassman ME, Ligler FS, Taitt CR (ตุลาคม 2548). "เปปไทด์ต้านจุลชีพสำหรับการตรวจจับแบคทีเรียในการทดสอบไบโอเซนเซอร์" Analytical Chemistry . 77 (19): 6504–6508. doi :10.1021/ac050639r. PMID  16194120
  54. ^ ab Peschel A, Otto M, Jack RW, Kalbacher H, Jung G, Götz F (มีนาคม 1999). "การทำให้ dlt operon ใน Staphylococcus aureus ไม่ทำงานช่วยให้ไวต่อดีเฟนซิน โปรตีกริน และเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์อื่นๆ" The Journal of Biological Chemistry . 274 (13): 8405–8410. doi : 10.1074/jbc.274.13.8405 . PMID  10085071.
  55. ^ Campos MA, Vargas MA, Regueiro V, Llompart CM, Albertí S, Bengoechea JA (ธันวาคม 2004). Weiser JN (ed.). "Capsule polysaccharide mediates bacteriophage resistance to antimicrobial peptides". Infection and Immunity . 72 (12): 7107–7114. doi :10.1128/IAI.72.12.7107-7114.2004. PMC 529140 . PMID  15557634. 
  56. ^ China B, N'Guyen BT, de Bruyere M, Cornelis GR (เมษายน 1994). "บทบาทของ YadA ในการต้านทาน Yersinia enterocolitica ต่อการฟาดกินโดยเม็ดเลือดขาวโพลีมอร์โฟนิวเคลียร์ของมนุษย์" Infection and Immunity . 62 (4): 1275–1281. doi :10.1128/IAI.62.4.1275-1281.1994. PMC 186269 . PMID  8132334. 
  57. ^ Shelton CL, Raffel FK, Beatty WL, Johnson SM, Mason KM (พฤศจิกายน 2554) "Sap transporter เป็นตัวกลางในการนำเข้าและการย่อยสลายของเปปไทด์ต้านจุลชีพใน Haemophilus" PLOS Pathogens . 7 (11): e1002360 doi : 10.1371/journal.ppat.1002360 . PMC 3207918 . PMID  22072973 
  58. ^ Nikaido H (ตุลาคม 1996). "ปั๊มขับยาหลายชนิดของแบคทีเรียแกรมลบ". Journal of Bacteriology . 178 (20): 5853–5859. doi :10.1128/jb.178.20.5853-5859.1996. PMC 178438 . PMID  8830678. 
  59. ^ Whitelock JM, Murdoch AD, Iozzo RV, Underwood PA (เมษายน 1996). "การสลายตัวของ perlecan ที่ได้จากเซลล์เยื่อบุผนังหลอดเลือดของมนุษย์และการปลดปล่อยปัจจัยการเจริญเติบโตของไฟโบรบลาสต์เบสิกที่ผูกไว้โดยสโตรเมไลซิน คอลลาจิเนส พลาสมิน และเฮพาราเนส" วารสารเคมีชีวภาพ . 271 (17): 10079–10086 doi : 10.1074/jbc.271.17.10079 . PMID  8626565
  60. ^ Kulkarni HM, Swamy C, Jagannadham MV (มีนาคม 2014). "ลักษณะโมเลกุลและการวิเคราะห์การทำงานของเวสิเคิลเยื่อหุ้มชั้นนอกจากแบคทีเรียแอนตาร์กติก Pseudomonas syringae ชี้ให้เห็นถึงการตอบสนองต่อสภาพแวดล้อมที่เป็นไปได้" Journal of Proteome Research . 13 (3): 1345–1358. doi :10.1021/pr4009223. PMID  24437924.
  61. ^ Chua SL, Tan SY, Rybtke MT, Chen Y, Rice SA, Kjelleberg S, et al. (พฤษภาคม 2013). "Bis-(3'-5')-cyclic dimeric GMP ควบคุมการต้านทานเปปไทด์ต้านจุลชีพใน Pseudomonas aeruginosa" Antimicrobial Agents and Chemotherapy . 57 (5): 2066–2075. doi :10.1128/AAC.02499-12. PMC 3632963 . PMID  23403434 
  62. ^ Habets MG, Brockhurst MA (มิถุนายน 2012). "เปปไทด์ต้านจุลชีพในการรักษาอาจทำให้ภูมิคุ้มกันตามธรรมชาติเสียหาย" Biology Letters . 8 (3): 416–418. doi :10.1098/rsbl.2011.1203. PMC 3367763 . PMID  22279153 
  63. ^ Bahar AA, Ren D (พฤศจิกายน 2013). "เปปไทด์ต้านจุลชีพ". Pharmaceuticals . 6 (12): 1543–1575. doi : 10.3390/ph6121543 . PMC 3873676 . PMID  24287494. 
  64. ^ Gumienna-Kontecka E, Carver PL (2019). "บทที่ 7. การสร้างม้าโทรจัน: ไซเดอโรฟอร์-ไดรัคคอนจูเกตสำหรับการรักษาโรคติดเชื้อ" ใน Sigel A, Freisinger E, Sigel RK, Carver PL (บรรณาธิการ). โลหะจำเป็นในทางการแพทย์: การใช้ในการรักษาและความเป็นพิษของไอออนโลหะในคลินิกเล่มที่ 19. เบอร์ลิน: de Gruyter GmbH. หน้า 181–202. doi :10.1515/9783110527872-013 ISBN 978-3-11-052691-2. PMID  30855108. S2CID  73727689. {{cite book}}: |journal=ไม่สนใจ ( ช่วยด้วย )
  65. ^ "เปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ของแมลง OPM". ฐานข้อมูลการวางแนวของโปรตีนในเมมเบรน (OPM )
  66. ↑ ไซมานอฟสกี้ เอฟ, บาลัทติ จีอี, อัมบร็อกจิโอ เอ, อูโก เอเอ, มาร์ตินี เอ็มเอฟ, ฟิเดลิโอ จีดี, และคณะ (มิถุนายน 2562). "กิจกรรมที่แตกต่างของเปปไทด์ lytic α-helical บนแลคโตบาซิลลัสและไลโปโซมที่ได้มาจากแลคโตบาซิลลัส" Biochimica และ Biophysica Acta (BBA) - ชีวเมมเบรน . 1861 (6): 1069–1077. ดอย : 10.1016/j.bbamem.2019.03.004 . PMID  30878358.
  67. ^ "เปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ในสัตว์สะเทินน้ำสะเทินบก" ฐานข้อมูลการวางแนวของโปรตีนในเมมเบรน (OPM )
  68. ^ Yang M, Zhang C, Zhang X, Zhang MZ, Rottinghaus GE, Zhang S (กันยายน 2016). "การวิเคราะห์โครงสร้าง-ฟังก์ชันของ β-defensin-6 และ β-defensin-12 ของนก: บทบาทของสะพานประจุและไดซัลไฟด์" BMC Microbiology . 16 (1): 210. doi : 10.1186/s12866-016-0828-y . PMC 5016922 . PMID  27613063 
  69. ^ Niedermaier H (9 กุมภาพันธ์ 2012). "สารเลียนแบบเปปไทด์ต้านจุลชีพ: ยาปฏิชีวนะชนิดใหม่". ภาควิชาเคมี . มหาวิทยาลัยจอร์เจีย. เก็บถาวรจากแหล่งเดิมเมื่อ 28 ตุลาคม 2016. สืบค้นเมื่อ 27 ตุลาคม 2016 .
  70. ^ Kohn EM, Shirley DJ, Arotsky L, Picciano AM, Ridgway Z, Urban MW และคณะ (กุมภาพันธ์ 2018). "บทบาทของโซ่ข้างประจุบวกในกิจกรรมต้านจุลชีพของ C18G". โมเลกุล . 23 (2): 329. doi : 10.3390/molecules23020329 . PMC 6017431 . PMID  29401708. 
  71. ↑ ชิน เจเอ็ม, กวัก เจดับบลิว, คามาราจัน พี, เฟนโน เจซี, ริกคาร์ด เอเอช, คาปิลา วายแอล (มิถุนายน 2559) "การประยุกต์ใช้ทางชีวการแพทย์ของนิซิน". วารสารจุลชีววิทยาประยุกต์ . 120 (6): 1449–1465. ดอย :10.1111/jam.13033. PMC 4866897 . PMID26678028  . 
  72. ^ Lee HT, Lee CC, Yang JR, Lai JZ, Chang KY (กุมภาพันธ์ 2015). "การจำแนกโครงสร้างขนาดใหญ่ของเปปไทด์ต้านจุลชีพ" BioMed Research International . 2015 : 475062. doi : 10.1155/2015/475062 . PMC 4426897 . PMID  26000295 
  73. ^ Waghu FH, Gopi L, Barai RS, Ramteke P, Nizami B, Idicula-Thomas S (มกราคม 2014). "CAMP: การรวบรวมลำดับและโครงสร้างของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์" Nucleic Acids Research . 42 (ปัญหาฐานข้อมูล): D1154–D1158 doi :10.1093/nar/gkt1157 PMC 3964954 . PMID  24265220 
  74. ^ Shi GB, Kang XY, Dong FY, Liu YC, Zhu N (มกราคม 2022). "DRAMP 3.0: ที่เก็บข้อมูลที่ครอบคลุมยิ่งขึ้นของเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์" Nucleic Acids Research . 50 (ปัญหาฐานข้อมูล): D488–D496 doi :10.1093/nar/gkab651 PMC 8728287 . PMID  34390348 
  75. ^ Jhong JH, Chi YH, Li WC, Lin TH, Huang KY, Lee TY (มกราคม 2019). "dbAMP: แหล่งข้อมูลบูรณาการเพื่อสำรวจเปปไทด์ต้านจุลชีพที่มีกิจกรรมการทำงานและคุณสมบัติทางฟิสิกเคมีบนข้อมูลทรานสคริปโทมและโปรตีโอม" Nucleic Acids Research . 47 (D1): D285–D297 doi :10.1093/nar/gky1030 PMC 6323920 . PMID  30380085 
  76. ^ Mooney C, Haslam NJ, Pollastri G, Shields DC (8 ตุลาคม 2012). "สู่การค้นพบและการออกแบบเปปไทด์เชิงฟังก์ชันที่ดีขึ้น: คุณสมบัติทั่วไปของคลาสที่หลากหลายช่วยให้ทำนายกิจกรรมทางชีวภาพได้ทั่วไป" PLOS ONE . ​​7 (10): e45012 Bibcode :2012PLoSO...745012M doi : 10.1371/journal.pone.0045012 . PMC 3466233 . PMID  23056189 
  77. ^ Mooney C, Haslam NJ, Holton TA, Pollastri G, Shields DC (พฤษภาคม 2013). "PeptideLocator: การคาดการณ์เปปไทด์ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพในลำดับโปรตีน" Bioinformatics . 29 (9): 1120–1126. doi : 10.1093/bioinformatics/btt103 . hdl : 10197/10121 . PMID  23505299
  78. ^ Müller AT, Gabernet G, Hiss JA, Schneider G (กันยายน 2017). "modlAMP: Python สำหรับเปปไทด์ต้านจุลินทรีย์" Bioinformatics . 33 (17): 2753–2755. doi : 10.1093/bioinformatics/btx285 . hdl : 20.500.11850/206770 . PMID  28472272
  79. ^ Agrawal P, Raghava GP (26 ตุลาคม 2018). "การทำนายศักยภาพต้านจุลชีพของเปปไทด์ที่ดัดแปลงทางเคมีจากโครงสร้างตติยภูมิ" Frontiers in Microbiology . 9 : 2551. doi : 10.3389/fmicb.2018.02551 . PMC 6212470 . PMID  30416494. 
  80. ^ Agrawal P, Bhalla S, Chaudhary K, Kumar R, Sharma M, Raghava GP (26 กุมภาพันธ์ 2018). "แนวทาง In Silico สำหรับการทำนายเปปไทด์ต้านเชื้อรา" Frontiers in Microbiology . 9 : 323. doi : 10.3389/fmicb.2018.00323 . PMC 5834480 . PMID  29535692 
  81. ^ Usmani SS, Bhalla S, Raghava GP (26 สิงหาคม 2018). "การทำนายเปปไทด์ต่อต้านวัณโรคจากข้อมูลลำดับโดยใช้ตัวจำแนกกลุ่มและคุณลักษณะไฮบริด" Frontiers in Pharmacology . 9 : 954. doi : 10.3389/fphar.2018.00954 . PMC 6121089 . PMID  30210341 
  • ADAM (ฐานข้อมูลเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์) เก็บถาวรเมื่อวันที่ 17 มิถุนายน 2015 ที่เวย์แบ็กแมชชีนที่ ntou.edu.tw
  • การทำนาย AntiFP ของเปปไทด์ต่อต้านเชื้อรา
  • การคาดการณ์ศักยภาพต้านจุลินทรีย์ของเปปไทด์ที่ดัดแปลงของ AntiMPmod
  • เปปไทด์ต้านจุลชีพ+ประจุบวก+ที่ หัวเรื่องทางการแพทย์ของหอสมุดการแพทย์แห่งชาติสหรัฐอเมริกา(MeSH)
  • การทำนาย AntiTbPred ของเปปไทด์ต่อต้านวัณโรค
  • ฐานข้อมูลเปปไทด์ต้านจุลชีพเก็บถาวรเมื่อวันที่ 20 กรกฎาคม 2011 ที่เวย์แบ็กแมชชีนของศูนย์การแพทย์มหาวิทยาลัยเนแบรสกา
  • เซิร์ฟเวอร์ทำนาย AMP บนพื้นฐานการเรียนรู้เชิงลึกของ Antimicrobial Peptide Scanner
  • ฐานข้อมูลเปปไทด์ต่อต้านวัณโรค AntiTbPdb
  • BioPD ที่ศูนย์วิทยาศาสตร์สุขภาพมหาวิทยาลัยปักกิ่ง
  • ค่าย: การรวบรวมเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ที่สถาบันวิจัยสุขภาพสืบพันธุ์แห่งชาติ (NIRRH)
  • DBAASP - ฐานข้อมูลกิจกรรมต้านจุลินทรีย์และโครงสร้างของเปปไทด์
  • LAMP ที่มหาวิทยาลัยฟู่ตัน
  • PeptideLocator การทำนายเปปไทด์ที่มีฟังก์ชัน รวมถึงเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ในลำดับโปรตีน
  • PeptideRanker เปปไทด์ชีวภาพ รวมถึงเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ การคาดการณ์
  • แพ็คเกจ Python ของ modlAMP สำหรับงานคำนวณด้วยเปปไทด์ต่อต้านจุลินทรีย์ รวมถึงการจัดการลำดับ การออกแบบ การทำนาย การคำนวณตัวอธิบาย และการพล็อต
ดึงข้อมูลจาก "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=เปปไทด์ต้านจุลชีพ&oldid=1248178601"