니트로스피로타
Nitrospirota니트로스피로타 | |
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과학적 분류 | |
도메인: | 박테리아 |
문: | 니트로스피로타 Garrity & Holt 2021[1] |
클래스 및 순서 | |
동의어 | |
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니트로스피로타는 박테리아 문이다.가장 큰 니트로스피라속과 같은 여러 속들을 포함하고 있다.이 문([2]문)의 첫 번째 구성원인 니트로스피라 마리나는 1985년에 발견되었다.두 번째 멤버인 Nitrospira moscoviensis는 [3][4]1995년에 발견되었다.
니트로스피로타는 2015년 발견돼 2017년 [8]배양된[6][7] 아질산염을 질산염으로 산화시키는 질화 분류군과 코마목스균[5] 니트로스피라 이노피나타를 함유하고 있다.
계통발생학
16S rRNA 기반 LTP 릴리즈 132 (모든 종류의 살아있는 나무[9] 프로젝트) | GTDB 05-RS95(Genome Taxonomy Database)[12][13]를 사용하는 Annotree v1.2[10][11].0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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분류법
현재 승인된 분류법은 원핵생물명목록(LSPN)[14]과 국립생명공학정보센터(NCBI)[4]에 기초하고 있다.
- 니트로스피로타문 가리티 & 홀트 2021
- "CandidatusTrogloea"속. Kostanjsek 외 2013년
- 종 "Ca"T. absolutonii" crig. Kostanjsek 외 2013년
- 클래스 "렙토스피릴리아"
- 렙토스피랄레스 주문
- 렙토스피렐라과 카발리에스미스 2020
- 렙토스피럼마르코시안 1972 ex 히페 2000
- 타이슨 외 2005년 종 "L. ferrodiazotrophum"
- 종 L. 철갑상어 코람&롤링스 2002
- 종 L. 페록시단스 마르코시안 1972 ex 히페 2000
- "L. rubarum" Aliaga Goltsman et al. 2009년
- 히페 2000년 서모페록시단스
- 렙토스피럼마르코시안 1972 ex 히페 2000
- 렙토스피렐라과 카발리에스미스 2020
- 렙토스피랄레스 주문
- 클래스 니트로스피리아 오렌 외 2015
- 'Candidatus Manganitrophus'속 Yu & Leadbetter
- 종 "Ca. M. noduliformans" Yu & Leadbetter 2020
- Nitrospirales Garrity & Holt 2001 주문
- Nitrospiraceae과 Garrity & Holt 2001
- 니트로스피라왓슨속 외 1986년
- 종 "Ca. N. al. 알칼리톨레란스" 대벨러 외 2020
- 종 "Ca. N. Bockiana" 레베데바 외 2008년
- 종 'Ca. N. inopinata' 다임스 외 2015년
- 종 "Ca. N. creftii" Sakoula et al. 2021
- 종 "Ca. N. nitrificans" van Kessel et al. 2015
- 종 "Ca. N. nitrosa" van Kessel et al. 2015
- 종 "Ca. N. salsa" Haijer et al. 2013
- 종 N. 칼리다 레베데바 외 2011
- N. defluvii Nowka 등 2015년
- 종 N. 자포니카 우시키 외 2013
- 종 N. 렌타 나우카 외 2015
- 종 N. 마리나 왓슨 외 1986 (타입 sp)
- N. moscoviensis Ehrich 등 1995년
- 니트로스피라왓슨속 외 1986년
- Nitrospiraceae과 Garrity & Holt 2001
- 'Candidatus Manganitrophus'속 Yu & Leadbetter
- 클래스 서모데술포브리오니아우메자와 외 2021년
- 'Thermodesulfovibrioles' 우메자와 외 2021년 주문
- 쐐기풀속 (Candidatus Sulfobium)제킨 외 2018년
- 종 "Ca. S. mesophilum" 제킨 외 2018
- 우메자와 등 2021년 과
- 우메자와 외 2021년산 쯔루후리스피라속
- 종 'D. thermophila' 우메자와 외 2021년
- 우메자와 외 2021년산 쯔루후리스피라속
- 마그네토박테리아과
- "CandidatusMagnetobacterium" 봄 외 1993년
- 종 "Ca. M. bavaricum" Spring et al. 1993
- 종 "Ca. M. casensis" 린 외 2014
- "CandidatusMagnetoovum" Lefevre et al. 2011
- 종 "Ca. M. mohavensis" Lefevre et al. 2011
- 종 "Ca. M. chiemensis" 코린코 2014
- "CandidatusMagnetobacterium" 봄 외 1993년
- 테르모데술포비브리오나과 우메자와 외 2021년
- 쐐기풀속 (Candidatus Sulfobium)제킨 외 2018년
- 'Thermodesulfovibrioles' 우메자와 외 2021년 주문
- "CandidatusTrogloea"속. Kostanjsek 외 2013년
「 」를 참조해 주세요.
레퍼런스
- ^ Oren A, Garrity GM (2021). "Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes". Int J Syst Evol Microbiol. 71 (10): 5056. doi:10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987.
- ^ Watson SW, Bock E, Valois FW, Waterbury JB, Schlosser U (1986). "Nitrospira marina gen. nov. sp. nov.: a chemolithotrophic nitrite-oxidizing bacterium". Arch Microbiol. 144 (1): 1–7. doi:10.1007/BF00454947. S2CID 29796511.
- ^ Ehrich S, Behrens D, Lebedeva E, Ludwig W, Bock E (July 1995). "A new obligately chemolithoautotrophic, nitrite-oxidizing bacterium, Nitrospira moscoviensis sp. nov. and its phylogenetic relationship". Archives of Microbiology. 164 (1): 16–23. doi:10.1007/BF02568729. PMID 7646315. S2CID 2702110.
- ^ a b Sayers. "Nitrospirae". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2016-03-20.
- ^ Daims H, Nielsen JL, Nielsen PH, Schleifer KH, Wagner M (November 2001). "In situ characterization of Nitrospira-like nitrite-oxidizing bacteria active in wastewater treatment plants". Applied and Environmental Microbiology. 67 (11): 5273–84. doi:10.1128/AEM.67.11.5273-5284.2001. PMC 93301. PMID 11679356.
- ^ Daims H, Lebedeva EV, Pjevac P, Han P, Herbold C, Albertsen M, et al. (December 2015). "Complete nitrification by Nitrospira bacteria". Nature. 528 (7583): 504–9. Bibcode:2015Natur.528..504D. doi:10.1038/nature16461. PMC 5152751. PMID 26610024.
- ^ van Kessel MA, Speth DR, Albertsen M, Nielsen PH, Op den Camp HJ, Kartal B, et al. (December 2015). "Complete nitrification by a single microorganism". Nature. 528 (7583): 555–9. Bibcode:2015Natur.528..555V. doi:10.1038/nature16459. PMC 4878690. PMID 26610025.
- ^ Kits KD, Sedlacek CJ, Lebedeva EV, Han P, Bulaev A, Pjevac P, et al. (September 2017). "Kinetic analysis of a complete nitrifier reveals an oligotrophic lifestyle". Nature. 549 (7671): 269–272. Bibcode:2017Natur.549..269K. doi:10.1038/nature23679. PMC 5600814. PMID 28847001.
- ^ 모든 종류의 살아있는 나무 프로젝트."16S rRNA-based LTP release 132". Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Retrieved 2015-08-20.
- ^ "AnnoTree v1.2.0". AnnoTree.
- ^ Mendler, K; Chen, H; Parks, DH; Hug, LA; Doxey, AC (2019). "AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life". Nucleic Acids Research. 47 (9): 4442–4448. doi:10.1093/nar/gkz246. PMC 6511854. PMID 31081040.
- ^ "GTDB release 05-RS95". Genome Taxonomy Database.
- ^ Parks, DH; Chuvochina, M; Chaumeil, PA; Rinke, C; Mussig, AJ; Hugenholtz, P (September 2020). "A complete domain-to-species taxonomy for Bacteria and Archaea". Nature Biotechnology. 38 (9): 1079–1086. bioRxiv 10.1101/771964. doi:10.1038/s41587-020-0501-8. PMID 32341564. S2CID 216560589.
- ^ Euzéby JP. ""Nitrospirae"". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2016-03-20.
추가 정보
- Lefèvre CT, Frankel RB, Abreu F, Lins U, Bazylinski DA (February 2011). "Culture-independent characterization of a novel, uncultivated magnetotactic member of the Nitrospirae phylum". Environmental Microbiology. 13 (2): 538–49. doi:10.1111/j.1462-2920.2010.02361.x. PMID 20977572.
외부 링크