열단백질
Thermoproteota열단백질 | |
---|---|
특정 바이러스 STSV-1에 감염된 고세균 Sulfolobus. | |
과학적 분류 | |
도메인: | 고세균 |
Clade: | TACK 그룹 |
문: | 열단백질 Garrity & Holt 2021[1] |
학급 | |
| |
동의어 | |
|
테르모프로테오타(Thermoproteota, 일명 크레나르카이아)는 고고학 영역의 [2][3][4]문으로 분류된 고고학이다.처음에, Thermoproteota는 유황 의존성 극친성 동물로 생각되었지만, 최근의 연구는 이 유기체가 해양 [5]환경에서 가장 풍부한 고고학일 수 있다는 것을 나타내는 특징적인 Thermoproteota 환경 rRNA를 확인했습니다.원래, 그것들은 rRNA 염기서열에 근거해 다른 고세균과 분리되었다; 비록 일부 쇄골류가 [6]히스톤을 가지고 있는 것으로 밝혀졌지만, 히스톤의 부족과 같은 다른 생리학적 특징들은 이러한 분열을 뒷받침해 왔다.최근까지 배양된 모든 Thermoproteota는 호열성 또는 고열성 유기체였으며, 일부는 최대 113°[7]C까지 자랄 수 있는 능력을 가지고 있었다.이 유기체들은 그램을 음성으로 염색하고 형태학적으로 다양하며 막대,[8] 구균, 필라멘트, 그리고 기묘한 모양의 세포를 가지고 있다.
술폴로부스속
Crenarcheota의 가장 특징적인 구성원 중 하나는 Sulfolobus solfataricus이다.이 유기체는 원래 이탈리아의 지열 가열된 황산샘에서 분리되었으며 80°C, pH 2-4에서 [9]자란다.온열성 및 고고학 연구의 선구자인 울프람 질릭에 의해 처음 특징지어진 이후, 전 세계에서 같은 속에 속하는 유사한 종들이 발견되었다.대부분의 배양된 온열 동물들과 달리, 술폴로부스는 곡예 및 화학 유기영양학적으로 자랍니다.이러한 요소들은 혐기성 유기체보다 실험실 환경에서 훨씬 더 쉽게 성장할 수 있게 해주며, Sulfolobus는 온열성 유기체와 그 안에서 복제되는 다양한 바이러스의 큰 그룹을 연구하는 모범 유기체가 되었다.
해양종
1992년부터, [10],[11]해양 환경에서 Thermoproteota에 속하는 유전자의 염기서열을 보고한 데이터가 발표되었습니다.이후 외양에서 채취한 테르모프로테오타 막의 풍부한 지질 분석을 통해 이들 '저온 크레나르카이아'의 농도를 측정했다(TEX-86 참조).그들의 특징적인 지질들의 측정치에 기초하여, Thermoproteota는 매우 풍부하다고 생각되고 탄소 [citation needed]고정의 주요 요인들 중 하나이다. Thermoproteota의 DNA 배열은 또한 토양과 담수 환경에서 발견되었고, 이것은 이 문군이 대부분의 [12]환경에서 유비쿼터스하다는 것을 암시한다.
2005년, 최초의 배양된 "저온 크레나르카이아"의 증거가 발표되었다.Nitrosopumilus maritimus라는 이름의 이것은 해양 수족관에서 격리되어 28 °C에서 자라는 암모니아를 산화시키는 생물이다.[13]
「 」를 참조해 주세요.
레퍼런스
- ^ Oren A, Garrity GM (2021). "Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes". Int J Syst Evol Microbiol. 71 (10): 5056. doi:10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987. S2CID 239887308.
- ^ Crenarchaeota의 NCBI 웹 페이지를 참조하십시오.
- ^ C. 마이클 호건, 2010년고고학, 에드 E. Monosson & C.클리블랜드, '지구 백과사전' 워싱턴 D.C.의 과학 및 환경 국가 위원회입니다.
- ^ 에서 추출된 데이터
- ^ Madigan M; Martinko J, eds. (2005). Brock Biology of Microorganisms (11th ed.). Prentice Hall. ISBN 978-0-13-144329-7.
- ^ Cubonova L, Sandman K, Hallam SJ, Delong EF, Reeve JN (2005). "Histones in Crenarchaea". Journal of Bacteriology. 187 (15): 5482–5485. doi:10.1128/JB.187.15.5482-5485.2005. PMC 1196040. PMID 16030242.
- ^ Blochl E, Rachel R, Burggraf S, Hafenbradl D, Jannasch HW, Stetter KO (1997). "Pyrolobus fumarii, gen. and sp. nov., represents a novel group of archaea, extending the upper temperature limit for life to 113 °C". Extremophiles. 1 (1): 14–21. doi:10.1007/s007920050010. PMID 9680332. S2CID 29789667.
- ^ Garrity GM, Boone DR, eds. (2001). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the Deeply Branching and Phototrophic Bacteria (2nd ed.). Springer. ISBN 978-0-387-98771-2.
- ^ Zillig W, Stetter KO, Wunderl S, Schulz W, Priess H, Scholz I (1980). "The Sulfolobus-"Caldariellard" group: Taxonomy on the basis of the structure of DNA-dependent RNA polymerases". Arch. Microbiol. 125 (3): 259–269. doi:10.1007/BF00446886. S2CID 5805400.
- ^ Fuhrman JA, McCallum K, Davis AA (1992). "Novel major archaebacterial group from marine plankton". Nature. 356 (6365): 148–9. Bibcode:1992Natur.356..148F. doi:10.1038/356148a0. PMID 1545865. S2CID 4342208.
- ^ DeLong EF (1992). "Archaea in coastal marine environments". Proc Natl Acad Sci USA. 89 (12): 5685–9. Bibcode:1992PNAS...89.5685D. doi:10.1073/pnas.89.12.5685. PMC 49357. PMID 1608980.
- ^ Barns SM, Delwiche CF, Palmer JD, Pace NR (1996). "Perspectives on archaeal diversity, thermophily and monophyly from environmental rRNA sequences". Proc Natl Acad Sci USA. 93 (17): 9188–93. Bibcode:1996PNAS...93.9188B. doi:10.1073/pnas.93.17.9188. PMC 38617. PMID 8799176.
- ^ Könneke M, Bernhard AE, de la Torre JR, Walker CB, Waterbury JB, Stahl DA (2005). "Isolation of an autotrophic ammonia-oxidizing marine archaeon". Nature. 437 (7058): 543–6. Bibcode:2005Natur.437..543K. doi:10.1038/nature03911. PMID 16177789. S2CID 4340386.
추가 정보
과학 저널
- Cavalier-Smith, T (2002). "The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 1): 7–76. doi:10.1099/00207713-52-1-7. PMID 11837318.
- Stackebrandt, E; Frederiksen W; Garrity GM; Grimont PA; Kampfer P; Maiden MC; Nesme X; Rossello-Mora R; Swings J; Truper HG; Vauterin L; Ward AC; Whitman WB (2002). "Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 3): 1043–1047. doi:10.1099/ijs.0.02360-0. PMID 12054223.
- Gurtler, V; Mayall BC (2001). "Genomic approaches to typing, taxonomy and evolution of bacterial isolates". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 1): 3–16. doi:10.1099/00207713-51-1-3. PMID 11211268.
- Dalevi, D; Hugenholtz P; Blackall LL (2001). "A multiple-outgroup approach to resolving division-level phylogenetic relationships using 16S rDNA data". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 2): 385–391. doi:10.1099/00207713-51-2-385. PMID 11321083.
- Keswani, J; Whitman WB (2001). "Relationship of 16S rRNA sequence similarity to DNA hybridization in prokaryotes". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 2): 667–678. doi:10.1099/00207713-51-2-667. PMID 11321113.
- Young, JM (2001). "Implications of alternative classifications and horizontal gene transfer for bacterial taxonomy". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 3): 945–953. doi:10.1099/00207713-51-3-945. PMID 11411719.
- Christensen, H; Bisgaard M; Frederiksen W; Mutters R; Kuhnert P; Olsen JE (2001). "Is characterization of a single isolate sufficient for valid publication of a new genus or species? Proposal to modify recommendation 30b of the Bacteriological Code (1990 Revision)". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 6): 2221–2225. doi:10.1099/00207713-51-6-2221. PMID 11760965.
- Christensen, H; Angen O; Mutters R; Olsen JE; Bisgaard M (2000). "DNA-DNA hybridization determined in micro-wells using covalent attachment of DNA". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 (3): 1095–1102. doi:10.1099/00207713-50-3-1095. PMID 10843050.
- Xu, HX; Kawamura Y; Li N; Zhao L; Li TM; Li ZY; Shu S; Ezaki T (2000). "A rapid method for determining the G+C content of bacterial chromosomes by monitoring fluorescence intensity during DNA denaturation in a capillary tube". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 (4): 1463–1469. doi:10.1099/00207713-50-4-1463. PMID 10939651.
- Young, JM (2000). "Suggestions for avoiding on-going confusion from the Bacteriological Code". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 (4): 1687–1689. doi:10.1099/00207713-50-4-1687. PMID 10939677.
- Hansmann, S; Martin W (2000). "Phylogeny of 33 ribosomal and six other proteins encoded in an ancient gene cluster that is conserved across prokaryotic genomes: influence of excluding poorly alignable sites from analysis". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 (4): 1655–1663. doi:10.1099/00207713-50-4-1655. PMID 10939673.
- Tindall, BJ (1999). "Proposal to change the Rule governing the designation of type strains deposited under culture collection numbers allocated for patent purposes". Int. J. Syst. Bacteriol. 49 (3): 1317–1319. doi:10.1099/00207713-49-3-1317. PMID 10490293.
- Tindall, BJ (1999). "Proposal to change Rule 18a, Rule 18f and Rule 30 to limit the retroactive consequences of changes accepted by the ICSB". Int. J. Syst. Bacteriol. 49 (3): 1321–1322. doi:10.1099/00207713-49-3-1321. PMID 10425797.
- Tindall, BJ (1999). "Misunderstanding the Bacteriological Code". Int. J. Syst. Bacteriol. 49 (3): 1313–1316. doi:10.1099/00207713-49-3-1313. PMID 10425796.
- Tindall, BJ (1999). "Proposals to update and make changes to the Bacteriological Code". Int. J. Syst. Bacteriol. 49 (3): 1309–1312. doi:10.1099/00207713-49-3-1309. PMID 10425795.
- Burggraf, S; Huber H; Stetter KO (1997). "Reclassification of the crenarchael orders and families in accordance with 16S rRNA sequence data". Int. J. Syst. Bacteriol. 47 (3): 657–660. doi:10.1099/00207713-47-3-657. PMID 9226896.
- Palys, T; Nakamura LK; Cohan FM (1997). "Discovery and classification of ecological diversity in the bacterial world: the role of DNA sequence data". Int. J. Syst. Bacteriol. 47 (4): 1145–1156. doi:10.1099/00207713-47-4-1145. PMID 9336922.
- Euzeby, JP (1997). "List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature: a folder available on the Internet". Int. J. Syst. Bacteriol. 47 (2): 590–592. doi:10.1099/00207713-47-2-590. PMID 9103655.
- Clayton, RA; Sutton G; Hinkle PS Jr; Bult C; Fields C (1995). "Intraspecific variation in small-subunit rRNA sequences in GenBank: why single sequences may not adequately represent prokaryotic taxa". Int. J. Syst. Bacteriol. 45 (3): 595–599. doi:10.1099/00207713-45-3-595. PMID 8590690.
- Murray, RG; Schleifer KH (1994). "Taxonomic notes: a proposal for recording the properties of putative taxa of procaryotes". Int. J. Syst. Bacteriol. 44 (1): 174–176. doi:10.1099/00207713-44-1-174. PMID 8123559.
- Winker, S; Woese CR (1991). "A definition of the domains Archaea, Bacteria and Eucarya in terms of small subunit ribosomal RNA characteristics". Syst. Appl. Microbiol. 14 (4): 305–310. doi:10.1016/s0723-2020(11)80303-6. PMID 11540071.
- Woese, CR; Kandler O; Wheelis ML (1990). "Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (12): 4576–4579. Bibcode:1990PNAS...87.4576W. doi:10.1073/pnas.87.12.4576. PMC 54159. PMID 2112744.
- Achenbach-Richter, L; Woese CR (1988). "The ribosomal gene spacer region in archaebacteria". Syst. Appl. Microbiol. 10 (3): 211–214. doi:10.1016/s0723-2020(88)80002-x. PMID 11542149.
- McGill, TJ; Jurka J; Sobieski JM; Pickett MH; Woese CR; Fox GE (1986). "Characteristic archaebacterial 16S rRNA oligonucleotides". Syst. Appl. Microbiol. 7 (2–3): 194–197. doi:10.1016/S0723-2020(86)80005-4. PMID 11542064.
- Woese, CR; Gupta R; Hahn CM; Zillig W; Tu J (1984). "The phylogenetic relationships of three sulfur dependent archaebacteria". Syst. Appl. Microbiol. 5: 97–105. doi:10.1016/S0723-2020(84)80054-5. PMID 11541975.
- Woese, CR; Olsen GJ (1984). "The phylogenetic relationships of three sulfur dependent archaebacteria". Syst. Appl. Microbiol. 5: 97–105. doi:10.1016/S0723-2020(84)80054-5. PMID 11541975.
- Woese, CR; Fox GE (1977). "Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: the primary kingdoms". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 74 (11): 5088–5090. Bibcode:1977PNAS...74.5088W. doi:10.1073/pnas.74.11.5088. PMC 432104. PMID 270744.
과학 서적
- Garrity GM, Holt JG (2001). "Phylum AI. Crenarchaeota phy. nov.". In DR Boone, RW Castenholz (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria (2nd ed.). New York: Springer Verlag. pp. 169. ISBN 978-0-387-98771-2.
과학 데이터베이스
외부 링크
Wikimedia Commons에는 Crenarchaeota 관련 미디어가 있습니다. |