시너지제
Synergistetes | 위키피아는 시너지스트와 관련된 정보를 가지고 있다. |
| 시너지스과 | |
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| 과학적 분류 | |
| 킹덤: | |
| 망울: | 시너지제 주마스-빌락 외 2009 |
| 클래스: | 시너지 주마스-빌락 외 2009 |
| 순서: | 시너지목 주마스-빌락 외 2009 |
| 패밀리: | 시너지스과 주마스-빌락 외 2009 |
| 제네라 | |
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| 동의어 | |
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시너지세트는 그람 음성 얼룩이 보이고 막대/비브리오이드 세포 모양이 있는 혐기성 박테리아의 망막이다.[1][2] 시너지스트에는 디더름 세포 봉투가 있지만,[3][4] 시너지스트에서는 아직 리포폴리사당체 생합성에 관여하는 다양한 단백질의 유전자가 검출되지 않아 비정상적인 외부 세포 봉투를 가지고 있을 수 있음을 알 수 있다.[3][4] 시너지세트는 동물의 위장막, 토양, 유정, 폐수처리장 등 혐기성 환경의 대부분에 서식하며 낭종, 종기, 치주질환 등의 인체 질환 현장에도 존재한다.[5][6] 질병 관련 현장에 존재하기 때문에 시너지세트는 기회주의적인 병원균으로 제안되지만, 탯줄의 미세 생물체와 정상적인 질 동식물에서 건강한 개인에게서도 발견될 수 있다.[6][7] 이 망막 안에 있는 종들은 또한 치주질환,[8] 위장염, 연조직염에 연루되어 있다.[6] 이 망울의 다른 종은 혐기성 굴착기의 생물가스 생산을 위한 슬러지 저하에 상당한 기여자로 확인되었으며, 수소 가스 생산을 통한 재생 에너지 생산에 사용할 수 있는 잠재적 후보종이다.[9] 알려진 시너지스테테스 종과 제네라는 모두 현재 단일 클래스(시네르기스티아), 순서(시네르기스티아스), 가족(시네르기스티아스과)의 일부분이다.[2]
유전체학 및 분자 서명 비교
최근 시너지세트의 게놈 서열화 비교 분석은 모든 시너지세트의 종에 특정한 단백질 서열에서 보존된 많은 수의 CSI(CSI)[10]를 식별하도록 유도했다. 그 CSIs는, RpoB, RpoC, UvrD, GyrA, PolA, PolC, MraW, NadD, PyrE, RpsA, RpsH, FtsA, RadA 등 널리 분포된 단백질에서, 큰 을 등은 RpoC 단백질에 300아아 삽입 32가 확인되고 중에서 다양한 Synergistetes 종에서도지만 고립된 박테리아를 제외하고, 이 CSIs은 단백질 homologues fr에서 발견되지 않어 있다.om 다른 모든 유기체들 이러한 CSI는 시너지세테스 종을 다른 모든 박테리아와 구별하기 위한 새로운 분자 표지를 제공한다.[10] RpoB의 13a를 포함한 중요한 단백질의 다른 7개의 CSI가 존케텔라, 피라미도박터, 데티오술포비브리오 종에서 특이하게 존재한다는 것이 발견되었는데, 이는 또한 계통생식나무에 의해 강력하게 지지되고 있다. Jonquetella와 Pyramidobacter에만 존재했던 15개의 추가 CSI는 이 두 종 사이의 밀접한 연관성을 나타낸다.[10] 마지막으로, 아미노모나스와 테르마나에로비브리오 종의 긴밀한 관계도 확인된 9개의 CSI에 의해 뒷받침된다. 확인된 분자 표지는 종을 속눈썹 시너지스테이트에서 가족이나 질서와 같은 중간 분류학적 등급으로 나누는 신뢰할 수 있는 수단을 제공한다.[10]
필로제니
전종 생활 나무 프로젝트의 작업에 기반한 계통생성.[11]
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분류학
현재 승인된 분류법은 LSPN(Listing in Nomenclature)과 NCBI([12]National Center for Biological Information)를 기준으로 한다.[13]
- Subpylum Synerstetes Jumas-Bilak 등. 2009년 [시네르기스타에오타 오렌 외 2015년 [아미나에로비아 후겐홀츠]
- 클래스 시너지 주마스-빌락 외 2009
- 시너지세일즈주마스빌락 외 주문 2009
- 패밀리 시너지스과 주마스-빌락 외 2009년 [클로스리디알 가족 XV]
- 아케토미크로비움속사우스섹 외 1985년
- 아세트미크로비디움 플라비디움 사우섹 외 1985년
- 속스 아미니필루스디아스 외 2007년
- 아미니필루스 할레스크립투스 디아스 외 2007년
- 속스 아미니비브리오혼다 외 2013년
- 아미니비브리오 피루바티필루스 혼다 외 2013년
- 속스 아미노박테리움바에나 외 1999
- A. colombiense Baena et al. 1999 (type sp)
- 종 A. 이동성 Baena 등 2000
- 2015년 종 A. Thunnarium Hamdi 등
- 아미노모나스바에나 외 1999년
- 아미노모나스 파키보란스 바이나 외 1999년
- AnaeracobulumRees 등 1997년 에멘드. 마우네 & 태너 2012
- A. 수소균류 마우네 & 태너 2012
- A. 모바일 메네스 & Muxi 2002
- A. Thermoterrenum Rees 등 1997년(유형 sp)
- 칸디다투스탐멜라홍고 외 2007년
- 칸디다스 타멜라 카듀세아 홍오 외 2007년
- ClaacibacillusGanesan 등 2008년 에멘드. 루프트 외 2013년
- 클루아시바실러스 에브리엔시스 가네산 외 2008년
- Cloacibacillus porcorum Looft et al. 2013
- 데티오술포비브리오마고트 외 1997년
- 속스 FatibacteriumVartoukian et al. 2013
- Fretibacterium fastidiosum Vartoukian et al. 2013
- 존케텔라주마스빌락 외 2007년
- 존케텔라 인류 주마스빌락 외 2007년
- LactivibrioQiu 등 2014년
- Lactivibrio 알콜중독자 Chiu 외 2014년
- PyramidobacterDownes et al. 2009
- Pyramidobacter piscolens Downes 등. 2009
- 씨스 시너지스트앨리슨 외 1993년
- 종 시너지제 존스이 앨리슨 외 1993년
- ThehermanaerovibrioBaena 등 1999년 에멘드. 팔라니아판 외 2013년
- T. acidaminovorans (Guangsung et al. 1997) Baena et al. 1999 [Selenomonas acidaminovorans et al. 1997] (type sp)
- 종 T. 벨록스 자바르지나 외 2000
- 테르모비르가달레와 버클랜드 2006년
- Thermovirga lieni Dahle and Birkland 2006 종
- 아케토미크로비움속사우스섹 외 1985년
- 패밀리 시너지스과 주마스-빌락 외 2009년 [클로스리디알 가족 XV]
- 시너지세일즈주마스빌락 외 주문 2009
- 클래스 시너지 주마스-빌락 외 2009
주의:
∘국가생명공학정보센터(NCBI)에서 발견된 변형률(Leading in Nomenclature, LPSN)이 있는 원핵생물 명칭 목록에는 수록되지 않음
참조
- ^ Hugenholtz, P, Hooper, S.D., Kyrpides, N.C. (2009). 집중: 시너지 효과. 환경. 마이크로바이올. 11, 1327–1329.
- ^ a b Jumas-Bilak, E.; Roudiere, L.; Marchandin, H. (2009). "Description of 'Synergistetes' phyl. nov. and emended description of the phylum 'Deferribacteres' and of the family Syntrophomonadaceae, phylum 'Firmicutes'". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 59: 1028–1035. doi:10.1099/ijs.0.006718-0.
- ^ a b 굽타, R. S. (2011) 디더름의 기원 (그램 음성) 박테리아: 내시경 검사보다는 항생제 선택 압력 때문에 두 개의 막이 있는 박테리아 세포가 진화했을 가능성이 있다. 안토니 판 류웬후크 100: 171–182
- ^ a b Sutcliffe, I.C. (2010). "A phylum level perspective on bacterial cell envelope architecture". Trends Microbiol. 18: 464–470. doi:10.1016/j.tim.2010.06.005. PMID 20637628.
- ^ Jumas-Bilak, E.; Carlier, J.P.; Jean-Pierre, H.; Citron, D.; Bernard, K.; Damay, A.; Gay, B.; Teyssier, C.; Campos, J.; Marchandin, H. (2007). "Jonquetella anthropi gen. nov., sp. nov., the first member of the candidate phylum 'Synergistetes' isolated from man". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 57: 2743–2748. doi:10.1099/ijs.0.65213-0. PMID 18048718.
- ^ a b c 바르투키안, S.R., 팔머, R.M., W.G. 웨이드(2007). 사단 "시네르기스트". 아나이로브, 13번, 99-106
- ^ 마천딘, H, 다메이, A, 루디에르, L, 티시어, C, 조르니오티, I, 데쇼우드, H, 장피에르, 주마스빌락, E. (2010) 인간 기원의 변종과 복제에 중점을 둔 망상 시너지스트에서 기형, 다양성, 숙주 전문화. 레스. 마이크로바이올. 161, 91–100.
- ^ Horz, H.P.; D.M. Citron; Y.A. Warren; E.J. Goldstein; G. Conrads (August 2006). "Synergistes Group Organisms of Human Origin". Journal of Clinical Microbiology. 44 (8): 2914–2920. doi:10.1128/JCM.00568-06. PMC 1594628. PMID 16891512.
- ^ Rivier, D, Desvignes, V, Pelletier, E, Chaussonnerie, S, Guermazi, S, Weissenbach, J, Li, T, Camacho, P, Sghir, A. 슬러지의 혐기성 소화와 관련된 미생물의 핵심을 정의하기 위해. ISME. J. 3, 700–714.
- ^ a b c d Bhandari, V.; Gupta, R. S. (2012). "Molecular signatures for the phylum Synergistetes and some of its subclades". Antonie van Leeuwenhoek. 102: 517–40. doi:10.1007/s10482-012-9759-2. PMID 22711299.
- ^ "16S rRNA-based LTP release 123 (full tree)" (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Retrieved 2016-03-20.
- ^ J.P. Euzéby. "Synergistetes". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2016-03-20.
- ^ Sayers; et al. "Synergistetes". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2016-03-20.
