Idi na sadržaj

GRB7

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
GRB7
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

3PQZ, 1MW4, 1WGR, 2L4K, 2QMS, 4WWQ, 4X6S, 5EEL, 5EEQ, 5D0J

Identifikatori
AliasiGRB7
Vanjski ID-jeviOMIM: 601522 MGI: 102683 HomoloGene: 3881 GeneCards: GRB7
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 17 (čovjek)
Hrom.Hromosom 17 (čovjek)[1]
Hromosom 17 (čovjek)
Genomska lokacija za GRB7
Genomska lokacija za GRB7
Bend17q12Početak39,737,927 bp[1]
Kraj39,747,291 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 11 (miš)
Hrom.Hromosom 11 (miš)[2]
Hromosom 11 (miš)
Genomska lokacija za GRB7
Genomska lokacija za GRB7
Bend11 D|11 61.75 cMPočetak98,337,220 bp[2]
Kraj98,346,199 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
phosphatidylinositol binding
vezivanje identičnih proteina
vezivanje sa RNK
protein kinase binding
lipid binding
Ćelijska komponenta citoplazma
citosol
projekcija ćelije
membrana
focal adhesion
ćelijska membrana
međućelijske veze
cytoplasmic stress granule
Biološki proces negative regulation of translation
epidermal growth factor receptor signaling pathway
positive regulation of cell migration
leukocyte migration
GO:0072468 Transdukcija signala
stress granule assembly
ERBB2 signaling pathway
positive regulation of signal transduction
axon guidance
GO:1901047 insulin receptor signaling pathway
GO:1903105 negative regulation of insulin receptor signaling pathway
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001030002
NM_001242442
NM_001242443
NM_005310
NM_001330207

NM_010346

RefSeq (bjelančevina)

NP_001025173
NP_001229371
NP_001229372
NP_001317136
NP_005301

NP_034476

Lokacija (UCSC)Chr 17: 39.74 – 39.75 MbChr 11: 98.34 – 98.35 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Protein 7, vezan za receptor faktora rasta, poznat i kao GRB7, jest protein koji je kod ljudi kodiran genom GRB7.[5][6]

Koristeći metod CORT (kloniranje ciljeva receptora) koju su osmislili Skolnik et al. (1991) za prikaz visoko ekspresijske biblioteke miša, Margolis et al. (1992) izolirali su gen za mišji Grb7, koji kodira protein od 535 aminokiselina. GRB7 je homolog ras-GAP (protein koji aktivira ras-GTPazu). Sadrži domen SH2 i vrlo je eksprimiran u jetri i bubrezima. Ovaj gen definira porodicu GRB7, čiji članovi uključuju mišji gen Grb10 i ljudski GRB14.

Tanaka et al. (1998) izolirali su cDNK navodne molekule za transdukciju signala GRB7 i novoprerađene varijante, GRB7V, iz invazivnog karcinoma jednjaka. Iako obje izoforme GRB7 dijele homologiju s migracijskim genom Mig10 Caenorhabditis elegans, izoformi GRB7V nedostaje 88 baznih parova na C kraju; rezultirajuće pomjeranje okvira dovodi do supstitucije SH2 domena kratkom hidrofobnom sekvencom.[7][8]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 532 aminokiseline, a molekulska težina 59.681 Da.[9]

1020304050
MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPDTPLPEEVKRSQPLLIPTT
GRKLREEERRATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASR
PHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHP
HLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFP
EKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFF
CFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFG
FCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQ
SRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQ
AWRKKTNHRLSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGL
VDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQT
RFTDLLQLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL
Simboli

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Proizvod ovog gena pripada maloj porodici adapterskih proteina za koje je poznato da stupaju u interakciju s velikim brojem receptora tirozin-kinaze i signalnih molekula. Ovaj gen kodira protein koji veže receptor faktora rasta koji stupa u interakciju sa receptora epidermnog faktora rasta (EGFR) i receptora efrina. Protein ima ulogu u integrinskom signalnom putu i migraciji ćelija, vezanjem sa fokusnom adhezionom kinazom (FAK). Alternativna prerada rezultira u više varijanti transkripta koji kodiraju različite izoforme, iako su do sada utvrđene prirode pune dužine samo dvije varijante.[5]

Klinički značaj

[uredi | uredi izvor]

GRB7 je adapterski protein domena SH2, koji se veže na receptor tirozin-kinaze i pruža unutarćelijsku direktnu vezu do Ras proto-onkogen . Ljudski GRB7 nalazi se na dugom kraku hromosoma 17, pored ERBB2 (alias HER2 / neu) proto-onkogena.

Ova dva gena se obično koamplificiraju (prisutna u prekomjernim kopijama) u raku dojke. Za GRB7, za koji se smatra da je uključen u migraciju, dobro je poznato da je prekomjerno eksprimiran u testisima, tumoru germ-ćelija, raku jednjaka i raku želuca.

Interakcije

[uredi | uredi izvor]

Pokazano je da GRB7 ima interakcije sa:

Modelni organizmi

[uredi | uredi izvor]

U proučavanju PNPO funkcije, korišteni su modelni organizmi. Uvjetna linija nokaut-miševa, zvana Pnpotm1a (KOMP) Wtsi,[15][16] generirana je kao dio programa Međunarosnog konzorcija za miševe – visokopropusnog projekta mutageneze za generiranje i distribuciju životinjskih modela bolesti zainteresiranim naučnicima.[17][18][19]

Muške i ženske životinje prolazile su standardizirani fenotipski skrining, kako bi se utvrdili efekti delecije.[20][21] Od 24 izvedena testa i na mutantnim miševima, nisu uočene značajne abnormalnosti.[20] Tokom gestacije, nije utvrđen homozigotni mutantni embrion, pa tako nijedan nije preživio do odvikavanja. Preostali testovi su izvedeni na mutiranim heterozigotnim odraslim miševima; nisu opažene nikakve dodatne značajne abnormalnosti kod ovih životinja.[20]

Fenotip nokaut-miša Pnpo
Svojstvo Fenotip
Vijabilnost homozigota Normalno
Studija recesivne letalnosti Normalno
Plodnost Normalno
Tjelesna težina Normalno
Test otvorenog polja: anksioznost Normalno
Neurološka procjena Normalno
Snaga stiska Normalno
Test vruće ploče Normalno
Dismorfologija Normalno
Indirektna kalorimetrija Normalno
Test tolerancije glukoze Normalno
Slušni odgovor moždanog stabla Normalno
DEXA Normalno
Radiografija Normalno
Tjelesna temperatura Normalno
Morfologija ika Normalno
Klinička hemija (nalaz) Normalno
Plazmatski imunoglobulini Normalno
Hematologija Normalno
Leukociti periferne krvi Normalno
Mikronukleus test Normalno
Težina srca Normalno
Histopatologija oka Normalno
Salmonella infekcija Normalno[22]
Citrobacter infekcija Normalno[23]
Svi testovi i analize su iz [20][24]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000141738 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000019312 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: GRB7 growth factor receptor-bound protein 7".
  6. ^ Tanaka S, Mori M, Akiyoshi T, Tanaka Y, Mafune K, Wands JR, Sugimachi K (Aug 1998). "A novel variant of human Grb7 is associated with invasive esophageal carcinoma". The Journal of Clinical Investigation. 102 (4): 821–7. doi:10.1172/JCI2921. PMC 508945. PMID 9710451.
  7. ^ Skolnik, E. Y., Margolis, B., Mohammadi, M., Lowenstein, E., Fischer, R., Drepps, A., Ullrich, A., Schlessinger, J. Cloning of PI3 kinase- associated p85 utilizing a novel method for expression/cloning of target proteins for receptor tyrosine kinases. Cell 65: 83-90, 1991. [PubMed]: 1849461
  8. ^ Tanaka, S., Mori, M., Akiyoshi, T., Tanaka, Y., Mafune, K., Wands, J. R., Sugimachi, K. A novel variant of human Grb7 is associated with invasive esophageal carcinoma. J. Clin. Invest. 102: 821-827, 1998. PubMed: 9710451
  9. ^ "UniProt, Q14451". Pristupljeno 22. 6. 2021.
  10. ^ Han DC, Shen TL, Miao H, Wang B, Guan JL (Nov 2002). "EphB1 associates with Grb7 and regulates cell migration". The Journal of Biological Chemistry. 277 (47): 45655–61. doi:10.1074/jbc.M203165200. PMID 12223469.
  11. ^ Kasus-Jacobi A, Béréziat V, Perdereau D, Girard J, Burnol AF (Apr 2000). "Evidence for an interaction between the insulin receptor and Grb7. A role for two of its binding domains, PIR and SH2". Oncogene. 19 (16): 2052–9. doi:10.1038/sj.onc.1203469. PMID 10803466.
  12. ^ Han DC, Guan JL (Aug 1999). "Association of focal adhesion kinase with Grb7 and its role in cell migration". The Journal of Biological Chemistry. 274 (34): 24425–30. doi:10.1074/jbc.274.34.24425. PMID 10446223.
  13. ^ Pandey A, Liu X, Dixon JE, Di Fiore PP, Dixit VM (maj 1996). "Direct association between the Ret receptor tyrosine kinase and the Src homology 2-containing adapter protein Grb7". The Journal of Biological Chemistry. 271 (18): 10607–10. doi:10.1074/jbc.271.18.10607. PMID 8631863.
  14. ^ Vayssière B, Zalcman G, Mahé Y, Mirey G, Ligensa T, Weidner KM, Chardin P, Camonis J (Feb 2000). "Interaction of the Grb7 adapter protein with Rnd1, a new member of the Rho family". FEBS Letters. 467 (1): 91–6. doi:10.1016/s0014-5793(99)01530-6. PMID 10664463. S2CID 4901644.
  15. ^ "International Knockout Mouse Consortium". Arhivirano s originala, 3. 4. 2012. Pristupljeno 22. 6. 2021.
  16. ^ "Mouse Genome Informatics".
  17. ^ Skarnes, W. C.; Rosen, B.; West, A. P.; Koutsourakis, M.; Bushell, W.; Iyer, V.; Mujica, A. O.; Thomas, M.; Harrow, J.; Cox, T.; Jackson, D.; Severin, J.; Biggs, P.; Fu, J.; Nefedov, M.; De Jong, P. J.; Stewart, A. F.; Bradley, A. (2011). "A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function". Nature. 474 (7351): 337–342. doi:10.1038/nature10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
  18. ^ Dolgin E (2011). "Mouse library set to be knockout". Nature. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038/474262a. PMID 21677718.
  19. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (2007). "A Mouse for All Reasons". Cell. 128 (1): 9–13. doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
  20. ^ a b c d Gerdin AK (2010). "The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
  21. ^ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). "The mouse genetics toolkit: revealing function and mechanism". Genome Biol. 12 (6): 224. doi:10.1186/gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.
  22. ^ "Salmonella infection data for Pnpo". Wellcome Trust Sanger Institute.
  23. ^ "Citrobacter infection data for Pnpo". Wellcome Trust Sanger Institute.
  24. ^ Mouse Resources Portal, Wellcome Trust Sanger Institute.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]