Idi na sadržaj

MESP1

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
MESP1
Identifikatori
AliasiMESP1
Vanjski ID-jeviOMIM: 608689 MGI: 107785 HomoloGene: 32039 GeneCards: MESP1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 15 (čovjek)
Hrom.Hromosom 15 (čovjek)[1]
Hromosom 15 (čovjek)
Genomska lokacija za MESP1
Genomska lokacija za MESP1
Bend15q26.1Početak89,749,875 bp[1]
Kraj89,751,249 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 7 (miš)
Hrom.Hromosom 7 (miš)[2]
Hromosom 7 (miš)
Genomska lokacija za MESP1
Genomska lokacija za MESP1
Bend7 D2|7 45.16 cMPočetak79,441,989 bp[2]
Kraj79,443,536 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje sa DNK
protein dimerization activity
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Ćelijska komponenta jedro
Biološki proces Notch signaling pathway
neurogenesis
cardiac ventricle formation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
lateral mesoderm development
positive regulation of hepatocyte differentiation
positive regulation of heart induction by negative regulation of canonical Wnt signaling pathway
negative regulation of mesodermal cell fate specification
cardiac muscle cell differentiation
positive regulation of Notch signaling pathway involved in heart induction
cardiac vascular smooth muscle cell differentiation
signal transduction involved in regulation of gene expression
heart morphogenesis
transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
sinus venosus morphogenesis
heart looping
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
cardioblast migration
cardiac cell fate determination
multicellular organism development
Gastrulacija
embryonic heart tube morphogenesis
growth involved in heart morphogenesis
positive regulation of striated muscle cell differentiation
cardioblast migration to the midline involved in heart field formation
endothelial cell differentiation
sinoatrial node cell differentiation
negative regulation of endodermal cell fate specification
secondary heart field specification
cardiac atrium formation
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
cardioblast anterior-lateral migration
mesodermal cell migration
positive regulation of Notch signaling pathway
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
mesoderm formation
somitogenesis
embryonic pattern specification
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_018670

NM_008588

RefSeq (bjelančevina)

NP_061140

NP_032614

Lokacija (UCSC)Chr 15: 89.75 – 89.75 MbChr 7: 79.44 – 79.44 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Mišji mezodermni stražnji homolog 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom MESP1.[5] MESP1 je transkripcijski faktor koji regulira specifikaciju kardiovaskularnih progenitora.[6]

Gen MESP1 kodira člana porodice heliks-petlja-heliks (bHLH), porodice transkripcijskih regulatornih proteina koji mogu imati ulogu u razvoju novonastajućeg mezoderma. Saga et al. (1996) mapirali su gen Mesp1 na mišji hromosom 7, unutar regije koja dijeli homologiju sintezije ljudskim hromosomom 15q26. Mišji Mesp1 i Mesp2 odvojeni su za otprilike 23 kb, pozicionirani su glava uz glavu i transkribirani iz interlokusne regije. Odredili su da gen Mesp1 ima dva egzona.[7]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 268 aminokiselina, a molekulska težina 28.501 Da.[8]

1020304050
MAQPLCPPLSESWMLSAAWGPTRRPPPSDKDCGRSLVSSPDSWGSTPADS
PVASPARPGTLRDPRAPSVGRRGARSSRLGSGQRQSASEREKLRMRTLAR
ALHELRRFLPPSVAPAGQSLTKIETLRLAIRYIGHLSAVLGLSEESLQRR
CRQRGDAGSPRGCPLCPDDCPAQMQTRTQAEGQGQGRGLGLVSAVRAGAS
WGSPPACPGARAAPEPRDPPALFAEAACPEGQAMEPSPPSPLLPGDVLAL
LETWMPLSPLEWLPEEPK
Simboli

Kloniranje i ekspresija

[uredi | uredi izvor]

Saga et al. (1996) identificirali su miš Mesp1 gen supstraktivnom hibridizacijom kako bi izolirali gene koji sudjeluju u diferencijaciji iskonskih staničnih ćelija miša. Transkript Mesp1 kodira pretpostavljeni faktor transkripcije od 243 aminokiseline koji sadrži motiv bHLH.[9] Whittock et al. (2004) objavili da ljudski MESP1 i MESP2 imaju 47,4% aminokiselinskog identiteta. I MESP1 i MESP2 sadrže jedinstveni CPXCP motiv C-terminalno na bHLH domenu. N- i C-terminalni domeni MESP1 odvojeni su GQ regijom sa po dva ponavljanja, koja je u MESP2 proširena na 13 ponavljanja.

Funkcija gena

[uredi | uredi izvor]

Hibridizacijom insitu mišjih embriona, Saga et al. (1996) otkrili su najraniju ekspresiju Mesp1 6,5 dana nakon koitusa (dpc) u svim novonastalim mezodermnim ćelijama. Na 7,5 dpc, ekspresija Mesp1 otkrivena je u dnu alantoisa. Ubrzo nakon toga, ekspresija se proširila na bočne rubove mezoderma repnih pupova, po obrascu koji odgovara onom početne migracije primordijalnih klica, prije nego što nestanu. Nije otkrivena ekspresija Mesp1 u kasnijem razvoju ili u tkivima odraslih, osim u sjemenicima, u kojima je uočena drugačija izoforma od one viđene u ranom mezodermu. Zaključili su da Mesp1 može i,ati važnu ulogu u razvoju novonastajućeg mezoderma, uključujući primordijalne zametne ćelije.

Lescroart et al. (2018) izveli su sekvenciranje jednolančane RNK divljih i Mesp1 nultih kardiovaskularnih prekursora (CP) kod miševa i pokazali da su populacije Mesp1 CP molekulaki različite i da obuhvataju kontinuum između epiblastnih i kasnijih mezodermnih ćelija, uključujući hematopoetske prekursore. Analiza jednolančanih transkriptoma CP s nedostatkom Mesp1 pokazala je da je Mesp1 potreban za izlazak iz pluripotentnog stanja i indukciju programa ekspresije kardiovaskularnih gena. Identificirali su različite skupine kardiovaskularnih prekursora Mesp1, koje odgovaraju rodovima predanim različitim ćelijama lozama i regijama srca, identificirajući molekulske značajke povezane s ranim ograničenjem loze i regionalnom segregacijom srca u ranoj fazi mišje gastrulacije.[10]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000166823 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030544 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Mesoderm posterior 1 homolog (mouse)".
  6. ^ Bondue A, Lapouge G, Paulissen C, Semeraro C, Iacovino M, Kyba M, Blanpain C (juli 2008). "Mesp1 acts as a master regulator of multipotent cardiovascular progenitor specification". Cell Stem Cell (jezik: engleski). 3 (1): 69–84. doi:10.1016/j.stem.2008.06.009. PMID 18593560.
  7. ^ Whittock, N. V., Sparrow, D. B., Wouters, M. A., Sillence, D., Ellard, S., Dunwoodie, S. L., Turnpenny, P. D. Mutated MESP2 causes spondylocostal dysostosis in humans. Am. J. Hum. Genet. 74: 1249-1254, 2004. PubMed: 15122512
  8. ^ "UniProt, Q9BRJ9". Pristupljeno 15. 7. 2021.
  9. ^ Saga, Y., Hata, N., Kobayashi, S., Magnuson, T., Seldin, M. F., Taketo, M. M. MesP1: a novel basic helix-loop-helix protein expressed in the nascent mesodermal cells during mouse gastrulation. Development 122: 2769-2778, 1996.
  10. ^ Lescroart, F., Wang, X., Lin, X., Swedlund, B., Gargouri, S., Sanchez-Danes, A., Moignard, V., Dubois, C., Paulissen, C., Kinston, S., Gottgens, B., Blanpain, C. Defining the earliest step of cardiovascular lineage segregation by single-cell RNA-seq. Science 359: 1177-181, 2018. PubMed: 29371425

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]